重庆医科大学利用lncRNA芯片和circRNA芯片来研究膀胱癌
重庆医科大学基础医学院的陈俊霞教授主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期,该课题组和西南医科大学田强教授课题组合作应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片和circRNA芯片分析了膀胱癌组织的非编码RNAs表达情况,同时筛选到一批可预测膀胱癌发生和复发的分子标志物,并阐明了lncRNA和circRNA在膀胱癌的发生和发展中可能发挥的作用。该研究成果于2016年发表在国际著名学术期刊Oncotarget(影响因子5.008)上。(芯片实验由康成生物提供技术服务) 研究背景 膀胱癌(BC)是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一,并且发病率在男性癌症患者中位列第七。每年全球新增44万膀胱癌患者,其中约有13万因患膀胱癌而死去,而较高的复发率是膀胱癌的典型特征。近几年,很多研究表明非编码RNA在肿瘤的发生和发展中发挥着极其重要的作用,比如lncRNA和circRNA。但是,非编码RNAs在膀胱癌的发展过程中具体的作用机制......阅读全文
重庆医科大学利用lncRNA芯片和circRNA芯片来研究膀胱癌
重庆医科大学基础医学院的陈俊霞教授主要从事肿瘤转移及信号传导方面的基础研究。近期,该课题组和西南医科大学田强教授课题组合作应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片和circRNA芯片分析了膀胱癌组织的非编码RNAs表达情况,同时筛选到一批可预测膀胱癌发生和复发的分子标志物,并阐明了lnc
circRNA在膀胱癌中的作用机制
研究背景膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,深入阐述
全转录组测序的“一箭三雕”:circRNA,lncRNA,mRNA
1. 文章主题:环状RNA通过靶向miRNA调控的信号传导促进结直肠癌的转移发表期刊:Journal of pathology影响因子:5.942发表时间:201906实验方法:全转录组测序实验样本:结直肠癌组织肝转移是结直肠癌(CRC)患者的主要死亡原因。作者使用全转录组测序在CRC肝转移的小鼠模
《EMBO-reports》上阐述circRNA在膀胱癌中的作用机制
研究背景 膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,
为什么荧光素酶互补实验结果阴性也有
三大类的非编码RNA(ncRNA),miRNA/lncRNA/circRNA仍然是医学基础研究领域最为火热的研究热点,大部分的研究人员在立项之初,通过查阅文献或二代测序+生物信息学分析,获得了合适的研究对象,但在实验推进的过程中却遇到了重重困难。主要有以下几个原因:1. 找错了转录本;2. ncRN
非编码RNA(ncRNA)在前列腺癌发生发展中的作用机制
人类基因组计划的研究结果显示, 仅有2.5万~3万个蛋白质编码基因, 占总基因组序列不到3%, 其余基因组序列转录产生的RNA都是非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA). ncRNA与恶性肿瘤发生发展关系密切. 近年来, 关于ncRNA中的长链非编码RN(lncRNA)以及环
伯豪客户《EMBO-reports》上阐述circRNA在膀胱癌中的作用机制
研究背景 膀胱癌(Bladder cancer)是一种常见的泌尿系统肿瘤,由于易转移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的发病机制,有助于对膀胱癌的诊断和治疗。circRNA是一类具有闭合环形结构的非编码RNA,是现阶段转录组学研究的新星。本研究从circRNA的角度出发,
当肿瘤遇上外泌体,会碰撞出怎样的火花?
