北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术

来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称,他们开发出了一种称作为MCTA-Seq(methylated CpG tandems amplification and sequencing)的新方法,可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的《细胞研究》(Cell Research)杂志上。 北京大学生命科学学院的汤富酬( Fuchou Tang)研究员、黄岩谊(Yanyi Huang)研究员以及首都医科大学彭吉润(Jirun Peng)教授是这篇论文的共同通讯作者。 异常的DNA甲基化改变,包括CpG岛(CGIs)超甲基化及广泛低甲基化,是包括肝细胞癌(HCC)在内的几乎所有人类癌症类型的标志性特征。检测循环游离DNA(ccfDNA)中超甲基化的CpG岛成为了诊断、预测和监测癌症一种有前景的非侵袭性方法。 然而由于ccfDNA高度碎片化,且癌症相关的ccfDNA只......阅读全文

MCTASeq检测DNA甲基化实现胃癌早期无创诊断

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)汤富酬教授/文路副研究员团队与北京大学第三医院普外科付卫教授团队合作,利用团队之前开发的甲基化CpG短串联扩增与测序技术(MCTA-Seq),通过对患者血浆游离DNA中异常高甲基化CpG岛进行基因组规模的高灵敏

新技术MCTASeq应用于探究外周血游离DNA的组织来源

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心文路副研究员与首都医科大学世纪坛医院肝胆外科彭吉润教授合作,利用团队之前开发的甲基化CpG短串联扩增与测序技术(MCTA-Seq),探究正常人、肝疾患者与急性胰腺炎患者外周血游离DNA的组织来源。研究成果以“Compre

-北京大学团队发布肝癌无创早期诊断新技术

   DNA甲基化是指DNA的胞嘧啶(C)被加上一个甲基而形成甲基胞嘧啶的表观遗传修饰,主要发生于CpG二核苷酸。CpG二核苷酸高度聚集于被称为CpG岛的基因组区域,这些区域主要位于基因转录起始处,具有重要的转录调控功能。CpG岛在正常细胞中大多处于去甲基化状态,但在肿瘤细胞中,大量CpG岛会发生异

北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术

  来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称,他们开发出了一种称作为MCTA-Seq(methylatedCpGtandemsamplificationandsequencing)的新方法,可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的《细胞研究

利用DNA图谱诊断癌症

  作为无创产前诊断等相关领域技术的首创者,来自香港中文大学的卢煜明(DennisLo)教授最早就曾发现孕妇外周血中存在“漂流”的胎儿DNA,也就是说,假设每毫升母亲样品相当于1000个基因组,则总共含有1900条母亲的21号染色体,100条整倍体胎儿的21号染色体或150条21三体胎儿的21号染色

何川教授亮点推荐中国学者成果:诊癌从血液入手

  芝加哥大学的何川(Chuan He)教授主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究。近年来在甲基化修饰,尤其是5hmC和m6A等方面获得了许多重要的发现。迄今已在Nature,Science等国际权威学术期刊发表了150余篇论文。曾荣获美国癌症研究青年科学家奖,凯克基金会医学研究杰

北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术

  来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称,他们开发出了一种称作为MCTA-Seq(methylated CpG tandems amplification and sequencing)的新方法,可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的

有了这个新技术,胃癌检测告别胃镜、钡餐

视觉中国供图  胃镜和钡餐是目前检测胃癌最常用的两种方法。相对于这两种方法,DNA甲基化检测方法的一大特点就是无创,既不用“插管”,也不用“拍片”,并且其最大的优势还在于,可以一次性完成多个癌种的筛查,大大提高了筛查效率。  胃癌由于早期不容易被发现,导致死亡率较高。定期进行筛查,及早发现及早治疗,

癌症与某些“垃圾DNA”有关

  英国研究人员日前报告说,人类基因组中一些“垃圾DNA”产生的物质与乳腺癌等癌症存在相关性,这项发现有助于研发新的癌症治疗方法。   英国诺丁汉大学等机构研究人员在美国《基因组学》(Genomics)杂志上报告说,他们发现人类基因组中名为L1的DNA序列会导致生成一些反常产物,而这些产物多见于乳

Nature解析癌症与“垃圾”DNA

  癌症是由多次遗传改变(或突变)而引起的一类疾病。我们从父母那里继承了或强或弱的形成某些癌症类型的遗传易感性;此外,在我们的一生中我们的细胞内也会不断地累积新的突变。尽管已开展了很长一段时间的癌症遗传起源研究,直到现在研究人员仍无法估量基因组一些非编码区域的作用。  来自日内瓦大学(UNIGE)的

