微创DNA甲基化检测可有效识别至少四种常见癌
中美研究人员２６日说，ＤＮＡ甲基化标记作为一种全新的微创检测方式，只需检测少量组织即可获得足量的ＤＮＡ用于分析，且至少可以有效识别结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌四种常见恶性肿瘤。 这项工作由美国加州大学圣迭戈分校张康教授与中国第四军医大学西京医院郝晓柯教授及中山大学徐瑞华教授等人合作完成，相关论文发表在新一期美国《国家科学院学报》上。 甲基是指一个碳原子和三个氢原子结合。ＤＮＡ（脱氧核糖核酸）甲基化涉及甲基修饰ＤＮＡ分子。作为一种最基本的表观遗传学现象，ＤＮＡ甲基化即在基因的ＤＮＡ序列不发生改变的情况下，基因表达发生了改变，是正常发育过程所必需，但它与包括肿瘤发生发展在内的许多重要病理生理过程也密切相关。 以张康教授为首的研究人员利用美中三个肿瘤数据库，分析了约２８００个肿瘤样本和约５９０个相应正常组织的ＤＮＡ甲基化水平，肿瘤样本包括结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌四种常见恶性肿瘤。 他们发现，利用特定位点ＤＮＡ甲基化水平......阅读全文
最新DNA甲基化测序技术比较研究
在不同疾病中，DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中，DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。 对于拥有成千上万个样本的大量病人来说，全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合
DNA甲基化的基本原理
DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作为甲基供体，通过共价键结合的
DNA甲基化的基本原理
DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶（DNA methyltransferase，DNMT）的催化作用下，以S—腺苷甲硫氨酸（S—adenosyl methionine，SAM）作为甲基供体，通过共价键结合的
DNA甲基化的基本原理
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
基因组DNA甲基化分析方法
早期的基因组DNA甲基化分析技术，如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等，已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化，它是在扩增片段长度多态性技术的基
DNA甲基化反应的作用机制描述
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性，人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先，甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化，如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次，附件因子（
DNA甲基化反应的主要类型介绍
DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化，称为从头甲基化（denovo methylation）；另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化，另一条未甲基化的链被甲基化，这种类型称为保留甲基化（maintenance methylation）。
张康等团队报道：DNA甲基化分析有助于癌症诊断
“以康复和生存为目的的最优癌症治疗策略选择，很大程度取决于特定癌症类型或癌症亚型确诊，”加州大学圣地亚哥分校基因组医学研究所张康教授说。“微创活检对癌症科学和医学研究具有重大意义，因此DNA甲基化标记可能是一种更有效的新方法。” 附着在DNA上的甲基基团包括1个碳原子和3个氢原子。DNA甲基化
北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术
来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称，他们开发出了一种称作为MCTA-Seq（methylatedCpGtandemsamplificationandsequencing）的新方法，可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的《细胞研究
北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术
来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称，他们开发出了一种称作为MCTA-Seq（methylated CpG tandems amplification and sequencing）的新方法，可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的
抽管血，揪出癌症“指纹”
该技术仅需抽取人体外周血，通过捕获这些微量ctDNA中的甲基化位点改变，即可精确检测到肝癌、乳腺癌、结直肠癌、肺癌等高发癌症的早期信号。 肿瘤在人体内如同器官一样，不断地有细胞生长和死亡。而在肿瘤细胞坏死或凋亡过程中会释放自身DNA并进入血液循环。这些在人体内不断流动的肿瘤DNA碎片，就是循环
检测DNA甲基化维持效率的方法研究中获新进展
3月8日，中国科学院生物物理研究所研究员朱冰课题组在Nature Protocols上，在线发表了以Simultaneously measuring the methylation of parent and daughter strands of replicated DNA at the s
揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
近日，《EMBO报告》在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文，该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重要的，DNA损伤修复功能的障碍会引起严重疾病，包括多种癌症、免疫缺陷、代谢紊乱、
有了这个新技术，胃癌检测告别胃镜、钡餐
