再创纪录!AI系统可诊断近100种脑癌

今日,《自然》杂志再出人工智能重磅成果。来自美国、德国、意大利等100多个实验室的近150位科学家通力合作,联合在顶级期刊《自然》发表了这篇文章,他们开发了一个超级AI系统,该系统基于肿瘤组织DNA的甲基化数据,可以准确区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。更厉害的是,这个AI系统还能自学成才,发现一些临床指南里面没有的新分类。为了更广泛的可访问性,团队设计了一个免费的在线分类工具,不需要任何额外的现场数据处理。团队称,研究结果为跨越其他癌症实体生成基于机器学习的肿瘤分类器提供了蓝图,并具有从根本上改变肿瘤病理的应用前景。大约一个月之前,张康教授那篇《重磅!中国科学家最新医学AI成果荣登《细胞》杂志》在朋友圈刷屏,也充分体现了公众对于AI技术在医疗领域的不断突破给予了极大的热情。准确的诊断对于适当的疾病治疗至关重要。目前,临床上中枢神经系统肿瘤的诊断核心技术还是基于显微镜的组织学诊断。然而,这需要对细微的细胞改变进行评估。在某些......阅读全文

关于DNA去甲基化作用的简介

  DNA去甲基化作用是指在哺乳动物细胞中缺乏和减少细胞内的DNA甲基转移酶含量会引起DNA的去甲基化,它对于开启特异性基因的表达和重编程的起始具有重要作用。长期以来,DNA主动去甲基化的机制一直是表观遗传领域的一个最基本的问题。与被动去甲基化相比,DNA的主动去甲基化是一个迅速的并且独立于细胞分裂

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

最新DNA甲基化测序技术比较研究

  在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。  对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合

DNA甲基化的基本原理

DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结合的

DNA甲基化反应分的类型介绍

DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化,称为从头甲基化(denovo methylation);另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化,另一条未甲基化的链被甲基化,这种类型称为保留甲基化(maintenance methylation)。

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。一、特异位点的甲基化检测1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR)这种方法经济实用,

DNA甲基化反应的主要类型介绍

DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化,称为从头甲基化(denovo methylation);另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化,另一条未甲基化的链被甲基化,这种类型称为保留甲基化(maintenance methylation)。

DNA甲基化检测技术全攻略

近年来涌现出不少 DNA 甲基化的检测技术,少说也有十几种。大致可以分为两类:特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析,后者也称为甲基化图谱分析 (methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 特异位点的甲基化检测 甲基化特异性 PCR (MS-PCR)

关于DNA甲基化检测的基本介绍

  DNA甲基化是基因表达调控的一种重要机制,DNA甲基化检测是指利用各种方法对肿瘤细胞DNA甲基化程度进行测定。在恶性肿瘤的发展中,甲基化的状态并不是一成不变,肿瘤细胞内全基因组的低甲基化程度与疾病进展、肿瘤大小和恶性程度都有密切的关系,DNA甲基化检测对肿瘤恶性程度的判断有重要意义。

基于循环肿瘤DNA甲基化特征的结外NK/T细胞淋巴瘤诊断预测模型

  结外NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)是非霍奇金淋巴瘤的一种少见亚型,多数病例发生在鼻腔和咽喉部以上部位,又称鼻型NK/T细胞淋巴瘤。ENKTL的诊断依赖于病理学检查,然而坏死组织的存在以及发病部位的解剖学复杂性为病理采样带来了挑战。目前临床使用Ann Arbor分期标准和NK/T细胞淋巴瘤预后指

揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用

  近日,《EMBO报告》在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文,该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。  准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重要的,DNA损伤修复功能的障碍会引起严重疾病,包括多种癌症、免疫缺陷、代谢紊乱、

循环肿瘤DNA比循环正常DNA矮半截

  如今,人们开始利用液体活检技术来诊断癌症,以及监测治疗效果,不过灵敏度是个问题。美国犹他州大学和华盛顿大学的研究人员近日在《PLOS Genetics》上发表文章,称来源于肿瘤的DNA片段比来源于正常细胞的片段要短,这个特征可用于改善液体活检。  犹他州大学的Hunter Underhill及其

甲基化——肿瘤检测治疗的又一靶标?

