NatureGenetics:全基因组测序领域的开拓性进展
当我们提到DNA的甲基化,通常是指胞嘧啶(C)碳环上5号碳原子的甲基化,5-甲基胞嘧啶(5mC)。实际上,在原核生物中存在着3种DNA甲基化型式,5mC、4mC(4-甲基胞嘧啶)和6mA(6-甲基腺嘌呤),6mA起主导作用,缺乏6mA可导致一些细菌的死亡。科学家们曾经以为具有重要生理功能的DNA 6mA修饰在生命的进化过程中,不可思议地从高等生物基因组中消失了。Nature重大发现改写表观遗传理论 为了检验真核生物基因组中是否存在DNA 6mA修饰,更高灵敏度的检测方法和设备应运而出。然而,由于检测技术手段限制,科学界在低等单细胞真核生物、植物和动物基因组内检测到低水平的6mA后,便猜测它可能是一个非典型的DNA碱基修饰型式。虽然有报道指出,与5mC的基因抑制作用不同,6mA似乎能启动某些基因的激活。但总的来说,有关6mA与真核生物基因组功能的研究基本还是一片空白。如今,高灵敏度的单分子实时测序(Single-Molecu......阅读全文
Nature-Genetics:全基因组测序领域的开拓性进展
当我们提到DNA的甲基化,通常是指胞嘧啶(C)碳环上5号碳原子的甲基化,5-甲基胞嘧啶(5mC)。实际上,在原核生物中存在着3种DNA甲基化型式,5mC、4mC(4-甲基胞嘧啶)和6mA(6-甲基腺嘌呤),6mA起主导作用,缺乏6mA可导致一些细菌的死亡。科学家们曾经以为具有重要生理功能的DNA
质谱分析法术语质谱
质谱(mass spectra mass spectrum)按照被测体质量大小排序的谱线。
质谱分析法的质谱分类
电子轰击质谱EI-MS,场解吸附质谱FD-MS,快原子轰击质谱FAB-MS,基质辅助激光解吸附飞行时间质谱MALDI-TOFMS,电子喷雾质谱ESI-MS等等,不过能测大分子量的是基质辅助激光解吸附飞行时间质谱MALDI-TOFMS和电子喷雾质谱ESIMS,其中基质辅助激光解吸附飞行时间质谱MALD
质谱分析法术语质谱图
质谱图(mass spectrogram)质谱测定结果经计算机处理统计后,以棒状图(或数据列表形式)表示的谱图。它是二维图谱,横坐标表示离子的质荷比(m/z),对于单电荷的离子,电荷数z=1,横坐标表示的数值即为离子的质量;纵坐标表示离子流的强度,通常用相对强度来表示,即把被记录的各个质量数的离子峰
研究揭示多物种全基因组6mA分布及可能来源
近日,中山大学生命科学学院教授骆观正团队研究揭示多物种全基因组N6-deoxyadenosine(6mA)分布及可能来源。相关研究发表于Cell Discovery。陈丽倩博士(现为广东省人民医院博士后)和张璋副教授为该论文共同第一作者,骆观正教授为通讯作者,团队成员陈鸿萱、奚剑飞、刘学弘、马冬
染色质免疫沉淀法(Chromatin-immunoprecitation,ChIP)
染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,这些
在纤毛虫鉴定了DNA6mA甲基转移酶复合物及阐明生物学功能
DNA甲基化是表观遗传调控的重要组成部分,在调控基因组印记,X染色体失活,转座子抑制,基因表达,胚胎发育等方面发挥重要作用。真核生物中最主要的DNA甲基化修饰是5-甲基胞嘧啶(5mC)。由于其在真核生物中的丰富性和重要性,以前的研究集中表征5mC。相反,N6-甲基腺嘌呤DNA(6mA)修饰是原核
质谱分析法术语同位素质谱
同位素质谱(isotope mass spectrum)按元素的同位素质量排序的质谱。
质谱分析法术语本底质谱图
本底质谱图(background mass spectrum)在不导入样品的情况下,由清洗仪器的残留溶剂、样品记忆、真空泵油蒸气、色谱柱流失、载气以及各种污染物所产生的质谱图,即为本底质谱图。如果本底质谱的离子峰多且很强,在进行样品测试时,不仅会影响仪器的最佳性能,还会成为样品谱图中的背景谱图(即本
