《自然—方法学》：一种分子海绵可吞食调控性RNA
研究人员在8月在线出版的《自然—方法学》上报告，通过基因工程合成的一种抑制剂能够吞食哺乳类动物细胞中的小分子RNA。抑制小分子RNA的活性有助于深入认识它们在正常发育和疾病中的功能。 与更长的信使RNA不一样，小分子RNA没有含有制造蛋白质的信息，它只拥有21个核苷酸，但这种序列却能调控信使RNA的表达。小分子RNA的序列与其目标物——信使RNA的序列部分相连，结果令信使RNA的或是分解或是蛋白质转录的过程被中止。科学家们早已将某种小分子RNA的过度表达与癌症和其他疾病联系起来，因此，深入认识这些小分子RNA的功能非常重要。 Philip Sharp和同事研制出一种可目标阻断小分子RNA的特殊工具，这个工具的基本原理是：用一种补充的假序列来吞食全部的小分子RNA，让信使RNA不受阻挡地表达出蛋白质。与以前描述的化学合成小分子RNA抑制剂的方法相反，这些吞食小分子RNA的“海绵”是通过基因工程编码的，它们提供给......阅读全文
赵方庆团队开发环形RNA定量和差异表达分析新方法
2020年1月3日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》（Nature Communications）杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw
研究人员开发环形RNA定量和剪接体转换识别新方法
2020年1月3日，中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-通讯》（Nature Communications）杂志上发表题为Accurate quantification of circular RNAs identifies extensive circular isoform sw
PNAS：华人科学家揭示神经退行性变背后的“RNA海绵”
近来人们发现，基因C9orf72的突变是肌萎缩侧索硬化症ALS和额颞叶痴呆FTD中最常见的病因。不过，人们还并不清楚该突变引发神经退行性疾病的机制。 Emory大学医学院的研究人员发现，这种ALS/FTD突变形成了一种“RNA海绵”，吸收并隔绝了一个重要的调节蛋白。文章于四月一日发表在美国
SUMO化修饰调控m6A－RNA甲基化酶METTL3及其催化功能分子机制
RNA甲基化是目前最炙手可热的研究领域，近3个月以来，该方向影响因子10分以上的文章数量竟接近20篇。云序生物曾对RNA甲基化研究方法及思路进行了深度剖析，感兴趣的老师可浏览云序生物前期公众号（2018国自然热点二：RNA甲基化研究深度剖析）。 近三个月高分文章部分列表： 2月28日
影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析
云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章，影响因子高达7.8分! 文章导读： 在非编码RNA的大家族中，环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环，所以在生物体中具有稳定性高，不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m
RNA干涉实验——采用RNA聚合酶Ⅲ启动子表达siRNA分子
实验方法原理因为哺乳动物细胞不具备低等真核生物细胞所具有的扩增 RNAi 信号的机制，因此人工合成或体外转录的 siRNA 分子在细胞内的作用是瞬时性的，不适合用于进行靶基因的表达受到抑制后细胞表型的长期变化观察，也不适于进行文库的筛选。此外，体外制备 siRNA 分子的成本比较高，而且 siRNA
激素调控植物干细胞分子机理揭示
山东农业大学张宪省教授带领的研究团队在植物干细胞领域研究取得了重大突破，揭示了激素调控植物干细胞活动的分子机理。6月2日，国际植物学领域顶级学术期刊《植物细胞》发表了这项研究成果。该成果为推动更大范围植物离体快繁、生物育种和基因工程奠定了重要的理论基础。 植物干细胞主要存在于茎端、根端和形成层
关于肝损伤修复及其分子调控机制
肝脏被称为人体的“生命塔”，承担着代谢，解毒，免疫，消化等重要的人体机能。肝脏拥有强大的代偿功能，一般轻伤不下火线。但当今社会快速的工作节奏和不规律的生活习惯，使得肝损伤在现代人群中成为一种常态，因此，关于肝损伤修复及其分子调控机制一直是学术研究热点。 最近几年利用谱系示踪技术发现，肝脏损
关于肝损伤修复及其分子调控机制
