GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 3. FASTA格式 — 定义行号后只跟随序列数据（示例），参见描述数据库的readme文件，包括nt.Z（每天更新的非冗余BLAST核酸数据库，包括GenBank+EMBL+DDBJ+PDB序列，但是不包括EST, STS, GSS, or HTGS序列），nr.Z（每日更新的非冗余蛋白质），est.Z, gss.Z, htg.Z, sts.Z,和其它文件。 分子数据库：1. 核酸序列1、 Entrez核酸： 用accession number,作者姓名，物种，基......阅读全文
GenBank数据库概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述，下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1，国际标准组织（ISO）数据表示格式，下载
GenBank数据库概述（一）
1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库，一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合（UniGene），人类基因组基因图
GenBank数据库概述（三）
结构： 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划，另外也可以访问分子模型数据库（MMDB）和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB：分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库，结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook
GenBank数据库概述（四）
NCBI站点地图---其他基因组数据介绍：1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 ：把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起，包括序列，图谱，和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序：小鼠基因组计划的测序进展，HTG序列contigs（可以用大小和染色体号来浏览）由
Using－GenBank
GenBank(R) is a comprehensive database of publicly available DNA sequences for more than 205,000 named organisms and for more than 60,000 within t
NCBI－GenBank数据库的起源、功能和常遇问题及解答
GenBank数据库功能为一、提交获取的基因序列；二、查找已知基因的序列生物学特性信息，例如编码区，科学命名等。那么Genebank ID 和Gene cluster ID又是什么呢？ GenBank数据库起源 GenBank数据库是1982年由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建
Using－GenBank－for－Genomic－Authentication:－A－Tutorial
The GenBank database is perhaps one of the most important repositories of genetic information. A researcher working in the field of genomic authe
－震惊！Genbank参考基因组序列多处错误！
震惊！Genbank参考基因组序列多处错误！ 随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低，全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源，但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用，使得基因组数据面临很多问题。 近日，约翰霍
糖异生概述（二）
三、糖异生的调节 糖异生的限速酶主要有以下4个酶：丙酮酸羧化酶、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、果糖二磷酸酶和葡萄糖磷酸酶。 (一)激素对糖异生的调节 激素调节糖异生作用对维持机体的恒稳状态十分重要，激素对糖异生调节实质是调节糖异生和糖酵解这两个途径的调节酶以及控制供应肝脏的脂肪酸，更大量的脂肪
核酸序列的检索实验
实验方法原理掌握核酸序列检索的操作方法；熟悉GenBank数据库序列格式及其主要字段的含义；了解EMBL数据库序列格式及其主要字段的含义；熟悉GenBank数据库序列格式的FASTA序列格式显示与保存；实验材料电脑仪器、耗材笔记本笔实验步骤1. 使用Entrez信息查询系统检索核酸序列BC0608
凝胶成像概述（二）
凝胶成像一般操作步骤 1．打开凝胶成像系统开关。 2．打开电脑，系统自动打开并进入成像软件。 3．打开凝胶成像系统前面板，选择使用紫外透射光源或者白光透射光源，将相应光源安放到位。 4．将样品放置在透射光源的样品台上。 5．在成像操作界面里面选择使用Upper wh
生物氧化概述（二）
加单氧酶主要分布在肝、肾组织微粒体中，少数加单氧酶也存在于线粒体中，加单氧酶主要参与类固醇激素(性激素、肾上腺皮质激素)、胆汁酸盐、胆色素、活性维生素D的生成和某些药物、毒物的生物转化过程。加单氧酶可受底物诱导，而且细胞色素P450基质特异性低，一种基质提高了加单氧酶的活性便可同时加快几种物质的
磷脂代谢概述（二）
