生物大数据挖掘寻找控制蛋白质死亡之门的钥匙

蛋白质是自然界中最神秘的物质之一,几乎所有的生命活动都有它的身影。正如人有生死,生物体内的蛋白质也有出生与死亡。蛋白质的出生是一个精准的从脱氧核糖核酸(DNA)转录得到的信使核糖核酸(mRNA)进而翻译合成蛋白质的过程。当蛋白质的功能使命完成后,需要被及时降解掉(死亡),否则,蛋白质过早或者过晚降解均会导致其功能失常,进而导致“阿尔兹海默综合征”、“克雅士病”等多种疾病的产生。 泛素-蛋白酶体途径是真核生物最重要的蛋白质降解途径。在这个途径中,蛋白质被特异进行泛素标记(即泛素化修饰),进而被送到蛋白酶体进行降解。该途径是一种能量(ATP)依赖的特异、高效的蛋白质降解途径, 发现该途径的三位科学家阿龙·切哈诺沃、阿弗拉姆·赫尔什科与欧文·罗斯共享了2004年诺贝尔化学奖。在此途径中,泛素连接酶发挥了“扳机”似的重要作用,特异地进行底物蛋白质的识别,并启动后续的降解过程,是打开蛋白质死亡之门的钥匙。然而由于泛素连接酶与底物......阅读全文

期刊对Western-Blot数据要求的四大要点

则责任自负2018年,PubMed 中共有194,262 篇蛋白相关的论文,其中有16,196(8.3%)篇用到了 WB。WB 的使用比例在过去30年中稳定在8%到9%左右,而更为现代和准确的蛋白质谱技术(MS),在过去十年中应用比例则稳定在4%,仅仅是WB的一半。四十年后的今天,WB依旧是应用

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

刘伟:生物多样性数据共享现状和建议

  数据共享对于科学发展和大科学研究模式至关重要,也是各国政府部门科学决策的重要基础,备受关注。  在信息时代的背景下,生物多样性领域面临的一个重要挑战是如何有效地共享及整合生物多样性数据。  生物多样性数据共享的重要性至少体现在三个方面:一是拓展生物多样性相关领域研究的深度和广度需要数据共享;二是

我国微生物大数据平台建设获进展

  近日,中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心团队题为World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia

各种模式生物必需基因在线数据库

Essential Genes are the genes that are indispensable to sustain cellular life. The functions encoded by essential genes are considered as a foundation

简述邻氯苯甲酸的生物学数据

  该物质对环境有危害,对水体和大气可造成污染,有机酸易在大气化学和大气物理变化中形成酸雨。因而当PH值降到 5以下时,会给动、植物造成严重危害,鱼的繁殖和发育会受到严重影响,流域土壤和水体底泥中的金属可被溶解进入水中毒害鱼类。水体酸化还会导致水生生物的组成结构发生变化,耐酸的藻类、真菌增多,而有根

科研数据难共享阻碍国内生物科技发展

  上海生物信息技术研究中心主任李亦学的“科研数据共享之梦”已做了13年。但在近日举行的首届金桥产业技术创新会议上,当记者向他问及相关进展时,听到的却是一声叹息。   13年前,“大数据”尚未被任何字典收录,而今却被公认是全球生命科学研究的核心工具。李亦学告诉记者,科研数据难以共享已成为国内生命科

生物医药产业大数据应用概览

  一、国家大数据战略  数据是国家基础性战略资源,是21世纪的“钻石矿”。党的十八届五中全会提出“实施国家大数据战略”,国务院印发《促进大数据发展行动纲要》、工信部印发《大数据产业发展规划(2016-2020年)》,全面推进大数据发展,加快建设数据强国。  2016年6月,国务院办公厅印发《国务院

生物学家借助数据科学破解生命奥秘

  自2000年人类基因组图谱绘制后,生物学研究迈入全新的“组学”时代,科学家们争先恐后地测序各种有机生物的基因组或蛋白质组。  现在,即使一些简单的实验都会产生大量数据,而从“背景噪音”中获得想要的结果则成为了一大挑战。美国趣味科学网站近日报道指出,计算机技术正帮助科学家们征服这些数据大山,甚至提

刘伟:生物多样性数据共享现状和建议

  数据共享对于科学发展和大科学研究模式至关重要,也是各国政府部门科学决策的重要基础,备受关注。  在信息时代的背景下,生物多样性领域面临的一个重要挑战是如何有效地共享及整合生物多样性数据。  生物多样性数据共享的重要性至少体现在三个方面:一是拓展生物多样性相关领域研究的深度和广度需要数据共享;二是

