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Sanger采用SMRT测序技术获得NCTC3,000株细菌基因组图谱

英国著名的Wellcome Sanger研究所与Pacific Biosciences（PacBio）合作已完成了对英国公共卫生部国家标准菌库NCTC中 3,000多株细菌的基因组的测序工作，其中包括一些世界上最危险的细菌，如引起鼠疫、痢疾和霍乱的细菌。通过解码DNA，研究人员能够更好地了解细菌引起的疾病以及它们如何形成耐药性。这些公开的基因组图谱也有助于人们开发新型的诊断检测、疫苗或治疗方案。 其中的2700多株细菌，超过56%的细菌株实现单个Contig组装，超过92%的细菌株实现少于5个Contig组装。 NCTC 3000这项合作项目始于2013年，旨在对建于1920年代的NCTC贮存的5500多种细菌中3000多株细菌进行全基因组测序。NCTC是世界上最大的菌库之一，收集了多种临床相关致病菌株，包括著名的耐受多重抗生素的超级细菌—耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）的样本。此外，NCTC还保藏了很多有历史意义的......阅读全文