NATNEUROSCI转录组+蛋白组联合揭示microRNA调控靶点功能机制
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功能的损伤进行了评价。借助于转录组+蛋白组联合分析,研究者进一步鉴定出phosphodiesterase 10a(Pde10a)是miR-137的重要调控靶点。 文献小笔记 Partial loss of psychiatric risk gene Mir137 in mice causes repetitive behavior and impairs sociability and learning via increased Pde10a Nature Neuroscience IF=19.912 原文链......阅读全文
NAT-NEUROSCI转录组+蛋白组联合揭示microRNA调控靶点功能机制
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功
转录组+蛋白组联合,揭示microRNA调控靶点与功能机制-二
4.转录组、蛋白组揭示miR-137调控底物。蛋白组结果发现:Mir137–/–组versus Mir137+/+组, Mir137+/–组versus Mir137+/+组, and Mir137–/–组versus Mir137+/–组,分别筛选到417、94和76个差异表达蛋白。这些蛋白与
转录组+蛋白组联合,揭示microRNA调控靶点与功能机制-一
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时,miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是,miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能,该研究构建了miR-137 KO动物,并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神
Nat-Neurosci:研究揭示中风的分子机制
巨噬细胞作为先天免疫系统的一部分,对大脑发育和功能至关重要。近日,来自耶拿大学医院,波恩大学和纽约纪念斯隆·凯特琳癌症中心的科学家使用一种新颖的方法成功地“看见”了在骨髓中形成的巨噬细胞。利用这项技术,研究人员能够观察到小鼠在中风后不久血液中出现大量迁移的巨噬细胞,它们开始攻击死亡的脑细胞以及邻
Nat-Commun-|-蛋白质组学揭示病毒性肝癌治疗靶点
发性肝癌是一种高度异质性肿瘤。其组织学病理分型可分为肝细胞肝癌、肝内胆管细胞癌和混合型肝癌三种类型。在亚洲,乙型肝炎病毒(HBV)或丙型肝炎病毒(HCV)感染在肝细胞癌的发生发展中起主要作用。在西方,酒精性肝病和非酒精性脂肪性肝炎是更普遍的驱动因素。尽管阿替利珠单抗联合贝伐单抗一线治疗晚期肝癌取
冯银刚课题组揭示新细菌转录调控因子的结构功能机制
近年来,在一些梭菌和杆菌中发现一类广泛存在的σ因子及其共转录的抗σ因子——SigI和RsgI,它们的一些结构域和已知蛋白没有同源性,代表了一类新的特殊的细菌σ/抗σ因子。热纤梭菌等一些产纤维小体细菌具有8-16对的SigI/RsgI因子,这在其他已知类型的σ/抗σ因子中比较少见。已有的研究表明这
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制(一)
2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Circ
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制(二)
3. 环状RNA的差异表达与前列腺癌的进展有关研究者对144个前列腺癌进行了聚类分析,与线性RNA相比,环状RNA最强模式与它们在每个样本中的总体丰度相一致。另外,极端circRNA分布的患者的预后明显较circRNA分布稳定的患者差,同时极端circRNA index组也与更高的转移发生率
Nature-Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制
m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰,其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶(writer)、结合蛋白(reader)以及去甲基化酶(eraser)的动态可逆调控。研究表明,m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动,参与调控机体的诸多生理或病理进程,包
研究揭示纤维小体转录调控因子的结构功能机制
纤维小体是一类可以高效降解木质纤维素生物质的多酶复合体,在生物质能源与合成生物学中具有广泛的应用价值。产纤维小体细菌根据底物种类调控纤维小体组分的表达,从而实现对特定底物类型的高效降解。在典型的产纤维小体细菌热纤梭菌中,一类特殊的σ和anti-σ因子SigI-RsgI负责感应底物并调控纤维小体基
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院,中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
m6A-RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成研究(二)
接着,作者对同类型样本进行了m6A CLIP测序,对三个样本分别进行motif分析后,发现三者共有将近有11,000个序列为GGACU的peaks(图5 c)。将peak分别于转录本和基因组比对后,发现与YTHDF1 CLIP的结果十分类似(图5 d,e)。对两次CLIP实验的peaks
Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制!
