微生物组测序分析的一大问题
BMC Biology杂志上的一项研究指出，许多已发表的微生物组研究其实受到了污染，错误的报告了来自于环境的杂菌。研究人员认为，在临床样本中检测到出人意料的细菌时，不应过早将其于疾病联系在一起。 我们机体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。微生物组参与了许多重要的机体功能，比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。就算在微生物数量较少的机体区域，菌群改变也被认为与疾病的发展有关，比如肺部的慢性阻塞性肺病和哮喘。 日新月异的DNA测序技术推动了微生物组研究的快速发展。然而，Wellcome Trust Sanger研究所的科学家们发现，DNA提取试剂盒、化学试剂和实验室环境中的杂菌很容易造成污染，影响微生物组分析的结果。 研究人员发现，没有污染的话对照样本应该只有一种菌，但有时却出现了270种不同的细菌。与高生物量的样本相比（粪便样本），来自血液或肺部的低生物量样本尤其容易受到污染。 “现在的DNA测......阅读全文
研究发现塑料际微生物组可应对复合污染
广东省科学院生态环境与土壤研究所研究员孙蔚旻团队在国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的资助下，研究揭示了重金属污染塑料际微生物组对塑料矿化和重金属抗性的代谢多功能性。近日，相关成果发表于《水研究》（Water Research）。塑料与重金属作为常见环境污染物，在水生环境中常相互作用，这会使重
空间转录组测序样本准备指南
现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究，所以在样本冻存前至少10分钟，将异戊烷和液氮浴准备好（之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻，是因为液氮沸点比较低，直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴，导致不同区域降温不同步而改变内部形态，甚至组织碎裂）。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到异戊
空间转录组测序样本准备指南
现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究，所以在样本冻存前至少10分钟，将异戊烷和液氮浴准备好（之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻，是因为液氮沸点比较低，直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴，导致不同区域降温不同步而改变内部形态，甚至组织碎裂）。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到
代谢组学样本收集答疑解惑
样本收集是代谢组学研究的第一步，是保障代谢组学研究结果可靠性的最重要的环节之一。根据不同的研究目的该选取何种生物样本？不同种类的生物样本的规范收集流程是什么？有哪些注意事项（抗凝剂、冻融、抑菌剂等使用细节）？如何保存生物样本？可保存多久等等？这些都是代谢组学实验中小伙伴经常咨询的问题，本文将针对
空间转录组测序样本准备指南
一、外泌体研究热度持续攀升 外泌体（exosome）是活细胞分泌的30-200nm的囊泡，在电镜下具有非常明显单层膜结构，通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体，经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体，
病原微生物样本的采集
传染病实验室诊断、传染源调查、自然疫源地监测、流行病学调查研究，都以检出特定的病原微生物或其相关物质为目的。这类样本来源主要是人和宿主动物、媒介昆虫，也包括水、土壤、食品等样本供调查传染源。1、病原微生物样本采集的一般注意事项1）针对性：不要求样品代表性，强调针对性，尽可能采集病原微生物含量最多的部
实验样本被污染如何处理？
