植物所在植物光形态建成转录调控方面取得进展

转录调控是生物体内由转录因子和其他调节蛋白协同或拮抗调控基因表达的重要生化机制。光信号是高等植物早期生长发育中光形态建成的决定性因素,其信号通路中光敏色素互作因子PIF为负向调控因子,HY5为正向调控因子。PIF和HY5分别是bHLH型和bZIP型转录因子,在植物生长发育及环境响应中具有广泛的功能,然而二者之间的相互调节仍不甚清楚。 中国科学院植物研究所林荣呈研究组通过对模式植物拟南芥开展研究,发现B-box型蛋白家族第四亚家族成员BBX23能够促进红光、远红光和蓝光条件下的光形态建成。进一步研究显示,在转录水平上,PIF1和PIF3蛋白能够直接结合到HY5和BBX23的启动子并激活它们的表达;在翻译后水平上,BBX23蛋白在黑暗下受到COP1介导的泛素化降解。研究同时表明,BBX23通过与HY5相互作用被招募到下游光响应基因的启动子上,并与HY5协同调控下游基因的表达。研究人员还发现,BBX23的转录受到光的抑制,而它的......阅读全文

版纳园研究揭示转录因子WRKY57调控拟南芥干旱耐受能力

  干旱是限制农作物产量和品质的重要环境因子之一,但是植物对干旱耐受性的潜在分子机制却仍不清楚。据报道,WRKY转录因子在植物适应非生物胁迫过程中起着重要的作用。WRKY蛋白质是一个转录调控因子大家族,在拟南芥中有74个成员,大量研究证实,WRKY基因家族各成员参与调控植物的抗逆反应及其信号转导途径

水稻双重活性转录因子可调控细胞死亡和抗病性

  近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队首次报道植物bZIP类型转录因子APIP5具有结合DNA和RNA的双重活性,在转录和转录后水平调控水稻细胞死亡和防御反应的新机制。研究论文发表于Nucleic Acids Research(《核酸研究》)。  稻瘟菌侵染引起的稻

研究揭示转录后调控的体细胞同义突变在癌症中的作用

  1月17日,中国科学院北京生命科学研究院孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)发表了题为Prevalence and architecture of posttranscriptionally impaired synonymo

揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制

  结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。  近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛

研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

NAT-NEUROSCI转录组+蛋白组联合揭示microRNA调控靶点功能机制

  基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功

研究发现自然杀伤细胞促进胚胎发育的转录调控新机制

  中国科学技术大学免疫学研究所教授魏海明、傅斌清和田志刚课题组合作研究发现,蜕膜自然杀伤细胞(NK细胞)高表达转录因子PBX1,能够增强生长因子转录,促进胚胎发育;NK 细胞 PBX1 功能异常与不明原因复发性流产病因存在相关性。研究成果于4月1日以PBX1 Expression in Uteri

中国热科院揭示木薯块根淀粉代谢转录协调调控的分子机制

近日,中国热科院生物所功能基因组与分子育种研究团队在木薯块根淀粉代谢转录协调调控方面取得重要进展。研究结果揭示了碳水化合物相关途径/基因的协调调控对淀粉木薯和糖木薯淀粉积累差异的重要贡献,为薯类作物淀粉遗传改良提供了重要理论支撑。木薯是一种重要的淀粉块根作物,为全球食品和非食品工业提供了重要原材料。

转录组+蛋白组联合,揭示microRNA调控靶点与功能机制-一

基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神

揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性

  m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所

南京大学、北大Cell子刊揭示转录后调控新机制

  来自南京大学、北京大学医学部的研究人员证实,在心脏发育过程中RHAU介导了对Nkx2-5的转录后调控。这一研究发现发布在10月15日的《Cell Reports》杂志上。  南京大学的杨中州(Zhongzhou Yang)教授和北京大学医学部的王文恭(Wengong Wang)教授是这篇论文的共

版纳植物园转录调控因子Alfinlike基因家族研究获进展

  通过比较基因组学,在基因组层次上研究特定基因家族的进化,进而揭示其变化的原因和机制,已成为目前进化生物学关注的热点问题。中科院西双版纳热带植物园生态进化生物学研究组研究人员利用模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及其近缘物种琴叶拟南芥(A. lyrata)和小盐芥(Th

研究发现调控杨树生长发育及耐盐性的转录因子

  近日,山西农业大学林学院林木分子遗传育种创新工作室在《经济作物和产品》(Industrial Crops and Products)接连发表了两项研究成果。研究发现,热休克因子PagHSF4和乙烯响应因子ERF194,在介导杨树发育过程、环境胁迫适应等方面发挥着重要作用。  植物由于自身生长的固

上海生科院发现转录中介体在表观遗传学调控新功能

  生命对遗传密码的解读遵循“中心法则”,首先是细胞能够对基因中的遗传密码进行“阅读理解”,即将DNA分子“转录”产生RNA分子,进而将RNA分子“翻译”为蛋白质,才能实施各种生命活动。在控制基因“转录”的众多因子中,有一种重要的蛋白复合物叫“中介体”。中介体复合物担当了转录因子与基础转录机器之间的

