全球最大的海洋微生物组数据库建立

9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等领域有了广泛的应用,这些应用大部分源自陆地微生物的长期研究开发,而占地球表面积70%以上的海洋中蕴含的微生物资源却尚未得到充分开发。近20年来,海洋探采技术、高通量测序技术以及宏基因组学研究日新月异,海洋微生物测序数据呈现爆炸式增长,海洋微生物功能基因和功能酶资源的开发应用有望取得重大突破,推动我国生物经济的技术创新和产业升级。 研究团队对目前已公开的近240 Tb海洋微生物宏基因组数据进行重分析,构建了包含超过4.31万个海洋微生物基因组和24.58亿条基因序列的大型数据库,深度揭示了海洋微生物的物种多样性,并成功发现多种PET塑......阅读全文

全球最大的海洋微生物组数据库建立

9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。该成果在《自然》报道   山东大学供图微生物已在生物制造、

全球最大的海洋微生物组数据库建立

  9月4日,《自然》在线发表中外科学家的合作成果,该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗菌肽等重要基因资源。山东大学微生物技术国家重点实验室教授李盛英为文章共同通讯作者,助理研究员刘琨为文章共同第一作者。  微生物已在生物制造、生物医药、生物农业、环境治理等

解码“基因宝藏”:最全海洋微生物基因数据库出炉

9月4日晚,华大生命科学研究院(简称“华大”)联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构,在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源

最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现

迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析,可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日,相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道,2021年,研究人员构建了一个目录,其中包含约3亿组陆地微生物和海洋微生物的基因。现在,沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大

最大的海洋微生物基因数据库有助于药物发现

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今对包括细菌、病毒和真菌在内的海洋微生物基因进行的最全面分析,可为研究人员发现抗生素、追踪气候变化影响和保护濒危物种奠定基础。1月16日,相关成果发表于《科学前沿》。据《自然》报道,

中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库

9月4日,国际顶级期刊《自然》(Nature)在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具、抗

中外科学家合作建立全球最大海洋微生物组数据库

  9月4日,国际顶级期刊《自然》(Nature)在线发表中外科学家的合作成果“ Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting ”。该成果建立了全球最大的海洋微生物组数据库,从中发掘塑料降解酶、基因编辑工具

全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

什么是海洋微生物?

定义1:分布在海洋中的个体微小、形态结构简单的单细胞或多细胞生物。所属学科:水产学(一级学科);水产基础科学(二级学科)定义2:海洋中个体微小,构造简单的低等生物的总称。包括细菌、放线菌、霉菌、酵母、病毒、衣原体、支原体、噬菌体和微型藻及微型原生动物等。所属学科:资源科技(一级学科);海洋资源学(二

我国首次发布海洋化合物数据库

3日,在青岛举行的“2018年全球海洋院所领导人会议”上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗发布了海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库。这是我国首次正式发布海洋化合物数据库。 管华诗表示,海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结

我国首次发布海洋化合物数据库

昨日,在青岛举行的“2018年全球海洋院所领导人会议”上,青岛海洋科学与技术试点国家实验室学术委员会主任、中国工程院院士管华诗发布了海洋试点国家实验室海洋天然产物三维结构数据库。这是我国首次正式发布海洋化合物数据库。 管华诗表示,海洋是一个巨大的药源宝库,迄今为止,人们已经发现了约3万个结

窥探海洋微生物的世界

   “大多数浮游生物种群沿纬度呈多样性梯度分布,最靠近两极的生物多样性最低。”  “微生物多样性及其基因表达在海洋微生物群落对不同地理环境变化的响应中发挥着不同的作用。”  近日,发表在《细胞》上的两篇论文利用塔拉海洋考察期间收集的样本和数据,分析了目前地球上的海洋生命多样性,为更好地了解气候变化

模拟海洋微生物生态系统创建仿生海洋电池

  生物光伏是一种绿色的太阳能发电技术,合成微生物组正逐渐成为生物光伏新的发展形式。具有光电转化功能的海洋微生物生态系统,可以视为一个由太阳能充电的“海洋电池”。位于水柱层透光区的光合微生物,通过光合作用吸收太阳能固定二氧化碳,把电子存储到有机质中;位于沉积层的两类异养微生物(初级分解者和终端消费者

变暖威胁产氧海洋微生物

  美国科学家研究显示,在中等和高升温情景下,原绿球藻——地球上最小、最丰富的光合生物以及一种重要的产氧生物,在热带海洋的种群规模到2100年或最多缩小51%。研究结果基于穿过太平洋船舶采集的十年期数据,提示这些细菌面对气候变化时可能比之前认为的更脆弱。相关研究9月8日发表于《自然-微生物学》。  

海洋微生物的主要特征

嗜盐性海洋微生物最普遍的特点。真正的海洋微生物的生长必需海水。海水中富含各种无机盐类和微量元素。钠为海洋微生物生长与代谢所必需此外,钾、镁、钙、磷、硫或其他微量元素也是某些海洋微生物生长所必需的。 嗜冷性大约90%海洋环境的温度都在5℃以下,绝大多数海洋微生物的生长要求较低的温度,一般温度超过37℃

全球最大数字微生物数据库建成

  来自爱尔兰、法国和意大利的科学家携手,成功构建了全球最大的数字微生物库——“阿波罗”(APOLLO)。“阿波罗”囊括了247092个计算模型,其中包含迄今为止最全面的人体微生物组计算模型,有望增进科学家对人体微生物组及其对健康影响的理解。相关论文发表于最新一期《细胞系统》杂志。  研究团队重点关

