美洲大蠊基因组测序完成
中科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所詹帅及同事对美洲大蠊进行了基因组测序和分析，表明在已测基因组的昆虫中，其基因组规模仅次于蝗虫。这项研究3月21日在线发表于《自然—通讯》，文章揭示了该物种成功适应城市环境的遗传学基础的相关洞察。 美洲大蠊（Periplaneta americana）是一种杂食性食腐动物，也是与人类近距离生活的最大昆虫物种之一。它生长速度快、繁殖能力强，而且具有组织再生能力，因而能够在城市环境中生存。 詹帅与同事发现，美洲大蠊与化学感受（生物体响应环境中化学刺激的过程）和解毒（承受化学和生物因素影响）相关的基因家族发生了扩张。此外，研究人员鉴定出其参与发育和再生的信号传导路径，他们认为美洲大蠊有望作为一个模式系统用来开展蟑螂的生物学研究。 作者总结表示，这项研究可能会为防治美洲大蠊提供一些思路。......阅读全文
华南师范大学李胜团队养蟑螂研究昆虫的再生原理
断了腿，很快就能长出来；断了头，能继续活好几天。缺氧条件下，昏过去好久能“复活”；手术台上，被切掉半个肚子依然活跃。这就是每家每户人人喊打的蟑螂。 在广州华南师范大学昆虫科学与技术研究所，养着大小不一、种类不同的蟑螂，足有数十万只。蟑螂分布在不同的“屋舍”内，主要有德国小镰、美洲大蠊、杜比亚蟑
Illumina宣布测序技术大创新
生物通报道 Illumina公司近日宣布了一系列产品和技术上的创新，从样品制备到系统改进再到数据分析，这有望带来基因组研究上的新突破。随着平台的不断改进，测序速度、准确性、产量和流程都有望改善。 样品制备新品 简化和加速样品制备的过程对改善测序流程和降低周转时间至关重要，这也是测
九大测序平台对比（二）
2.454企业: Roche推出时间: 2005年主流型号: Genome Sequencer FLX Titanium（2008年推出）样品要求: 5 μg of DNA，浓度≥300 ng/μL测序原理：焦磷酸测序在测序时，使用了一种叫做“Pico TiterPlate”（PTP）的平板，它
九大测序平台对比（五）
7.The PacBio RS system企业: Pacific Biosciences推出时间: 2010年2月开始早期试用主流型号: PacBio RS样品要求: 1kb以下500ng，纯化的基因组 DNA, BACs, cDNA 文库 或PCR 产物测序原理: 边合成边测序，single m
九大测序平台对比（四）
5.Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer（2008年推出）样品要求: 1-3 μg，起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随
九大测序平台对比（一）
1.Sanger2.4543.Solid 4.HiSeq20005.Helicos6.DNA Nanoball array7.The PacBio RS system8.PGM9.MiSeq sanger企业：Life Technology推出时间：1977年发明，1986年第一台商业化测序仪主流
九大测序平台对比（二）
Helicos企业: Helicos Biosciences推出时间: 2008年主流型号: HeliScope™ Single Molecule Sequencer（2008年推出）样品要求: 1-3 μg，起始DNA体积不超过100 μL.测序原理: 边合成边测序,可逆阻断测序待测DNA被随机打
九大测序平台对比（六）
8.PGM企业: Ion Torrent推出时间: 2010年主流型号: Ion Personal Genome Machine™（2010年）样品要求: 5 μg DNA，起始DNA体积不超过130μL测序原理: 半导体芯片测序该测序仪使用了一种高密度半导体小孔芯片。该芯片置于一个离子敏感层和离子
九大测序平台对比（三）
4.HiSeq2000企业: Illumina推出时间: 2010/1/1主流型号: Illumina HiSeq2000样品要求: 6ug/sample,无RNA、蛋白污染，无降解，OD260/OD280=1.8-2.0测序原理: 边合成边测序这种测序技术通过将基因组DNA的随机片断附着到光学透明
