再创纪录！AI系统可诊断近100种脑癌
今日，《自然》杂志再出人工智能重磅成果。来自美国、德国、意大利等100多个实验室的近150位科学家通力合作，联合在顶级期刊《自然》发表了这篇文章，他们开发了一个超级AI系统，该系统基于肿瘤组织DNA的甲基化数据，可以准确区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。更厉害的是，这个AI系统还能自学成才，发现一些临床指南里面没有的新分类。为了更广泛的可访问性，团队设计了一个免费的在线分类工具，不需要任何额外的现场数据处理。团队称，研究结果为跨越其他癌症实体生成基于机器学习的肿瘤分类器提供了蓝图，并具有从根本上改变肿瘤病理的应用前景。大约一个月之前，张康教授那篇《重磅！中国科学家最新医学AI成果荣登《细胞》杂志》在朋友圈刷屏，也充分体现了公众对于AI技术在医疗领域的不断突破给予了极大的热情。准确的诊断对于适当的疾病治疗至关重要。目前，临床上中枢神经系统肿瘤的诊断核心技术还是基于显微镜的组织学诊断。然而，这需要对细微的细胞改变进行评估。在某些......阅读全文
揭示DNA甲基化与基因沉默的关系
DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关，但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
DNA甲基化酶的主要类型介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
简述DNA甲基化检测的临床意义
在肿瘤的发生发展过程中，由于CpG岛的局部高度甲基化要早于细胞恶性增生，故其甲基化的检测可用于肿瘤的预测，而全基因组水平的低水平甲基化状态，则随着肿瘤恶性程度的增加而进一步降低，使其可用于肿瘤的诊断以及分级。此外，除了在肿瘤组织中检测甲基化以外，大量研究通过对肿瘤患者血清及其他体液中的肿瘤细胞的
亚硫酸氢盐修饰后测序法检测甲基化——DNA甲基化
亚硫酸氢盐修饰后测序法主要可用来检测甲基化。基化实验方法原理重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基转变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，用PCR扩增（引物设计时尽量避免有CpG，以免受甲基化因素的影响）所需片段，则尿嘧啶全部转化成胸腺嘧啶。最后对PCR产物进行测序，并且与未经处理的序列比较
再创纪录！AI系统可诊断近100种脑癌
今日，《自然》杂志再出人工智能重磅成果。来自美国、德国、意大利等100多个实验室的近150位科学家通力合作，联合在顶级期刊《自然》发表了这篇文章，他们开发了一个超级AI系统，该系统基于肿瘤组织DNA的甲基化数据，可以准确区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。更厉害的是，这个AI系统还能自学成才，发现
肿瘤检测新指标血浆DNA
目前，人们对血浆中游离DNA作为诊断标准越来越感兴趣。尤其是，在肿瘤患者中的血浆中已经检测到了肿瘤相关DNA，在孕妇的血浆中发现了胚胎衍生的DNA。对血浆中这些DNA的发现在肿瘤检测以及非侵染性产前检查中具有重要意义。 香港中文大学李嘉诚健康研究所的K. C. Allen Chan使用
ctDNA甲基化检测在肿瘤诊疗中的价值
循环肿瘤DNA（circulating tumor DNA，ctDNA）来源于肿瘤细胞的凋亡、坏死或分泌产生的DNA片段，是循环游离DNA（circulatingcell-free DNA，cfDNA）的一部分。健康人群中大部分cfDNA的长度在70~200 bp，但肿瘤患者的ctDNA长度
关于DNA甲基化分析仪的基本介绍
DNA甲基化分析仪是一种用于基础医学领域的分析仪器，于2017年3月14日启用。 DNA甲基化分析仪的技术指标： 焦磷酸测序技术基于测序原理，数分钟内可获得定量数据。PyroMark Q24是提供实时测序信息的完整体系，高度适用于表观遗传学研究和遗传分析。该系统包括PyroMark Q24、
Cell发布革命性DNA甲基化分析技术
Whitehead研究所的研究人员开发出了一种方法，监测单个细胞中随着时间推移发生的DNA甲基化改变。这一突破性的研究成果发布在顶级科学期刊《细胞》（Cell）杂志上。 DNA甲基化对正确控制基因表达及细胞身份——使得细胞具有相同遗传物质的细胞变为神经细胞、肌肉细胞或皮肤细胞，起至关重要的作用
研究揭示肠癌DNA甲基化调控新机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508004.shtm
Alpha助力DNA甲基化表型调控新发现
NA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式
检测DNA甲基化识别四种常见癌
中美研究人员26日说，DNA甲基化标记作为一种全新的微创检测方式，只需检测少量组织即可获得足量的DNA用于分析，且至少可以有效识别结直肠癌、肺癌、乳腺癌和肝癌4种常见恶性肿瘤。 这项工作由美国加州大学圣迭戈分校张康教授与中国第四军医大学西京医院郝晓柯教授及中山大学徐瑞华教授等人合作完成，相
DNA甲基化酶的类型和作用介绍
基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类，即维持DNA甲基化转移酶（Dnmtl或维持甲基化酶）和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能，真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类：Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C
植物DNA甲基化的调控研究获重要进展
近日，中国科学院华南植物园农业与生物技术中心研究员陈琛、副研究员王昌虎团队与合作者，在国家自然科学基金面上项目和青年项目、广州市科技计划项目的资助下，对植物DNA甲基化的调控研究取得重要进展。相关成果发表于《自然-通讯》（Nature Communications）。DNA甲基化是表观遗传修饰中的一
Nature：10000人最大研究！“超重”改变DNA甲基化
12月21日，发表在Nature杂志上题为“Epigenome-wide association study of body mass index, and the adverse outcomes of adiposity”的研究证实，节假日养出的“肉”（biao）除了会让你看起来更bigge
DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)
摘要： DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分，在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用，是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入，各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类：整体水平的甲
植物DNA甲基化的调控研究获重要进展
近日，中国科学院华南植物园农业与生物技术中心研究员陈琛、副研究员王昌虎团队与合作者，在国家自然科学基金面上项目和青年项目、广州市科技计划项目的资助下，对植物DNA甲基化的调控研究取得重要进展。相关成果发表于《自然-通讯》（Nature Communications）。 DNA甲基化是表观遗传修
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名称Ⅱ型DNA甲基化酶英文名称type Ⅱ DNA methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。三类甲基化酶之一，包括内切酶和甲基化酶两种成分，作用在识别位点(回文结构)内或其附近，反应不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的双功能酶，在距不对称的识别序列较远处使DNA甲基化，又能
关于DNA甲基化检测的操作方法介绍
1、DNA甲基化检测— 基因组DNA的提取及浓度测定，设计引物时要求所扩增的片段中必须含有一个或一个以上的CpG岛，以保证检测可以正常进行。 2、DNA甲基化检测— 基因组DNA进行化学修饰，主要采用亚硫酸氢钠修饰，注意温度和时间的掌握，修饰后的DNA单链比较脆弱，操作应轻柔，避免剧烈振荡。适
DNA分析系统：基因甲基化研究的最佳工具
甲基化研究对于基因的 调控和肿瘤的发生有非常密切的关系。在一般正常的细胞中，基因调控区CpG岛处于非甲基化的状态。而当细胞发生癌变后，这些CG区域往往呈现甲基化状态。英国医学刊物《the Lancet》报道奥地利因斯布鲁克医学院的专家们早就可以通过检测大便中DNA的甲基化变化，把健康人的大便
Ⅱ型DNA甲基化酶的基本信息
中文名称Ⅱ型DNA甲基化酶英文名称type Ⅱ DNA methylase定 义编号：EC 2.1.1.37。三类甲基化酶之一，包括内切酶和甲基化酶两种成分，作用在识别位点(回文结构)内或其附近，反应不需要ATP；而Ⅰ型和Ⅲ型都是需要ATP的双功能酶，在距不对称的识别序列较远处使DNA甲基化，又能
揭示玉米DNA甲基化变异对表型的贡献
DNA甲基化对植物的生长发育和环境响应起着十分重要的作用。作为一种较为稳定的遗传信息，DNA甲基化既可由DNA序列变异诱发，也可独立于DNA序列产生纯表观遗传变异，这种独立的程度和DNA甲基化对基因表达以及表型变异的影响一直是研究热点。近日，华中农业大学和美国明尼苏达大学合作解析了玉米自然群体中
线虫基因组中存在DNA甲基化现象
2012年10月18日，吉林大学和华大基因合作完成的旋毛形线虫不同发育阶段DNA甲基化差异分析的相关研究成果在国际著名期刊《基因组生物学》(Genome Biology)上发表。该研究首次证实了线虫基因组中存在DNA甲基化现象，改写了长期以来认为线虫中没有该表观遗传修饰的历史，同时也使以DN
哺乳类动物的DNA甲基化特点
哺乳类动物一生中DNA甲基化水平有着显著变化：在受精卵最初几次卵裂中，去甲基化酶清除DNA分子上几乎所有从亲代遗传下来的甲基化标记；在胚胎植入子宫时，一种新的甲基化遍布整个基因组，构建性甲基化酶使DNA重新建立一个新的甲基化模式，一旦细胞内新的甲基化模式建成，将通过维持甲基化酶以“甲基化维持”的形式
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中，沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题，目前仍处于研究阶段，还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程，如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用；而甲基化CpG结合蛋白—
汪海林：维生素C调控DNA甲基化
2014年8月26日，第十三届全国青年分析测试学术报告会在陕西西安南洋大酒店隆重开幕。本届全国青年分析测试学术报告会由中国分析测试协会青年学术委员会举办，西安交通大学电子材料研究所承办，来自全国各地的分析测试学界代表近200人参加了此次报告会。来自中科院生态环境中心的汪海林教授为大家带来题为《维
昆明动物所揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
3月21日，EMBO Reports在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文，该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。昆明动物所助理研究员蒋德伟为文章第一作者，研究员李家立为通讯作者。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重
肝癌复发预测：循环肿瘤细胞DNA
根据最近公布的数据显示，广岛大学的研究人员发现，循环肿瘤细胞DNA是能够准确预测肝切除术后2年内肝细胞癌复发的一个因子。 “我们发现，循环肿瘤细胞DNA水平能够准确反映肝细胞癌的肿瘤进程和治疗效果，”广岛大学Atsushi Ono博士在新闻发布会上说。“通过进一步的研究，循环肿瘤细胞DNA的基
－循环肿瘤DNA实时跟踪癌症发展
据本周三在《Nature Communications》杂志发表的一项新的研究中，科学家首次发现，流进入血液中的肿瘤DNA，可用于实时跟踪肿瘤的发展以及对治疗的响应。 三年多来，剑桥大学的研究人员，从肿瘤已经扩散到身体其他部位的一名乳腺癌患者身上，采集了外科肿瘤样本（活检）和血液样本。他们仔细
甲基化试验有助于区分原发肿瘤类型
未知性癌症（CUP）在转移性肿瘤患者中占比10%，然而这些癌症的原发肿瘤位置通常无法确定。由于无法分辨究竟是哪种肿瘤类型，这些患者的生存率很低。 “传统方法只能鉴定30%不明病灶的转移性肿瘤的原发肿瘤位置，一些分子生物学方法可以提高这一比例，但往往造价昂贵，并且，所使用的RNA样本比较脆弱容易