肝脏被称为人体的“生命塔”，承担着代谢，解毒，免疫，消化等重要的人体机能。肝脏拥有强大的代偿功能，一般轻伤不下火线。但当今社会快速的工作节奏和不规律的生活习惯，使得肝损伤在现代人群中成为一种常态，因此，关于肝损伤修复及其分子调控机制一直是学术研究热点。最近几年利用谱系示踪技术发现，肝脏损伤后主要是通
关于肝损伤修复及其分子调控机制
利用 CRISPR/Cas9 技术，针对靶基因序列设计 sgRNA， 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂，在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中，靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中，最终导致靶基因无法正常转录翻译，达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR
调控记忆开关的关键分子得到确认
为开发逆转记忆缺失新疗法铺平了道路 英国布里斯托大学研究人员近日在《神经回路前沿》期刊上发表论文称，他们确认了一种关键分子，可以诱发大脑中记忆形成的化学过程，其对大脑分子记忆开关的控制是形成记忆的一个关键步骤。相关研究为开发逆转记忆缺失的疗法提供了一种新的思路。 记忆是如何形成的，是有关
3月21日《自然》杂志内容精选
大脑中的语言组织方式 说话的动作需要嘴唇、下巴、舌头和喉部的活动在时间上精确协调。人感觉运动皮层中的多电极记录显示，语言中所涉及的大脑区域是根据面部和声带的一种 “躯体特定区”表示方式布局的，其中大量细胞相应于特定语音特征。研究人员特别感兴趣的是位于“腹侧感觉运动皮层”“最背
环状RNA结合功能蛋白
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转录前
植物如何实现精准免疫调控？我国成果登《自然》
水稻是主粮，是国家安全的基础。5月15日，记者从中国科学院分子植物科学卓越创新中心了解到，中国水稻生产主要面临的挑战包括：一、水稻生长过程中常常受到稻瘟病等病原真菌的侵扰，过度依赖化学农药，从而对环境和食品安全构成严重威胁。二、水稻对磷、氮等营养元素的巨大需求，导致过度施肥，严重污染环境。因此，深入
环状RNA研究方法（二）
在此基础上，哪些环状RNA分子发生了差异表达？在这里火山图、Venn图应有尽有。根据p=2的标准，一共发现42个环状发生上调，47个环状发生下调。 图3. 差异环状RNA的筛选2. 差异环状RNA分子的qPCR验证对于一篇做谱的文章，差异环状RNA的结果验证只需做到qPCR即可。对5个上调和5个下调
计算小RNA分子的单细胞测序新法
最近，卡罗林斯卡学院的研究人员开发出了一种单细胞程序，测量了单个胚胎干细胞中短的非编码RNA序列的绝对数量。这种新方法可以加深我们对于“基因是如何被调节、不同的细胞类型如何发展”的理解。相关研究结果发表在10月31日的《Nature Biotechnology》。当我们基因中的信息被使用时――例如构
复旦大学揭示－DNAzyme－剪切－RNA－分子机制
国际知名学术期刊《自然·通讯》（Nature Communications）日前在线 发表 了复旦大学生命科学学院、遗传工程国家重点实验室甘建华课题组与麻锦彪课题组合作的关于 RNA-cleaving DNAzyme 的研究成果。该研究用 X -射线晶体学方法解析了 8 -17 DNAzyme
小分子RNA的识别方法的介绍
多个研究小组采用生物化学结合以及生物信息学的方法开展对miRNAs的研究工作。由于据推测都是由Dicer酶降解RNA得到的，21—23个碱基大小、有5’端磷酸基和3’羟基的RNA片段，有的实验室采用改良的定向克隆方法来筛选具有相同特征的小分子——筛选一定大小的RNA分子，连接到3’和5’的适配子
科学家揭示了竞争性内源RNA作用于经典的双负反馈回路
竞争性内源RNA (ceRNA)假说提出了一种调节生物学过程的内在机制。miRNA是调控生物功能的核心分子，ceRNA（如高表达的mRNA）可以中合miRNA，通过类似海绵吸水的效应来调控生物过程。但是ceRNA的动态变化是否能通过ceRNA来影响miRNA的活性，进而调控重大疾病仍然存在争议
揭示RNA－m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制