-“垃圾DNA”中发现潜在癌症病源

  人类基因组中仅有1%~2%是负责蛋白质编码的基因,其余非编码区域早先被认为是毫无用处的“垃圾DNA”。但是,美、英等国研究人员最近在这个“垃圾”区域中找到近百个乳腺癌与前列腺癌的潜在“导火索”,提示研究“垃圾DNA”对了解癌症的重要性。   美国耶鲁大学、英国韦尔科姆基金会桑格研究所等机构的研

癌症猎手:血液中的微量DNA

        癌症,多细胞复杂生命的魔咒,随着人类医学的不断发展、平均寿命的不断提高,癌症从一种罕见病,逐步发展成为一种常见流行病。伴随着癌症患者人数的飞速增长,曾一度在大众中引发恐慌,当其时也,美苏政府均承诺要在若干年之内攻克癌症。许诺的时间早已过去,但人类的医学离彻底解决癌症,还相当遥远。只不

-循环肿瘤DNA实时跟踪癌症发展

  据本周三在《Nature Communications》杂志发表的一项新的研究中,科学家首次发现,流进入血液中的肿瘤DNA,可用于实时跟踪肿瘤的发展以及对治疗的响应。  三年多来,剑桥大学的研究人员,从肿瘤已经扩散到身体其他部位的一名乳腺癌患者身上,采集了外科肿瘤样本(活检)和血液样本。他们仔细

垃圾DNA是诱发癌症的动力

  根据“人类卫星二”,人类基因组认为是“垃圾DNA”的异常高拷贝但未被探索的序列具有令人惊讶的能力,影响我们基因组的主要监管者。放松管制时,这些重复核苷酸序列的大片段将主要调节蛋白结合并分解成癌细胞中的大核体。这可能导致表观遗传学不稳定  -基因调控的变化  -这是许多癌症进展的动力。  神经学教

每个癌症患者都应进行DNA测序

  英国首席医疗官萨利·戴维斯女士近日发布了一份年度报告,主旨是建议每个癌症患者接受DNA测序,以防止误诊、不必要的反复确诊和无效的化疗。  目前,英国每年有超过35万人被诊断患有癌症,每年约有16.3万人因此死亡。萨利表示,是时候结束“诊断性恶性肿瘤”了,这类患者一般要咨询5位以上医生,在确诊前平

利用DNA甲基化检测实现结直肠癌早期无创诊断

  北京大学生命科学学院生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心与北京大学第三医院普外科合作,利用团队之前开发的甲基化CpG短串联扩增与测序技术(MCTA-Seq),通过对患者血浆游离DNA中异常高甲基化CpG岛进行基因组规模的高灵敏度测序分析,实现结直肠癌早期无创诊断。

何川教授亮点推荐中国学者成果:诊癌从血液入手

  芝加哥大学的何川(Chuan He)教授主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究。近年来在甲基化修 饰,尤其是5hmC和m6A等方面获得了许多重要的发现。迄今已在Nature,Science等国际权威学术期刊发表了150余篇论文。曾荣获美国癌症 研究青年科学家奖,凯克基金会医学研

DNA修复机制如何帮助抵御癌症

  2015年的诺贝尔化学奖颁发给了细胞DNA修复机制的相关研究,而理解细胞如何修复损伤的DNA对于开发有效的抗癌疗法或许非常重要。通过揭示机体细胞如何自发地修复引发疾病的DNA突变,研究者或许就可以帮助开发改善治疗癌症的化疗方法的有效性。  研究者Nora Goosen表示,我们可以利用知识来战胜

神秘DNA提供新的癌症检测法

  最近,美国弗吉尼亚大学的研究人员发现,存在于染色体外面的奇特环状DNA,根据产生它们的细胞类型,而有所差异。这一研究结果增加了一种诱人的可能性,即,这些环状DNA可以作为不同类型癌症的生物标志物。相关研究结果发表在最近的《Cell Reports》。  MicroDNAs,是一类已被命名的新DN

癌症“照妖镜”——游离DNA助力肿瘤早期探查

“人体细胞也有生命周期。细胞衰老凋亡后,细胞内的物质会渗透出来。其中,DNA会随之‘崩裂降解’,进入血液,成为游离DNA。”中国医学科学院肿瘤医院防癌科副主任张凯教授告诉科技日报记者,“肿瘤细胞的游离DNA和正常细胞的游离DNA有所不同,这就给了我们探测肿瘤细胞的机会。”随着分子检测技术的发展,科研

