转录、降解组技术对毛白杨次生维管系统再生microRNA的鉴定
木材的形成是一个复杂的发展过程，主要由转录网络调控。microRNA (miRNA)通过mRNA降解和翻译抑制，调节植物生长发育过程中靶基因的表达。 这项研究中，中国林业科学院卢孟柱课题组使用小RNA测序和降解组测序技术，研究不同剥皮时间后，毛白杨miRNAs参与SVS再生的表达情况。实验中取材四年生毛白杨树干，环状剥皮后7, 10, 12, 16, 18,和21天的再生组织。 小RNA测序结果表明，在再生组织中共发现209个已知miRNAs，187个新miRNAs。 降解组测序分析发现，157个靶基因由21个已知miRNAs控制，75个靶基因由30个新miRNAs调控。 GO分析结果表明，15个miRNAs的靶基因在生长素信号通路、细胞分化,分生组织发育中富集表达。 次生维管系统再生主要包括维管形成层启动，形成和分化阶段的连续过程。 本研究为miRNAs在SVS再生调控方面发挥的作用提供了理论依据。 本研究中......阅读全文
提取RNA－和反转录的操作注意事项
你按照买的反转录试剂盒来做就行.（1）、从细胞中提取细胞总RNA用GIBCO公司的Trizol试剂提取细胞总RNA.按试剂使用说明操作:离心收集细胞,倾去细胞液,向沉淀中加1 ml Trizo1(每106-107细胞),混匀至室温5分钟,用1 ml加样器反复吹打,直至细胞完全裂解成均一溶液,不粘稠时
北京生科院提出环形RNA全长转录本解析技术
4月12日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长
Nat－Catalysis：RNA是如何保证被准确转录的？
生命的信息通过信使RNA的转录和蛋白质的翻译在我们的基因组DNA中编码以执行细胞功能。为了确保准确的转录， RNA聚合酶II将合成并校正信使RNA以去除任何不匹配的错误。 虽然已知RNA聚合酶II对于确保转录的准确性至关重要，但对于这种酶如何完成这项艰巨的任务而言，这是一个长期存在的难题。科学
Thogoto病毒的RNA转录和复制机制获揭示
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员熊晓犁团队与广州国家实验室研究员陈新文团队合作，在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下，研究揭示了正黏病毒科Thogoto病毒的RNA转录和复制机制。相关成果发表于《自然-通讯》。 RNA的转录和复制是RNA病毒生命周期中至关重要的步骤
科研家提出环形RNA全长转录本解析技术
近日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》（Nature Protocols）上，发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文，建立了环形RNA全长转录本解析
体外转录rna后用dnaase消化多少时间
v如果从细胞或者组织提取RNA，有可能看不见pellet。但是体外转录的RNA看不见pellet，着实奇怪。你入等体积的异丙醇/1ul Glycoblue，或者3倍体积的无水乙醇/0.1体积醋酸钠/1ul Glycoblue，-80C沉淀过夜。次日高速离心30min，吸取液体时小小心。
Thogoto病毒的RNA转录和复制机制获揭示
近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员熊晓犁团队与广州国家实验室研究员陈新文团队合作，在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下，研究揭示了正黏病毒科Thogoto病毒的RNA转录和复制机制。相关成果发表于《自然-通讯》。THOV 聚合酶在RNA合成过程中呈现不同的构象。研究团队供图
上海生科院揭示反向剪接RNA成环与RNA转录的偶联机制
4月19日，国际学术期刊Cell Reports 发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与计算生物学研究所杨力研究组最新合作研究论文。此工作深入研究了环形RNA生成与RNA转录的偶联机制，揭示了环形RNA在神经分化过程中表达上调原理。 环形RNA是一类通过反向
体外转录测序揭示RNAseq的终极误差
高通量RNA测序（RNA-seq）是了解转录调控的一种强大技术。利用RNA-seq，我们不仅可以更好地进行传统的基因差异表达分析，而且还可以全面地研究可变剪接、RNA编辑、等位基因特异性表达和确定新的转录本（编码RNA和非编码RNA）。 与更成熟的、以RNA表达分析为基础的微阵列相反，RNA-
体外转录测序揭示RNAseq的终极误差
高通量RNA测序（RNA-seq）是了解转录调控的一种强大技术。利用RNA-seq，我们不仅可以更好地进行传统的基因差异表达分析，而且还可以全面地研究可变剪接、RNA编辑、等位基因特异性表达和确定新的转录本（编码RNA和非编码RNA）。 与更成熟的、以RNA表达分析为基础的微阵列相反，RNA-
RNA干涉实验——体外转录合成siRNA分子实验
实验方法原理采用噬菌体 RNA 聚合酶（T7、T3 或 SP6 RNA 聚合酶）可以很方便地在体外合成 siRNA 分子的正义与反义 RNA 链，然后再通过退火形成双链的 siRNA 分子。体外转录合成 siRNA 分子与化学合成双链 RNA 分子相比，其成本相对要低得多，而且有研究报道前者对靶基因
抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料 N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒 储存液缓冲液仪器、耗材 蛋白胨培养基蛋白胨平板N-表达质粒组合文库培养板实验步骤 ―、材料与设备1. 通过比较 β-半乳糖苷酶表达
抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。实验材料N-表达质粒E.coil N567 感受态细菌试剂、试剂盒储
RNA测序技术如何绘制全基因组转录终止？
近日，南方科技大学生命科学学院翟继先团队利用纳米孔单分子RNA测序技术绘制了拟南芥全基因组水平转录终止图谱。该方法能同时捕获包括已转录过polyA位点的 readthrough转录本、完成3’末端切割的5’或3’切割产物、以及已完成或正在进行多腺苷酸化（polyadenylation）的转录本在