烟草转录调控因子WRKY基因家族基因功能分析取得进展

  大量研究工作证实,植物WRKY基因家族的主要生物学功能是调控植物抗病反应及其信号转导途径的建立。WRKY转录调控因子在植物的抗病性方面,如抗病毒、抗细菌、抗机械伤害等方面参与了植物对逆境的应答反应,对高盐、干旱、高温、低温等非生物逆境因子的抗性也具有重要作用,这些对于一生保持原地不

最新进展:胰岛素基因转录调控通路进化取得进展

  5月25日,Nature Communications以Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals为题,在线报道了中国科学院海洋研究所

揭秘m6A修饰新功能----调控染色质状态和转录活性

  文章导读   m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。   2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院

转录组+蛋白组联合,揭示microRNA调控靶点与功能机制-二

4.转录组、蛋白组揭示miR-137调控底物。蛋白组结果发现:Mir137–/–组versus Mir137+/+组, Mir137+/–组versus Mir137+/+组, and Mir137–/–组versus Mir137+/–组,分别筛选到417、94和76个差异表达蛋白。这些蛋白与

武汉植物园等长链非编码RNA调控基因转录研究获进展

  长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)一般指长度大于200个核苷酸的非编码RNA,目前已在多种生物中发现了大量lncRNA,然而只有少数lncRNA的精细作用机理被阐明。   中国科学院武汉植物园汪志伟博士在植物种群遗传学科组王艇研究员支持和中国科学院留学

中国科学家揭示热纤梭菌转录调控因子新机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/510487.shtm

营养所研究揭示胰岛素转录和分泌调控的新机制

  近日,国际期刊Diabetes 在线发表了中科院上海生命科学研究院营养所翟琦巍研究组的研究论文WldS enhances insulin transcription and secretion via a SIRT1-dependent pathway and improves

华南植物园关于植物转录起始调控机制的研究获进展

  转录复合体将DNA转录为RNA,是遗传信息由细胞核向细胞质转递的基础。由于核小体与基因组的紧密结合,转录复合体需克服核小体障碍进而确保功能基因的表达。染色质重塑复合体(Chromatin Remodeler)被认为在转录过程中发挥了重要作用。这类蛋白复合体能通过水解ATP来调控核小体的组成和分布

遗传发育所等发现基础转录因子可以特异调控脂类代谢

  脂肪是生物体主要的能量储存形式,脂肪能量代谢与多种人类重大疾病(肥胖、糖尿病、癌症等)密切相关。细胞内的脂肪主要储存在脂滴(Lipid Droplet)中。脂滴的大小和动态调控与细胞的功能和代谢状态息息相关。前人的研究在不同模式系统中发现了许多影响脂类储存和脂滴动态变化的分子机制,但是人们对脂类

转录中介体MED23亚基在色素合成和DNA修复的调控机制

  近日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所王纲研究组的研究成果以Mediator MED23 Links Pigmentation and DNA Repair through the Transcription Factor MITF为题在线发表在Cell Reports上。

生物物理所揭示致瘤疱疹病毒转录调控及病毒复制机理

  2015年5月,病毒学期刊Journal of Virology 以“亮点文章”形式发表了中国科学院生物物理研究所邓红雨课题组题为Murine Gammaherpesvirus 68 ORF48 Is an RTA-Responsive Gene Product and Functions in

由染色质调控的基因隐秘转录参与哺乳动物干细胞衰老

  细胞老化有其独特而明显的分子表型特征,但其诱导机制尚不完全清楚,基因隐秘转录 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隐秘转录现象是指基因在某些突变体中或应激情况下,开始从本应该被抑制的下游“类启动子 (promoter-like) ”区域起始转录,并产生与基因原功能不

生化与细胞所揭示转录因子KLF4调控早期T细胞分化定向

  11月22日,Cell Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘小龙研究组的研究成果Downregulation of the transcription factor KLF4 is required for the lineage commitment

复旦大学Science最新发文:揭示+1核小体调控转录起始机制

  作为基因表达调控的核心,转录起始过程发生在基因启动子区,通过染色质重塑复合物剔除核小体暴露出启动子, 允许转录起始复合物(preinitiation complex,PIC)的组装,在中介体(Mediator)的帮助下组装成PIC-Mediator转录起始超级复合物。我院徐彦辉团队在2020和2

南开大学团队揭示乙肝病毒转录复制调控新机制

HAT1调控HBV cccDNA微小染色体组装和表观修饰模式图  记者获悉,长期从事乙肝、肝癌研究的南开大学生命科学学院张晓东教授团队在乙肝病毒转录、复制调控机制方面有了新突破。日前,他们在生物医学领域学术期刊《Theranostics》上发文,首次报道了“组蛋白乙酰转移酶HAT1信号通路促进HBV

基于转录调控因子的2羟基戊二酸生物传感器

   2-羟基戊二酸(2-Hydroxyglutarate,2-HG)是2-酮基戊二酸(2-Ketoglutarate,2-KG)的结构类似物,存在两种手性异构体L-2-HG和D-2-HG。2-HG可抑制多种2-KG依赖性双加氧酶、转氨酶的活性,通过抑制抑癌基因活性、改变细胞表观遗传水平等方式,引起