研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高的修饰类型,广泛参与哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化以及肿瘤生成和转移等生命过程。然而,目前尚不清楚m6A是否能作为R-loop中RNA组分的本源特征来调控R-loop水平,进而发挥各种生物学功能。 中国科学院北京基因组研究所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文团队合作研究,发现m6A能稳定R-loop的形成,进而调控基因转录的有效终止。这一成果以m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination 为题于10月12日在线发表于《细胞研究》......阅读全文

研究揭示RNA甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

利用ssDRIPseqRNA揭示甲基化调控Rloop形成及转录终止机制

  R-loop是一种由RNA:DNA杂合链和单链DNA组成的特殊核酸结构,在原核和真核生物的基因组中分布广泛且普遍存在。R-loop在很多关键的生物学过程中发挥重要功能,包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等,但其如何被精确调控的机制尚不清楚。m6A修饰作为信使RNA上丰度最高

RNA甲基化调控基因出核新机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-

Nature-Plants文章:精准高通量检测Rloop分布的新方法

  来自清华大学生科院,清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥

研究发现RNA甲基化调控果实成熟的作用机制

  8月7日,《国家科学评论》(National Science Review)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所——马普计算生物学研究所徐书华团队的研究成果“Prioritizing natural selection signals from the deep-sequencing gen

植物所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制

  DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是两种重要的核酸修饰,在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而,这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日,中国科学院植物研究所秦国政研究组和田世平研究组合作,揭示了DNA甲基化可通过调节m6A去甲基化酶基因表达的方式影响番茄果

RNA甲基化研究

近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:

RNA甲基化测序

1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行

我国首次发现RNA甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟

  我国科研人员在国际上首次发现脊椎动物的配子成熟需要甲基转移酶mettl3催化的m6A甲基化修饰,从而揭开了该甲基化修饰可调控脊椎动物配子成熟这一此前尚未为人所知的秘密。(2018(第二届)模式动物与重大疾病动物模型研究与应用研讨会)  记者13日从中国科学院水生生物研究所了解到,该所科研人员以模

研究揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制

  m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一,但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。  中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究,发现m5C通过细胞

北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6A甲基化修饰调节mRNA选择性剪接规律过程中,发现了读码器YTHDC1通过招募前体mRNA剪接因子SRSF3同时抑制剪接因子SRSF10与RNA的结合,促进外显子被保留的分子机制。该研究结果于2016

同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平

  RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微量RNA甲基化测序技术,首发推出RNA甲基化研究一站式系统性解决方案,云

快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平

  占领C位!云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平   RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA

检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)

  云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上)   RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测

dna甲基化与rna甲基化的区别

DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点:都有包含甲基化修饰;不同点:修饰对象不同,一个是对DNA修饰,一个是对蛋白:组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解,与前两者差异较大。

研究揭示RNA甲基化调控斑马鱼母源mRNA稳定性机制

  斑马鱼母源-合子转换 (maternal-to-zygotic transition, MZT)过程伴随着母源RNA和蛋白质的降解以及合子基因组的激活(maternal-to-zygotic transition, ZGA)。已有研究表明多种关键因素通过母源和合子途径促进母源mRNA降解,其中包

同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)

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解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)

  云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上)   RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测

快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

RNA甲基化研究深度剖析

  一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?   1、高分文章频现   说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。

RNA甲基化促进草莓成熟

  果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分,对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成,受到精确调控。解析果实成熟调控机制,将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同,果实可分为两种类型:呼吸跃变型(如番茄、苹果、香蕉)和非呼吸跃变型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素

研究揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物细胞微环境维持机制

  近期,中国科学院西北生态环境资源研究院西北高原生物研究所研究员杨其恩课题组以小鼠为模型,揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持的新机制。  成体干细胞命运决定受到特殊微环境调控,在大多数组织中,微环境的形成和维持机制并不明确。精原干细胞是一类经典的成体干细胞,是哺乳动物精子发生的基

Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制

  肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发

精氨酸甲基化在RNA剪接和翻译全局调控中的关键作用

  7月15日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员王泽峰课题组在Science Bulletin上发表了题为A systematic survey of PRMT interactomes reveals the key roles of arginine methylation in the g

科学家揭示RNA甲基化调控实体瘤膀胱癌发生机制

  m5C修饰是mRNA上分布广泛的碱基修饰形式之一,但对于进入细胞质内的含有m5C修饰的mRNA的命运决定及其在生理和病理中的调控作用目前尚不清楚。  中国科学院北京基因组研究所杨运桂团队联合中山大学肿瘤医院周芳坚团队、谢丹团队和中科院生物化学与细胞生物学研究所黄旲团队合作研究,发现m5C通过细胞

北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能

4月2日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)任捷团队和杨运桂团队,在《分子细胞》(Molecular Cell)上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription

北京基因组所RNA-m6A甲基化调控mRNA剪切研究获进展

  6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最为丰富的甲基化修饰形式之一,发生于保守序列RRACH(R=G ,A; H=A,C or U)中,富集在mRNA的外显子编码区及3’-非编码区。类似于DNA甲基化修饰,RNA的m6A甲基化修饰也是可逆的,由

北京基因组所等发现RNA甲基化调控基因出核新机制

  中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究,揭示了m5C(5-甲基胞嘧啶)修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-

研究揭示RNA去甲基化酶的氧化还原修饰调控番茄果实成熟机制

活性氧作为重要的信号分子,在植物抵御病原菌侵染、响应逆境胁迫以及维持正常生长发育的多个生物学过程中发挥重要的调控作用。在多种活性氧分子中,过氧化氢具有较长的半衰期,可调控干细胞分化、花粉管伸长、气孔发育、果实成熟等植物发育过程,但过氧化氢如何与其他信号途径协同作用,共同调控植物发育过程却不甚清楚。中