微生物组影响的不仅是肠道,还有头发
为了让自己看上去美美哒,每个人每年都在头发上花了不少时间和金钱。不过,也许你还不知道,细菌和头发之间也存在着一种奇怪的共生关系。近日,加州大学旧金山分校的研究人员在《Cell Host & Microbe》上阐明了这种关系。 调节性T细胞(Treg)是一类让人体能够耐受共生微生物的免疫细胞,因此,当研究人员在研究与毛发生长有关的微生物活性时,他们便自然而然地将Treg作为一个重要的考虑因素。 加州大学旧金山分校皮肤学系的Tiffany Scharschmidt是这篇文章的第一作者。她表示:“在这项研究中,一个值得我们注意的现象是皮肤中存在明显且突然的调节性T细胞积累。” 为了探索Treg在这个区域中的作用,研究团队首先去除了小鼠皮肤上的Treg,创建了一个小鼠模型。然后,他们将这些小鼠和野生型小鼠一小块皮肤上的毛发刮掉,并惊讶地发现,在没有Treg细胞的皮肤上,毛发并没有生长。 研究人员在标记Treg之后,......阅读全文
全球微生物组大数据搜索引擎上线
日前,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞研究中心正式发布首个微生物组大数据搜索引擎——MSE(Microbiome Search Engine; http://mse.single-cell.cn),使得以整个微生物组为分析单元的智能搜索和大数据挖掘成为现实。 微生物组,又称“菌群”。
全球最大的海洋微生物组数据库建立
9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等
Science新子刊:前所未知的别样微生物组
科学家们收集了来自亚马逊部落Yanomami族人的口腔、皮肤和粪便细菌样品,发现这些微生物群与我们所知的微生物大不同,这些原始部落的人从未与西方人群接触过,而他们体内存在的这些药物抗性基因也许未来能用于临床医疗。 这一研究成果公布在4月17日的Science Advances杂志上。 Sci
微生物组控制着我们?还是我们控制着它?
一项新的分析揭示了小鼠如何操控它们胃肠道的微生物,人类或许也是如此。 我们终究还是可以控制我们的肠道的。最近发表的一篇论文阐述了这一诱人的发现,它揭示了小鼠可以控制它们肠道微生物的组成和行为,而人类也有这样的潜能。这一发现颠覆了主流观念。主流观念认为存在于我们肠道中的复杂的生态系统实际上是我们
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征,这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日,国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
揭秘机体微生物组与人类健康之间的关联
人类机体中充满了能够帮助消化食物和对抗疾病的细菌,但由于饮食、居住地、爱好甚至病史的不同,两个人的体内可能会存在不同种类的细菌。长期以来科学家们一直在研究寻找哪种细菌与人类疾病有关,以及哪些细菌能帮助机体抵御疾病发生,研究人员对人类机体微生物组进行比较研究后得出的结论往往并不一致,因为他们分析的
如何利用微生物组来驱动精准医学的进展?
2016年11月20日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一项发表于国际杂志Trends in Pharmacological Sciences上的研究报告中,来自芝加哥大学的研究人员通过研究表示,对微生物组的研究对于未来精准医学的研究或许非常重要;机体的微生物组是由消化道中细菌、病毒、真菌及
研究发现肿瘤内微生物组可预测肝癌预后
近日,Clinical and Translational Medicine以论著形式发表了北京协和医院肝脏外科主任医师毛一雷、副研究员杨华瑜团队关于肝细胞癌肿瘤内微生物组相关研究。研究显示,肝细胞癌肿瘤内微生物组显著不同于癌旁组织,不同患者之间、同一患者的不同病灶之间均存在明显异质性。这表明肝
微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出,许多已发表的微生物组研究其实受到了污染,错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为,在临床样本中检测到出人意料的细菌时,不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物,它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能
断奶、抗生素都会影响孩子的微生物组
我们肠道中的共生菌能够与正常细胞过程相互作用,生产人体所必需的物质(比如氨基酸)。理解肠道菌对代谢、免疫和行为的影响,一直是科学家们的研究热点。 本期《Cell Host & Microbe》推出了“The Host-Microbiota Balance”特刊,通过一系列文章探讨了宿主与共生菌
改变机体肠道微生物组真能逆转乳糖不耐受?