美推出生物医学数据管理战略

组织良好、安全高效运营的数据资源对于现代科学研究至关重要。4日,美国国立卫生研究院(NIH)发布了其第一个数据科学管理战略——《NIH数据科学战略计划》,为推动生物医学数据科学管理现代化制定路线图。NIH希望通过最大程度地提高其所资助研究生成的医学数据的利用价值,更好地推动美国生物医学研究。

首个国际ISO微生物数据标准正式发布

  微生物资源是国家的重要战略资源,微生物数据资源则是微生物资源共享和开发的关键环节,数据资源的丰富性、准确性和共享水平,决定着微生物学领域研究和应用的综合能力。  2020年11月9日,国际标准化组织生物技术委员会(ISO/TC 276)正式发布微生物资源中心数据管理和数据发布标准(ISO 217

生物芯片实验信号检测及数据处理

芯片实验完成后,芯片就可以放人商品化的生物芯片扫描仪中进行扫描、识别、提取和分析(扫描仪的操作根据商家提供的具体操作执行)。扫描仪得到图像后,必须对数据进行提取,才能进行后续的数据分析。图像处理和数据分析是基因芯片研究的核心技术之一。对于SNP实验结果分析较简单,而对于基因表达谱研究、CGH分析及高

历经五次生物大绝灭-古生物“海豆芽”研究解密

近日,西北大学地质学系研究团队通过对5.2亿年以来的舌形贝腕足动物壳体进行大数据整理分析和壳体形态解剖研究,得出舌形贝类穴居型生活方式早在奥陶时期就已建立,其壳体形态和生活方式(包括固着、黏附、群居和穴居)多样性达到高峰。随后,穴居型和群居型生活类型在奥陶纪末和二叠纪末的生物大灭绝事件中被随机性地保

全球生物医药大咖共话新药研发

  日前,药物研发论坛暨中关村生命科学园发展论坛在北京中关村生命科学园举办,来自全球的顶尖科学家、跨国药企负责人、国内创新药企负责人、医院临床一线专家等齐聚一堂,从肿瘤免疫疗法、“中西合璧”共促创新、创新药临床评价等不同角度,共话新药研发。  论坛上,耶鲁大学医学院免疫学教授、美国国家科学院院士陈列

华南奥陶纪生物大辐射研究获进展

  早—中奥陶世的扬子台地上发育过一次台地淹没事件,具体是指由于海平面上升的影响,浅水碳酸盐台地没入透光带之下,从而减缓发育甚至“死亡”的过程,通常会导致沉积体系的改变。  此次台地淹没恰好发生在华南奥陶纪生物大辐射(这里的大辐射是指海洋生物多样性急速增加事件)的第一次高潮之前,赋予了这次事件重要的

川大牵头设立“生物治疗”前沿创新中心

  记者昨日获悉,我国首批“2011协同创新中心”已进入名单认定公示阶段,四川大学牵头的“生物治疗协同创新中心”等14个项目入选。据悉,四川大学、西南交通大学还分别是“中国南海研究协同创新中心”、“轨道交通安全协同创新中心”的“主要协同单位”。   “高等学校创新能力提升计划”(“2011计划”)

解密十大军事生物技术

  美国国防部本月2日宣布新成立“生物技术办公室”,开启新国防之门以来,生物技术在军事上的应用再一次引起大众的关注。   本文盘点了10大生物技术在军事国防上的应用。10大生物技术   一、基因武器   基因武器是指运用遗传工程技术,在一些致病细菌或病毒中,接入能对抗普通疫苗或药物的基因,产生

小芯片上的大文章——生物芯片

想象一下,在一块指甲大小的玻片、硅片、尼龙膜等材料上放上生物探针,它首先与待检测样品进行反应,然后对与反应结果相关的信号进行收集,最后再用计算机或其他方法分析数据结果,会产生什么效果呢?答案就是对细胞、蛋白质、DNA以及其他生物组分的准确、快速、大信息量的检测。这也就是我们所说的生物芯片。生物芯片的

7大生物安全柜保养方法详解

在使用过生物安全柜后,你又没有对其进行有效的维护和保养的呢?下面给大姐介绍几种方法,具体如下:日常维护可用70﹪的乙醇,或其他中性洗涤剂将生物安全柜的内、外部进行彻底的擦拭。清洗时先断电,防止消毒剂引起电器导电。检查日光灯和紫外线灯管,确定他们的正常工作。日光灯和紫外线灯管在长时间使用后,可以用酒精

