章鱼藐视遗传“中心法则”头足类动物RNA编辑程度令人吃惊
章鱼、鱿鱼和乌贼经常并不严格地遵循其DNA中的遗传指令,相反,它们利用酶清除RNA中的特定碱基A(腺苷),并且利用一种不同的碱基I(肌苷)替代它们。大多数动物很少使用这种被称作RNA编辑的过程重新编码蛋白,但章鱼等头足类动物在超过半数的转录基因中编辑RNA。在一项新研究中,当研究人员定量和描述头足类动物的这种RNA编辑程度时,发现这种遗传策略深刻地限制了头足类动物基因组的进化。相关研究结果发表在近日出版的《细胞》期刊上。 头足类动物具有强大的RNA编辑能力 图片来源:美国国家地理新闻网 之前,科学家已发现章鱼利用RNA编辑快速适应温度变化,而且鱿鱼神经元中的绝大多数RNA转录副本含有这些编辑。而在这项新研究中,研究人员希望发现这些编辑过程如何在头足类动物谱系中进化出来,以及如何影响这些动物基因组进化。 实际上,脊椎动物细胞也能发生RNA编辑,但很少使用。人类有2万个基因,仅几十个RNA编辑位点可编码功能性蛋白。研究人员......阅读全文
使用“RNA桥”的新基因编辑技术问世
《自然》6月26日发表的两篇论文描述了一种新的基因组编辑技术,这种技术能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,这项技术有望成为这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法可能比现有技术更有优势,比如有望进行比后者更精准有效的大规模基因组编辑,以及能够实现基因组的介
使用“RNA桥”的新基因编辑技术问世
《自然》6月26日发表的两篇论文描述了一种新的基因组编辑技术,这种技术能在用户指定的基因组位点插入、倒位或删除长DNA序列,这项技术有望成为这些基本DNA重排的单步法或提供一种更简易的基因组编辑方法。该方法可能比现有技术更有优势,比如有望进行比后者更精准有效的大规模基因组编辑,以及能够实现基因组的介
科学家提出“RNA编辑”新方式遭质疑
Vivian G. Cheung 美国宾州大学Vivian G. Cheung课题组今年五月份在《科学》发表文章指出,人类细胞中有超过10000个外显子位点存在转录RNA序列和模板DNA序列不匹配现象。此结论意味着可能存在“RNA编辑”新方式。然而,该结论遭到了其他科学家的
中山大学等开发RNA编辑新工具
CRISPR-Cas9系统使用一段引导RNA(其与Cas9蛋白结合起来才能发挥作用)来靶定一段DNA,并裂解双链DNA。这一现象提出了一个问题:由一个Dicer结合RNA元件和一段反义RNA组成的一种人造小RNA(asRNA,是否也能用来诱导Dicer处理和降解一段特定的RNA呢? 为此,5月
PNAS:利用RNA控制CRISPR/Cas9基因编辑
在过去的几年里,研究人员找到了一种方法利用天然存在的细菌免疫系统CRISPR/Cas9来失活或纠正任何生物体内的特定基因。然而,CRISPR/Cas9持续地发挥基因编辑活性,带来了额外编辑不必要位点的风险。 现在,来自加州大学圣地亚哥医学院、Ludwig癌症研究所和艾希司制药公司(Isis P
基因编辑鼠的构建-Guide-RNA设计和筛选
众所周知,CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”,它可以高效地实现靶基因的编辑,自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成,Cas9核酸酶会在向导RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因组上的特定位点完成切割反应,同
科学家开发新型RNA单碱基编辑工具AMBER
中国科学院上海药物研究所研究员郝沛团队和中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员李轩团队合作,开发了一种新型RNA单碱基(C>U)编辑工具AMBER,并在细胞和小鼠动物模型体内实现对多个靶标基因RNA转录本的精准编辑,为基于RNA编辑的遗传病治疗策略开拓了新技术路径,同时进一步丰富了RNA编辑工具库
新型植物RNA甲基化编辑工具研发成功
记者10月6日从华中农业大学获悉,该校棉花遗传改良团队开发出基于CRISPR/dCas13(Rx)的新型植物RNA甲基化编辑工具。研究成果日前发表于《先进科学》杂志。N6-甲基腺苷(m6A)是真核生物mRNA最普遍的内部修饰,可能引起mRNA配对、热动力和折叠性能的改变,从而影响RNA的可变剪接、翻
孟山都CTO谈基因编辑、RNA干扰与行业并购影响
