Sanger采用SMRT测序技术获得NCTC3,000株细菌基因组图谱

英国著名的Wellcome Sanger研究所与Pacific Biosciences(PacBio)合作已完成了对英国公共卫生部国家标准菌库NCTC中 3,000多株细菌的基因组的测序工作,其中包括一些世界上最危险的细菌,如引起鼠疫、痢疾和霍乱的细菌。通过解码DNA,研究人员能够更好地了解细菌引起的疾病以及它们如何形成耐药性。这些公开的基因组图谱也有助于人们开发新型的诊断检测、疫苗或治疗方案。 其中的2700多株细菌,超过56%的细菌株实现单个Contig组装,超过92%的细菌株实现少于5个Contig组装。 NCTC 3000这项合作项目始于2013年,旨在对建于1920年代的NCTC贮存的5500多种细菌中3000多株细菌进行全基因组测序。NCTC是世界上最大的菌库之一,收集了多种临床相关致病菌株,包括著名的耐受多重抗生素的超级细菌—耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的样本。此外,NCTC还保藏了很多有历史意义的......阅读全文

Sanger采用SMRT测序技术获得-NCTC-3,000株细菌基因组图谱

  英国著名的Wellcome Sanger研究所与Pacific Biosciences(PacBio)合作已完成了对英国公共卫生部国家标准菌库NCTC中 3,000多株细菌的基因组的测序工作,其中包括一些世界上最危险的细菌,如引起鼠疫、痢疾和霍乱的细菌。通过解码DNA,研究人员能够更好地了解细菌

Sanger研究所测序3,000种危险细菌

   对于人类而言,细菌扮演着多重角色,有时是亲密的伙伴,有时是致命的敌人。英国著名的Wellcome Sanger研究所近日与Pacific Biosciences(PacBio)合作,测序了3,000多种细菌的基因组,其中包括一些世界上最危险的细菌。  这些细菌是由英国国家菌种保藏中心(NCTC

Cell综述:抗生素耐药性

  抗生素耐药性研究也许不再是追捧的研究热点,但确实是我们大家都需要的一个研究方向,尤其是在流感肆掠的今天。耐药的细菌机制由基因组变化编码,从点突变到预先存在的遗传元件的组装,再到从环境中水平导入基因。耐药机制与编码它们的基因变化谱之间存在多对多的关系。图片来源于网络  对多种药物都耐药的慢性感染怎

新型抗生素狙击耐药性

Arylomycin一类的天然产物经化学优化后,能够成为对多重耐药革兰氏阴性菌(如大肠杆菌)感染具有强效、广谱抗菌活性的化合物。近日发表在《自然》上的这项体外实验和小鼠实验的最新研究成果,有望让这类化合物成为一种全新的必需药物,用来对抗全球健康所面临的一大严重威胁。 多重耐药菌日益增

干旱加剧抗生素耐药性

  一项研究显示,干旱可能会增加土壤中天然抗生素的浓度,促进耐抗生素微生物生长。利用116个国家的临床数据,研究人员还报告了干旱程度和医院中抗生素耐药性平均发生率之间的关联,提出了气候变化对公共健康影响的另一种途径。相关论文3月24日发表于《自然-微生物学》。  土壤是自然抗生素化合物的丰富来源,许

最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm   ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图   日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学

基因组学研究细菌抗生素耐药性如何在不同物种间传播

  在最近一项研究中,来自克莱姆森大学的研究者们记录了人体内寄生菌所产生的抗生素耐药性基因向其它物种内寄生菌横向传播的趋势。  每年都会有大量的人群患有各种人畜共患病,这些疾病通常通过食物,水或与动物直接接触传播,而直接导致疾病发生的病原菌则包括沙门氏菌,大肠杆菌,炭疽等。  对此,研究员Richa

细菌如何获得抗生素耐药性

  一项新的研究发现揭示了抗生素耐药性是如何能在抗生素存在的时候在细菌细胞间传播的,而这些抗生素理应能阻止细菌生长。这些结果揭示,先前对药物敏感的细菌能够在长时间接触抗生素时存活下来以表达其刚刚获得的耐药基因,进而有效地让它们不受抗生素的影响。  这一过程的基础机制——包括一个在几乎所有细菌中都被发