童年以后,全球大约三分之二的人群都会失去消化牛奶的能力,正如我们所知,断奶后100%的非人类哺乳动物也会失去这种能力,进入成年期,持续消化乳糖(牛奶中的主要糖类)的能力是一种生物学异常表现。 乳糖并不会被肠道直接吸收,相反,其必须被乳糖酶破碎成两种较小的糖类分子,正常情况下, 产生乳糖酶的基因
微生物做代谢组学分析的样品怎么处理
微生物代谢组学主要研究细胞生长或生长周期百某一时刻细胞内外所有低分子量代度谢物。分析技术的不断发展促进了微生物代谢组学研究的进展。本文结合微生物样品前处理方法,综述了目前研究中所采用内的各种分析技术的特点与应用,并展望微生物代谢组学研究中容分析技术的发展趋势。
母乳喂养对乳汁中微生物组的影响
一项针对人类的大规模分析显示,与直接母乳喂养相比,使用抽乳的间接母乳喂养会导致口腔细菌的减少以及更多的潜在病原体的出现。 2月13日在Cell Host&Microbe杂志上发表的研究结果表明,牛奶微生物群受到来自婴儿口腔和来自环境来源(如吸乳器)的细菌的影响,尽管未来的研究将需要评估具体的变化
呼吸道微生物组决定机制研究获进展
近日,中山大学中山医学院教授丁涛团队与教授田国宝团队合作,研究揭示了口腔细菌对于肺部菌群和肺部健康的差异化塑造作用。相关研究在线发表于《先进科学》(Advanced Science)。 该研究团队发现,肺部菌群由口腔和鼻腔菌的输入共同塑造,而口腔菌输入占比越高所塑造的肺部菌群与肺部炎症因子的上
全球微生物模式基因组测序计划获进展
近日,《核酸研究》(Nucleic AcidsResearch)在线发表了国家微生物科学数据中心(中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心)关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株(t
口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析
2015年7月28日,北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎(RA)口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节,并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。 RA是一种致
解读人类机体如何与肠道微生物组共生共荣
长期以来,我们一直认为“良好”的免疫细胞能够帮助识别并且抵御外来入侵者,这就是为何很大一部分药物能够直接靶向杀灭致病微生物并且抵御这些微生物引发的感染。对机体免疫力的理解往往能够反映20世纪的文化,同时,适者生存也是促进进化和竞争发生的驱动子,但理解人类和微生物之间的根本改变往往始于体内50%的
益生菌与微生物组研发、应用或成大健康产业焦点
近年来,在微生物学领域,关于益生菌等微生态制剂的研究进入了新的层次,随着第二代益生菌制剂的应用,国内对益生菌及微生物组学的研究掀起了新一轮高潮。9 月 16 日至 9 月 17 日,由全国卫生产业企业管理协会、中华医学会指导,上海真合生物和真合园——医疗资源整合及慢性病管理平台联合承办的第二届真
华大基因参与全球最大微生物基因组研究项目
华大基因3月22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目EarthMicrobiomeProject(简称“EMP”),将负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序,以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。 EMP将对来自全球的20万个样本进
宏基因组学:查明微生物身份新手段
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文,引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法,不通过培养,直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物,甚至可以
微生物宏基因组测序可以解释地球氮循环?
