国内首个乙肝病毒基因多功能共享数据库建成

近日,国内首个乙型肝炎病毒基因多功能共享数据库在解放军302医院建成并投入使用,其收录了我国10000余例患者乙型肝炎病毒基因序列、基因克隆和相关临床资料,具有较强的生物信息学分析功能,为研究我国患者乙型肝炎病毒基因变异与耐药、分子致病机制、疫苗设计和免疫应答等提供了共享信息平台,也可为临床合理制订抗病毒治疗方案提供帮助。 据全军传染病研究所副所长、解放军302医院徐东平研究员介绍,这个数据库具有序列数据量大、数据资源免费共享的特点,并可系统地检测和监控核苷(酸)类抗病毒药物耐药变异;此外,该数据库还在不断收录新的病例资料和序列信息,具有可扩充性。该数据库目前已收录了2000多个代表性病毒基因克隆,收录了耐药变异、抗病毒药物治疗和临床应答指标等相关信息。 数据库具有多种实用生物信息学分析功能,包括序列相似性比对、基因亚型分析、HBV血清型分析、核苷类似物耐药位点分析、特异性T淋巴细胞表位分析、病毒基因组系统进化......阅读全文

冰冻“木乃伊”中发现天花病毒基因片段

  法国、俄罗斯和丹麦研究人员在美国新一期《新英格兰医学杂志》上报告说,他们在俄罗斯西伯利亚地区的几具死于300多年前的冰冻“木乃伊”中检测出了天花病毒的基因片段。这一发现有助于研究者深入了解天花的演化史。   天花是世界上传染性最强的疾病之一,于1979年被彻底消灭。目前仅有美国和俄罗斯的两个实

关于病毒基因组的基本介绍

  病毒是最简单的生物,完整的病毒颗粒包括外壳蛋白和内部的基因组DNA或RNA(有些病毒的外壳蛋白外面有一层由宿主细胞构成的被膜(envelope),被膜内含有病毒基因编码的糖蛋白。病毒不能独立地复制,必需进入宿主细胞中借助细胞内的一些酶类和细胞器才能使病毒得以复制。外壳蛋白(或被膜)的功能是识别和

病毒基因组的结构特点介绍

  1.病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比,病毒的基因组很小,但是不同的病毒之间其基因组相差亦甚大。如乙肝病毒DNA只有3kb大小,所含信息量也较小,只能编码4种蛋白质,而痘病毒的基因组有300kb之大,可以编码几百种蛋白质,不但为病毒复制所涉及的酶类编码,甚至为核苷酸代谢的酶类编码,因此

小儿乙肝—急性乙肝的症状的临床特点

  无黄疸型乙肝:无黄疸者远较黄疸者为多,但不易发现。常是仅有轻度血清转氨酶增高的亚临床疾病;或有食欲不振、恶心,低热、不适等非肝病特异症状;即使有较明显的症状,因无黄疸,也可能被误诊为上呼吸道感染、急性胃肠炎。  黄疸型乙肝:临床过程也比甲型肝炎缓和。黄疸前期大多有发热,少数小儿可有高热,大多仅持

乙肝表面抗体阳性与乙肝核心抗体阳性

  1、乙肝表面抗体阳性 乙肝核心抗体阳性:  乙肝表面抗体是人体的保护性的抗体,能保护人体不再感染乙肝。乙肝核心抗体阳性是现症感染或既往感染的标志。这两项同时呈现阳性,表明人体原来感染了乙肝,正处于恢复期或已经痊愈。  2、感染乙肝:  乙肝表面抗体阳性是人体产生乙肝保护抗体的标志,通常说明可以保

简述乙肝两对半全阴的判定标准

  乙肝两对半全阴的判定标准— 这是由于HBVDNA聚合酶缺乏校正功能、宿主的免疫压力及药物治疗等因素的影响,使乙肝病毒基因在乙肝病毒持续感染过程中普遍存在着变异现象,导致常规试剂盒难以检测出体内已经变异、不表达或低水平复制表达的乙肝病毒血清学标志物(如HBsAg,HBeAg)。也就是说,乙肝病毒血

黄曲霉毒素对肝脏的危害

  黄曲霉毒素是一种剧毒的致肝癌物质,其中黄曲霉毒素B1可引起细胞错误地修复DNA,导致严重的DNA诱变,还可抑制DNA和RNA的合成,从而抑制蛋白质的合成。从我国肝癌流行病学调查研究中发现,某些地区人群膳食中黄曲霉毒素的污染水平与原发性肝癌的发生率呈正相关。专家对其他肝癌发病率高的地区进行调查,也

