PacBioSMRT测序技术揭示第七次霍乱大流行致病菌的来源
霍乱是一种由霍乱弧菌引起的可怕疾病。在人类历史上,自1817年以来,全球曾发生过七次可怕的霍乱大流行。而离我们最近的第七次霍乱大流行起始于1961至今,发源地是印度尼西亚,由此逐渐散布到了全世界。到目前为止,第七次霍乱大流行已经感染的人数大概在每年300-500万人左右。2010年海地地震后,霍乱也出现了一次大的爆发,导致近70万人感染,超过8500人死亡。 图1,霍乱弧菌(来自bacteriainphotos.com) 对于这样一个极具历史意义的细菌性传染性疾病,现代科学技术能够研究的致病菌只有第六次(1899-1923)和第七次(1961至今)霍乱大流行。通过血清学分析,第六次由经典型(classical)引起,而第七由El Tor型引起。而经过基因组分析进化树,发现除第七次大流行外,其他几次的霍乱菌全部来源于同一个classical型。这也说明第七次大流行并不是由第六次大流行的菌株直接演变而来的。 在今天向大家介......阅读全文
关于霍乱样综合征的基本介绍
霍乱样综合征多称为伪膜性肠炎,是主要发生于结肠的急性黏膜坏死性炎症,并覆有伪膜。此病常见于应用抗生素治疗之后,故为医源性并发症。现已证实是由难辨梭状芽孢杆菌的毒素引起,病情严重者可以致死。 现认为本征由难辨梭状芽胞杆菌感染所致,对于某些重病患者,外伤、手术、应激及服用广谱抗生素可诱发本征。难辨
霍乱正在改变疫区居民的基因组
据《科学》杂志网站近日报道,霍乱每年夺去成千上万人的生命,但人体并没有坐以待毙,研究人员现已找到证据:在霍乱流行的孟加拉国,当地人的基因组已经进化出多种不同的方式来应对这种疾病。这是人类进化发生在现代社会的一个引人注目的例子,研究传染病对人类进化的影响将有助于设计更有效的疫苗。 霍乱已经蔓
霍乱疫苗在也门面临大规模测试
试想在一个面积和西班牙相当、饱受战争蹂躏的贫困国家,有2000余万人受到一种在城市间快速传播的致命疾病的威胁。你可以支配100万份疫苗。你会试图保护谁? 这是在也门同迅速扩散的霍乱疫情作斗争的公共卫生专家和国际小组面临的问题。近日,一个管理全球霍乱疫苗适度储备的小组决定向也门分发100万份疫苗
霍乱弧菌的生化鉴定检测方法介绍
能发酵葡萄糖、麦芽糖、甘露醇、蔗糖、半乳糖等产酸产气,迟缓发酵乳糖。不分解阿拉伯糖、水杨素、卫矛醇、鼠李糖、木糖、侧金盏花醇和肌醇。氧化酶、明胶液化试验阳性。V-P试验大多数EL-Tor生物型阳性,而古典生物型大多为阴性。霍乱弧菌能分解色氨酸产生吲哚,同时能还原硝酸盐为亚硝酸盐。因此当霍乱弧菌培
关于霍乱样综合征的检查介绍
1.实验室检查 周围白细胞计数增多,以中性粒细胞为主。有低白蛋白血症、电解质失平衡或酸碱平衡失调。粪便细菌在特殊条件下培养,多数病例可发现有难辨梭状芽孢杆菌生长。粪内细胞毒素检测有确诊价值,将患者粪的滤液稀释不同的倍数,置组织培养液中观察细胞毒作用,1∶100以上有诊断意义。污泥梭状芽孢杆菌抗
霍乱样综合征的病原学
1.形态染色 霍乱弧菌革兰染色阴性,菌体长1.5-2.0μm,宽0.3-0.4μm,弯曲如逗点状,有一根极端鞭毛,其长度为菌体的4~5倍。 该菌运动活泼,在暗视野悬液中可见穿梭运动,粪便可用于直接涂片检查。 2.培养特性 霍乱弧菌在碱性(pH8.8-9.0)肉汤或蛋白胨水中繁殖迅速,表面
霍乱样综合征的病原学
1.形态染色 霍乱弧菌革兰染色阴性,菌体长1.5-2.0μm,宽0.3-0.4μm,弯曲如逗点状,有一根极端鞭毛,其长度为菌体的4~5倍。 该菌运动活泼,在暗视野悬液中可见穿梭运动,粪便可用于直接涂片检查。 2.培养特性 霍乱弧菌在碱性(pH8.8-9.0)肉汤或蛋白胨水中繁殖迅速,表面
霍乱样综合征的疾病诊断
(一)诊断标准 具有下列之一者,可诊断为霍乱样综合征。 1.有腹泻症状,粪便培养霍乱弧菌阳性。 2.霍乱样综合征流行期间,在疫区内有典型的霍乱腹泻和呕吐症状,迅速出现严重脱水,循环衰竭和肌肉痉挛者。虽然粪便培养未发现霍乱弧菌,但并无奉承舞厅中查者。如有条件可作双份血清凝集素试验,滴度4倍上
霍乱样综合征的临床表现
