核酸数据库的概念

中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定 义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)......阅读全文

核酸数据库的概念

中文名称核酸数据库英文名称nucleic acid data bank定  义DNA、RNA序列的资料库,主要包括已知序列名称、DNA或RNA全序列及其特性,如启动区、起始和终止密码的位置、编码区、限制酶切位点以及推导的翻译产物蛋白质序列等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级

核酸分子杂交的概念

核酸分子杂交(简称杂交,hybridization)是核酸研究中一项最基本的实验技术。互补的核苷酸序列通过Walson-Crick碱基配对形成稳定的杂合双链DNA或RNA分子的过程称为杂交。杂交过程是高度特异性的,可以根据所使用的探针已知序列进行特异性的靶序列检测。

核糖核酸的概念

核糖核酸(缩写为RNA,即Ribonucleic Acid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A(腺嘌呤)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)、U(尿嘧啶),其中,U(尿

核酸变性的概念、诱因

在一定理化因素作用下,核酸双螺旋等空间结构中碱基之间的氢键断裂,变成单链的现象称为变性(denaturation)。引起核酸变性的常见理化因素有加热、酸、碱、尿素和甲酰胺等。在变性过程中,核酸的空间构象被破坏,理化性质发生改变。由于双螺旋分子内部的碱基暴露,其A260值会大大增加。A260值的增加与

核酸杂交的概念和意义

核酸杂交(Hybridization): 互补的核苷酸序列(DNA与DNA、DNA与RNA、RNA与RNA等)通过Watson-Crick碱基配对形成非共价键,从而形成稳定的同源或异源双链分子的过程,称为核酸分子杂交技术,又称核酸杂交。

核酸适配体的基本概念

核酸适配体(Aptamer)是一段DNA(脱氧核糖核酸),RNA(核糖核酸)序列,XNA(核酸类似物)或肽。通常是利用体外筛选技术——指数富集的配体系统进化技术(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX),从核酸分

核酸适配体的基本概念

核酸适配体(Aptamer)是一段DNA(脱氧核糖核酸),RNA(核糖核酸)序列,XNA(核酸类似物)或肽。通常是利用体外筛选技术——指数富集的配体系统进化技术(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX),从核酸分

核酸杂交的概念和发生条件

具有互补序列的不同来源的单链核酸分子,按碱基配对原则结合在一起称为核酸杂交(hybridization)。杂交可发生在DNA-DNA、RNA-RNA和DNA-RNA之间。杂交是分子生物学研究中常用的技术之一,利用它可以分析基因组织的结构,定位和基因表达等,常用的杂交方法有Southern印迹法,No

脱氧核糖核酸的概念和特点

脱氧核糖核酸(英文DeoxyriboNucleic Acid,缩写为DNA)是生物细胞内含有的四种生物大分子之一核酸的一种。DNA携带有合成RNA和蛋白质所必需的遗传信息,是生物体发育和正常运作必不可少的生物大分子。

限制性核酸内切酶的概念和功能

限制性核酸内切酶(restrictionendonuclease),又简称限制酶或内切酶。它们是基因工程和基因诊断重要的一类工具酶。它们的发现和应用为从基因组中分离目的基因提供了必要的手段.限制酶能特异地识别和切割特异的核苷酸序列,将双链DNA切成较小的片段。酶切后目的基因可能完整地或部分地保存于某

核酸分子杂交的概念、基本原理、探针及类型

主要内容:一、分子杂交的概念 二、分子杂交基本原理 (一)DNA变性: 1、DNA变性的方法2、增色效应3、溶解曲线4、融解温度5、影响Tm值的因素。 (二)复性:退火一、分子杂交的概念: 分子杂交(molecular hybridization)指具有一定同源序列的两条核酸单链(DNA或RNA),

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表

核酸纯化怎样保存核酸

纯化后的核酸,最后多使用水或者低浓度缓冲液溶解;其中 RNA 以水为主,DNA 则多以弱碱性的 Tris 或者 TE 溶解。经典的 DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,认为 EDTA 可以减少 DNA 被可能残留下来的 DNase 降解的风险;如果操作过程控制得当,DNase 的残留几乎是可以忽

核酸纯化怎样保存核酸

纯化后的核酸,最后多使用水或者低浓度缓冲液溶解;其中 RNA 以水为主,DNA 则多以弱碱性的 Tris 或者 TE 溶解。经典的 DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,认为 EDTA 可以减少 DNA 被可能残留下来的 DNase 降解的风险;如果操作过程控制得当,DNase 的残留几乎是可以忽

核酸纯化怎样保存核酸

纯化后的核酸,最后多使用水或者低浓度缓冲液溶解;其中 RNA 以水为主,DNA 则多以弱碱性的 Tris 或者 TE 溶解。经典的 DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,认为 EDTA 可以减少 DNA 被可能残留下来的 DNase 降解的风险;如果操作过程控制得当,DNase 的残留几乎是可以忽