(二)甘油磷脂的合成 合成全过程可分为三个阶段，即原料来源、活化和甘油磷脂生成。甘油磷脂的合成在细胞质滑面内质网上进行，通过高尔基体加工，最后可被组织生物膜利用或成为脂蛋白分泌出细胞。机体各种组织(除成熟红细胞外)即可以进行磷脂合成。 1.原料来源 合成甘油磷脂的原料为磷脂酸与取代基团。磷
凝胶成像概述（二）
凝胶成像一般操作步骤1．打开凝胶成像系统开关。2．打开电脑，系统自动打开并进入成像软件。3．打开凝胶成像系统前面板，选择使用紫外透射光源或者白光透射光源，将相应光源安放到位。4．将样品放置在透射光源的样品台上。5．在成像操作界面里面选择使用Upper white光源，点击绿色（即时成像）按钮。常见问
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
安全输血概述（二）
（五）人群免疫水平。如果某病毒可以经血传播，并且在感染人体后可能引起严重的损伤和后果，这种情况下，人群中对此病毒的免疫水平将成为决定这种病毒经血传播危险大小的重要因素。如果人群对此病毒的免疫力低，大多数人感染后将发病，则该病毒输血传播危险大。反之，如果人群免疫水平高，则输血传播病毒并造成危害的危险就
分析化学概述（二）
色谱法也称层析法。1906年俄国茨维特将绿叶提取汁加在碳酸钙沉淀柱顶部，继用纯溶剂淋洗，从而分离出叶绿素。此项研究发表在德国《植物学》杂志上，但未能引起人们注意。直到1931年德国的库恩和莱德尔再次发现本法并显示其效能，人们才从文献中追溯到茨维特的研究和更早的有关研究，如1850年韦曾利用土壤柱进行
血脂及其代谢概述（二）
(三)脂蛋白的代谢 1.乳糜微粒(CM) 乳糜微粒是在小肠粘膜细胞中生成的，食物中的脂类在细胞滑面内质网上经再酯化后与粗面内质网上合成的载脂蛋白构成新生的(nascent)乳糜微粒(包括甘油三酯、胆固醇酯和磷脂以及poB48)，经高尔基复合体分泌到细胞外，进入淋巴循环最终进入血液。 新生乳
二妙丸的概述
二妙丸，中成药名。为祛湿剂，具有燥湿清热功效。用于湿热下注，足膝红肿热痛，下肢丹毒，白带，阴囊湿痒。
基因突变概述（二）
（二)移码突变 移码突变（frame-shift mutation)是指DNA链上插入或丢失1个、2个甚至多个碱基（但不是三联体密码子及其倍数)，在读码时，由于原来的密码子移位，导致在插入或丢失碱基部位以后的编码都发生了相应改变。移码突变造成的肽链延长或缩短，取决于移码终止密码子推后或提前
色谱法概述（二）
第七课 液相色谱仪 气相色谱法是一种很好的分离、分析方法，它具有分析 速度快、分离效能好和灵 敏度高等优点。但是气相色 谱仅能分析在操作温度下能汽化而不分解的物质。据估 计，在已知化合物中能直接进行气相色谱分析的化合物 约占15％，加上制成衍生物的化合物，也不过20％左右。 对于高沸点化合物；难挥发
血液辐照仪概述（二）
2 技术特性2.1 主要性能1、允许最大装源活度：2000Ci。2、放射源几何尺寸：φ30mm×70mm。3、辐照方式：时间控制、剂量控制。4、具有多项安全联锁（参见“安全保护及事故处理”）。5、具有剂量计算功能，可根据放射源衰减系数自动计算当前放射源活度并实时显示；可显示预置时间、已照时间、剩余时
多肽合成仪概述（二）
3、固相多肽合成的应用——多肽合成仪 多肽固相合成技术的发明同时促进了多肽合成的自动化。世界上第一台真正意义上的多肽合成仪出现在1980年代初期，它是利用氮气鼓泡来对反应物进行搅拌，用计算机程序控制来实现有限度的自动合成。虽然在各项功能方面有着明显的缺陷，但是它毕竟把人从实验室里解放出来，极大地提高
血型与输血概述（二）
2．ABO抗原的生物合成：基因ABO及H控制着A、B抗原的形成。每个人从父母处分别获得ABO基因，它们决定阒红细胞膜上有抗原。O基因为无效基因，它没有相应的答产生。H位点的两个等位基因之一，H产生一种酶，在其作用下生成A或B抗原的前身物质。ABH血型抗原决定簇的前身物质是红细胞膜上含4个糖的低聚
基因敲除技术概述（二）
2.1.2条件性基因敲除法条件性基因敲除法可定义为将某个基因的修饰限制于小鼠某些特定类型的细胞或发育的某一特定阶段的一种特殊的基因敲除方法[2]。它实际上是在常规的基因敲除的基础上，利用重组酶Cre介导的位点特异性重组技术，在对小鼠基因修饰的时空范围上设置一个可调控的“按钮”，从而使对小鼠基因组的修
层析技术概述（二）
分辨率： 由上式可见，Rs值越大，两种组分分离的越好。当Rs = 1时，两组分具有教好的分离，互相沾染约2%，即每种组分的纯度约为98%。当Rs=1.5时，两组分基本完全分开，每种组分的纯度可达到99.8%。如果两种组分的浓度相差较大时，尤其要求较高的分辨率。 为了提高分辨率Rs 的值，可采用以下方
生命科学国外重要数据库
EMBL数据库结构EMBL数据库的基本单位也是序列条目，包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。序列条目由字段组成，每个字段由标识字起始，后面为该字段的具体说明。有些字段又分若干次子字段，以次标识字或特性表说明符开始，最后以双斜杠“//”作本序列条目结束标记。条目的关键字包括ID（序列名称），DE（序列
基因表达轮廓（gene－expressed－profile）技术2
经过这轮ＲＤＡ过程,Tester中的目的DNA将得到第一次富集。将第一轮产物更换新接头,进行第二轮RDA过程,目的DNA可得到进一步的富集。该技术假阳性很低。但仍不能解决个体mRNA在丰度上存在巨大差异的问题,当靶序列浓度较低时,其富集受抑制。3：抑制消减杂交（suppression subtrac
RNAi技术专有名词(2)
21.Homologous Chromosome：同源染色体一对染色体，分别来自父本和母本，染色体上有着相同的线性基因序列。 22.Recombinant Clone：重组克隆将不同来源的DNA片段合成在一个DNA分子中，这种技术称为重组，得到的分子为重组克隆。 23.Ribonucleic
旋转蒸发器概述（二）
四、旋转蒸发仪的优点: 1.所有的旋转蒸发仪都内置了一个升降马达，该装置可以在断电的时候自动将烧瓶提升到加热锅以上的位置。 2.由于液体样品和蒸发瓶间的向心力和摩擦力的作用，液体样品在蒸发瓶内表面形成一层液体薄膜，受热面积大; 3.样品的旋转所产生的作用力有效抑制样品的沸腾。综上特征