李劲松,于翔最新文章:CRISPR技术构建基因功能分析方法
来自中科院生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组和中国科学院神经科学研究所于翔研究组合作发表了最新成果:利用CRISPR/Cas9技术和细胞谱系示踪技术对小鼠两细胞胚胎中的单个卵裂球进行了基因敲除,一步法获得了Tet3基因敲除的健康嵌合小鼠,并对Tet3基因敲除后大脑皮层和海马神经元的突触传递进行了探究。该方法是一种快速地分析致死基因在各个组织器官中功能的新方法。 这一研究成果公布在Cell Research杂志上,文章的通讯作者是李劲松研究员和于翔研究员,第一作者是汪凌波博士和李敏寅博士。 DNA双加氧酶Tet3是Tet蛋白家族的一个重要成员,之前的研究发现, Tet3全身性敲除小鼠有部分可以发育到出生,但是出生后24小时内死亡。因此,若想研究Tet3在成年小鼠中的功能,需要借助Cre/loxP系统在不同的组织中进行特异性的敲除。这就带来一系列的问题:待研究的组织是否有特异性的Cre小鼠资源;若想在不同组织中研究基因的......阅读全文
Nature癌症综述:如何用CRISPR进行癌症研究
CRISPR/Cas9系统可以很容易地改写多种生物的基因组,这一技术很快如风暴一般席卷了整个基因组工程领域。可想而知,以CRISPR/Cas9为基础的各种应用也将为癌症遗传学领域带来一场变革。麻省理工霍华德・休斯医学研究所的Tyler Jacks就是这方面的先行者,他去年连发两篇Nature文
遗传发育所在小麦DNAfree基因组编辑方法研究中取得进展
CRISPR/Cas9是目前应用最为广泛的基因组编辑技术,已在作物基因功能研究以及品种改良中取得了巨大的成功。常规植物基因组编辑手段多通过农杆菌或基因枪的方法将CRISPR/Cas9 DNA表达框转入并整合到植物基因组中,进而发挥功能对目的基因进行编辑。但是这些方法多存在许多不足,如较高的潜在脱
魏文胜:CRISPR功能性筛选新方法
自2013年Science杂志将CRISPR技术选为年度突破开始,这一新技术就给基因编辑世界带来一场风暴:在过去的这一年半时间里,CRISPR方法已迅速席卷了整个动物王国,成为DNA突变和编辑的一种明星技术。 国内外各大生物实验室的科学家们纷纷尝试利用这种技术进行攻关,近期来自北京大学生命
北京大学Nature发布CRISPR研究重要成果
来自北京大学的研究人员开发出了一个新型的CRISPR/Cas9 sgRNA文库,提出了一种基于sgRNA文库功能筛查和高通量测序分析的基因鉴别新方法。 论文的通讯作者是北京大学生命科学学院的魏文胜(Wensheng Wei)研究员。其主要研究领域包括病原微生物感染分子机理,发展宿主
海洋所在牡蛎基因组编辑方面获进展
近日,中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室张琳琳团队在牡蛎基因组编辑方面获新进展。相关研究成果发表在Frontiers in Marine Science(DOI:10.3389/fmars.2022.912409)上。 随着高品质动物蛋白需求的增长,水产养殖正成为人类食用海产品的主要
张锋博士Nature子刊再发CRISPR重要成果
规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,原本是细菌抵御病毒的重要武器,现在这一组合已经成为了一个通用工具,被用于在真核生物中进行位点特异性的基因组编辑。 由于这种基因组编辑技术更易于操作,也具有更强的扩展性,CRISPRs-Cas9迅速成为了科研领域的新宠儿。 日前,麻省
基因组学突破性成果:斑马鱼序列解析
人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2,报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴
突变按照基因功能改变分类
按照基因功能改变分类功能丧失突变也称失活突变,导致基因产物具有较少或完全没有功能(部分或完全失活)。当等位基因完全丧失功能(无效等位基因)时,它通常被称为无定形突变,与此类突变相关的表型通常是隐性的。功能获得性突变也称为激活突变,改变的基因产物,使其功能变强(增强激活),甚至被不同的异常功能所取代。
创建荧光鱼研究基因功能