九大测序平台对比（一）
1.sanger企业：Life Technology推出时间：1977年发明，1986年第一台商业化测序仪主流型号：3730XL样品要求：PCR产物：浓度≥50ng/ul 体积≥10ul；质粒：含量≥5ug；菌液：体积≥1ml。测序原理:双脱氧链终止法：Sanger法测序的原理就是，每个反应含有所有
小蠊的“婚姻”：基因之命，激素之言
“关关雎鸠，在河之洲。窈窕淑女，君子好逑。”《诗经》描写了人类爱恋的复杂行为，而昆虫界的恋爱和婚姻就简单多了。 7月4日，《自然—生态与进化》在线发表了华南师范大学和西北农林科技大学等单位合作研究成果，鉴定出控制德国小蠊接触性信息素合成途径最为关键的基因，系统揭示了其性吸引力产生的分子机制——有
简述单分子测序技术—第三代测序技术的基因组测序应用
由于具有读长长的特点，SMRT测序平台在基因组测序中能降低测序后的Contig数量，明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量，节省大量的时间[25]。Christophern等[26]仅仅用0.5*的Pacbio RS系统长度的数据与38*的二代测序(NGS)的测序数据，对马达加斯加的一种指猴基因
人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域
J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标 美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”，计划于今年夏季启动，终极目标
国内首个菊花脑基因组测序纳米孔测序再发高分论文
菊属植物种类繁多，又含多种栽培种，兼具观赏和药用价值，且染色体组结构从2n=18到8n=72之间，十分复杂，多年来难以攻破。 中药所所长陈士林研究员、副研究员宋驰博士等利用ONT平台解析了可能代表栽培菊属祖先基因组的二倍体菊花脑基因组，分析表明其演化受重复序列爆发和近期WGD事件的驱动，该基因
新突破！掌上测序仪首次完成人类全基因组测序
最近，英国牛津大学（Oxford University）Wellcome Trust人类遗传学中心（Wellcome Trust Centre for Human Genetics）和在基因组分析领域领先的英国公司Genomics plc宣布，首次使用掌上纳米孔测序仪完成了多个人类全基因组测序和
人类基因组测序先驱欲进军生物医疗测序领域
J. Craig Venter(中)希望通过利用基因组学实现对抗衰老的目标。 美国人类基因组测序先驱J. Craig Venter将和其新创立的公司Human Longevity Inc.(HLI)进军生物医疗测序领域。HLI是“基因组学和细胞的诊断与治疗公司”，计划于今年夏季启动，终极目
突破耐药基因组测序缺陷－靶向测序对抗耐药菌新契机
自以抗生素为代表的抗菌剂问世以来，细菌对人类健康的危害得到了极大的控制。然而进入21世纪后，情况好似走入了另一个极端——由于抗生素滥用所致的耐药菌的出现以及广泛传播。这是由于在药物的选择压力下，敏感菌株被抑制或杀灭，天然耐药或获得性耐药菌株则继续生存、繁殖和克隆传播，导致细菌的耐药性增高。 细
OPGEN全基因组图谱应用系列——鞭虫全基因组测序
鞭虫是一种常见的土壤传播寄生虫，地理分布广，感染率高，寄生于人体盲肠，导致人体慢性感染，对人类危害巨大。鞭虫的全基因组测序研究由著名的桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）完成，发表在世界顶级期刊《Nature Genetics》上。该研究通过对2种不同
美洲登革热疫情创纪录
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505752.shtm今年到目前为止，美洲已经报告了300多万登革热病例。这意味着，自1980年泛美卫生组织开始收集病例数据以来，2023年已成为登革热年发病率第二高的年份。 ?登革热患者会出现