抗生素耐药性的隐藏热点

  根据瑞典哥德堡大学最近的一项研究,废水中抗生素抗性进化的效力被大大低估了。该研究显示,废水具有独特的特性,允许抗性基因开始从无害的细菌到导致疾病的细菌的旅程。早在人类利用抗生素作为药物之前,微生物就已经发展出生产这些分子的能力。因此,环境中许多细菌抵抗抗生素的能力是一种古老的特性。  自从抗生素

全球面临抗生素耐药性挑战

  澳大利亚首席科学家伊恩·查布10日说,抗生素耐药性很可能会成为全球面临的最严重公共卫生挑战之一,这需要科学界、企业界和公众共同应对。   作为政府的科学顾问,查布的办公室当天发布了一份题为《面对抗生素耐药性的威胁:建立预防新防线》的报告,警告错用和滥用抗生素所导致的相关耐药性会对公众健康带来风

抗生素耐药性危害近在眼前

  现在,进入冬季感冒高发时期,滥用抗生素的现象又有所抬头。图片来源于网络  “你知道抗生素对细菌性感冒才有效,病毒性感冒无需使用抗生素吗?”  对很多人来说简单明白的常识,但同时对很多人,即使有些高知人群,却也是知识的盲点。有不少国人习惯于一感冒就输液。  日前,在由联合国粮农组织和世界卫生组织共

抗生素耐药性问题有望解决

法国国家科学研究中心日前宣布,该机构参与的科研团队成功识别出一种新分子NM102,能够在不破坏宿主微生物群的前提下,使致病菌在面对免疫系统时“解除武装”。这一成果有望推动新型药物开发,并解决抗生素耐药性问题。虽然抗生素能降低感染性疾病的死亡率,但滥用却导致细菌产生耐药性。抗生素具备广谱杀菌能力,也容

Nature公布大麦基因组图谱

  大麦是世界上最重要的粮食作物之一,17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程,在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下,历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值

AEM:噬菌体可扩散抗生素耐药性

  近日,来自维也纳兽医大学(University of Veterinary Medicine)的研究人员通过对从奥地利超市、街边市场等处购买的50份鸡肉样本进行分析,发现有将近一半的样本都被噬菌体污染了,而且这种噬菌体还有能力将抗生素耐药性基因从一种细菌转移到另一种细菌;相关研究发表于Appli

华南农大抗生素耐药性研究刊登Lacent

  根据最近在《Lancet Infectious Diseases》发表的一项新研究表明,一个新的基因(MCR-1)——可使细菌对多粘菌素(polymyxins,我们剩下的最后一道抗菌防御)产生高度耐药性,广泛存在于取自中国南方的猪和患者的肠杆菌科细菌中,包括具有流行可能性的菌株。  MCR-1被

-抗生素耐药性-究竟是什么?

  上个世纪初,世界上三分之一人死于肺炎、结核、肠炎及腹泻。今天心脏病和癌症成为人类的主要杀手,因肺炎和流感死亡的人数则不到4.5%。 这是人类应用抗生素在公共卫生领域取得的重要成果[1]。而现在人类却又走到了事情的另一个极端:滥用抗生素导致耐药菌的出现及广泛传播。  一项世界规模的宏基因组研究显示

全球抗生素耐药性处于非常高水平

  科技日报联合国1月29日电 世界卫生组织首次发布的抗生素耐药监测数据显示,高收入和低收入国家对抗一些严重细菌感染的抗生素耐药性处于非常高的水平。   2015年10月,世卫组织启动了全球抗微生物监测系统(GLASS),该系统建立在世卫组织其他监测方案的经验基础之上。迄今为止,共有52个国家(2

全球抗生素耐药性处于非常高水平

  世界卫生组织首次发布的抗生素耐药监测数据显示,高收入和低收入国家对抗一些严重细菌感染的抗生素耐药性处于非常高的水平。  2015年10月,世卫组织启动了全球抗微生物监测系统(GLASS),该系统建立在世卫组织其他监测方案的经验基础之上。迄今为止,共有52个国家(25个高收入国家,20个中等收入国

“基因剪刀”出手应对抗生素耐药性

  据英国《自然·微生物学》杂志近日发表的一项研究,美国研究人员报告称,他们利用被称为“基因剪刀”的基因编辑技术,开发出一个新系统,可以确定某种特定抗生素能靶向作用于致病菌的哪些基因。该成果将用于改进现有抗生素效果,或帮助人类开发出新型抗生素。  致病菌对抗生素产生耐药性,已然是严重的全球性公共卫生

“基因剪刀”出手应对抗生素耐药性

   据英国《自然·微生物学》杂志近日发表的一项研究,美国研究人员报告称,他们利用被称为“基因剪刀”的基因编辑技术,开发出一个新系统,可以确定某种特定抗生素能靶向作用于致病菌的哪些基因。该成果将用于改进现有抗生素效果,或帮助人类开发出新型抗生素。  致病菌对抗生素产生耐药性,已然是严重的全球性公共卫

细菌如何进化出抗生素耐药性?

