NatureGenetics:GWAS和HiC技术解密全新癌症相关基因

睾丸癌是最常见的年轻男性癌症。铂类化疗是较为成功的治疗手段,但仍有少部分男性对其缺乏反应。一般患者的初次确诊年龄在二三十岁,这意味着他们今后的人生不得不忍受长期化疗带来的副作用。 伦敦癌症研究所(ICR)的科学家们调查了3万名男性DNA,发现了19种与睾丸癌有关的新基因变异。结合先前鉴定的遗传因素,研究人员受试者中挑选出了1%的高危人群。这些男性一生中患睾丸癌的风险约为7%,是普通男性(约0.5%)的14倍。 这项由Movember资助的研究,发表于6月12日的《Nature Genetics》,文章指出的风险基因的激活方式为潜在的新型疗法提供了线索。 研究结果与同期《Nature Genetics》的另一篇名为“Meta-analysis of five genome-wide association studies identifies multiple new loci associated with testi......阅读全文

Nat-Commun:新技术发现睾丸癌耐药相关基因

  一项科学调查研究已发现了可能驱动睾丸癌的一些新基因突变,也确定了可能导致肿瘤获得耐药的关键基因。  这项研究是第一次使用最先进的测序技术,探索睾丸生殖细胞肿瘤的相关细节,睾丸生殖细胞肿瘤是一种睾丸癌,在年轻男子中是最常见的癌症类型。  该项研究由Movember基金会资助,结果发表在Nature

研究发现5种新的睾丸癌基因突变

  睾丸癌多出现在某一特定家族。这意味着,遗传因素对肿瘤产生起到促进作用。   日前,德国汉诺威医学院等机构的研究人员发现了促使睾丸肿瘤形成的 5 种基因突变。这一发现将有助于今后睾丸癌的防治。相关研究报告发表在了近期出版的《自然—遗传学》和《人类分子遗传学》杂志上。   在这项最新研究中,

Nature-Genetics:GWAS和HiC技术解密全新癌症相关基因

  睾丸癌是最常见的年轻男性癌症。铂类化疗是较为成功的治疗手段,但仍有少部分男性对其缺乏反应。一般患者的初次确诊年龄在二三十岁,这意味着他们今后的人生不得不忍受长期化疗带来的副作用。  伦敦癌症研究所(ICR)的科学家们调查了3万名男性DNA,发现了19种与睾丸癌有关的新基因变异。结合先前鉴定的遗传

Nature发布癌症研究新发现:独一无二的基因特征

Dana-farber癌症研究所的研究人员发现了生殖细胞肿瘤睾丸癌发生过程中的一种独特基因组变化,这解释了为何绝大部分睾丸癌患者可以通过化疗治愈,这对于其它实体肿瘤来说几乎是不可能的。这一研究成果公布在Nature杂志上,这有助于分析影响其它癌症对化疗手段的敏感性因素。2016年美国预计睾丸癌新发病

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3

2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1

㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较

DNA重组技术(DNA-Recombination)

一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定2

(1)CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子(如Ca2+、Mg2+等)低渗溶液中时,细菌细胞膨胀成球形,处于感受态;此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面,重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面,在丰富培养基中生长数小时后,球状细胞恢复原

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体2

二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体,大多数具有编码多种蛋白质的基因,能利用宿主细胞的蛋白质合成体系,进行生长和增殖。构建的噬菌体载体,以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA,全部序列已知,共编码50多个基因。其中约一半基因参与

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体3

在作为载体时,这些噬菌体有一个很大的优点,即克隆到M13mp载体的外源DNA片段(双链),在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆,可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板:①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板;②制备仅有一条

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定3

当多克隆位点有外源DNA片段插入时,破坏此酶的N端阅读框架,产生无α互补功能的N端片段,因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色,见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短,不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框,有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定1

重组DNA是在体外用限制性内切酶,将不同来源的DNA分子进行特异地切割,获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接,从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞,在宿主细胞中进行无性增殖,获得大量的目的基因或DNA片段,此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体1

载体(vector)是携带靶DNA(目的DNA)片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型,亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下

DNA合成(DNA-synthesis-)技术介绍

蛋白质概念提出:DNA多肽合成(DNA synthesis ):按照预定核苷酸的顺序,将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法,即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸,可自动化操作。)目前,oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,此方法具有高效

DNA-指纹的概念高变区DNA与DNA指纹

人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段(10bp 左右)多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后,用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ,然后将样品进行

简述盐酸阿霉素的药理作用

  1、阿霉素对机体可产生广泛的生物化学效应。具有强烈的细胞毒性作用。其作用机制主要是阿霉分子嵌入DNA而抑制核酸的合成。  吸收、分布、排泄  阿霉素静脉注射后在血浆中很快消失。广泛分布于肝、脾、肾、肺和心脏中。本品主要在肝脏代谢,大约有一半由胆汁中排出。尿排泄量约为4-5%,肝功能不全将导致排泄

睾丸自我检查的临床意义

  异常结果:如睾丸有异常的豌豆或鸽蛋大小、没有疼痛的肿块提示可能患上睾丸癌。  需要检查的人群:怀疑患有睾丸癌的患者。

DNA-Immunoprecipitation-for-the-Determination-of-DNABinding-Specificity

Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Corresponding autho

DNA-Fingerprinting,-DNA-Barcoding,-and-Next-Generation-Sequencing-...

