研究在构建大规模异构生物分子关联网络取得进展

中国科学院新疆理化技术研究所多语种信息技术研究室研究生郭镇豪、易海成在研究员尤著宏的指导下,开展的关于大规模异构生物分子关联网络的研究“Construction and Comprehensive Analysis of a Molecular Association Network via lncRNA-miRNA-Disease-Drug-Protein Graph”(《构建及综合分析基于长非编码RNA-微小RNA-环状RNA-信使RNA-微生物-疾病-药物-蛋白质的生物分子关联网络》)于近日发表在Cells杂志上。 该工作在国际学术界首次提出了生物分子关联网络(Molecular Association Network,MAN)的定义,MAN网络系统地集成了8种不同类型的生物分子(包括lncRNA、miRNA、circRNA、mRNA、microbe、disease、drug及protein)及18种关联关系(包括m......阅读全文

研究在构建大规模异构生物分子关联网络取得进展

  中国科学院新疆理化技术研究所多语种信息技术研究室研究生郭镇豪、易海成在研究员尤著宏的指导下,开展的关于大规模异构生物分子关联网络的研究“Construction and Comprehensive Analysis of a Molecular Association Network via l

什么是分子位置异构体?

组成相同而分子中的取代基或官能团(包括碳碳双键和三键)在碳架(碳链或碳环)上的位置不同,这些化合物叫位置异构体。

什么是分子位置异构体?

组成相同而分子中的取代基或官能团(包括碳碳双键和三键)在碳架(碳链或碳环)上的位置不同,这些化合物叫位置异构体。

欧阳证团队实现高分辨生物分子异构体分析研究

  生物分子的结构解析与相关生物学功能的关联研究已成为现今生命科学的前沿。生物分子存在多级结构,而其结构复杂度的一个重要因素为分子异构。不同的异构分子(Isomers and isoforms)具有相同的化学式和分子量,但化学结构不同。例如,单糖存在多种异构体,包括葡萄糖、果糖、半乳糖等;多糖由单糖

构象异构体的分子链构象

晶体中的高分子链构象晶体中的分子链构象有螺旋形构象、平面锯齿形构象等。1、两个原子或基团之间距离小于范德华半径之和时,将产生排斥作用。2、分子链在晶体中的构象,取决于分子链上所带基团的相互排斥或吸引作用的情况。3、有规立构高分子链在形成晶体时,在条件许可下总是尽量形成时能最低的构象形式。4、基本结构

分子扭转诱导的单晶异构化和价态异构转变试验研究

近日,北京理工大学陶军教授团队利用晶体熔化相变与配合物结构异构化相结合,实现原位单晶到单晶的异构化转变,从而在分子水平上操纵价态异构转变特性。这种结构异构化提供了一个理想的测试平台,可以直接研究配位环境、堆叠模式和分子间相互作用对价态异构转变的影响,从而建立精确的结构-性质关系,指导价态异构配合物的

葡萄糖异构酶的生物学物质介绍

  GI 它是工业上大规模从淀粉制备高果糖浆的关键酶,且该酶可将木聚糖异构化为木酮糖, 再经微生物发酵生产乙醇。  热稳定性  乳酸杆菌和埃希杆菌GI 的热稳定性较差,链霉菌和枯草芽孢杆菌GI 在高温下相当稳定。嗜热高温菌(Thermus thermophi lus)GI 的热稳定性最高,可能是它对

立体异构与顺反异构有什么区别

顺反异构是立体异构的一种,顺反异构主要指由于双键的不可旋转性,造成的同分异构现象。简单的说就是同一侧上下连的东西不同造成的。至于立体异构里主要是旋光异构,大部分是由于手性碳造成(一个碳连了四个不同的基团)。造成对应镜像关系的异构。

​什么立体异构?

立体异构(stereoisomerism)是在有相同分子式的化合物分子中,原子或原子团互相连接的次序相同,但在空间的排列方式不同,与构造异构(根据情况不同可以分为:碳链异构、位置异构、官能团异构三种。)同属有机化学范畴中的同分异构现象。

生物大分子是什么?脂肪是生物大分子吗?

  生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。  脂肪不是生物大分子。  脂类是油、脂肪、类脂的总称。脂肪由C、H、O三种元素组成。 脂肪是由甘油和脂肪酸组成的三酰甘

生物大分子是什么?脂肪是不是生物大分子?

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

生物分子的提取概述

       生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。        生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

生物分子的提取概述

生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,把被破碎的细胞置于一定的提取液

生物细胞分子的功能

  DNA 是负责遗传的主要分子,由 A、C、T、G 四种不同的单元依任意的顺序排列,例如一个有 10 个单元的 DNA 分子,会有 4 的 10 次方种不同的排列顺序,各种生物的遗传虽然均由 DNA 分子负责,由于排列顺序的差异,以致造成相互间极大的不同;RNA 是负责传递遗传讯息的分子,它将 D