GenBank数据库概述(四)

NCBI站点地图---其他基因组数据介绍:1、 小鼠基因组 1) 小鼠基因组资源向导 :把从各个中心来的各种小鼠相关的资源整合在一起,包括序列,图谱,和克隆信息以及指向小鼠种系和突变资源的指针。 2) 小鼠基因组测序:小鼠基因组计划的测序进展,HTG序列contigs(可以用大小和染色体号来浏览)由

GenBank数据库概述(三)

结构: 1、 结构主页 — 关于NCBI结构小组的一般信息和他们的研究计划,另外也可以访问分子模型数据库(MMDB)和用来搜索和显示结构的相关工具。 2、 MMDB:分子模型数据库 — 一个关于三维生物分子结构的数据库,结构来自于X-ray晶体衍射和NMR色谱分析。MMDB是来源于Brook

GenBank数据库概述(二)

FTP GenBank and Daily Updates:1. GenBank普通文件格式 — 参见GenBank记录样本和在GenBank公布通知中的详细描述,下载大多数最近的完全公告和日常积累或非积累更新数据。 2. ASN.1格式 — 摘要句法记号1,国际标准组织(ISO)数据表示格式,下载

GenBank数据库概述(一)

1. GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。是NIH遗传序列数据库,一个所有可以公开获得的DNA序列的注释过的收集。GenBank同日本和欧洲分子生物学实验室的DNA数据库共同构成了国际核酸序列数据库合作。唯一人类基因序列集合(UniGene),人类基因组基因图

核酸的提取

要回答这个问题要确定你是在哪一步发现降解了。是在质粒提取后后,直接点样发现降解的话,可能是提取过程中大肠杆菌富含DNase,或是操作过程中碱裂解过长如果是在酶切过程中降解了,可能有盐离子污染导致特异性酶变成非特异性酶了,把质粒都降解了。如果是在保存一段时间发现降解了,可能是保存液不是TE或是质粒发生

核酸的种类

核苷酸是组成核酸的基本单位,即组成核酸分子的单体。一个核苷酸分子是由一分子含氮的碱基、一分子五碳糖和一分子磷酸组成的。根据五碳糖的不同可以将核酸分为脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)两大类。核酸DNARNA名称脱氧核糖核酸核糖核酸结构规则的双螺旋结构通常呈单链结构基本单位脱氧核糖核苷酸核糖核

核酸的定量

核酸的定量    核酸的定量是分光光度计使用频率最高的功能。可以定量溶于缓冲液的寡核苷酸,单链、双链DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波长260nm。每种核酸的分子构成不一,因此其换算系数不同。定量不同类型的核酸,事先要选择对应的系数。如:1OD的吸光值分别相当于50μg/ml的dsDN

核酸的定量

核酸的定量 核酸的定量是分光光度计使用频率最高的功能。可以定量溶于缓冲液的寡核苷酸,单链、双链DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波长 260 nm。 每种核酸的分子构成不一,因此其换算系数不同。定量不同类型的核酸,事先要选择对应的系数。如:1OD 的吸光值分别相当于50μg/ml的d

核酸疫苗的应用及常见的核酸疫苗介绍

有关质粒DNA疫苗在人类及动物产生预防和治疗作用的研究报道不断增加,应用范围也逐渐扩大。人们期望用核酸疫苗来征服诸如微生物感染性疾病、寄生虫病等顽症,并用于肿瘤、遗传病和其他多种疾病的基因水平治疗,所以作了多方面的尝试。非病毒微生物感染性疾病的核酸疫苗非病毒微生物感染时,非病毒微生物蛋白都由微生物本

核酸与核酸类似物的区别

核酸类似物是与天然存在的RNA和DNA类似(结构相似)的化合物,用于医学和分子生物学研究。核酸类似物在组成核酸的核苷酸分子以及组成核苷酸的碱基、五碳糖和磷酸基团的分子间发生了改变 。通常,这些改变使得核酸类似物种的碱基配对和碱基堆积性质发生了改变。比如通用碱基可与所有四个经典碱基配对,又比如磷酸-糖

代谢组学常使用的数据库

  代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。  目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD

生命科学常用数据库

The NationalCenter for Biotechnology Information. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html T

QP2010农药数据库

Shimadzu气质联用的多种农药库 QP2010农药数据库

美国更新食品掺假数据库

  9月5日食品安全新闻网消息,美国药典委员会(USP)更新了食品掺假数据库(FFD2.0)。食品掺假数据库主要为行业、监管部门以及消费者预防和应对食品掺假事件发生提供技术支持。最新的FFD2.0涵盖了科研文献、媒体信息、食品监管记录、司法裁决记录中涉及食品掺假事件的各种信息。新版食品掺假数据库将于