除了CRISPR,细菌体内还存在超10种免疫防御系统
数十亿年来,细菌一直运用复杂的防御体系保护自己免受噬菌体的入侵。人类通过解析这些免疫机制,研发出强大的分子生物学工具,例如耳熟能详的限制性内切酶、CRISPR/Cas9。然而,这只是“冰山一角”。 图片来源:网络 1月15日,《Science》期刊一篇最新文章揭示,科学家们在细菌体内发现了超10种免疫机制,是已知免疫防御体系的两倍多。 最新发现 来自于以色列Weizmann研究所的分子遗传学家Rotem Sorek带领团队试图全面解析细菌的免疫防御系统。他们分析了来自于细菌、古生菌约45000个基因组,研究了位于 “防御岛”(defense islands,已被证实的防御基因)附近的基因群。 研究人员针对这些看起来很有前途的候选基因构建出相应的细菌模型,随后用大量的噬菌体检测这些基因的防御功能。 在他们测试的26个抗噬菌体系统中,有9个被证实参与抗病毒机制,另外有1个与防御质粒(plasmid)有关。Rotem ......阅读全文
除了CRISPR,细菌体内还存在超10种免疫防御系统
数十亿年来,细菌一直运用复杂的防御体系保护自己免受噬菌体的入侵。人类通过解析这些免疫机制,研发出强大的分子生物学工具,例如耳熟能详的限制性内切酶、CRISPR/Cas9。然而,这只是“冰山一角”。 图片来源:网络 1月15日,《Science》期刊一篇最新文章揭示,科学家们在细菌体内发现了超
反CRISPR噬菌体合作克服CRISPRCas免疫
英国埃克塞特大学的研究人员发现,一种被称为噬菌体的病毒在面对迎面而来的攻击时,首先削弱细菌的防御力,然后再杀死细菌。 这一发现是一个关键性突破,它将有助于改善噬菌体疗法,治疗危机生命的细菌感染。 细菌有防御系统,例如众所周知的CRISPR-Cas,以保护自身免受病毒侵袭。像军备竞赛一样,噬菌
Science:除了CRISPR,细菌体内还存在超10种免疫防御系统
“魔剪”CRISPR最初发现于细菌体内,是细菌用来抵抗入侵病毒及外源DNA的一种天然免疫系统。现在,科学家们又在细菌体内发现了另外10种未知的免疫防御系统。他们相信,这些新系统的挖掘将有望成为下一个基因编辑工具,或者是潜能更大的分子工具。 图片来源:网络 数十亿年来,细菌一直运用复杂
窃取CRISPR的免疫“黑客”
英属哥伦比亚大学的研究人员发现,一种感染主要淡水细菌的病毒使用“偷来”的CRISPR劫持宿主的免疫系统。这种病毒黑客在控制宿主免疫系统之后,迅速给系统打上补丁,以确保其他黑客无法闯入。这项研究发表在美国微生物学会旗下的mBio杂志上。 细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防
惊人发现!揭秘CRISPR“前所未有”的防御机制
7月19日,在线发表于Nature杂志上题为“Type III CRISPR–Cas systems produce cyclic oligoadenylate second messengers”的研究中,来自瑞士苏黎世大学等机构的科学家小组发现了细菌抵御入侵病毒的一种前所未有的防御机制。
Science:细菌CRISPR适应性防御机制新见解
细菌都会有一种复杂的自我防御机制,近日,刊登在国际著名杂志Science上的两篇研究论文中,来自史丹福大学直线加速国家实验室(SLAC National Accelerator Laboratory)的研究人员通过研究提出了名为CRISPR的细菌适应性防御系统的新见解,CRISPR是有规律间隔的
CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR
两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中
CRISPR专家发表CRISPR/Cas9综述
CRISPR技术的确在科学界掀起了基因组编辑的狂潮。在Pubmed中快速检索“CRISPR”,目前已有1400多项结果。也相继有专家为该技术撰写了综述论文,例如:Science综述:CRISPR-Cas9系统的历史和未来;北大魏文胜最新发表CRISPR综述。 最近,来自美国加州大学伯克利分校和
CRISPR女王:她的生命被CRISPR照亮
一位多年来埋头于实验室枯燥生活的微生物学家,突然有一天由于基因编辑技术站在了聚光灯下 现年48岁的Emmanuelle Charpentier在过去二十年学术生涯中辗转去过了5个国家九所不同的研究院,“我总是不得不从零开始,亲自构建新的实验室,”她说。45岁之前Charpentier还无法雇