法国拟建高速基因组测序分析平台
法国总理菲利普17日在巴黎宣布，法国在法兰西岛大区（又称“巴黎大区”）和中部奥弗涅—罗讷—阿尔卑斯大区启动建设两个高速基因组测序分析平台，以推动法国基因组相关研究的发展。 法国政府去年6月提出“法国基因组医学2025”计划，这两个基因组测序分析平台的建设就隶属该计划，预计将于2018年正式开始
科学家完成柑橘基因组测序
美国佛罗里达大学研究人员带领的一个国际研究小组日前完成了对甜橙和克莱门氏小柑橘（为柑橘与酸柑杂交的品种）树的基因测序工作，并公布了相关基因图谱，这在柑橘属果树中尚属首次。 研究人员称，该基因图谱的公布将有助于科学家找到新方法来对抗包括柑橘黄龙病（又称黄枯病、青果病，对柑橘危
《自然》封面：大熊猫基因组测序
由深圳华大基因研究院发起，中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所、成都大熊猫繁育研究基地和中国保护大熊猫研究中心参与的合作研究成果《大熊猫基因组测序和组装》，1月21日以封面故事形式在国际权威杂志《自然》上发表。 在国家林业局、深圳市政府、深圳市盐田区政府及相关企业的支持下，“
我国率先完成枣树全基因组测序
在科技部“十一五”和“十二五”科技支撑计划项目的持续资助下，河北农业大学刘孟军教授研究团队在世界上率先完成了枣树的高质量全基因组测序，组装出总长4.38亿个碱基的枣基因组序列，达估测基因组的98.6%，使枣树成为世界鼠李科植物（近千种）和我国干果树种中第一个完成基因组测序的物种。 相关论文
中药材“甘草”基因组测序完成
科技日报东京10月27日电 （记者陈超）日本理化学研究所、千叶大学、高知大学和大阪大学等组成的一个研究小组宣布，他们对中药材“甘草”进行了全基因组测序，成功取得了推测的全部基因94.5%的基因信息。 甘草是一种豆科植物，广泛应用于各种中药中，是重要的中药原料。它具有改善肝功能、治疗消化性溃疡
Nature新闻：基因组测序追踪超级病菌
研究人员通过基因组测序最终了解了去年困扰英国剑桥一家新生儿特护病房达数月之久的超级细菌疫情。他们将这一案例报告在11月14日的《柳叶刀传染病》(Lancet Infectious Disease)杂志上，标志着首次科学家们通过测序病原体基因组积极控制了一场持续爆发的疫情。 在两天内Ro
当宏基因组遇上单细胞测序
日前，科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性，但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上，研究者人员向人们展示了在四个温泉样本
个人基因组测序预测能力遭质疑
一项新的研究给全基因组测序对每个人都很有用的说法泼了一盆冷水。图片来源：N.J. Roberts等，《科学—转化医学》 “每个人都将拥有自己的基因组序列，并且可以将这些信息装在一个U盘中”——生物医学家曾这样给我们描绘一幅美妙的蓝图，当脱氧核糖核酸（DNA）测序变得很廉价时，这一
近期最受关注的基因组测序研究
想象一下有人递给你一杯奶昔，要你鉴别出里面所有的东西。或许你能够辨别出有一点点的草莓或是酸奶的味道。但总体上它的味道就像是无法分辨的成分构成的混成品。 现在再想象一下，这杯奶昔是由来自大脑的2万个碾碎了的细胞所组成。你可以通过测试来确定样本中有什么分子，这就是科学家们现在所做的事情。这当然会提
近期最热门的基因组测序成果
生物通报道：The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，包括濒临灭绝的几维鸟和极其聪明的章鱼。 种属：甜瓜（Cucumis melo） 西班牙和意大利的研究团队在Molecular Biology and Evolution杂志上率先发布了七个甜瓜品种的基因组分
个人基因组测序收费将大幅降价
新华社伦敦2月9日电针对个人的基因组测序服务刚出现时，测序费用高达上百万美元，普通人望尘莫及。不过，美国一家公司计划从今年6月开始，推出低价个人基因组测序业务，顾客只需支付5000美元，就可向这家公司预约基因组测序服务。 据英国《新科学家》杂志网站报道，这家名为“完全基因组”的公司位于美国