Fraley对两公司的合并持乐观态度,并认为这是一次积极健康的合并。通过合并,两者可扩大规模,同时得到更多研发资金,继续保持育种优势。 记者:关于基因编辑的问题。之前有报道说孟山都已经在谈基因编辑的ZL问题,很多人猜测孟山都很可能已经有基因编辑的产品在研发,或者是将要推出来,能不能介绍一下基因
梁晗:RNA编辑为精确癌症治疗带来新希望
如果说所有癌症都有一个共同点的话,那就是无共同性。 因此这造成了癌症难以治疗的一个根本原因。近期来自德州大学MD安德森癌症中心的研究人员发现了为什么作为许多癌症的“孵化器”的蛋白质,会出现癌症类别的差异,甚至患者之间的差异。这一发现为科学家们提供了新思路,对于开发更有效的癌症精确治疗方法十分重
DNA碱基编辑器或能诱导大量脱靶RNA突变!
DNA碱基编辑方法能够直接在基因组DNA中进行点突变的校正,同时并不会产生任何双链的断裂(DSBs,double-strand breaks),但潜在的脱靶效应常常限制了这些方法的应用,腺相关病毒(AAV)是DNA编辑基因疗法中最常用的传递系统,由于这些病毒能够在体内持续维持基因表达的功能,因此
新型植物RNA甲基化编辑工具研发成功
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519898.shtm近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内多家单位成功开发出新型植物RNA甲基化编辑工具。该研究对作物基因编辑育种有重要的潜在应用价值。相关研究成果发表在《植物生物技术》(Pla
RNA编辑:肿瘤和遗传疾病治疗的新选择
2018年,美国FDA和欧洲EMA批准了来自RNA药物制造两大巨头Ionis Pharmaceuticals公司的反义寡核苷酸疗法药物Tegesedi(Inotersen)和Alnylam Pharmaceuticals公司的siRNA疗法药物Onpattro(Patisiran),用于治疗遗传
Nature子刊:最大、最精确的RNA编辑位点列表
由布朗大学领导的一个研究小组编译出了一份最大型、经最严格验证的果蝇RNA编辑位点列表。该研究生成了关于这一模式生物基础生物学的一些新见解,研究结果发表在9月29日的《自然结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。 这一“主列
张锋连发Science,Nature文章:CRISPR下个技术趋势—RNA编辑
10月25日Science发表了CRISPR技术先驱张锋研究组的最新成果:RNA editing with CRISPR-Cas13,咋一看这个标题还以为是张锋一稿多投,因为实在是与本月初他们研究组发表在Nature的论文标题太像了(Nature论文:RNA targeting with CRI
《自然》子刊:升级版RNA编辑技术效率变高
近日,北京大学教授、博雅辑因科学创始人魏文胜实验室在Nature Biotechnology 发文,报道了RNA单碱基编辑技术“LEAPER”的升级版本,升级后该技术可大幅提升体外和体内编辑的效率和精准性。 LEAPER(Leveraging endogenous ADAR for progr
基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象
核糖核酸(RNA)编辑是RNA水平一种常见的修饰,是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日,来自中科院昆明动物研究所的消息,由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队,在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍,对二倍体生物来说,虽然两个等位基
基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象
核糖核酸(RNA)编辑是RNA水平一种常见的修饰,是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日,来自中科院昆明动物研究所的消息,由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队,在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍,对二倍体生物来说,虽然两个等位基因的
Science:从结构上揭示布氏锥虫RNA编辑机制
