转录、降解组技术对毛白杨次生维管系统再生microRNA的鉴定

木材的形成是一个复杂的发展过程,主要由转录网络调控。microRNA (miRNA)通过mRNA降解和翻译抑制,调节植物生长发育过程中靶基因的表达。 这项研究中,中国林业科学院卢孟柱课题组使用小RNA测序和降解组测序技术,研究不同剥皮时间后,毛白杨miRNAs参与SVS再生的表达情况。实验中取材四年生毛白杨树干,环状剥皮后7, 10, 12, 16, 18,和21天的再生组织。 小RNA测序结果表明,在再生组织中共发现209个已知miRNAs,187个新miRNAs。 降解组测序分析发现,157个靶基因由21个已知miRNAs控制,75个靶基因由30个新miRNAs调控。 GO分析结果表明,15个miRNAs的靶基因在生长素信号通路、细胞分化,分生组织发育中富集表达。 次生维管系统再生主要包括维管形成层启动,形成和分化阶段的连续过程。 本研究为miRNAs在SVS再生调控方面发挥的作用提供了理论依据。 本研究中......阅读全文

RNA降解

新鲜细胞:如果试剂没有问题,且外源性污染也可以排除,那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如  果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞,一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织:某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏,胸腺等),即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是:在液氮条件下将组织

RNA提取时RNA降解原因

1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存

RNA-反转录

 实验材料 poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒 oligo(dT)12-18 lmol LTris-Cl 1mol LTris-Cl lmol LKC1 25 mmol LMgCl2 dNTP 混合物 0.lmol LDTT RNasin实验步骤 一材料与设备1)p

RNA-反转录

            实验材料 poly(A)+RNA 反转录酶 鼠源反转酶  或禽源反转录酶 试剂、试剂盒 oligo

信使RNA的降解

同一细胞内的不同mRNA具有不同的寿命(稳定性)。在细菌细胞中,单个mRNA可以存活数秒至超过一小时,但平均寿命为1至3分钟,因此,细菌mRNA的稳定性远低于真核mRNA。哺乳动物细胞mRNA的寿命从几分钟到几天不等。mRNA的稳定性越高,从该mRNA产生的蛋白质越多。 mRNA的有限寿命使细胞能够

RNA的转录和逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

RNA复制、转录与逆转录

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

RNA-大量转录合成

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE TE 饱和酚 氯仿异内醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5X 转录缓冲液 lOOmmoL LDTT RNasin rATPrGTPrUTPrCTP SF6T3 或 T7RNA 聚合酶 异戊醇 DNase 7.5mol L 乙酸铵 无水乙醇 乙醇实验

3.5-RNA-反转录

利用 RNA 模板通过反转录获得 DNA,进而复制和感染细胞实验材料poly(A)+RNA反转录酶鼠源反转酶 或禽源反转录酶试剂、试剂盒oligo(dT)12-18lmol LTris-Cl1mol LTris-Cllmol LKC125 mmol LMgCl2dNTP 混合物0.lmol LDTT

RNA-大量转录合成

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE   TE 饱和酚   氯仿

RNA-标准转录反应

实验材料 模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc 无水乙醇 5×转录缓冲液 l00 mmol L DTT RNasin rATPrGTPrUTP 各 2.5 mmol L [α42P] rCTP SPGT3 或 T7RNA 聚合酶 TE-饱和的酚氯仿异戊醇 DN

RNA-标准转录反应

            实验材料 模板 DNA 或质粒 试剂、试剂盒 TE 异丙醇 3mol LNaAc

Nature揭秘RNA降解机制

  就好像我们利用碎纸机来销毁不再有用或包含有潜在破坏性信息的文件一样,细胞利用一些分子机器来降解不必要或有缺陷的大分子。来自马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的科学家们,现在揭示出了细胞核区室利用一种特异的RNA外来体(exosome)的机制——这一大分子机器负责了核糖核酸(RNAs)的降解和

3.1.2-RNA-大量转录合成

RNA 标准转录体系的一般回收率为 lugRNA/ug 质粒 DNA, 使用下面的方法,可以提高回收率至 5〜l0ug RNA/ug 质粒 DNA。大量制备 RNA 可以用于体外翻译。实验材料模板 DNA 或质粒试剂、试剂盒TETE 饱和酚氯仿异内醇3mol LNaAc无水乙醇5X 转录缓冲液lOO

