转录组+蛋白组联合，揭示microRNA调控靶点与功能机制一
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时，miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是，miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能，该研究构建了miR-137 KO动物，并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功能的损伤进行了评价。借助于转录组+蛋白组联合分析，研究者进一步鉴定出phosphodiesterase 10a(Pde10a)是miR-137的重要调控靶点。文献小笔记Partial loss of psychiatric risk gene Mir137 in mice causes repetitive behavior and impairs sociability and learning via increased Pde10aNature Neuroscience IF=19.912原文链接：h......阅读全文
转录组+蛋白组联合，揭示microRNA调控靶点与功能机制－一
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时，miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是，miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能，该研究构建了miR-137 KO动物，并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神
转录组+蛋白组联合，揭示microRNA调控靶点与功能机制－二
4．转录组、蛋白组揭示miR-137调控底物。蛋白组结果发现：Mir137–/–组versus Mir137+/+组, Mir137+/–组versus Mir137+/+组, and Mir137–/–组versus Mir137+/–组，分别筛选到417、94和76个差异表达蛋白。这些蛋白与
NAT－NEUROSCI转录组+蛋白组联合揭示microRNA调控靶点功能机制
基因水平的研究发现miR-137与多种神经精神疾病存在相关性。同时，miR-137在正常的神经发生与神经发育过程中也具有重要作用。但是，miR-137的体内功能与作用机制仍然不清楚。为了揭示miR-137的功能，该研究构建了miR-137 KO动物，并对KO动物的突触可塑性、学习能力等多种神经功
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制（一）
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Circ
Nature－Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制
m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰，其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶（writer）、结合蛋白（reader）以及去甲基化酶（eraser）的动态可逆调控。研究表明，m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动，参与调控机体的诸多生理或病理进程，包
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制（二）
3. 环状RNA的差异表达与前列腺癌的进展有关研究者对144个前列腺癌进行了聚类分析，与线性RNA相比，环状RNA最强模式与它们在每个样本中的总体丰度相一致。另外，极端circRNA分布的患者的预后明显较circRNA分布稳定的患者差，同时极端circRNA index组也与更高的转移发生率
冯银刚课题组揭示新细菌转录调控因子的结构功能机制
近年来，在一些梭菌和杆菌中发现一类广泛存在的σ因子及其共转录的抗σ因子——SigI和RsgI，它们的一些结构域和已知蛋白没有同源性，代表了一类新的特殊的细菌σ/抗σ因子。热纤梭菌等一些产纤维小体细菌具有8-16对的SigI/RsgI因子，这在其他已知类型的σ/抗σ因子中比较少见。已有的研究表明这
研究揭示纤维小体转录调控因子的结构功能机制
纤维小体是一类可以高效降解木质纤维素生物质的多酶复合体，在生物质能源与合成生物学中具有广泛的应用价值。产纤维小体细菌根据底物种类调控纤维小体组分的表达，从而实现对特定底物类型的高效降解。在典型的产纤维小体细菌热纤梭菌中，一类特殊的σ和anti-σ因子SigI-RsgI负责感应底物并调控纤维小体基
GUT揭示癌症治疗靶点调控RNA可变剪接的分子机制
来自浙江大学基础医学院，中国药科大学等处的研究人员发表了题为“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
《Cell》重磅！全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
Cell》重磅！全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制！
2月7日，加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序，结合后续的功能机制研究，揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制！该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci
科学家为非小细胞肺癌治疗提供新靶点
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499496.shtm肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一。基因突变是非小细胞肺癌发生发展和转移的重要因素。KRAS突变是非小细胞肺癌中最主要的基因突变之一，近年来针对KRAS G12C抑制剂的开发取得了突破性
如何预测microRNA的作用靶点蛋白
很多软件都可以预测miRNA作用靶点，如miRBase，PicTar，TargetScan，也可以做miRNA芯片
研究揭示microRNA定量调控规律