-解密十大军事生物技术

  美国国防部本月2日宣布新成立“生物技术办公室”,开启新国防之门以来,生物技术在军事上的应用再一次引起大众的关注。   本文盘点了10大生物技术在军事国防上的应用。  一、基因武器   基因武器是指运用遗传工程技术,在一些致病细菌或病毒中,接入能对抗普通疫苗或药物的基因,产生具有显著抗药性的致

-To生物高新企业:ZL申请的11大误区

  误区1:自主研发的成果不申请ZL就有知识产权。  一些技术人员认为只要是自主创新,就有了自主知识产权。其实不然,ZL是一种垄断权,自主研发的技术成果如果不申请ZL,就得不到法律确认和保护。当他人盗用其研究成果时,因研发者对成果不具有ZL权,得不到法律保护,就无法追究盗用者的法律责任。同时,在我国

甲烷为外星生物基础的三大证据

地球以外的行星上是否有生命存在?其证据不可能像外星飞船降落在巴黎埃菲尔铁塔旁边那样引人注目,更可能来自对遥远行星的观测——该行星带有暗示生物活动的大气化学物质。一项发表在28日的《美国国家科学院院刊》上的新研究证明,如果宇宙中有丰富的生命,那么其大气中的甲烷或是能探测到的地球以外生命的第一个迹象。

大容量生物制药离心机分类

大容量生物制药离心机分类有多种。1、按分离目的可分:实验室大容量生物制药离心机和工业大容量生物制药离心机。2、按速度可分:低速大容量生物制药离心机和高速大容量生物制药离心机。3、按分离功能可分:大容量生物制药分析离心机和大容量生物制药制备离心机。4、按温控可分:冷冻大容量生物制药离心机和常温大容量生

6.02亿年前生物如何长“大”?

人们现在所见的大多数生物,由数以亿计的细胞组成,有着复杂的身体结构。然而,地球上的生物刚出现时,只有几微米长,肉眼无法看到。长“大”这一变化是何时发生的?近日,中、英科学家联合进行的一项研究发现,生物长“大”这一关键性变化在6.02亿年前已经发生。 参与研究的中科院地质与地球物理研究所博士杨传介

生物安全柜常见问题大汇总

   请勿堵塞生物安全柜前后的穿孔格栅。生物安全柜的进气口通过堵住烤架而变得灰暗。在生物安全柜的开口处堵塞烤架也可能使被污染的房间空气不经过滤地进入柜内。  不要将不需要的设备或耗材存放在机柜中。内阁越混乱,空气流动的破坏就越大。  请勿使用机柜的顶部进行存放。HEPA过滤器可能会损坏并且气流中断。

合成生物学十大赛道

  合成生物学概况  合成生物学(synthetic biology)是生物科学在21世纪刚刚出现的一个分支学科,成为继“DNA双螺旋结构”、“基因组技术”之后的第三次生物科技革命。合成生物学侧重创造自然界中尚不存在的人工生命系统,广义上可分为“基于细胞的合成生物学”和“无细胞合成生物学”,前者的核

医药数据面临三大挑战,“天花板”效应近在咫尺

  在生命科学和医疗健康护理领域的基础研究从来不缺乏新的技术:实时研究、基于人类的大数据,提高客户的消费动机,而且这仅仅是开始。但是为了满足这样或者那样的需求,如何在恰当的时间以合适的方式增强产品的可及性,并适当地阻止那些以“更新换代”为噱头的新产品/技术过快推向老百姓。如今,医药数据面临三大挑战。

香港理大研究团队以数据模型助力疫情防控

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472656.shtm 【解说】香港新一波新冠疫情来势汹汹。日前,香港特区政府召开紧急会议并以“快、准、狠”措施,与奥密克戎病毒“竞赛”。在此关键时期,香港理工大学讲座教授史文中带领研究团队利用数据模型

媒体揭秘:环保数据造假都有哪七大“障眼法”

  党的十八大以来,我国环保工作深入推进。环境监测数据是环境决策的基础,然而一些地方和不法企业为逃避监管,在利益驱动下破坏环境质量监测系统,干扰监测系统正常运行,导致企业污染源数据问题频出,造假失真情况时有发生。  半月谈网梳理出包括暗度陈仓、断污水注清水蒙混过关、给监测探头“戴口罩”、“阴阳台账”