NatureMethods发布CRISPR新技术:CRISPRX
斯坦福大学遗传学系,药理学系的几位学者合作,开发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术―― CRISPR-X ,这将能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。这一研究成果在线公布在10月31日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是斯坦福大学Micha
CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR
两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中
CRISPR实验指南:如何检测CRISPR脱靶突变(一)
张锋实验室的一位研究生:Winston Yan的项目就是利用CRISPR-Cas9基因组编辑系统的一个突变来敲除调控小鼠胆固醇的基因。“最终的目的是为治疗应用铺平道路,”Yan说,他最近完成了他的研究生工作,同时也第一次遇到CRISPR脱靶效应的问题。 CRISPR能帮助研究人员快速有效地对基
Nature-Methods发布CRISPR新技术:CRISPRX
斯坦福大学遗传学系,药理学系的几位学者合作,开发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术—— CRISPR-X ,这将能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。 这一研究成果在线公布在10月31日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是斯坦福大学Mi
Nat-Commun:新研究发现细菌中的CrisprCas9防御系统
借助高度先进的显微镜和同步加速器,哥本哈根大学的研究人员对细菌防御其他细菌和病毒的分子机制提出了开创性的见解。 相关结果发表在最近一期的《Nature Communications》杂志上。这一发现可能会成为将来与疾病作斗争的重要基石。 研究人员已经证明,被病毒攻击的细胞如何激活称为COA(环
Nature:CRISPR用于免疫疗法,结果让人振奋
Dana-Farber/波士顿儿童医院癌症及血液疾病中心开发了一种新型筛选方法:使用CRISPR-Cas9基因编辑技术测试小鼠中数千种肿瘤基因的功能。新型筛选方法揭示了新的药物靶标,可能潜在地增强 PD-1检查点抑制剂的有效性,是一种有前景的新型癌症免疫治疗手段。 研究结果在线发表在Natur
Cell:重磅!揭示抗CRISPR蛋白阻断CRISPR系统机制
想象一下细菌和病毒一直处于军备竞赛之中。对很多细菌而言,一种抵抗病毒感染的防御线是一种复杂的RNA引导的“免疫系统”,即CRISPR-Cas。这个免疫系统的核心是一种识别病毒DNA和触发它破坏的监视复合物。然而,病毒能够反击,利用抗CRISPR蛋白让这种监视复合物不能够发挥功能。但是,在此之前,
CRISPR/Cas9抗体—CRISPR/Cas9研究
能够方便而精确的对DNA和核苷酸序列进行编辑,是科研工作者们长期以来的梦想。CRISPR/Cas9系统的诞生和成熟标志这这一梦想逐渐变为现实。CRISPR/Cas9系统,作为第三代基因编辑技术,它的本质其实是细菌中一种对付诸如病毒等外来DNA的防御系统。此系统的工作原理是 成簇的、规律间隔的短回
CRISPR先驱Nature解析新一代CRISPR系统
在4月20日《自然》(Nature)杂志上的一篇新研究论文中,科学家们描绘了一种新型细菌CRISPR-Cpf1系统的分子细节,这为实现其他的基因编辑应用,如平行靶向多个基因打开了可能的途径。 领导这一研究的任职于德国马克思普朗克感染生物学研究所和瑞典于默奥大学的Emmanuelle Charp
美国防部资助Jennifer-Doundna研究组开发CRISPR基因防御技术
“历史中永远充满了杀戮与血腥”,在殖民时代美国经济史学家贡德.弗兰克在《白银资本》中描述了欧洲殖民者到达美洲大陆后的一个世纪内,印第安人土著减少了95%。英国学者伊恩.珍妮弗.格雷恩的流行病学著作《天花的历史》一书中也描述到欧洲人在美洲大量传播天花,以抛尸或向当地土著赠送天花病人睡过的毛毯换物等