立体异构的分类

立体异构分为几何异构(顺反异构)、旋光异构、构象异构三类。

构造异构的种类

1、碳链异构:异构体的分子式相同而碳骨架不同的现象。例如:正丁烷CH3CH2CH2CH3和异丁烷(CH3)2CHCH32、位置异构:异构体的分子式相同而分子中官能团或取代基在碳骨架上的位置不同的现象。又可分为官能团位置异构和取代基位置异构。①官能团位置异构是因官能团取代不同类型的氢而引起的。例如:1

差向异构的作用

具两个手性碳原子的L-异亮氨酸,仅在α-碳原子上发生构型变化,部分转化成其非对映体D-别异亮氨酸的过程。含有多个手性碳原子,其中一个手性碳原子的构型相反,其他手性碳原子的构型相同,这样的两种异构体互称差向异构体。两种差向异构体的组成和构造式相同,它们之间不是构造异构体,而是立体异构中的构型异构体。差

异构酶的分类

异构酶isomerase 亦称异构化酶,是催化生成异构体反应的酶之总称。是酶分类上的主要类别之一。根据反应方式而分类。(1)结合于同一碳原子的基团的立体构型发生转位反应(消旋酶、差向异构酶),如UDP葡萄糖差向酶(生成半乳糖);(2)顺反异构;(3)分子内的氧化还原反应(酮糖-醛糖相互转化等),如葡

顺反异构活性应用

活性不同人工合成的乙烯雌酚是一种雌性激素,反式构型的生物活性比顺式构型的高7~10倍。维生素A分子中所有的双键全部都为反式构型。具有降血脂作用的亚油酸及花生四烯酸分子的碳碳双键都是顺式构型。若改变上述化合物的构型,将导致生理活性的降低甚至丧失。并且反式脂肪酸(TFA)对血管内皮细胞的功能具有损伤作用

顺反异构发现历史

贝采里乌斯建议把相同组成而不同性质的物质称为“同分异构(isomerism)‘’的物质。同分异构现象的发现以及从理论上的阐明,是在物质组成和绪构理论发展中迈出的重要一步,它开始了分子结构问题的研究,促进了有机化学的发展。在发现了酒石酸的旋光异构之后,1874年9月荷兰物理化学家范特霍夫(Jacobu

电荷异构体

  对于单抗电荷变异体的测定有多种分析方法,20版中国药典通则3129收录了单抗电荷变异体测定法-全柱成像毛细管等电聚焦电泳法(icIEF法)外,新版中国药典将毛细管等电聚焦电泳(cIEF法)也写入3129通则。  离子交换(IEX)色谱和成像毛细管等电聚焦(iCIEF)或(CIEF),传统上都使用

常见的异构类型

常见的异构类型分为两大类:1.构造异构:(1).碳链异构 由于分子中碳链形状不同而产生的异构现象。如正丁烷和异丁烷。(2).位置异构 由于取代基或官能团在碳链上或碳环上的位置不同而产生的异构现象;2.立体异构:结构相似,但由于微小偏差导致结构不同。具体又可分为构型异构和构象异构

顺反异构互相转换

自然界的顺反异构体中通常是反式比较稳定,而顺式较不稳定。顺反异构体的构型转化是一个化学动态平衡过程。此过程一般可分为3种类型:光致异构化、热致异构化和催化异构化。基态时反式异构体总是比顺式稳定,所以后一类异构化过程的结果通常是反式异构体占多数,而光致异构化的结果往往相反 [1]  。如将顺式异构体加

顺反异构命名法

两个相同原子或基团在双键或脂环的同侧的为顺式异构体,也用 cis- 来表示。两个相同原子或基团在双键或脂环的异侧的为反式异构体,也用 trans- 来表示。用顺反异构命名法命名的有机化合物例举顺反异构命名举例顺反命名法命名存在一个缺陷:若双键上两个碳原子上连有四个完全不同的原子或基团,就无法命名,因

强激光场下分子异构化反应超快成像检测和控制通过验收

  5月12日,中科院上海光学精密机械研究所承担的浦江人才计划项目“强激光场下分子异构化反应的超快成像检测和控制研究”通过了上海市科委组织的验收。验收专家组听取了项目负责人刘鹏研究员的工作报告,认为项目全面完成任务书规定的考核指标,一致同意通过验收。   分子最高

异构酶的测定实验_D木糖异构酶测定

实验方法原理D-木糖 ⇌ D-木酮糖实验材料酶溶液试剂、试剂盒TES NaOHD-木糖MnSO4半胱氨酸·HCl咔唑溶液硫酸仪器、耗材分光光度计实验步骤实验所需「试剂」具体见「其他」20 ul 的实验混合物和 20 ul 酶溶液(各自用 20 ul TES 缓冲液作对照)混合,并在测定温度(例 50

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...  经过了免疫学的热潮,20世纪中叶开始兴起了又一门新的学科“分子生物学”。人们怀着满腔热忱,期待这一学科能够对那些机理不清的疾病予以新的认识。众多科学家经过了半个世纪的努力,终于用分子生物学方法整理出一批单基因病等和基因相关的疾病。随着基因基础

生物分子的溶剂提取法

一、生物分子的溶剂提取法原理:利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素:  1、溶剂的性质:根据相似相溶原理。  2、离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度对不同物质溶解度的影响不同,如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加,低离子强度下RN