2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
《Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制
2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
Nat-Neurosci:科学家发现精神分裂症疗法的新靶点
近日,一篇发表于国际杂志Nature Neuroscience上的研究论文中,来自麻省理工学院的研究人员通过研究鉴别出了一种主要的遗传调节子,其或可帮助解释引发精神分裂症的错误大脑功能;相关研究或可帮助开发治疗因突触异常而引发的精神分裂症和其它疾病的新型策略提供一定的帮助。 信使RNA(mRN
Nat-Neurosci:科学家揭示大脑细胞稳定连接的分子机制
当我们出生时,我们的大脑并不是非常具有组织条理性,那时每一个大脑细胞都在同附近的细胞进行“交流”,它们通过突触来互相发送和接收神经信号。但是随着我们成长和学习,我们的大脑会变得更加稳定,此时低活性或者不充足的神经元突触将会被关闭。 但是其发生的原因和分子机制是什么?近日刊登在国际杂志Nat
如何预测microRNA的作用靶点蛋白
很多软件都可以预测miRNA作用靶点,如miRBase,PicTar,TargetScan,也可以做miRNA芯片
研究揭示microRNA定量调控规律
将系统生物学建模分析与合成生物学实验相结合解析microRNA 定量调控规律。 日前,清华大学的汪小我、谢震研究组,通过合成与系统生物学方法揭示microRNA定量调控规律。相关成果发布在《美国科学院院刊》上。 microRNA是一类短的非编码RNA,通过与靶RNA结合抑制靶基因表达,在动植物中
研究揭示代谢调控血栓形成的新机制和治疗新靶点
上海交通大学医学院刘俊岭课题组与孙海鹏课题组合作首次将支链氨基酸(BCAA)代谢与血小板功能和血栓风险建立紧密联系,揭示了一个全新的BCAA代谢调控血小板活化和血栓形成的机制。3月23日,该成果发表于《血液循环》。 由于摄入BCAA被广泛用于专业运动员和运动人士增肌营养物,BCAA注射剂被用于
代谢调控血栓形成的新机制和治疗新靶点被揭示
上海交通大学医学院刘俊岭课题组与孙海鹏课题组合作首次将支链氨基酸(BCAA)代谢与血小板功能和血栓风险建立紧密联系,揭示了一个全新的BCAA代谢调控血小板活化和血栓形成的机制。3月23日,该成果发表于《血液循环》。 由于摄入BCAA被广泛用于专业运动员和运动人士增肌营养物,BCAA注射剂被用于
科学家为非小细胞肺癌治疗提供新靶点
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499496.shtm肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一。基因突变是非小细胞肺癌发生发展和转移的重要因素。KRAS突变是非小细胞肺癌中最主要的基因突变之一,近年来针对KRAS G12C抑制剂的开发取得了突破性
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一,是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展,但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想,我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来,随着宏基因组测序等研究手段的不断进展,人们发现肠道菌群能广泛
健康所研究揭示microRNA参与狼疮炎症因子调控的机制
人类疾病往往是由于一些基因表达调控紊乱引起的。MicroRNA(miRNA)是近年来广为关注的重要的基因表达调控因子,在人类疾病的发生发展中起着重要作用。沈南教授领导的研究组整合上海交通大学附属仁济医院风湿科的临床优势和中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所的基础研究力量,近年
国人佳作惊艳时代风口!蛋白质组学2021科研成果汇编
蛋白质组学(proteomics)是指系统研究某一基因组所表达的所有蛋白质,包括组成蛋白质一级结构的氨基酸序列,蛋白质的丰度,蛋白质的修饰以及蛋白质之间的相互作用。蛋白质组(proteome)的概念最早在1994年由澳大利亚 Maquaire大学的一个学生 Marc wilkins 提出,蛋白质组被
新研究揭示动物断腿再生的转录调控机制
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518620.shtm
植物所揭示果实成熟的转录后调控机制
成熟是果实发育的重要阶段,伴随着颜色、香气及硬度等一系列变化。这一过程受到内外因素的共同调控,机制非常复杂。对果实成熟调控的有关机制开展研究,对于提高果实品质、优化贮藏保鲜技术具有很大的指导意义。近年来,有关果实成熟的转录调控已有较多报道,鉴定到多个重要的转录因子,对它们的作用机制也进行了较多研
新研究揭示动物断腿再生的转录调控机制
近日,华南师范大学生命科学学院教授李胜和研究员任充华合作,以美洲大蠊为研究对象对其肢体再生的转录调控机制进行解析,找到了两条(BMP/JAK-STAT-zfh-2-B-H2和Notch-drm/bowl-bab1)在再生过程中分别控制着前期基芽细胞增殖和中后期形态建成的转录级联通路。相关成果以长文(
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日,中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中,增
研究揭示白血病干细胞RNA表观遗传新机制
中山大学肿瘤防治中心研究员黄慧琳团队联合广州实验室研究员翁桁游团队,研究揭示了RNA乙酰化及其修饰酶N-乙酰基转移酶10(NAT10)通过重塑丝氨酸代谢驱动急性髓系白血病发生及干性维持的重要机制。相关成果近日在线发表于《自然-细胞生物学》(Nature Cell Biology)。论文共同通讯作者黄
Nat-Neurosci:研究揭示脑癌干细胞如何争夺营养
通过增强葡萄糖运输有关蛋白的表达,脑癌干细胞为争夺大脑内有限的营养提高了自身的竞争力。10月发表在《自然—神经科学》上的一项研究揭示了这些干细胞是如何能在营养相对缺乏的大脑中存活并繁殖的,并有助于进一步研发出针对这类癌症的疗法。 多形性胶质母细胞瘤(GBM)是成人脑肿瘤中最常见以及最致命的