本征主要有腹泻,多为水样泻,有粘液,严重者每日排便量可达4000ml,部分患者排出特征性伪膜。腹泻与用药剂量及时间长短无关。可有腹痛、恶心、呕吐等消化道症状,并常有发热、心动过速,甚至脱水、休克、酸中毒、谵妄等毒血症症状 主要根据临床症状和X线造影检查为“鹅征”进行诊断,其他辅助检查有:肛门测
关于副霍乱的基本信息关介绍
潜伏期短者数小时,长者3d--5d,一般为1d--2d。 (一)典型临床症状先泻后吐,全身中毒症状不明显,多数病人无发热。也无明显腹痛、里急后重症状,排便次数常不大多(个别病人大便失禁,无法计数),但排泄量大,初为泥浆样或稀水样便,有粪质,而后很快呈米泔样或无色水样、洗肉水样便,无明显粪臭,病
霍乱样综合征的临床表现
本征主要有腹泻,多为水样泻,有粘液,严重者每日排便量可达4000ml,部分患者排出特征性伪膜。腹泻与用药剂量及时间长短无关。可有腹痛、恶心、呕吐等消化道症状,并常有发热、心动过速,甚至脱水、休克、酸中毒、谵妄等毒血症症状 主要根据临床症状和X线造影检查为“鹅征”进行诊断,其他辅助检查有:肛门测
简述霍乱弧菌检测的临床意义
异常结果:阳性结果的临床分析:显微镜检查可作为快速诊断的参考。革兰染色镜检可见典型革兰阴性弧菌。悬滴暗视野检查可见穿梭样活泼运动。免疫制动试验阳性,具有重要参考意义。上述结果只能做出初步诊断,最后的确诊仍需以培养结果为准。 阳性:见于霍乱。 需要检测的人群:频繁急剧腹泻、呕吐等怀疑为霍乱的病
刚刚!武汉疑似霍乱学生确诊报告发布
武昌区卫生健康局通报,7月9日晚,武昌区疾控中心接医院报告,武汉大学出现一例感染性腹泻病例,以呕吐腹泻为主,伴低热,血清学凝集试验为O139阳性。经省市区三级疾控中心复核,该病例的血清学凝集试验为O139阳性,诊断为霍乱,毒力基因阴性。患者经有效诊治,病情已得到控制,症状已消失。我局已组织专业机构对
出口食品中霍乱弧菌检验方法!
出口食品中霍乱弧菌检验方法! 一、培养基明细: 名称 规格 价格(元) 碱性蛋白胨水(APW) 250g 70 TCBS琼脂 250g 95 三糖铁琼脂(TSI) 250g 85 双糖铁琼脂(KIA) 250g 85 T1N1琼脂 250g 85
概述霍乱弧菌检测的检查过程
一.采样 1. 腹泻患者样本采集: ①水样便采1~3ml,成形便取指甲大小量; ②肛拭子:生理盐水浸湿采便管由肛门插入直肠内3~5cm处旋转取出; ③呕吐物采1~3ml。 2. 水样及液体标本采相对静止表层水(30cm内)500ml,其他液体标本采集500ml,2 ~3小时内送检。
Sanger采用SMRT测序技术获得-NCTC-3,000株细菌基因组图谱
英国著名的Wellcome Sanger研究所与Pacific Biosciences(PacBio)合作已完成了对英国公共卫生部国家标准菌库NCTC中 3,000多株细菌的基因组的测序工作,其中包括一些世界上最危险的细菌,如引起鼠疫、痢疾和霍乱的细菌。通过解码DNA,研究人员能够更好地了解细菌
PacBio-RS-II测序仪革新HLA检测分型技术[创新技巧]
PacBio RS II测序系统一经推出,其长读长、单分子碱基分辨率及无GC偏好性的特征即受到广大研究者的推崇,尤其是在HLA检测分型领域,国际上权威HLA检测分型机构相继引进PacBio RS II测序技术进行相关服务或试剂盒的研发,推起了PacBio在HLA研究应用领域的高潮。His
PacBio测序有望掀起下一场遗传诊断的革命
从一代到二代再到三代,近年来测序技术的发展势不可挡。单分子测序也逐渐表现出它的优势,在测序舞台上发挥着举足轻重的作用。近日,比利时鲁汶大学和瑞典乌普萨拉大学的研究人员在《Nucleic Acids Research》发表综述文章,介绍了PacBio SMRT测序技术在临床中的应用。 文章简单回
PacBio单分子测序揭示丹参叶绿体DNA修饰的相互作用
2014年6月10日,中科院药用植物研究所(IMPLAD)刘昶团队在《PLOS ONE》杂志上发表了利用PacBio测序技术揭示丹参(Salvia miltiorrhiza)叶绿体DNA修饰之间复杂相互作用的相关文章,该文章报道了丹参叶绿体中编码及非编码RNA的表达情况。这也是国内PacBio第