微生物(细菌和古细等)是全球生物地球化学循环的重要驱动者。阐明微生物生物地理分布及其驱动过程对于预测环境变化将如何影响生物地球化学循环非常重要。以往微生物生物地理学的研究常常聚焦在物种的层面。然而,越来越多的研究表明,由于微生物群落固有的功能冗余性,微生物群落的功能变化通常与其物种组成变化是解耦
“万种微生物基因组计划”在深圳启动
由深圳华大基因研究院联合中国微生物领域顶尖研究机构、院校和企业组成的“万种微生物基因计划”,八月一日在深圳启动。 据悉,该计划是深圳华大基因研究院在“国际千人基因组计划”后启动的又一重大基因组计划,目前该计划的地位为亚洲第一、世界第三。 该计划预计在三年内完成一万种微生物物种全基因组
微生物组学助力癌症免疫疗法,阿斯利康达成合作
近日,Seres Therapeutics宣布将与阿斯利康(AstraZeneca)开展一项为期3年的研究合作。两家公司将从机理方面去试图理解微生物组学如何增益癌症免疫疗法,包括和阿斯利康产品的潜在协同作用。在两年时间内,阿斯利康将向Seres支付2000万美元的分期付款,并为Seres提供与合
Nature:测序人类皮肤微生物组-解析真菌多样性
历史上,人类很久以前就会利用真菌做面包和啤酒了,然而我们对居住在自己身体上的真菌却并十分不了解。 现在,美国国立卫生研究院(NIH)的研究人员,首次解析了人类皮肤上的真菌多样性。他们对健康人不同皮肤部位的真菌 DNA 进行了测序,明确了皮肤上正常真菌群落的构成,为研究真菌类皮肤病打下了
微生物组科学研究新发现带来治疗革命
组成人体的细胞大约有 10 万亿个。这是一个巨大的数字,但与生活在人体内及体表的 40 万亿个细菌细胞相比,10 万亿显然少了一大截。研究人员试图用细菌来治病。 细菌可被用来治病 据全国广播公司新闻网(NBC News)报道,近些年来,科学家们了解到,人们身上及体内的细菌(统称为微生物组)与
微生物所等发表植物基因组编辑研究综述
序列特异性核酸酶使得基因组编辑成为可能,快速推动了基础和应用生物学的发展。CRISPR-Cas9系统自出现以来,作为可转化植物的基因组编辑工具已得到广泛应用。CRISPR-Cas9对基因组靶位点进行定向切割,造成DNA双链断裂。DNA双链断裂主要通过两种高度保守的机制进行修复,即非同源末端连接(
中美德科学家呼吁启动《国际微生物组计划》
《自然》刊物28日在线发表了一篇来自中国、美国和德国科学家的评论文章,呼吁建立国际微生物组计划。“想搞清楚微生物如何影响人和地球的健康,需要启动一个《国际微生物组计划》。”中国上海交通大学生命学院教授赵立平、美国威斯康星大学麦迪逊分校动物学教授玛格丽特和德国马普海洋微生物学研究所教授妮科尔认为,
分子植物卓越中心等提出“农业精准微生物组”概念
10月7日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心王二涛研究组和深圳华大生命科学院合作,在《自然-通讯》(Nature Communications)上,发表了题为GWAS, MWAS and mGWAS provide insights into precision agriculture bas
Nat-Commun:研究发现数学指数能预测健康微生物组
是什么导致某些人更容易患类风湿性关节炎,癌症和代谢综合症等慢性疾病?在肠道微生物组中或许可以帮助揭示其中的主要线索。 近日,梅奥诊所的研究人员开发了肠道微生物组健康指数。该指数将健康的微生物组与患病的微生物组区分开来。(图片来源:Www.pixabay.com) 在9月15日出版的《natu
权威期刊:微生物组学对于精准医疗不可或缺
来自美国芝加哥大学的科学家们,在11月1日的《Trends in Pharmacological Sciences》发表的一篇评论文章认为,微生物组学研究,对于未来的精准医疗项目是不可或缺的。《Trends in Pharmacological Sciences》 是美国著名出版集团Cell Pre