抑制细菌转录终止检测技术筛选RNA结合蛋白实验
实验方法原理 一种通过筛选重组 cDNA 文库研究多肽与 RNA 相互作用的细菌抗转录终止检测系统。 实验材料 N-表达质粒 E.coi
Nat－Struct－Mol－Biol：冷冻电镜技术揭示RNA降解新通路
2013年12月15日，清华大学生命科学学院王宏伟教授课题组在《Nature》子刊《Nature Structural and Molecular Biology》在线发表题为“Visualization of Distinct Substrate Recruitment Pathways
中山大学RNA团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库
中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库，系统鉴定RNA聚合酶III（PolⅢ）转录的非编码RNA(P3RNA)，全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。 Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚
分卓中心发现长非编码RNA对细胞核仁和RNA转录的调控机制
7月30日，《科学》（Science）以Research Article形式发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）研究员陈玲玲研究组和研究员刘珈泉研究组的合作研究成果——lncRNA SLERT controls phase separation of FC/DF
转录、降解组技术对毛白杨次生维管系统再生microRNA的鉴定
木材的形成是一个复杂的发展过程，主要由转录网络调控。microRNA (miRNA)通过mRNA降解和翻译抑制，调节植物生长发育过程中靶基因的表达。 这项研究中，中国林业科学院卢孟柱课题组使用小RNA测序和降解组测序技术，研究不同剥皮时间后，毛白杨miRNAs参与SVS再生的表达情况。实验中取
eRNA与Super－Enhancer－RNA在转录调控中扮演的角色
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
2微克RNA反转录后的cDNA浓度大约为多少
2微克RNA反转录后的cDNA浓度大约为多少可以大概估算。考虑一下几个因素：1. 大多数RNA是28s，16s ，5s等rRNA，mRNA其实占少数。他们都会反转录为cDNA.。你若估计mRNA反转为cDNA的量较难。2、反转录和你添加的引物量有关。假设你加了1份引物，那就只能转录1分cDNA，按1
A20酶活性通过促进转录因子C/EBPβ降解抑制肺纤维化
肺纤维化严重影响呼吸功能，表现为干咳、进行性呼吸困难（自觉气不够用），且随着病情和肺部损伤的加重，患者呼吸功能不断恶化。特发性肺纤维化发病率和死亡率逐年增加，诊断后的平均生存期仅2.8年，死亡率高于大多数肿瘤，被称为一种“类肿瘤疾病”。 科学家们认为，肺纤维化既是独立疾病，也是慢性纤维增生性
如何使用KeyPro污染净化仪防止RNA的降解和保证PCR的结果...
如何使用KeyPro污染净化仪防止RNA的降解和保证PCR的结果准确性在此次的新型冠状病毒疫情中，核酸检测作为确诊的金标准发挥着重要的作用。众所周知，本次新冠病毒的核酸检测流程为采样（咽拭子、肺泡灌洗液），提取病毒RNA，再经过RT-qPCR或者一步法RT-数字PCR检测样本。但近期关于核酸检测准确
科学家揭示RNA聚合酶III转录起始动态过程
复旦大学研究员徐彦辉、青年研究员陈曦子团队，重建了人源RNA聚合酶Pol III转录起始的完整动态过程，揭示了转录因子与聚合酶催化活性协同驱动Pol III由转录起始向延伸过渡的分子机制，为理解真核短链非编码RNA合成的调控提供了关键结构基础。6月4日，相关研究发表于《自然》。RNA聚合酶（RNAP
北京生科院提出环形RNA全长转录本重建和定量新方法
国际学术期刊Genome Medicine 在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为Reconstruction of full-length circular RNAs enables isoform-level quantification 的最新研究成果。该研
PCR疑难问题粉碎机：逆转录PCR的操作要点与方法
逆转录 PCR（Reverse TranscriptionPCR, RT-PCR）是一种以 RNA 为样本，RNA链被逆转录成为互补 DNA（cDNA），再以此为模板通过 PCR 进行 DNA 扩增。在实际应用中，RT-PCR 分为一步法 RT-PCR 和两步法 RT-PCR。
于军研究组：首次利用RNAseq解析小鼠乳腺转录组学
乳腺是哺乳动物特有的器官, 90%的发育过程集中在出生之后。近期来自中科院北京基因组研究所，中国科学院大学等处的研究人员首次利用RNA-seq技术对小鼠乳腺发育进行转录组学研究, 包括怀孕期、哺乳期和退化期小鼠乳腺的基因表达情况，并解析了怀孕哺乳周期乳腺的关键调控基因。 作为哺乳动
武汉植物园等长链非编码RNA调控基因转录研究获进展
长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指长度大于200个核苷酸的非编码RNA，目前已在多种生物中发现了大量lncRNA，然而只有少数lncRNA的精细作用机理被阐明。 中国科学院武汉植物园汪志伟博士在植物种群遗传学科组王艇研究员支持和中国科学院留学
研究发现RNA测序新方法：检测亚细胞水平转录组空间分布
斯坦福大学研究团队在RNA测序方面取得突破性进展，发明了一种亚细胞水平转录组空间分布的RNA测序新方法，研究论文于近日在线发表于国际期刊Cell，论文标题为“Atlas of subcellular RNA localization revealed by APEX-Seq”。 该研究发明了一
Nature：RNA－修饰研究有助表观转录组学进一步发展
这是一个与 mRNA 结合的细菌核糖体的分子模式图，该核酸蛋白复合体正在合成蛋白质。 随着科研人员逐渐揭开 RNA 修饰的奥秘，帮助我们了解表观转录组学（epitranscriptomics）的工具也变得越来越多了。 2004 年，以色列特拉维夫大学（Tel Aviv University