研究人员正在利用作为分子“灯塔”来研究动物的早期发育阶段。研究人员聚焦的Sp2基因可调节其他的表达,他们创建的荧光鱼也可为探究发展成因提供线索。此项研究成果刊登在近期出版的《期刊》(The Journal of Biological Chemistry)上。 Sp2是Sp转录因子家庭的成员之一,
关于基因功能分类的介绍
只要是编码基因,则一定在体内发挥某一种功能,如果一群基因或蛋白是样本变化后的主要结果,将基因或蛋白按照功能进行分类,可直观看出样本变化体现出的功能特点。但是,这些功能特点并不一定都是重要的,需要通过统计学分析,找到其中重要的功能。而后,还要对挑选的重要功能分类进行验证,以保证分析的准确性。 对
Cell:科学家们开发出更精准、更高通量的分析基因新方法
西班牙卡洛斯三世心血管研究中心的科学家找到一个新方法来产生和研究基因嵌合体。在这些基因嵌合体中,相同组织可以含有不同的已知基因型的细胞群,能够允许研究这些基因型在细胞行为中的差异。发表在8月10日Cell上的新方法将允许任何研究人员在脊椎动物模型中诱导多谱系基因嵌合体,如小鼠和斑马鱼。 用多谱
刘小乐、张锋CRISPR最新论文
最近,来自哈佛大学医学院Dana-Farber癌症研究院、哈佛大学统计系和麻省理工学院-哈佛大学布罗德研究所的研究人员,在国际基因组研究权威期刊《Genome Research》发表题为“Sequence determinants of improved CRISPR sgRNA design”
专家Science警告CRISPR等新技术的应用
7月24日Science杂志发文,警告新兴技术的应用需要更多监管,其中尤其提及了近期十分火热的CRISPR-Cas9技术在临床上的应用。 文章作者是曾任前总统比尔克林顿生物伦理顾问委员的R. Alta Charo,这位来自威斯康星大学的伦理学家在今年Nature Biotechnology杂志
CRISPR技术脱靶效应有了解决之道
CRISPR基因编辑技术广受争议的最大副作用——脱靶效应有了解决办法。据物理学家组织网12日报道,CRISPR-Cas9技术发明人之一詹妮弗·杜德纳参与的研究团队证实,抗CRISPR蛋白能将CRISPR导致的脱靶效应降低四分之一,其中一种名叫“AcrllA4”的蛋白甚至能将脱靶效应发生率减少4倍
新技术显著提高CRISPR系统精确性
麻省总医院的研究人员开发了新一代的基因组编辑系统,可大大降低生成不必要的、脱靶基因突变的风险。在发表于《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上的一篇论文中,作者们报告称,一种新型的基于CRISPR的RNA引导性核酸酶技术通过利用两条引导RNAs,大大降低了在错误的位
基于CRISPR的新冠病毒快速诊断技术
英国《自然·生物技术》杂志16日公开的一项生物医学研究,美国科学家报告了一种基于CRISPR的诊断工具可以快速检测出新冠病毒。这一诊断工具大概需要45分钟就能给出结果,准确性与传统的RT-PCR检测相当。 之前的疾病大流行告诉人们,快速且易获取的检测方法对于实现有效的公共卫生响应很重要。然而,目
crispr基因编辑技术的基本原理
基本原理CRISPR簇是一个广泛存在于细菌和古生菌基因组中的特殊DNA重复序列家族,其序列由一个前导区(Leader)、多个短而高度保守的重复序列区(Repeat)和多个间隔区(Spacer)组成。前导区一般位于CRISPR簇上游,是富含AT长度为300~500bp的区域,被认为可能是CRISPR簇
CRISPR技术可研究人类早期胚胎发育
英国《自然》杂志近日发表一篇论文报告称,CRISPR-Cas9基因组编辑技术已被用于研究OCT4基因在人类早期胚胎发育中的作用。该成果为未来相关研究建立起框架,并为认识控制胚胎发育的分子机制提供了新见解。这一原理研究表明,CRISPR-Cas9基因组编辑技术可用于评估基因在人类早期发育阶段所起的
Nature技术突破:将CRISPR效率提高19倍
CRISPR/Cas系统可以构建出多个基因精确突变的小鼠,但其效率低下阻碍了生成足够数量的转基因小鼠来建立人类疾病模型。通过添加一种抗癌药物Scr7到遗传编辑的受精卵中,Whitehead研究所的科学家将CRISPR/Cas的效率显著提高了19倍。这一重要的成果发表在本周的《自然生物技术》(Na
MIT:“女神”谈CRISPR技术的机遇和风险