  目前,研究人员利用高分辨率的低温电子显微镜,在前所未有的细节上,揭示了导致抗生素红霉素(erythromycin)耐药性的细菌核糖体变化。  多重耐药性细菌病原体,对几乎所有可用的抗生素都不敏感,是当今一个重大的公共卫生挑战。各种抗生素的耐药性是如何发展的?这个问题是德国路德维希 -马克西米利安

天然抗生素-有望对抗耐药性感染

   据国外媒体报道,美国科罗拉多大学博尔德分校的化学研究员最新开发出一种合成和优化天然抗生素化合物的新方法,这种化合物未来有一天可能用于对抗致命的耐药性感染,例如金黄色葡萄球菌。  数据表明,美国每年有200多万居民饱受抗生物耐药性感染的折磨。2018年一项研究发现,2015年欧洲有3.3万人死于

华南农大抗生素耐药性研究刊登Lacent

  根据最近在《Lancet Infectious Diseases》发表的一项新研究表明,一个新的基因(MCR-1)――可使细菌对多粘菌素(polymyxins,我们剩下的最后一道抗菌防御)产生高度耐药性,广泛存在于取自中国南方的猪和患者的肠杆菌科细菌中,包括具有流行可能性的菌株。延伸阅读:耐抗生

华南农大抗生素耐药性研究刊登Lacent

  根据最近在《Lancet Infectious Diseases》发表的一项新研究表明,一个新的基因(MCR-1)——可使细菌对多粘菌素(polymyxins,我们剩下的最后一道抗菌防御)产生高度耐药性,广泛存在于取自中国南方的猪和患者的肠杆菌科细菌中,包括具有流行可能性的菌株。延伸阅读:耐抗生

基因组图谱的方法和意义

中文名称基因组图谱英文名称genomic map定  义展示一种生物全基因组结构的图谱。按建立图谱的研究目的方法和精细程度,可以有不同的形式,包括以遗传学方法建立的遗传连锁图谱,按距离绘出基因位置分布的物理图谱,经测定核酸序列建立的核苷酸序列图谱,以及标记出可表达序列的转录图谱等。应用学科生物化学与

首次绘制小麦表观基因组图谱

  最近,英国利物浦大学的科学家们,对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化,进行了首次全基因组范围的调查,这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读:权威期刊发布首个小麦单体型图谱。  表观遗传标记是一种化学标签,将自己附着在DNA上

揭秘:帝王蟹的基因组图谱

  科学家成功获得高质量帝王蟹基因组图谱   帝王蟹 唐伯平供图  帝王蟹基因组染色体图谱 唐伯平供图  帝王蟹和其他泛甲壳动物的系统演化关系 唐伯平供图  近日,《分子生态资源》发表了首个歪尾类螃蟹的高质量基因组图谱,即一种重要经济蟹类蓝帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因组

首个家鸡基因组图谱绘制完成

西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日,相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题,发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中

英报告呼吁重视抗生素耐药性问题

  3月11日,英国推出《首席医务官年度报告》第二卷,将目标瞄向了日益严重的感染和抗生素耐药性问题。报告指出,疾病的不断演进和耐药性不断增强,使得人类面临的健康威胁越来越大。呼吁政府在鼓励研发新药物的同时,重视抗生素的使用状况,使用更卫生的手段预防感染的发生,并尽可能地减少病人服用抗生素的数量。

基因编辑、噬菌体疗法与抗生素耐药性

  一项概念验证研究提出,噬菌体疗法可能提供一种方法从而解决长期以来难以处理的抗生素耐药性问题。以瞄准病原细菌的定制病毒为基础的噬菌体疗法可能帮助应对抗生素耐药性的激增,但是这种策略也受到一些缺点的影响,尤其是向受感染组织提供噬菌体的困难,以及耐噬菌体基因在细菌之间的频繁转移。Udi Qimron及