关于染色质免疫沉淀法的基本介绍
染色质免疫沉淀法(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。 核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛
关于染色质免疫沉淀法改变分析介绍
是研究转录调控蛋白和相应核苷酸序列结合的常用方法,但是由于许多转录调控蛋白有相似或相同的DNA结合位点,这种体外分析获取的结果不一定能真实地反映体内转录调控蛋白和DNA结合的状况。染色质免疫沉淀分析(ChIP)是基于体内分析发展起来的方法,它能真实、完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白,是确定
关于染色质免疫沉淀法—沉淀分析的基本介绍
沉淀分析是基于体内分析发展起来的方法,它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。它能真实、完整地反映结
全系质谱,全新高度-|-屹尧科技衡昇质谱重磅新品发布
2025年9月10日至12日,由中国分析测试协会主办的第二十一届北京分析测试学术报告会暨展览会(BCEIA 2025)在北京中国国际展览中心盛大召开。本次展会聚焦分析测试领域前沿技术与行业发展趋势,吸引了众多专业人士参与。开展当日,衡昇质谱、屹尧科技、艾恩质谱、微纳智造携4款新品联袂亮相。同日,屹尧
关于染色质免疫沉淀法—真核生物的基本介绍
是由内源和外源因素共同影响的,所有信号传递途径的终点都是DNA。DNA通过核蛋白复合物组成染色质,染色质是基因调控的一个重要作用位点。转录激活因子和辅助抑制因子的研究显示存在一种新的调节机制--“组蛋白密码”,其信息存在于组蛋白的转录后修饰等过程中。该类修饰包括组蛋白磷酸化、乙酰化、甲基化、AD
免疫沉淀法的类型
个别免疫沉淀法(IP):用来分离某个细胞萃取物中的已知特定蛋白质免疫沉淀法免疫共沉淀法(Co-IP):研究整个蛋白质复合体染色质免疫沉淀法(ChIP):用来研究DNA上的特定蛋白质RNA免疫沉淀法(RIP):和ChIP相近,但RNA免疫沉淀法是用来研究会与RNA结合的蛋白质RIP技术(RNA Bin
使用全扫描及农药质谱库对农药进行筛选
气质联用仪被用于农产品中农药存在性的筛选。这是因为气质联用仪可以将农产品中的农药残留与其他化合物分开,并给出可以确认农药结构的农药的质谱图。为了这个目的,气质联用仪的离子化模式通常被设为电子轰击电离模式,采集方式被设为全扫描。 使用全扫描及农药质谱库对农药进行筛选
谱育科技:全系质谱累计突破2500台套,高端仪器全面开花
——谱育科技副总经理俞晓峰先生专访从2015年谱育成立,每年均实现翻倍增长,谱育科技既是聚光体系中最耀眼的明星,也是中国实验室分析仪器领域最壮大的公司。2023年12月,谱育科技青山湖创新基地迎来了第1000套 7000系列 ICP-MS、第500套 5000系列 LC-MS/MS正式下线,毫无悬念
质谱分析法
先将中性分子离子化,再顺次分离和记录各种离子的质荷比和丰度先将中性分子离子化,再顺次分离和记录各种离子的质荷比和丰度( 强度),从而实现分析目的的一种分析方法。
质谱分析法
用高速电子束的撞击等不同方式使试样分子成为气态带正电离子,其中有分子离子M+和各种分子碎片阳离子。在高压电场(电压为V)加速下,质量m的带正电粒子在磁感应强度为B的磁场中作垂直于磁场方向的圆周运动,其运动半径r与粒子的质荷比(m/e)有如下关系: 显然质荷比大小不同的正离子将按不同的曲率半径依次分散
质谱分析法
原理使试样中各组分电离生成不同荷质比的离子,经加速电场的作用,进入质量分析器,通过电磁场按不同m/e的变化,分子离子及碎片离子的质量数及其相对峰度,提供分子量,元素组成及结构的信息。主要特点:(1)质量测定范围广泛;(2)分辨高;(3)绝对灵敏度,可检测的最小样品量。