迄今为止,化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为,一些化疗药物,在杀死癌细胞的时候,还会促进癌细胞的转移,在这个过程中,外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell
当肿瘤遇上外泌体,会碰撞出怎样的火花
迄今为止,化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为,一些化疗药物,在杀死癌细胞的时候,还会促进癌细胞的转移,在这个过程中,外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell Bi
当肿瘤遇上外泌体,会碰撞出怎样的火花
迄今为止,化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为,一些化疗药物,在杀死癌细胞的时候,还会促进癌细胞的转移,在这个过程中,外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell Bi
circRNA再发IF=18.88高分文章circRNA机制研究汇总
超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子机制
circRNA再发IF=18.88高分文章circRNA机制研究汇总
超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
circRNA研究新成果
研究背景放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一,然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症,制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰,有待进一步研究。环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA,在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
中科院Cell子刊发表lncRNA新发现
生物通报道:长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段特异性表达。研究者们普遍认为lncRNA具有重要的生物学意义,但对它们的具体功能还知之甚少。 中科院上海生命科学研究院生物化
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点,也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature,cell级别高分文章领域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码,之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究(详细见云序课堂之前往期回顾)。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
双荧光素酶验证
miR 和LncRNA/circRNA/mRNA 结合双荧光素酶验证方案 一、 检测原理全基因合成 miR 潜在结合位点上下游~500bp( LncRNA、circRNA 或 mRNA 的3’UTR)野生形式 WT 及结合位点的突变形式 Mut,克隆到 psiCHECK-2 多克隆位点处
空间转录组测序样本准备指南
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,
2020年自然研究热点外泌体研究
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,
一次RNA甲基化测序的多项成果云序RNA甲基化测序技术...1
一次RNA甲基化测序的多项成果-云序RNA甲基化测序技术大公开文章导读RNA修饰是表观遗传学中调控转录后基因表达的关键过程,目前对m6A RNA修饰的研究已进行的如火如荼,而除了m6A以外仍有多种RNA修饰类型参与调控转录后的基因表达,其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修饰以及ac
环状rna,为什么blast上标注mrna
环状RNA(circRNA)区别传统线性RNA类新型RNA具闭环结构量存于真核转录组部环状RNA由外显序列构同物种具保守性同存组织及同发育阶段表达特异性由于环状RNA核酸酶敏比线性RNA更稳定使其作新型临床诊断标记物发应用具明显优势近已新热点阅微基于2015始提供lncRNA环状RNA表达检测服务运
2020年自然研究热点外泌体研究
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,
circRNA机制研究汇总(二)
结合蛋白:(2)CircNfix与Ybx1结合并促进其降解:circNfix和对照组的蛋白质谱分析(A)。采用Ybx1、Nedd4l或阴性IgG抗体进行RIP实验(云序生物提供该服务)(B)。P0 CMs中过表达circNfix后Ybx1蛋白表达水平(C-D)。qRT-PCR检测P0 CMs中Y
circRNA机制研究汇总(一)
文章导读超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子
又传喜讯云序客户一次测序两项成果影响因子合计10分!
感恩有你,一路同行,新年快乐! 感恩有你,一路同行!2019年伊始,云序生物携全体员工对一直以来关心和支持公司发展的广大新老客户致以最诚挚的问候!一元复始,万象更新!转眼间我们迎来了2019年,站在新时代新的历史起点,回望刚刚过去的2018年,不断创新收获硕果丰盈;展望2019,任重道远却
lncRNA甲基化如何研究?
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能,这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛,引入甲基化就能轻松的变废为宝,竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章,你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化,作为最新的国自然热点受到
不得了,大牛告诉你lncRNA甲基化如何研究
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研究在构建大规模异构生物分子关联网络取得进展
中国科学院新疆理化技术研究所多语种信息技术研究室研究生郭镇豪、易海成在研究员尤著宏的指导下,开展的关于大规模异构生物分子关联网络的研究“Construction and Comprehensive Analysis of a Molecular Association Network via l
中外学者Nature子刊发文:环状RNA翻译出抑癌蛋白质!
由中山大学、复旦大学、暨南大学、美国安德森癌症中心等多家单位发表一项发现:使用翻译组测序技术,在脑胶质瘤细胞中发现了数千种可能翻译的环状RNA(circRNA),其中320个有差异表达现象,并具体验证了一种名为LINC-PINT的环状RNA可编码长度为87个氨基酸的蛋白质PINT87aa。 近