关于乙肝病毒DNA检测的复制过程介绍

  不同于一个真正的生物体,病毒并不通过生长和分裂等方式繁殖自身,而是像铸造机器零件一样,按照一定的模具拷贝出来的。病毒DNA中包含有一些程序,指导病毒的遗传物质和其它一些结构蛋白组分增殖。另外,病毒DNA中还包含有一些信息,使得单一组分能够在细胞因子的帮助下,自发组装成新的病毒颗粒。  在医学上,

加拿大团队开发出基于 NGS 平台的丙型肝炎病毒基因分型

  日前,英属哥伦比亚大学(以下简称英属哥大)卓越教学中心的研究人员开发了一种基于高通量测序的丙型肝炎病毒检测方法,该方法可鉴定产生耐药的病毒变种。研究人员表示,该检测方法还可进行病毒分型,是 PCR、杂交和基于 Sanger 平台检测技术的有力补充。与传统检测方法,基于 NGS 的检测方法具有更佳

乙肝表面抗体

  乙型肝炎是一个令人担心的疾病,在预防乙型肝炎时都希望大多数人有抗体,乙肝检测抗原时,乙肝检测标志物有很多项,其中有一项叫乙肝表面抗体。  乙肝表面抗体是乙肝病毒的外壳,含有乙肝的表面抗原,用抗原免疫正常人的机体,正常人就会针对抗原产生抗体,这种抗体叫乙肝表面抗体,它的正常值大于十,对于正常健康人

慢性乙肝防止

 一般适应症包括:(1) HBeAg 阳性者,HBV DNA ≥105 拷贝/m l(相当于2000 IU/mL);HBeAg阴性者,HBV DNA ≥104 拷贝/m l(相当于2000 IU/mL);(2) ALT ≥2×ULN;如用干扰素治疗,ALT应≤10×ULN,血清总胆红素应40

全球患病人数超过2.5亿!杀灭乙肝病毒药物开发成功

  日前,俄罗斯联邦消费者权益保护和公益监督局流行病学中心科学研究所的代表向卫星通讯社表示,俄科学家已研制出一批可以破坏乙型肝炎(简称“乙肝”)病毒基因组的药物,该药物或在6年后上市。  专家表示,目前世界上还没有类似药物,现有药物只能抑制但无法杀灭病毒。  俄消费者权益保护局下属临床诊断科学咨询中

关于HBVDNA的基本介绍

  HBV-DNA即是乙肝病毒的脱氧核糖核酸(即乙肝病毒基因)。 HBV-DNA是HBV感染最直接、特异性强和灵敏性高的指标,HBV-DNA阳性,提示HBV复制和有传染性。HBV-DNA越高表示病毒复制越厉害,传染性强。

“世界如果不共享疫苗-病毒将会共享世界”

  中国科学院院士、中国疾病预防控制中心主任高福6日在北京举行的第三届世界科技与发展论坛上提醒说,面对新冠疫情,“世界如果不共享疫苗,病毒将会共享世界”。  高福当天下午以“新冠疫情防控与国际科技合作”为题作论坛首场开幕式主旨报告指出,病毒没有护照,病毒旅行不需要签证,我们更需要国际合作。  他说,

港首次出现甲流病毒基因“洗牌”现象

  据香港《明报》报道,科学界关注的猪流感病毒基因洗牌在香港出现!香港大学在一只猪身上验出的一般猪型流感病毒,竟含有人类的甲型H1N1流感(俗称人类猪流感)病毒基因,港大要进一步测试,确定此基因洗牌病毒特性会否更恶更毒。卫生署正密切监察是否已有人中招。   卫生署指出,暂时没有迹象显示香港市民感染

灵长类动物非病毒基因传递系统出炉

长期以来,由于病毒基因传递方法的局限性,非人类灵长类动物的基因工程进展受限。现在,日本科学家采用了一种非病毒基因传递系统,成功将人工基因引入了与人类亲缘关系较近的食蟹猴体内。该成果被认为是基因工程领域的里程碑,相关研究发表在最新一期《自然·通讯》杂志上。小型动物模型如小鼠,在模拟人类疾病复杂性方面存