(1)空气收集器未经质量验收,空气收集器的本底值较高,影响检测结果。如用于采集钠等金属元素的微孔滤膜中可能会含有微量的钠等金属,采样后,可能会出现样品空白的吸光度高于样品吸光度的现象,使得检测结果为负值。(2)空气收集器未清洗干净,使得样品空白值高于实验室空白。(3)采样过程不规范,导致样品空白值异
如何避免核酸检测的样本污染？
进行 PCR 反应时，遵照下列规则有助于防止 PCR 的污染。（1）PCR 的前处理和后处理在不同的房间或不同的隔离工作台上进行。即整个 PCR 操作要在不同的隔离区（标本处理区，PCR 扩增区，产物分析区）进行，特别是阳性对照需在另一个隔离环境中贮存、加入。（2）试剂要分装，每次取完试剂后盖紧
微生物污染的污染途径
微生物污染常见的是空气的微生物污染和水的微生物污染。空气虽然不是微生物产生和生长的自然环境,没有细菌和其他形式的微生物生长所需要的足够的水分和可利用的养料, 但由于人们的生产和生活活动使空气中可能存在某些微生物, 包括一些病原微生物如结核杆菌、白喉杆菌、金葡菌、流感病毒、麻疹病毒等,可成为空气传播疾
卫生指标微生物样本的采集
1、卫生指标微生物样本采集的一般注意事项1）代表性：采样量、采样部位应依据检样归属类别的标准要求执行，注意采用随机抽样法，并按批号抽样。2）均匀性：固体粉末样品应边取边混合；液体样品应振荡混匀；涂抹取样的棉拭子应将棉拭子尾部剪断，投入稀释液内充分振荡后，作为原液检样。3）及时性：为避免样品变质和样品
美公布禽流感样本被污染原因
美公布禽流感样本被污染原因 由于一位联邦科学家劳累过度并急着召开实验室会议，一个低致病性禽流感病毒样本不慎被高致病性H5N1禽流感病毒感染。这是近日美国疾病控制与预防中心（CDC）发布的内部报告得出的结论。 在3月发生的事故中，一个隶属于CDC的流感实验室将低致病性H9N2禽流感病毒
消除微生物污染
实验方法原理通过冲洗单层培养物或通过离心重悬非贴壁细胞，以高浓度抗生素清洗培养物数次，然后将培养物传代，用加抗生素的培养基传三次，再用不加抗生素的培养基传三次，每次传代后都要检测是否污染。实验材料DBSS
消除微生物污染
实验方法原理 通过冲洗单层培养物或通过离心重悬非贴壁细胞，以高浓度抗生素清洗培养物数次，然后将培养物传代，用加抗生素的培养基传三次，再用不加抗生素的培养基传三次，每次传代后都要检测是否污染。实验材料 DBSS试剂、试剂盒 高浓度抗生素培养液仪器、耗材 用于传代培养的材料带有40×或60×物镜的相差显
消除微生物污染
实验方法原理通过冲洗单层培养物或通过离心重悬非贴壁细胞，以高浓度抗生素清洗培养物数次，然后将培养物传代，用加抗生素的培养基传三次，再用不加抗生素的培养基传三次，每次传代后都要检测是否污染。实验材料DBSS试剂、试剂盒高浓度抗生素培养液仪器、耗材用于传代培养的材料带有40×或60×物镜的相差显微镜用于
微生物污染的概念和污染来源
微生物污染是指由细菌与细菌毒素、霉菌与霉菌毒素和病毒造成的动物性食品生物性污染。微生物污染包括细菌性污染、病毒和真菌及其毒素的污染。据世界卫生组织估计,在全世界每年数以亿计的食源性疾病患者中,70%是由于食用了各种致病性微生物污染的食品和饮水造成的。微生物污染也是主要传染性疾病的源头。当前有20%的
微生物污染的种类
微生物污染包括有害微生物污染、病原微生物污染和微生物毒素污染三种类型。有害微生物污染因环境条件变化打破了正常的生态平衡体系,抑制一些微生物生长而促进另一些微生物旺长,形成了不同于正常微生物群落结构的有害微生物群落,改变原来的生态功能,造成了环境质量的恶化,直接或间接地影响其他生物的生存。与另外两种类
微生物所发表中国微生物组数据平台
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在线发表中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心马俊才团队题为gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
“豹纹”岩芯样本或为火星远古微生物新证据
美国航天局官网日前发布消息说，美国“毅力”号火星车近日在火星耶泽罗陨石坑附近采集到一块带有“豹纹”的独特红色岩芯样本。科学团队初步分析认为，这种“豹纹”可能表明火星远古时期曾存在微生物。本月21日，“毅力”号火星车在探索火星内雷特瓦河谷北部边缘时采集到这块箭头形状的岩芯。它是“毅力”号采集到的第22
微生物污染的排除实验