Jennifer Doudna(左) 2012年6月,加州大学伯克利分校的Jennifer Doudna及其同事在《Science》杂志上发文,介绍了一种可编程 的DNA核酸内切酶,从而开启了CRISPR/Cas9基因组编辑的黄金时代。近日,这位女科学家在MIT的 《Technology Revi
-MIT:“女神”谈CRISPR技术的机遇和风险
Jennifer Doudna(左) 2012年6月,加州大学伯克利分校的Jennifer Doudna及其同事在《Science》杂志上发文,介绍了一种可编程 的DNA核酸内切酶,从而开启了CRISPR/Cas9基因组编辑的黄金时代。近日,这位女科学家在MIT的 《Technology Revi
Cell:CRISPR技术在癌症领域大放异彩
科学家们绘制出了让我们细胞存活的基因的图谱,为了解我们基因组的运作机制以及哪些基因对像癌症这样的疾病至关重要建立了一个期盼已久的立足点。 由多伦多大学Donnelly中心Jason Moffat教授领导的一个研究小组,在药学系Stephane Angers的帮助下,逐个关闭了近1.8万个基因(
Technology-Review十大突破技术:CRISPR上榜
MIT Technology Review杂志近日评选出了2014年度十大突破技术(10 Breakthrough Technologies 2014)。近期大热的基因组编辑、3D打印技术纷纷上榜。编辑认为,这些技术在过去一年中,解决了许多棘手的问题,或创造出强大的新方法。对于未来几年,它们
Nature-Methods发布CRISPR/Cas9新技术
麻州大学医学院的科学家们开发出了一种新的CRISPR/Cas9技术,其可以精确地在几乎所有的基因组位点如外科手术般编辑DNA,同时避免标准CRISPR基因编辑技术中看见的一些潜在的有害脱靶改变。通过配对CRISPR/Cas9系统与一个可编程的DNA结合结构域(CRISPR/Cas9-pDBD),
北大教授用CRISPR技术定点改造水稻基因
长期以来,科学家们一直想按照人类的设计定点改造特定基因以提高水稻的产量和质量,但定点基因改造技术在水稻等植物中一直没有突破。 CRISPR-Cas 系统定点突变水稻基因 北京大学生命科学学院的瞿礼嘉教授实验室利用最新的CRISPR-Cas系统成功地实现了对水稻特定基因的定点突变,效率
CRISPR-技术进行细胞-TP53-基因敲除
实验原理 TP53 是重要的抑癌基因。在多种肿瘤中都能发现 TP53 基因突变及功能丧失。我们将针对 TP53 基因设计的靶点构建到 pCas9/gRNA1 载体,转染 293T 细胞,构建了 TP53 基因敲除 293T 细胞系。 1、本实验基因敲除原理:pCas9/gRNA1 载体表达
CRISPR技术可研究人类早期胚胎发育
英国《自然》杂志近日发表一篇论文报告称,CRISPR-Cas9基因组编辑技术已被用于研究OCT4基因在人类早期胚胎发育中的作用。该成果为未来相关研究建立起框架,并为认识控制胚胎发育的分子机制提供了新见解。这一原理研究表明,CRISPR-Cas9基因组编辑技术可用于评估基因在人类早期发育阶段所起的
CRISPR技术如何助力寻找帕金森病新药?
近日,来自美国中佛罗里达大学(University of Central Florida, UCF)的科学家们通过前沿的DNA编辑技术CRISPR,创造出了一种新的细胞模型,这个模型可以帮助科研人员更快更方便的筛选治疗帕金森病的药物。这项研究发表在了自然出版集团旗下的《Scientific Re
Cell:CRISPR技术在癌症领域大放异彩
科学家们绘制出了让我们细胞存活的基因的图谱,为了解我们基因组的运作机制以及哪些基因对像癌症这样的疾病至关重要建立了一个期盼已久的立足点。 由多伦多大学Donnelly中心Jason Moffat教授领导的一个研究小组,在药学系Stephane Angers的帮助下,逐个关闭了近1.8万个基因(
Nature:进化中的CRISPR技术又有新突破
来自哈佛医学院和麻省总医院的研究者们在最新一期Nature杂志上发表了他们新改进的CRISPR-Cas9技术,识别序列的范围更大,识别也更为精准。文章第一作者Benjamin Kleinstiver介绍说新技术里的Cas9变种可以识别那些野生型Cas9无法修饰的人类和斑马鱼基因的位点,这使得CR