用海洋微生物种植新鲜蔬菜

  7月12日,“向阳红03”船奔赴太平洋执行中国大洋45航次科考任务。长时间出海,能否吃到足够的新鲜蔬菜对人的健康十分重要。令科考队员们欣喜的是,在本航次中,国家海洋局第三海洋研究所最新的“基于海洋微生物特殊功能的新型栽培基质的研究”,或许能为船员们带来口福。   远洋航行期待“一抹绿”   

快速检测海洋微生物有新招

近日,海南大学南海海洋资源利用国家重点实验室研究员万逸带领的海洋微生物传感团队,在海洋微生物快速检测技术方面取得了一系列突破性新进展。相关成果发表在《化学综述》上。 该团队设计研发的FORBID荧光光电微生物检测仪基于上述研究成果,结合实验室优化的检测方法,以海洋病原微生物为靶标,通过实现海洋微

南海海洋所在海洋微生物次级代谢产物研究中取得进展

  在海洋生态系统漫长的演化过程中,海洋微生物形成了适应严酷生存环境的独特机制,进化出基因型、代谢途径和生理生态功能的多样性,蕴藏着大量新颖的次级代谢产物。近十年来,海洋微生物逐渐成为药物研发的新源泉。   2009年开始,在中国科学院生物局工业生物技术领域重要方向项目“南海海洋工业微生物的资源开

海洋所孙超岷团队:发现可以“吃”塑料的海洋微生物

孙超岷团队成员正在研究“吃”碎片的海洋微生物。海洋微生物对聚酯型聚氨酯的降解图示。  仅仅一年时间,深耕海洋微生物研究的中国科学院海洋研究所孙超岷课题组就接连获得两项重大科研进展。“2021年,我们首次发现能有效降解塑料垃圾的海洋微生物菌群。今年,我们再次发现并培养出‘升级版’海洋微生物,不仅能有效

中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库

青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。 现在,中国科学家构建的

中国科学家建立全球首个冰川微生物数据库

  青藏高原被称为世界“第三极”和“亚洲水塔”。除南北极外,它是全球最大的冰川分布区,现有冰川2万条以上,面积超过2万平方公里,也是我国及亚洲20亿人赖以生存的十多条大江大河的源头。青藏高原冰川是微生物的天然存储器,封存了不同历史时期的微生物。   现在,中国科学家构建的全球首个青藏高原冰川微生物

细胞和基因技术有望揭开海洋微生物之谜

  全球50%的氧气都是由海洋微生物产生。然而,这些微小的海洋生物在很大程度上仍然是科学界的一个谜。4月6日发表在《自然—方法学》的研究称,在全球100多名研究人员的努力下,科学家们找到了一种通过细胞和基因技术解开部分海洋生物细胞基因组的方法。添加到海洋原生生物(左)的基因在荧光显微镜下显示为绿点(

首个海洋微生物农药实现产业化

  华东理工大学教授李元广团队和国家海洋局第一海洋研究所、上海泽元海洋生物技术有限公司等单位共同创制的海洋微生物农药,近日获得国家颁发的生产批准证,成为国内外第一个利用海洋微生物为生防菌的海洋微生物农药。  青枯病等土传病害素有“植物癌症”之称,常常造成一些茄科植物虽开花但无收获的结局。这种名叫“1

促进海洋极端微生物在发酵食品中应用

  2017年5月3日,中国轻工业联合会组织有关专家对江南大学、大连工业大学、江苏恒顺醋业股份有限公司和会稽山绍兴酒股份有限公司共同完成的“海洋极端微生物在传统发酵食品中的应用”项目进行了科技成果鉴定。  鉴定会由中国轻工业联合会朱业耘处长主持,会议首先通过了鉴定委员会专家组名单,推荐中国工程院院士

-Nature:探秘海洋微生物的化学多样性

  来自细菌的几乎所有药物和候选药物,都是由少数几组代谢丰富的生物产生的。这使得那些占绝大多数的、不能培养或没有培养出的微生物成为一个基本上未被开发利用的资源。   Jrn Piel及同事在本文中报告,他们利用单细胞和元基因组分析识别出两个潜在的“环境工厂”,二者都是候选属Entotheone

微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展

中国科学院计算机网络信息中心大数据技术与应用发展部与中科院微生物研究所等,在微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展,提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法,可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和ZL等多源异构数据映射至资源描述框架(RDF),并构建了基于语义网框

海洋所海洋微生物抗感染药物的生物合成研究获新进展

  替达霉素(Tirandamycins)含有2,4-吡咯烷二酮和双环缩酮两个特征结构单元,能够跟细菌RNA聚合酶结合,从而抑制细菌转录过程中链的起始和延伸,产生抗菌活性(对耐甲氧西林葡萄球菌和耐万古霉素的粪肠球菌也有抑制作用);替达霉素还选择性地抑制马来布鲁线虫天冬氨酰-tRNA合成酶的活力,杀虫

解码-“基因宝藏”!科学家揭示海洋微生物基因资源利用潜力

  9月5日,记者在“千种海洋生物基因测序项目”暨全球海洋微生物基因库建设及应用成果联合发布会上获悉,华大生命科学研究院联合山东大学、英国东安格利亚大学等机构,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现大量具有应用潜力的基因资源。该研究为开发抗菌肽、新型基因编辑工具、PET塑料降解酶等提

海洋腐蚀微生物检测技术研发取得新进展

检测技术研发取得新进展 日前,国际期刊《先进材料》刊发中国科学院海洋研究所在海洋腐蚀微生物检测技术研发方面的最新研究成果。铜绿假单胞杆菌(P. aeruginosa)是一种常见的海洋腐蚀微生物,快速、精准检测P. aeruginosa的技术开发对于腐蚀环境评估、预测具有重要的价值。具有高熵材料制备中