前言在测序和相关技术不断进步的今天,研究人员不仅能够获得DNA、RNA的碱基序列,更能够获得碱基修饰的复杂信息。目前已经证明DNA甲基化能够导至的肿瘤产生,而Ribomed、基准医疗和鹍远基因等公司作为该领域的先行者,已经开发出相关产品。RNA作为中心法则的下游分子,也有多种多样的修饰,特别是m6A

DNA甲基化酶的基本信息

大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶,即DNA甲基化酶,它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统(R-M系统)Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化,形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中,常用的甲基化酶属于Ⅱ型,它与相应的

DNA甲基化酶的基本信息

大多数限制性内切酶常常伴随有1~2种修饰酶,即DNA甲基化酶,它能保护细胞自身的DNA不被限制性内切酶破坏。限制修饰系统(R-M系统)Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中的甲基化酶可使细菌DNA分子中的胞嘧啶和腺嘌呤发生甲基化,形成5‘-甲基胞嘧啶和6‘-甲基腺嘌呤.在DNA重组实验中,常用的甲基化酶属于Ⅱ型,它与相应的

DNA甲基化酶的主要类型介绍

基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与C

DNA甲基化酶的主要类型介绍

DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中,主要特征

我科学家改写DNA甲基化经典

  近日,吉林大学人兽共患病研究所和华大基因研究院通过合作,首次在旋毛虫基因组中发现了甲基转移酶,并证实了DNA甲基化的存在,改写了长期以来认为线虫中没有该种表观遗传修饰的历史。相关成果发表于《基因组生物学》。业内专家认为,该研究为以DNA甲基化为靶标的抗旋毛虫及类似病原药物与预防制剂

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

Nature:基于DNA甲基化的早期癌症检测

  加拿大玛格丽特公主癌症中心和多伦多大学的研究人员近日开发出一种新方法,能够通过甲基化DNA实现癌症的早期检测。尽管这些结果还有待更多独立样本的验证,但他们认为这有望催生非侵入性的新型癌症筛查检测。  研究人员在上周的《Nature》杂志上介绍了一种基于免疫沉淀的实验方案,能够分析少量循环游离DN

植物DNA去甲基化的机理和功能

  10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i

关于DNA甲基化的酶分类的介绍

  基因组中DNA的甲基化模式是通过DNA甲基转移酶实现的。DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参

DNA去甲基化的两种方式

  本公司提供专业的DNA甲基化修饰服务,有需要的客户请与本公司的工作人员。   作为发现较早的一种修饰途径,DNA甲基化能够引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而控制基因表达。DNA甲基化修饰过程会使甲基添加到DNA分子上,例如在胞嘧啶环的5'碳上:这种

DNA甲基化与拟南芥的免疫力

  DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力,它动态调控了某些基因的表达,让植物能够抵御细菌感染。近日,一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。   美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴

DNA甲基化研究方法的回顾与评价

摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲

DNA甲基化与癌症之NGS检测篇

  摘要  DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中,DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化,大量实验研究表明,在多种类型癌症中,DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外,甲基化还与非

科学研究揭示DNA甲基化的秘密

甲基化指 DNA 的化学修饰,这种修饰发生在 DNA 序列的数百万个位置上。直到现在,科学家们相信这种表观遗传学的现象减少了一些基因的表达。   近日,来自UNIGE大学的研究团队们,发现 DNA 甲基化在基因调节中扮演着积极和消极的角色。 DNA 序列的变异性与基因表达之间的关系也

DNA甲基化酶的作用和种类

DNA甲基化酶分为2类,即维持DNA甲基化转移酶(Dnmtl或维持甲基化酶)和从头甲基化酶。根据序列的同源性和功能,真核生物DNA甲基化转移酶又分为4类:Dnmtl/METl、Dnmt2、CMTs和Dn-mt3。DnmtliiMETl类酶参与CG序列甲基化的维持。CMTs类酶仅发现在植物中,主要特征

DNA甲基化:诊断癌症的强大工具

  最近,来自香港中文大学的研究人员,通过分析血浆DNA中的甲基化序列,能够检测到癌症患者的肝肿瘤和淋巴瘤,以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱,能够识别循环DNA的组织起源,从而使其成为一种强大的工具,用于筛选、癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作,由香港中文大

DNA甲基化:在衰老细胞中的作用

   近日,科学家们在45万个基因组位点中发现了8%的与衰老有关的DNA甲基化的改变。这项研究成果题为“Age-related variations in the methylome associated with gene expression in human monocytes and T c