作为美国波士顿大学的分子生物学家和夫妻,Ruslan Afasizhev和Inna Afasizheva已经合作了几十年。他们共同发表了数十篇关于单细胞致病寄生虫---布氏锥虫(Trypanosoma brucei)---线粒体DNA和RNA机制的论文。如今,在一项新的研究中,他们详细介绍了一种
Nature发布CRISPR重大突破:可编程的RNA编辑工具
一种用来编辑基因组中DNA指令的强大科学工具现在也可以应用于RNA。来自加州大学伯克利分校和劳伦斯伯克利国家实验室的一个研究人员小组,证实借助于一种方法可以编程CRISPR/Cas9蛋白复合物在序列特异性的靶位点识别并切割RNA。这一研究发现有可能改变RNA功能研究的模式,为检测、分析和操控RN
殷平教授Nature子刊解析植物RNA编辑的分子机制
早在1989年研究人员就在植物中发现了RNA编辑的现象。2005年,第一个参与RNA编辑的蛋白因子被鉴定出来,发现它是一个PLS-type的PPR蛋白。近期来自华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室的研究人员报道了RNA编辑关键因子MORF蛋白可以和PLS-type PPR蛋白相互作用形成复报道
我国科学家开发出一种新型RNA编辑系统
使用工程核酸酶的基因组编辑技术,比如锌指核酸酶(ZFN)、转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN)和CRISPR系统中的Cas蛋白已被用于操纵许多有机体的基因组。最近,科学家们已将胞苷脱氨酶或腺苷脱氨酶与CRISPR-Cas9融合在一起,构建出可编程的DNA碱基编辑器,从而为校正致病性突变提供新
常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法
2018年10月5日,国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可
植物所发现四吡咯合成酶参与RNA编辑新机制
四吡咯代谢途径广泛存在于动物、植物和微生物中,如人体内的血红素以及植物的叶绿素都经该途径合成,对包括呼吸作用和光合作用在内的生命活动具有不可缺少的作用。RNA编辑是真核生物的一种重要调控方式,可在基因序列不变的情况下产生蛋白质的多样性。之前,人们尚不清楚四吡咯代谢途径与RNA编辑两个迥然不同的过
研究揭示真菌中RNA编辑的酶复合体和调控机制
近日,西北农林科技大学植保学院作物病原真菌功能基因组学研究团队刘慧泉教授课题组揭示了真菌中A-to-I mRNA编辑的酶复合体,并明确了其起源、进化和调控机制,为真菌病害防控和基因编辑工具开发提供了重要的新思路,相关研究成果发表在《自然-通讯》上。A-to-I mRNA编辑是一种关键的遗传信息修饰机
基因编辑:经编程后杀死人细胞中RNA病毒的新技术
世界上许多最常见或致命的人类病原体都是RNA病毒,比如埃博拉病毒、寨卡病毒和流感病毒,并且大多数都没有美国食品药品管理局(FDA)批准的治疗方法。在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院、哈佛大学和布罗德研究所等研究机构的研究人员将一种CRISPR RNA切割酶转变为一种经编程后检测和破坏人细胞中
免费开源给学术研究,升级版CRISPR拓展RNA功能编辑
近日,张锋团队再次升级CRISPR基因编辑系统,升级版的CRISPR通过靶向特定的RNA能够将致病蛋白扼杀在萌芽状态。该研究发表于Science。DOI: 10.1126/science.aax7063 基因编辑新品发布 张锋教授像极了基因编辑技术领域的“乔布斯”。张峰团队在基因编辑从无到有
上海生科院等揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律
7月28日,PLOS Genetics 杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究论文。
上海生科院等揭示RNA编辑表观遗传位点的系统进化规律
7月28日,PLOS Genetics 杂志发表了中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所李轩研究组题为The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究论文。
美研究人员利用可编辑RNA疫苗技术发明寨卡病毒候选疫苗
利用可编辑RNA疫苗技术,美国麻省理工学院的研究人员发明出一种寨卡病毒候选疫苗。这种疫苗由信使RNA簇构成,信使RNA簇被封装到一种纳米微粒中,一旦进入细胞,RNA将转译为蛋白质并引发宿主免疫反应。研究人员认为,这种疫苗效果如同合成病毒,但不是病原体、不会传染,人类可以控制疫苗表达的时间。因为它