视觉中国供图 胃镜和钡餐是目前检测胃癌最常用的两种方法。相对于这两种方法，DNA甲基化检测方法的一大特点就是无创，既不用“插管”，也不用“拍片”，并且其最大的优势还在于，可以一次性完成多个癌种的筛查，大大提高了筛查效率。 胃癌由于早期不容易被发现，导致死亡率较高。定期进行筛查，及早发现及早治疗，
血检中DNA浓度可以检测出卵巢癌治疗进展
发表于《国家公共图书馆》医学杂志上的文章写道，血检中循环肿瘤DNA（ctDNA）水平与与卵巢癌的大小有关，可以预测病人的治疗效果，以及疾病发展阶段。CA-125蛋白质的血浓度是用来衡量浆液性卵巢癌（HGSOC）患者化疗效果的，然而在一两个化疗周期后，CA-125血浓度变化不够迅速，无法衡量化疗效果。
科学家揭示防止卵巢癌新基因HELQ
近日，英国癌症研究中心(Cancer Research UK)的研究人员在小鼠中发现了一个防止卵巢癌的新基因，如果其发生缺陷就可以提高形成这一疾病的机会。相关研究论文刊登在了近期出版的《自然》(Nature)杂志上。 这一称作为 HELQ 的基因，可帮助修复细胞增殖时 DNA 复制过程
Nature揭示新型癌症致病基因
来自英国癌症研究中心(Cancer Research UK)的科学家们在小鼠中发现了一个防止卵巢癌的新基因，如果其发生缺陷就可以提高形成这一疾病的机会。这项研究发表在9月4日的《自然》(Nature)杂志上。 这一称作为HELQ的基因，可帮助修复细胞增殖时DNA复制过程中所发生的所有的
鳞状细胞癌常见类型
常见类型包括：鳞状细胞皮肤癌:一种皮肤癌肺鳞状细胞癌：肺癌的一种鳞状细胞甲状腺癌：一种甲状腺癌食管鳞状细胞癌：一种食管癌阴道鳞状细胞癌：一种阴道癌尽管同名“鳞状细胞癌”，但不同身体部位的鳞状细胞癌在症状、自然病程、预后和对治疗的反应方面存在差异。
Pyrosequencing技术在遗传疾病诊断中的常见问题及解决方法
目前，Pyrosequencing技术被越来越多的应用于临床快速分子诊断，如通过Pyrosequencing技术检测 MTHFR编码基因的C677T位点的基因型，作为成年人冠心病和中风的辅助诊断手段；通过检测ApoE基因上的SNP112和SNP158，作为阿滋海默征的辅助诊断手段；对人基因组上1
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果，欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序，通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。正确诊断肿瘤，对于癌症的治疗至关重要。但是，在已知的约100种肿瘤中，中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。为了解决这个问题，德国癌症研究中心科学
DNA甲基化酶的基本信息
大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶，即DNA甲基化酶，它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统（R-M系统）Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化，形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中，常用的甲基化酶属于Ⅱ型，它与相应的
我科学家改写DNA甲基化经典
近日，吉林大学人兽共患病研究所和华大基因研究院通过合作，首次在旋毛虫基因组中发现了甲基转移酶，并证实了DNA甲基化的存在，改写了长期以来认为线虫中没有该种表观遗传修饰的历史。相关成果发表于《基因组生物学》。业内专家认为，该研究为以DNA甲基化为靶标的抗旋毛虫及类似病原药物与预防制剂
DNA“甲基化指纹”鉴定出91种肿瘤
科技日报北京3月18日电 英国《自然》杂志近日在线发表了一项癌症研究成果，欧洲科学家研发了一种全新机器学习程序，通过DNA甲基化数据——“甲基化指纹”技术可以改善脑肿瘤的诊断。 正确诊断肿瘤，对于癌症的治疗至关重要。但是，在已知的约100种肿瘤中，中枢神经系统肿瘤尤其难以准确鉴定出来。
DNA甲基化与拟南芥的免疫力
DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力，它动态调控了某些基因的表达，让植物能够抵御细菌感染。近日，一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。 美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴
科学研究揭示DNA甲基化的秘密
甲基化指 DNA 的化学修饰，这种修饰发生在 DNA 序列的数百万个位置上。直到现在，科学家们相信这种表观遗传学的现象减少了一些基因的表达。 近日，来自UNIGE大学的研究团队们，发现 DNA 甲基化在基因调节中扮演着积极和消极的角色。 DNA 序列的变异性与基因表达之间的关系也
DNA甲基化酶的作用和种类
DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中，主要特征
DNA甲基化：诊断癌症的强大工具
最近，来自香港中文大学的研究人员，通过分析血浆DNA中的甲基化序列，能够检测到癌症患者的肝肿瘤和淋巴瘤，以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱，能够识别循环DNA的组织起源，从而使其成为一种强大的工具，用于筛选、癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作，由香港中文大
DNA甲基化：在衰老细胞中的作用
近日，科学家们在45万个基因组位点中发现了8%的与衰老有关的DNA甲基化的改变。这项研究成果题为“Age-related variations in the methylome associated with gene expression in human monocytes and T c
在基因组范围定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳动物基因表达中扮演了重要角色。尽管通过线粒体遗传且随时间稳定，但是细胞分化、疾病或环境影响都会改变DNA甲基化的模式。近年来，科学家们开发出多种新方法，试图在基因组范围定位DNA甲基化。 尽管从理论上来说，全基因组亚硫酸氢盐测序能让研究人员全面观察甲基化组，但它还是面临技
揭示DNA甲基化与基因沉默的关系
DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关，但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s