NaturePlants文章:精准高通量检测Rloop分布的新方法

来自清华大学生科院,清华-北大生命科学联合中心的研究人员发表了题为“The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome”的文章,首次报道了精准、高效、高通量检测R-loop的方法,并利用此方法首次揭示模式植物拟南芥基因组中R-loop的分布特征。 这一研究成果公布在Nature Plants杂志上,文章的通讯作者为清华大学生科院孙前文和杨雪瑞,第一作者为徐炜博士。Nature Plants杂志专门邀请加州大学戴维斯分校Frederic Chedin教授为本研究撰写评论文章,彰显此项研究在领域内的重要性。Metaplot分析显示拟南芥基因组中既存在正义R-loops(sense R-loops,由基因自身转录本与其模板链形成的R-loop),也存在反义R-loop(antisense R-loops,大多是由基因的反义转录本在正义链转录起始位点......阅读全文

高通量、低成本-SNP、突变和甲基化检测方法-——HRM技术应用

  HRM介绍    HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高分

高通量芯片技术在细胞遗传学检测领域的划时代飞跃

  细胞遗传学是从细胞的角度,主要是从染色体的结构和行为来研究遗传现象,并找出遗传机制和遗传规律。目前和基础理论与临床医学紧密结合对于遗传咨询和产前诊断具有重要意义。而迅速发展的芯片技术在检测通量、分辨率、灵敏度等方面都远远超过了传统的细胞遗传学方法。因此可以说高通量芯片技术是细胞遗传学检测领域的一

高通量、低成本-SNP、突变和甲基化检测方法-——HRM技术应用

HRM介绍     HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高

应用HPLC/MS/MS-高通量检测食品中多类有毒生物碱

摘要:本应用简报介绍了一种简便的样品前处理方法,结合 Agilent 1290 Infinity II LC 和 Agilent 6470A 三重四极杆液质联用系统对食品基质中的多类生物碱进行高通量测定。采用基质匹配校准标样进行校正,发现在稀释的面包、牛奶、葡萄酒和米粉提取基质中,18 种生物碱

朱永官院士实现环境中致病菌毒力基因高通量检测

   近日,中科院生态环境研究中心土壤环境科学与技术实验室朱永官院士团队在环境中致病菌毒力基因高通量检测方面取得新进展,相关研究成果以“VFG-Chip: A high-throughput qPCR microarray for profiling virulence factor genes f

《安全风险物质高通量质谱检测技术》新书发布会在穗举办

  2月26日上午,由广东省测试分析研究所(中国广州分析测试中心)、华南理工大学出版社主办的“《安全风险物质高通量质谱检测技术》新书发布会”在广州保利世贸博览馆1层二号厅茶歇区举行。活动现场  广东省测试分析研究所所长(中国广州分析测试中心主任)陈江韩,广东省测试分析研究所(中国广州分析测试中心)研

纳米流式分析法肾结石高通量无创检测新方法

肾结石是泌尿外科最常见的的疾病之一,是一种全球性疾病。中国是世界上肾结石患者最多的国家之一。近年来,肾结石在我国的发病率有逐渐上升趋势,大约5%-15%的人群一生中会罹患肾结石。肾结石严重影响患者的身体健康,如果肾结石得不到及时诊断和治疗,可能会造成尿路阻塞,排尿疼痛和肾积水,严重者甚至可能造成尿毒

高通量、低成本SNP、突变或甲基化检测方法—HRM-技术应用

HRM 介绍HRM 技术是high-resolution melting analysis 即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的PCR 技术,HRM 不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在PCR 结束后直接运行高分辨熔解,即

CRISPR先驱获得新突破:开发更安全的CRISPRCas9基因疗法

人们一直希望用CRISPR-Cas9基因编辑技术治疗甚至治愈复杂的神经疾病。帕金森病、亨廷顿舞蹈病和阿尔茨海默症的现有药物只能缓解症状,无法阻止疾病的发展。“但对于确定了致病基因的疾病来说,基因编辑技术有望永久终止其进程,”加州大学伯克利分校Jennifer Doudna实验室的博士后Brett S

简述高通量测序的意义

  高通量测序技术的诞生可以说是基因组学研究领域一个具有里程碑意义的事件。该技术使得核酸测序的单碱基成本与第一代测序技术相比急剧下降, 以人类基因组测序为例, 上世纪末进行的人类基因组计划花费 30 亿美元解码了人类生命密码, 而第二代测序使得人类基因组测序已进入万(美)元基因组时代。如此低廉的单碱

高通量筛选技术简要综述

  药物高通量筛选(HTS)技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。  发展中的高通量筛选技术  高通量筛选的组合模式近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基因组研究、生物信