3.1.1-RNA-标准转录反应

利用 DNA 聚合酶 I 的大片段(Klenow 酶)的 3'— 5'外切酶活性将 3'黏性末端转化成平末端。具体方法是在体外转录体系尚未加入核苷酸和 RNA 聚合酶时,加入 Klenoow 片段 (终浓度为 5U/ug),于 22℃ 孵育 15mim, 然后再加入核苷酸混合物和RNA 聚合酶实验材

信使RNA转录的调控

  一、遗传信息的表达有时序调控和适应调控,转录水平的调控是关键环节,因为这是表达的第一步。转录调控主要发生在起始和终止阶段。  二、操纵子是细菌基因表达和调控的单位,有正调节和负调节因子。阻遏蛋白的作用属于负调控。环腺苷酸通过其受体蛋白(CRP)促进转录,可促进许多诱导酶的合成。操纵子可构成综合性

RNA转录的技术特点

转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体

真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录的区别

  真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程在总体上基本相同,但是,其过程要复杂得多,主要有以下几点不同:  1、真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的,而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统,或核外基因及其表达体系。这是

RNA的转录与逆转录相关介绍

转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成。大

RNA逆转录(RT)过程

一,准备工作    1, 实验器具与材料: (1)移液枪:200ul、10ul (2)吸头:200ul、20ul (3)EP 管 1.5ml、100ul (4)水浴箱 2,实验器具的处理与准备    逆转录(RT)    塑料制品:(包括吸头、EP 管等)    将塑料制品逐个浸泡于 1‰DEPC

Cell新文章解析RNA降解机制

  如同我们利用碎纸机来销毁不再有用或是包含潜在破坏性信息的文件一样,细胞利用分子机器来降解不需要或有缺陷的大分子。来自马克思普朗克生物化学研究所的科学家们现在解码了在降解核糖核酸(RNA)过程中起至关重要作用的一个蛋白质复合物(Ski复合物)的结构。这项研究发表在8月15日的《细胞》(Cell)杂

避免RNA降解的方法有哪些?

(1)在用来验证完整性之前先在变性胶上分析RNA。(2)运用良好无污染的技术分离RNA(3)将组织提取后立刻提取RNA,并将提取好的RNA反转录为cDNA进行低温保存。

RNA-和-DNA-提取的降解问题

降解问题是RNA制备中常常到的问题。因为在 RNA 提取过程中,样品储存不当或裂解效率低等情况都会导致降解。对于 DNA 提取,降解不是一个大问题,因为对于 PCR,DNA 可以被剪切并且工作正常,如果不希望有较多剪切的 DNA,可以使用弱裂解的方法。

真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程差异

⒈ 真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的,而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统,或核外基因及其表达体系。这是因为研究发现,线粒体和叶绿体中除有DNA外,还有RNA(mRNA、tRNA、 RNA)、核糖体、氨基酸活化酶等。说明

信使RNA的反转录酶与反转录过程

  定义:以反义RNA为模版,通过反转录酶,进行的RNA转录  1.概念反转录是以RNA为模板合成DNA的过程,也称逆转录。这是DNA生物合成的一种特殊方式。  2.反转录酶与反转录过程  反转录过程由反转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。合

RNA复制的转录与逆转录的过程介绍

  转录是以DNA为模板合成RNA的过程,经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中,再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的,以RNA分子中的一条链为模板,在逆转录酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,合成方向仍是5'→3',完成cDNA的合成

真核生物RNA的转录与原核生物RNA的转录过程的区别

⒈ 真核生物RNA的转录有的是在细胞核内进行的,而蛋白质的合成则是在细胞质内进行的。且真核生物线粒体和叶绿体的遗传信息系统被称为真核细胞的第二遗传信息系统,或核外基因及其表达体系。这是因为研究发现,线粒体和叶绿体中除有DNA外,还有RNA(mRNA、tRNA、 RNA)、核糖体、氨基酸活化酶等。说明

转录组的重编写:RNA编辑

  基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA的纠正,成为了

转录组的重编写:RNA编辑

  前 言   基因的功能探索是生命科学研究的永恒主题。近几年以CRISPR-Cas9技术的发展让直接在高等生物体内进行基因的功能研究成为可能。但除了DNA之外, DNA的转录产物--RNA在生命活动中也发挥着极其重要的作用,且与癌症等多种疾病的发生密切相关。因此,对RNA进行功能研究和错误RNA

rna浓度太低能反转录么

要看你的rna浓度有多低,一般20ng/ul。rna浓度太低可能反转不出来或者反转不是目的产物,浓度太低建议不做。