质谱分析法
质谱分析法是通过对被测样品离子的质荷比的测定来进行分析的一种分析方法。被分析的样品首先要离子化,然后利用不同离子在电场或磁场的运动行为的不同,把离子按质荷比(m/z)分开而得到质谱,通过样品的质谱和相关信息,可以得到样品的定性定量结果。 从J.J. Thomson制成第一台质谱仪,到现在已有近9
质谱分析法
质谱仪种类非常多,工作原理和应用范围也有很大的不同。从应用角度,质谱仪可以分为下面几类:有机质谱仪:由于应用特点不同又分为:①气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)在这类仪器中,由于质谱仪工作原理不同,又有气相色谱-四极质谱仪,气相色谱 质谱-飞行时间质谱仪,气相色谱-离子阱质谱仪等。②液相色谱-质谱联
质谱分析法
用高速电子束的撞击等不同方式使试样分子成为气态带正电离子,其中有分子离子M+和各种分子碎片阳离子。在高压电场(电压为V)加速下,质量m的带正电粒子在磁感应强度为B的磁场中作垂直于磁场方向的圆周运动,其运动半径r与粒子的质荷比(m/e)有如下关系:显然质荷比大小不同的正离子将按不同的曲率半径依次分散成
质谱分析法
质谱仪种类非常多,工作原理和应用范围也有很大的不同。从应用角度,质谱仪可以分为下面几类:有机质谱仪:由于应用特点不同又分为:① 气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)在这类仪器中,由于质谱仪工作原理不同,又有气相色谱-四极质谱仪,气相色谱 质谱书籍-飞行时间质谱仪,气相色谱-离子阱质谱仪等。② 液相色谱
质谱及质谱的目的
质谱,是一种分析方法,原理就是让带电原子、分子或分子碎片按质荷比的大小顺序排列,打出相应的谱线。待分析的样品分子在离子源中离化成具有不同质量的单电行分子离子和碎片离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能并形成一束离子,进入由电场和磁场组成的分析器中;其中离子束中速度较慢的离子通过电场后编转大,
气体分析质谱质谱原理
质谱仪配备QuaderaTM 分析软件, 操作简单, 功能强大, 有128 个检测通道,可生成用户特殊应用软件界面. 在参数设置, 多种实测方式, 谱库, 数据统计, 谱图放大, 光标, 输入输出模块等性能的支持下, 可以更方便地进行定性定量分析以及在线离线分析. Omnistar/
6mA甲基化修饰调控工业微藻油脂合成过程揭示
微藻在全球光合作用、二氧化碳固定及初级生产力中贡献卓著,是颇有前景的合成生物学底盘细胞。为了探索工业固碳产油微藻的表观遗传机制和生理作用,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心以海洋微拟球藻为模式,解析了野生型和6mA扰动突变株中N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,6
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫,地理分布广,感染率高,寄生于人体盲肠,导致人体慢性感染,对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
免疫分析法免疫扩散
基本原理:可溶性的抗原和相应的抗体在溶液或凝胶中彼此接触,形成不溶性抗原-抗体复合物沉淀。 单向免疫扩散(Single immunodiffusion) 基本原理:指抗原和抗体两 种成分中只有一种扩散,另 一种被固定在凝胶中。 双向免疫扩散(Double immunodiffusion)
看表观新修饰6mA甲基化如何助力IF飙升!
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m