生物物理所揭示噬菌体防御CRISPRSpyCas9的分子机制
2018年12月31日,《分子细胞》(Molecular Cell)杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组在CRISPR-Cas系统研究中取得的最新进展。标题为Phage AcrIIA2 DNA Mimicry: Structural Basis of the CRISPR and
安捷伦推出CRISPR-激活和干扰-(CRISPR-a/i)-的混合文库
安捷伦通过基于 CRISPR 的产品扩展了 SureGuide 产品系列,从而加速疾病研究 基于 CRISPR 的全新转录激活和干扰 (a/i) 文库 2017年10月20日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所: A)今日宣布首次将 SureGuide 混合 CRISPR 文库扩展到功能基因
吴志坚发布CRISPR重要成果:CRISPR敲除治疗疾病
美国国立卫生研究院眼科研究所的一组研究人员报道了最新成果:他们通过一种病毒载体直接向眼睛输送了基于CRISPR-as9的治疗元件,成功在视网膜变性小鼠中阻止了视网膜色素变性。这一研究成果公布在3月14日的Nature Communications杂志上,文章的通讯作者是美国国立卫生研究院眼科研究
CRISPR技术的前景因免疫反应而蒙上阴影
通过基因组编辑来纠正异常,这个概念似乎简单明了。几十年来,科学家也一直尝试用基因编辑来开展治疗,获得了不同程度的成功。最大的障碍来自基因导入系统,它往往使用病毒,具有一定的风险。图片来源于网络 2013年,研究人员首次利用CRISPR-Cas9系统来编辑哺乳动物细胞的基因组,对编辑发生的位置有
基因编辑crispr原理
ZFNZFN,即锌指核糖核酸酶,由一个 DNA 识别域和一个非特异性核酸内切酶构成。DNA 识别域是由一系列 Cys2-His2锌指蛋白(zinc-fingers)串联组成(一般 3~4 个),每个锌指蛋白识别并结合一个特异的三联体碱基。锌指蛋白源自转录调控因子家族(transcription fa
“希望之光”——CRISPR技术
2020年4月17日早晨,“STAT”网站发布了一篇新闻报道,该报道指出科学家正在测试将CRISPR技术应用于新冠肺炎的快速检测。作为近几年大热的一个全新的基因编辑技术,CRISPR与中国也颇有渊源。拥有“CRISPR之父”之称的著名科学家张锋是出生于中国河北石家庄的华裔科学家,更是当今最受关注的华
CRISPR大战落下帷幕
美国ZL局审查与上诉委员会近日就CRISPRZL纠纷作出裁决,麻省理工学院和哈佛大学共同创建的布罗德研究所可继续保有此前获批的“基因剪刀”技术ZL。这意味着这场价值数十亿美元的ZL案纠纷以张锋一方获胜暂告一段落。CRISPR技术先驱(从左到右):George Church、Jennifer Do
基因编辑crispr原理
ZFNZFN,即锌指核糖核酸酶,由一个 DNA 识别域和一个非特异性核酸内切酶构成。DNA 识别域是由一系列 Cys2-His2锌指蛋白(zinc-fingers)串联组成(一般 3~4 个),每个锌指蛋白识别并结合一个特异的三联体碱基。锌指蛋白源自转录调控因子家族(transcription fa
CRISPR的优势分析
前言时至今日,很多研究者仍着迷于研究细菌CRISPR系统的功能,以及如何借助对相关机制的理解来产生新的技术。CRISPR系统目前在临床诊断与基因疗法中的研究成果也在不断涌出。近日,Sherlock Biosciences公司宣布其基于CRISPR技术的新冠病毒试剂盒已获得美国FDA的紧急使用
基因编辑crispr原理
ZFNZFN,即锌指核糖核酸酶,由一个 DNA 识别域和一个非特异性核酸内切酶构成。DNA 识别域是由一系列 Cys2-His2锌指蛋白(zinc-fingers)串联组成(一般 3~4 个),每个锌指蛋白识别并结合一个特异的三联体碱基。锌指蛋白源自转录调控因子家族(transcription fa
当ChatGPT遇上CRISPR
在探索CRISPR基因编辑系统的过程中,研究人员从温泉、泥炭沼泽、粪便甚至酸奶中搜寻各种微生物。现在,由于生成式人工智能的进步,他们可能只需按一下按钮就能设计出这些系统。 据《自然》报道,日前,研究人员公布了他们使用一种名为蛋白质语言模型的生成式人工智能工具,设计CRISPR基因编辑蛋白质的细