-DNA甲基化:癌症共有的“指纹”

  8月26日在线发表在Genome Medicine上的一篇文章中,研究人员说他们发现了多种癌症中都存在的普遍特异性变化,DNA甲基化标记,它们帮助控制基因的开、关以及最终细胞的行为。这种DNA上可逆的化学标记就是表观遗传学。  约翰霍普金斯医学院的Andrew Feinber

检测癌症相关DNA修饰新测序方法

  牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明,他们开发的新方法,TET辅助吡啶硼烷测序(TET-assisted pyridine borane sequencing,TAPS)是一种比亚硫酸氢盐测序(bis

DNA检测将替代常用癌症检测方法

  巴氏涂片检查方法(Pap smear)是公共卫生一种广泛使用的金标准检查方法,这种方法主要针对子宫颈癌等疾病,能有效的检测出人类乳头瘤病毒(HPV)细胞的异常变化。然而近期美国食品药品管理局(FDA)批准了一种以DNA为基础的病毒检测方法。   1943年,Papanicolaou和Tra

癌症“坏运气”?Science:近2/3癌症突变源于DNA复制出错!

  “近2/3的癌症突变源于DNA复制过程中随机发生的错误!”  这是来自于约翰•霍普金斯大学基默尔癌症中心(Johns Hopkins Kimmel Cancer Center)的科学家们在3月24日发表于《Science》期刊上的一篇最新学术论文的结论。它意味着,DNA复制出错是导致癌变的主要因

Cell子刊:癌症患者独有的古老DNA

  一种改变了尼安德特人(Neanderthal)和丹尼索瓦人(Denisovan)的古老逆转录病毒,现在被发现同样也在现代人类——某些癌症患者的DNA中留下了一些改变。来自英国的一个研究人员小组在《当代生物学》(Current Biology)杂志的一篇论文中,著述了这一惊人的研究发现。  

DNA的端粒长度可以有效预测癌症风险

  匹兹堡大学癌症研究所(UPCI)的科学家在美国华盛顿特区的AACR年会上报道,保护染色体末端的DNA端粒长度可以预测癌症的风险并成为未来治疗的潜在靶标。  皮特和新加坡科学家率先研究的研究表明,超过预期的端粒由重复的DNA序列组成,每次细胞分裂时都会缩短---与癌症风险增加相关。  持有阿诺德·

超强DNA修复让弓头鲸远离癌症

据英国《新科学家》杂志网站22日报道,弓头鲸是世界上寿命最长的哺乳动物,很少受癌症的影响。美国科学家在一项新研究中发现,弓头鲸的细胞似乎能比人类或小鼠的细胞更快速有效地修复DNA,这或许可解释为什么它们能活到200岁以上,且癌症发病率较低。在最新研究中,罗切斯特大学科学家研究了不同动物的皮肤细胞如何

癌症DNA环“密码”被科学家破解

  美国斯坦福大学医学院团队及其国际合作者在《自然》杂志上发表了三篇研究论文,彻底改变了科学界对小DNA环(ecDNA)在人类癌症中所起作用的理解。这些研究详细阐述了ecDNA在近15000例癌症患者中的分布及对预后的影响,揭示了一种违反遗传学基本规律的新型遗传方式,并介绍了一种针对ecDNA的抗癌

敏感检测癌症DNA甲基化技术,有望改进非侵入式癌症检测

  检测肿瘤释放进入血液中的游离DNA(cfDNA,cell-free DNA)的突变是一种极具潜力的癌症检测方法。然而这类检测的敏感性和准确性及其检测早期癌症的能力目前仍然处于低水平。一种潜在的替代方法是检测cfDNA上的甲基化水平,因为在肿瘤中,DNA甲基化水平会发生显着的变化。  早期的全基因

新DNA分析技术可快速诊断癌症等疾病

  加拿大研究人员取得的一项技术突破,有望用以更快地开展癌症及各种产前诊断。新开发的工具将允许研究人员在类似人体条件下,将长链DNA(脱氧核糖核酸)装载入可调谐纳米成像室,同时维持其结构不变。此项重要发现发表在本周美国《国家科学院学报》上。   麦吉尔大学物理系教授萨波莉娜·莱斯利、沃尔特