英机构提议阻止Illumina收购PacBio-维护测序市场公平竞争
大约一年前,美国基因测序巨头Illumina宣布了其20年发展史上最大的一笔交易,一时震惊了整个基因测序行业。 2018年11月,Illumina与英国三代测序上游制造商PacBio宣布签署了一项收购协议,Illumina将斥资12亿美元以全现金交易形式收购PacBio,将长读长测序技术收入囊
PacBio-RS-II测序仪革新HLA检测分型技术[创新技巧]
PacBio RS II测序系统一经推出,其长读长、单分子碱基分辨率及无GC偏好性的特征即受到广大研究者的推崇,尤其是在HLA检测分型领域,国际上权威HLA检测分型机构相继引进PacBio RS II测序技术进行相关服务或试剂盒的研发,推起了PacBio在HLA研究应用领域的高潮。 His
2022年PacBio营收1.28亿美元,继续专注长度条测序
Pacific Biosciences近日发布2022年财政报告,由于用户等待该公司最新的 Revio 长读长测序仪导致其他测序仪器需求下降,其 2022 年第四季度收入同比下降 24%。2022年收入1.28亿美元,较上年1.31亿降低1.7%;净亏损3.14亿美元。第四季度概况 第四季度总
肠道门诊腹泻病例霍乱防治基础知识
1、高度可疑霍乱的诊断标准是什么? 答:(1)凡有典型临床症状,如剧烈腹泻、小学校便伴有呕吐,迅速出现严重脱水,循环衰竭及肌肉痉挛的首发病例,在病原检验尚末肯定前。 (2)霍乱浒期间有明显接触史(同餐、同住或护理者),并发生吐泻症状而无其他原因可查者。
荧光PCR检测霍乱弧菌的过程与方法
霍乱弧菌是引起人类霍乱的病原菌.也是我国传染病防治法规定的甲类传染病病原之一作为国际检疫传染病——霍乱的病原诊断.以检出O。群霍乱弧菌或O。剪群霍乱弧菌为准。O.群霍乱弧菌可再分为古典生物型和埃尔托生物型埃尔托霍乱弧菌在外环境水源中长期存在.特别是在水体PH值为7.6—8.5、水温26—32cI=、
国际疫苗研究所开发出廉价霍乱疫苗
总部设在韩国首尔的国际疫苗研究所4月20日宣布,该研究所开发出每剂售价仅为1美元的廉价霍乱疫苗,并在印度获得ZL,这为该疫苗的更广泛使用奠定了基础。 据该研究所介绍,这是世界上第一种廉价霍乱疫苗,而目前国际通用的口服霍乱疫苗在孟加拉国这样的发展中国家的售价为每剂18美元。新疫苗已在印度加尔
关于非霍乱弧菌感染的并发症
非霍乱弧菌感染的并发症主要有水电解质代谢紊乱、休克等。
非霍乱弧菌感染的临床表现检查
经过15~24小时的潜伏期后,疾病开始急性发作,那么,非霍乱弧菌感染有哪些症状呢?一般会出现痉挛性腹痛、水泻(大便可为血性并含有多形核白细胞)、里急后重、乏力、有时有低热。 24~48小时后症状自行消退,非凝集性弧菌可引起霍乱样疾病,并在伤口和血液可分离得到该菌。通过温暖的海水感染的伤口可演化
霍乱弧菌致病因素和所致疾病介绍
致病因素 霍乱弧菌产生肠毒素,是一种剧烈的致泄毒素。该毒素作用于肠壁促使肠黏膜细胞极度分泌从而使水和盐过量排出,导致严重脱水虚脱;进而引起代谢性酸中毒和急性肾功能衰竭。 所致疾病 引起烈性肠道传染病霍乱,为我国的甲类法定传染病。在自然情况下,人类是霍乱弧菌的唯一易感者。在地方性流行区,除病
概述霍乱样综合征的临床表现
发热,恶心,腹痛,腹胀,大量腹泻,腹泻物呈绿色海水样或黄色蛋花样稀便,脱落的伪膜;腹泻后腹胀减轻,脉搏增快,血压下降,呼吸急促,脱水征象,精神错乱,腹部压痛,腹肌紧张,肠胀气及肠鸣音减弱。 本病发病年龄多在50~59岁组,女性稍多于男性,起病大多急骤,病情轻者仅有轻度腹泻,重者可呈暴发型,病情
检验科粪便霍乱弧菌检测应急预案
1、收到病人标本以及医生出具的霍乱弧菌(O1及O139群)检验申请单。2、肉眼观察,标本呈米泔样水样便,显微镜下发现镜下弧菌呈鱼群穿梭样运动,O1及O139群霍乱弧菌检测(胶体金法)呈阳性/弱阳性。3、电话询问当班医生病人是否具有无痛性腹泻等霍乱感染症状,若符合霍乱感染症状,告知当班医生患者霍乱检测