DNA fingerprinting of plants has become an invaluable tool in forensic, scientific, and industrial laboratories all over the world. PCR has become

“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”

   “垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的,用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,而在学术上被称为非编码DNA序列。  由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键,而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因,于是“垃圾DNA”这一观念便形

“垃圾DNA”或是编码DNA的“保镖”

"垃圾DNA"的概念源自上世纪70年代,用来形容基因组中不是编码蛋白质的DNA序列,在学术上被称为非编码DNA序列。 非编码DNA"开关说"究竟是个啥? 科学家们发现,人类基因组中包含多达400万个基因开关和功能调节因子,它们的载体便是"垃圾DNA"。这强烈地冲击了"DNA序列=生物性

DNA重组(DNA-recombination)技术:工具酶

一、限制性内切酶限制性内切酶(restriction endonucleases,RE)是其中最重要的工具酶之一。它是一类核酸水解酶,能识别和切割双链DNA分子中的特定核苷酸序列。(一)命名原则限制性内切酶大多从细菌中发现,根据来源进行命名,限制酶的第一个字母(大写,斜体)为宿主菌的属名,第二、第三

DNA连接酶(DNA-ligase)介绍

DNA连接酶是1967年在三个实验室同时发现的。它是一种封闭DNA链上缺口酶,借助ATP或NAD水解提供的能量催化DNA链的5'-PO4与另一DNA链的3'-OH生成磷酸二酯键。但这两条链必须是与同一条互补链配对结合的(T4DNA连接酶除外),而且必须是两条紧邻DNA链才能被DNA

DNA提取方法洗涤-DNA(或-RNA)

当裂解物通过硅胶膜进行离心分离,现在所提取的 DNA 或 RNA 应该与柱子结合,杂质、细胞蛋白和多糖应该已经通过了。 但是,膜仍然被残留的细胞蛋白质和盐弄脏。如果样品来自植物,仍然会有多糖,也许一些色素留在膜上,或者如果样品是血液,膜可能会被染成棕色或黄色。洗涤步骤用于去除这些杂质。通常有两次洗涤

Inorg-Chem:新型铜类化合物或可有效抑制癌症扩散

  近日,来自比勒费尔德大学的研究人员通过研究开发出了一种包含铜的分子,其可以特异性地同DNA相结合来抑制癌症的扩散,相关研究刊登于国际杂志Inorganic Chemistry上。研究者表示,这种特殊分子相比顺铂而言可以有效杀灭癌细胞,顺铂是一类常用癌症化疗中的抗癌药物。  研究者指出,是否这种含

DNA提取方法DNA-提取后纯化:将-DNA-与色谱柱结合

离液盐对于裂解至关重要,而且对于将 DNA(或 RNA)与色谱柱结合也是如此。此外,为了增强和影响核酸与二氧化硅的结合,还添加了酒精。大多数情况下这是乙醇,但有时可能是异丙醇。乙醇百分比和体积有很大的影响。太多,你会带入大量降解的核酸和小物种,这会影响 A260 读数并降低你的一些产量。太少,可能难

如何治疗不孕不育?

  不孕不育是现代社会年轻夫妇经常会遇到的问题。引发不孕不育的原因有很多,其中既包括遗传性的因素,也包括环境因素。生活习惯的改变也会导致不孕不育的发生。为了解决这一问题,研究者们也进行了大量的工作。针对近期不孕不育相关领域的研究进展,进行简要盘点,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Science:新

盐酸阿霉素的药理作用

  盐酸阿霉素抗肿瘤抗生素,通过抑制癌细胞遗传物质核酸的合成,本品抗瘤谱较广,对多种肿瘤细胞均有杀灭作用。阿霉素对机体可产生广泛的生物化学效应。具有强烈的细胞毒性作用。其作用机制主要是阿霉分子嵌入DNA而抑制核酸的合成。  1.吸收、分布、排泄  阿霉素静脉注射后在血浆中很快消失。广泛分布于肝、脾、

DNA电泳

DNA电泳(主要内容如下)  Preparation of Agarose Gel and Electrophoresis  Extraction of DNA From Agarose Gel  Extraction of DNA from Acrylamide Gels  DNA Marker