将系统生物学建模分析与合成生物学实验相结合解析microRNA 定量调控规律。 日前，清华大学的汪小我、谢震研究组，通过合成与系统生物学方法揭示microRNA定量调控规律。相关成果发布在《美国科学院院刊》上。 microRNA是一类短的非编码RNA，通过与靶RNA结合抑制靶基因表达，在动植物中
研究揭示代谢调控血栓形成的新机制和治疗新靶点
上海交通大学医学院刘俊岭课题组与孙海鹏课题组合作首次将支链氨基酸（BCAA）代谢与血小板功能和血栓风险建立紧密联系，揭示了一个全新的BCAA代谢调控血小板活化和血栓形成的机制。3月23日，该成果发表于《血液循环》。 由于摄入BCAA被广泛用于专业运动员和运动人士增肌营养物，BCAA注射剂被用于
代谢调控血栓形成的新机制和治疗新靶点被揭示
上海交通大学医学院刘俊岭课题组与孙海鹏课题组合作首次将支链氨基酸（BCAA）代谢与血小板功能和血栓风险建立紧密联系，揭示了一个全新的BCAA代谢调控血小板活化和血栓形成的机制。3月23日，该成果发表于《血液循环》。 由于摄入BCAA被广泛用于专业运动员和运动人士增肌营养物，BCAA注射剂被用于
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一，是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展，但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想，我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来，随着宏基因组测序等研究手段的不断进展，人们发现肠道菌群能广泛
健康所研究揭示microRNA参与狼疮炎症因子调控的机制
人类疾病往往是由于一些基因表达调控紊乱引起的。MicroRNA(miRNA)是近年来广为关注的重要的基因表达调控因子，在人类疾病的发生发展中起着重要作用。沈南教授领导的研究组整合上海交通大学附属仁济医院风湿科的临床优势和中国科学院上海生命科学研究院健康科学研究所的基础研究力量，近年
与转录组学和蛋白组学比较，代谢组学有何优点
那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点：①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易；②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究
新研究揭示动物断腿再生的转录调控机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518620.shtm
植物所揭示果实成熟的转录后调控机制
成熟是果实发育的重要阶段，伴随着颜色、香气及硬度等一系列变化。这一过程受到内外因素的共同调控，机制非常复杂。对果实成熟调控的有关机制开展研究，对于提高果实品质、优化贮藏保鲜技术具有很大的指导意义。近年来，有关果实成熟的转录调控已有较多报道，鉴定到多个重要的转录因子，对它们的作用机制也进行了较多研
新研究揭示动物断腿再生的转录调控机制
近日，华南师范大学生命科学学院教授李胜和研究员任充华合作，以美洲大蠊为研究对象对其肢体再生的转录调控机制进行解析，找到了两条（BMP/JAK-STAT-zfh-2-B-H2和Notch-drm/bowl-bab1）在再生过程中分别控制着前期基芽细胞增殖和中后期形态建成的转录级联通路。相关成果以长文（
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日，中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》（Nature）上，在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中，增
生化与细胞所揭示酵母转录中介复合物调控端粒机制
真核生物的端粒（Telomere）对于保证染色体正常复制以及维持基因组的稳定性有重要作用，也是研究基因组中异染色质（Heterochromatin）结构的重要模型。 9月19日，Nucleic Acids Research在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所周金秋研
基因组所等在混合性白血病基因组研究方面取得新进展
近日，中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员王前飞与美国芝加哥大学血液学教授Michael J. Thirman合作开展的“MLL融合蛋白在急性白血病中的致病机制研究”取得阶段性进展，其研究论文《MLL融合蛋白在白血病基因组中选择性调控MLL野生型的部分靶基因》(MLL Fusio
联合团队揭示有丝分裂保真性调控机制
华东理工大学药学院副教授何薇薇课题组与中国科学院上海有机化学研究所研究员李昂课题组、中国科学院上海药物研究所研究员罗成课题组、海军军医大学教授张卫东课题组合作，利用吲哚萜模拟物作为工具，在有丝分裂保真性调控机制研究中取得新进展，有助于理解微管抑制剂诱导耐药性出现的机制细节。相关成果发表于《先进科学》
华中农大：水稻株型及分枝调控研究获进展
华中农业大学张启发、王磊等在水稻株型及分枝调控研究方面取得新进展。他们通过分析水稻3个microRNA及其靶基因在水稻株型发育中的作用及其分子机制，揭示了一个新的控制水稻株型建成的调控途径。相关成果日前发表于美国《国家科学院院刊》。 水稻的产量由单株穗数、每穗粒数和粒重共同构成，彼此之间相互
中国科大揭示细胞有丝分裂期转录调控动态机制
中国科学技术大学生命科学与医学部教授瞿昆课题组和合肥微尺度物质科学国家研究中心特任研究员王志凯团队合作，揭示了细胞有丝分裂期转录调控动态机制。相关成果日前果发表于《科学进展》。细胞在进入有丝分裂时，通常伴随着染色质的逐渐固缩和基因转录的显著减少，而当细胞退出有丝分裂时，子细胞的染色质状态和基因转录又
研究揭示噬菌体蛋白调控宿主转录的分子机制
7月11日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所合成生物学重点实验室张余研究组与浙江大学医学院冯钰研究组合作完成的题为Structural basis for transcription anti
分子植物卓越中心揭示天然反义转录本调控机制
近期，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上，发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and a