实验方法原理 细胞培养中用抗生素是杀灭微生物的主要手段；但迄今尚无对抗支原体特效抗生素。各种抗生素性的性质不同，联合应用比单用效果好；一般在已发生微生物污染后，再使用抗生素，常难以根除．预防性应用比污染后使用更好。有时抗生素仅对细菌有抑制作用，而无杀灭效应；反复使用抗生索还能使微生物产生抗药性，且对
食品微生物污染控制（一）
食品加工可以利用水分活度、pH、化学物质及包装来控制病原体生长。而对食品加工来讲，通过控制病原体所需的营养成分，则难以达到目的，因为除特别情形之外，大多数食品为病原体生长产提供了充足的营养。我们还是集中精力通过水分活度、pH、化学物质及包装控制病原体生长。 通过分别控制食品中水分活度和p
关于微生物污染的控制
酶反应器不需要在完全无菌条件下进行，但仍需要控制微生物污染。因为微生物污染会降低酶反应器的生产效率和降低产品质量，不仅会堵塞反应柱，还能使固定化酶活性载体降解，它们产生的酶和代谢物会使产物降解和增加反应副产物，减少产物的产出，增大产物分离难度。因此，应采取适当的方法对底物进行灭菌，酶反应器每次使
食品微生物污染控制（二）
某些微生物生长温度范围如下表： 1、冷藏库 冷藏温度对控制致病菌的生长确实起到了很好的作用，但是一些病菌比如：李斯特菌和耶尔森氏菌在接近冻结点时仍可以生长。冷藏在减慢食品变质、氧化酸败和导致其它质量缺陷的生物的、化学的变化过程方面具有显著作用。 2、时间/温度 食
Nature聚焦微生物组的家
人体内充满了微小的微生物，这些成百上千的细菌物种被统称为微生物组(microbiome)，人们认为它们有助于人体的健康与生存。胃肠道，尤其是结肠是最高密度和最高多样性细菌物种的家园。然而由于食物和流体的通过，这一系统不断发生变化，这些生物体是如何能够存留于其中并旺盛生长的呢? 由加州理工大
国际人类微生物组联盟启动
经过近3年的酝酿和筹备，以解析人类共生微生物与健康关系为目标的国际人类微生物组联盟(IHMC)近日在德国海德堡宣布成立。来自美国国立卫生研究院(NIH)、欧盟委员会，以及中国、日本等9个国家的科学家出席成立大会并交流了各自的计划和进展。 基因与环境相互作用决定人体健康，目前大量的研究都集中在分析人
Cell：微生物组的确影响免疫
麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划（HFGP）的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。 人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等
Cell：微生物组的确影响免疫
麻省总医院MGH、Broad研究所与荷兰的两家医学研究中心在Cell杂志上发表了人类功能基因组计划（HFGP）的重要研究成果。他们通过三项研究揭示了基因、微生物组和环境对免疫应答的影响。人类消化道中居住着大量的微生物，它们被统称为肠道微生物组。肠道微生物组在人类代谢食物、抵御感染和应答药物等过程中起
Nature：揭秘地球微生物组计划
地球微生物组计划（Earth Microbiome Project）的目标是尽可能多地对地球微生物群落进行取样，以便促进人们对微生物及其与包括植物、动物和人类在内的环境之间的关系的理解。这一任务需要来自世界各地的科学家的帮助。到目前为止，这一计划已覆盖了从北极到南极的七大洲和43个国家，而且有超
油类有机污染物样本的采集和保存原则
油类物质要单独采样,不允许在实验室内再分样。采样时,应连同表层水一井采集并在样品瓶上做一标记,用以确定样品体积。每次采样时,应装水样至标线。当只测定水中乳化状态和溶解性油类物质时,应避开漂浮在水体表面的油膜层,在水面下20~50 cm处取样。当需要报告一段时间内油类物质的平均浓度时,应在规定的时间间
乌鲁木齐市大气污染治理成全疆样本
近日，新疆维吾尔自治区环保厅召开全区环保系统电视电话会议，对今年以来环保工作进展情况进行了总结，并部署了今年第四季度环保重点工作。 自治区环保厅党组书记孙昌华提出四季度重点环保工作。乌鲁木齐联防联控区域内昌吉、阜康、五家渠三城市要认真学习借鉴乌鲁木齐市大气污染治理工作的经验做法，制定出台各
测序基因组勘探食品污染
上周，两家公司因李斯特菌食品感染发令召回其所有产品。Sabra Dippin召回30,000例鹰嘴豆泥制成的食品，至今疾病防治中心未发现因食用该公司食品造成的食物中毒或死亡的病例。然而，堪萨斯州的蓝铃冰激淋工厂（Blue Bell Creameries）已确认有少量食品原料已感染李斯特菌，目