《自然》:蛋白高通量定量技术

  来自美国德州大学西南医学中心的Rama Ranganathan和他的同事研发了一种能全面分析单基因突变的高通量定量技术,这对于理解蛋白结构,以及蛋白工程应用具有重要意义。相关成果公布在Nature杂志上。   生物学的一个基本原则就是蛋白的氨基酸序列能特异性构成相应的三维结构,并行使生物化

高通量筛选技术的简介

  高通量筛选(High throughput screening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运

高通量测序技术SOLiD简介

目前市场上有四种高通量测序仪,分别是Solexa,454 (GS-FLX),SOLiD和Polonator。根据测序原理,它们可以被分为两大类:使用合成法测序(Sequencing by Synthesis)的Solexa和454,及使用连接法测序(Sequencing by Ligat

高通量测序的实验过程

1.样本准备(sample fragmentation)2.文库构建(library preparation)3.测序反应(sequencing reaction)4.数据分析(data analysis)

高通量筛选的特点简介

  高通量筛选时每天要对数以千万的样品进行检测,工作枯燥,步骤单一,操作人员容易疲劳、出错。自动化操作系统由计算机及其操作软件、自动化加样设备、温孵离心设备和堆栈4个部分组成。自动化操作系统代替人工操作显然有诸多优势,它利用计算机通过操作软件控制整个实验过程,编程过程简洁明了。

高通量组织研磨仪介绍

中药材质量最主要的体现在农药残留的问题上,不仅影响民众的健康,也是阻碍进出 口贸易发展的最大问题。开发快速高效,高灵敏度的中药材农残检测方法,同时对中药材质量进行评价显得尤为重要。金银花为忍冬科多年生藤本植物忍冬的花蕾。别名忍冬花、银花、二花、双花、鹭鸶花、苏花、双苞花、金藤花。花(金银花)、茎藤(

高通量植物表型平台简介

  高通量植物表型平台是植物表型组学、植物功能基因组学、现代遗传育种研究的强大工具。利用高通量植物表型平台可以快速获取大量植株的各种信息。现代农业育种的一个主要方向就是性状改良,获得更大的果实/种子,更高的含油量(油料作物),更发达的根系等等。通过高通量植物表型平台可以快速获取大量植物表型信息。

高通量测序的实验过程

1.样本准备(sample fragmentation)2.文库构建(library preparation)3.测序反应(sequencing reaction)4.数据分析(data analysis)

高通量药物筛选的简介

1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具,简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统

高通量测序发展史

人类基因组计划(human genome project, HGP)  在介绍高通量测序发展之前,需要先为大家介绍一个人类发展史上的一项重要创举——人类基因组计划(human genome project, HGP)。HGP的完成对测序技术的推动作用意义重大。  HGP是由美国科学家于1985年率先

高通量测序分的原理

对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S

高通量测序的相关介绍

  高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。  名词解释  根据发展历史、影响力、测序原

高通量筛选有哪些种类?

该技术使用较低剂量,在短时间内完成对大量化合物的生物活性筛选,由于具有微量化,快速,高效等特点,被国内外多数医药研究机构广泛采用。国外许多大型农药公司亦将这种技术用于新农药的筛选。高通量筛选和组合化学(combinatorialchemistry)、自动化操作系统等技术的有机结合,可以缩短新农药创制

高通量测序技术及原理

高通量测序技术及原理介绍如下:1.什么是高通量测序高通量测序技术也被称作二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS),这是相对一代测序技术(Sanger Sequencing)而言的,同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成

高通量细胞分析设备简介

  仪器主要用途:可用于细胞的定性和定量分析(包括检测细胞表面和细胞浆抗原、细胞因子、细胞内DNA、RNA含量等,定量分析细胞内pH值,蛋白总含量、DNA及RNA含量、免疫表现、细胞周期动力学、细胞特殊配体、细胞生物活性鉴定、细胞凋亡研究、细胞功能分析、钙流等),并将具有将特定形状或功能的细胞从混合

高通量筛选神经毒性实验

优点:完全自动化的图像获取与分析 快速得到每个细胞的多表型参数 实时监测活细胞的毒性,可持续几分钟至几天 神经系统对许多毒性化合物以及自然环境中生成的有害物质非常敏感。在疾病发生过程中,神经毒性可以对大脑或者外周神经系统造成短暂或持续性的损伤,例如脊髓损伤,中风,创伤性脑损伤等。同时这种神经毒性

什么是高通量筛选技术

官方的定义是:高通量筛选技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系。简单来说,就是用机器来替代人工,高效的

高通量测序技术的应用

  测序技术推进科学研究的发展。随着第二代测序技术的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行重头测序(de novosequencing),获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测

什么是高通量筛选技术

以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运转的技术体系。高通量筛选技术具有微量、快速、灵敏和准确等特点。简言之就是可以通过一次