免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地，其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原，难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点，提高免疫治疗效果。 中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、
非编码RNA调控作用机制重大研究计划项目申报
关于发布“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2014年度项目指南的通告 国科金发计〔2014〕59号 国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2014年度项目指南，请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事
非编码RNA的调控作用机制研究计划项目指南
非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究，有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络，从不同于蛋白质编码基因的角度注释和阐明基因组的结构与功能，深入阐明生命活动的本质和规律。 一、科学目标 本重大
营养所在RNA剪接调控研究中取得新进展
近日，PNAS在线发表了中科院上海生科院营养科学研究所冯英研究组的最新研究进展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
非编码RNA调控的新的胃癌促癌基因
近日，重庆医科大学药学院肖斌教授团队与陆军军医大学（原第三军医大学）国家免疫生物制品工程技术研究中心邹全明教授团队在肿瘤学领域权威杂志《Oncogene》（JCR 1区）在线发表了题为“The miR-29c-KIAA1199 axis regulates gastric cancer mig
RNA甲基化调控基因出核新机制
中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂研究组和郑州大学第一附属医院生殖与遗传专科医院孙莹璞研究组、中国科学院生态环境研究中心汪海林研究组合作研究，揭示了m5C（5-甲基胞嘧啶）修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。该研究成果以5-
非编码RNA调控骨骼肌发育研究取得进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508336.shtm骨骼肌约占成年动物体重的45%～60%，是维持动物运动和代谢功能的重要组织。经济动物骨骼肌纤维的数量和质量直接影响了产肉能力和肉品质，决定了动物的经济价值。动物肌纤维数量在胚胎期基本固
关于真核生物的基因调控—RNA分工的介绍
真核生物的基因调控—RNA分工：与原核生物不同，真核生物有三种不同的 RNA多聚酶，它们各自负责不同类型的基因的转录。从表中不难看出由RNA多聚酶Ⅰ和Ⅲ转录的RNA都与所有细胞的生命活动的基本功能──翻译有关，而只有 RNA多聚酶Ⅱ才能转录结构基因而进一步产生蛋白质。显然这种分工反映了这三类基因
生物所揭示非编码RNA协同调控固氮机制
近日，中国农业科学院生物技术研究所微生物功能基因组创新团队林敏课题组在水稻根际联合固氮施氏假单胞菌中发现新型非编码RNA参与协同调控固氮酶活性，为进一步揭示生物固氮网络调控机制奠定了重要理论基础。相关研究成果在线发表于《应用环境微生物学（Applied and Environmental Mic
基于基因工程机器的生物传感和生物调控放大器件的研究
2014年8月26日，第十三届全国青年分析测试学术报告会在陕西西安南洋大酒店隆重开幕。来自全国各地的分析测试学界代表近200人参加了此次报告会，分析测试百科网作为合作媒体全程跟踪报道了此次会议。来自北京理工大学生命学院的邓玉林教授做了题为《基于基因工程机器的生物传感和生物调控放大器件的研究》的报
上海生科院揭示反向剪接RNA成环与RNA转录的偶联机制
4月19日，国际学术期刊Cell Reports 发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组与计算生物学研究所杨力研究组最新合作研究论文。此工作深入研究了环形RNA生成与RNA转录的偶联机制，揭示了环形RNA在神经分化过程中表达上调原理。 环形RNA是一类通过反向