新“基因剪刀”可切除免疫缺陷病毒基因

  据在线发表于《自然·通信》上的一项最新研究,美国科学家已成功从非人类灵长类动物的基因组中编辑了SIV(猴免疫缺陷病毒,与人类免疫缺陷病毒HIV密切相关,即艾滋病的病因)。这一突破是在艾滋病病毒研究方面迈出的重要一步,将使研究人员比以往任何时候都更接近于开发出治疗人类HIV感染的方法。 主持研

-英公开埃博拉病毒基因测序数据

  一个英国科研团队成功完成了对埃博拉病毒的基因测序,并已将数据在网上公开发布,免费提供给全球科研人员使用。这有助于各国研发更高效的治疗药物和疫苗。  剑桥大学3日发布公告称,2014年埃博拉疫情在西非暴发后,来自该校及英国多个科研机构的研究人员开始在塞拉利昂采集病毒样本,并利用美国一家公司开发的新

人类免疫缺陷病毒基因扩增检测的介绍

  人类免疫缺陷病毒(HIV)基因扩增检测是通过将病毒所含的基因进行扩增的技术,检测出怀疑病毒感染者体内是否含有人类免疫缺陷病毒的基因检测方法。由于该检测方法可以测出普通检验难以检测出的病毒并具有灵敏度高、特异性高、快捷、对样品要求低等优点,因此被临床广为认可。

数据支撑-助力科技“战疫”

  在此次疫情防控攻坚战过程中,2020年春节前一天,采集自湖北武汉一名临床患者的病毒毒株和电子显微镜照片等信息发布后,很快便吸引了媒体的注意力,申请使用相关信息的用户不乏许多英美知名媒体。  这些信息正是来自于当天开通的新型冠状病毒国家科技资源服务系统。“这个系统的特点是把实物资源优势和信息技术能

GenBank数据库概述(四)

NCBI站点地图---其他基因组数据介绍:1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 :把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序:小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由

核酸数据库的概念

中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定  义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级

GenBank数据库概述(三)

结构: 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB:分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库,结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook

GenBank数据库概述(一)

1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库,一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合(UniGene),人类基因组基因图

GenBank数据库概述(二)

FTP GenBank and Daily Updates:1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述,下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1,国际标准组织(ISO)数据表示格式,下载

英国使用人工智能来识别新冠病毒新变体

3月13日,英国曼彻斯特大学、牛津大学科研团队在学术期刊《美国科学院院刊》发表成果,他们开发出一种人工智能框架,能够从大量数据中快速识别出未来可能存在风险的病毒基因组,可识别和追踪新冠肺炎病毒新型变体,有助于应对病毒传播。自新冠肺炎爆发以来,全球已出现了多波新变种,传播性、免疫反应逃逸程度不断增强,

俄开发出了新冠病毒变异国家数据库

  俄罗斯联邦消费者权益保护和公益监督局网站消息,该局流行病中央研究所根据政府关于创建统一疫情信息分析中心的指示,开发出了新冠病毒变异国家数据库。  消息说,该数据库将加快抗击新冠病毒的进程,因为到目前为止,俄罗斯有关新冠病毒变异的信息是零散的。根据俄政府关于创建统一疫情信息分析中心的指示,流行病中

关于HBVDNA定性定量检测仪的概述

  HBV-DNA定性定量检测仪是一种检测乙肝的仪器。利用病毒基因检测最新技术,动态观察患者肝脏的变化,精确检测出血清中病毒DNA分子含量,显示病毒复制和被清除的程度,准确反映人体免疫状态和功能。  HBV-DNA定性定量检测是乙肝的检查项目之一, 其中HBV(HepatitisBvirus),中文

合金炉共享

仪器名称:合金炉仪器编号:11013950产地:美国生产厂家:THERMCO型号:MB-81出厂日期:200406购置日期:201107所属单位:集成电路学院>微纳加工平台>薄膜工艺放置地点:新所一楼工艺平台固定电话:固定手机:固定email:联系人:曹秉军(010-62784044,1391080

乙肝e抗原和乙肝e抗体的显性原因介绍

  乙肝e抗原和乙肝e抗体同时阳性一般有两种可能:  1、如病情好转,应考虑目前正处于乙肝e抗原向乙肝e抗体转换阶段,乙肝e抗体提早出现,乙肝e抗原在近期内可能趋向消失,对此应进行随访观察。  2、如病情严重,则应考虑患者免疫功能低下,细胞免疫调控处于紊乱状态,提示预后不良。  e抗体阴性怎么回事