中科院“细菌全基因组测序及分析”取得阶段性成果
中科院北京基因组研究所的胡松年研究员和浙江大学医学院附属二院的胡讯教授合作研究的项目“细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序及分析”取得阶段性成果，相关论文发表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方从K562细胞系中分离到的兼性细菌。系统分类学上，该细菌属于Phenylobacterium。早期研究者发现Phenylobacterium属细菌可以把苯丙氨酸(phenylalanine)作为唯一碳源，故将该细菌属命名为Phenylobacterium。P.zucineum基因组含有苯丙氨酸代谢通路的所有关键基因，这为Phenylobacterium属细菌利用苯丙氨酸提供了遗传依据。P.zucineum能在细胞外自由生长，又能在体外培养的细胞系中长期生存，具有强大的环境适应能力。P.zucineum基因组编码大量的细胞外周sigma作用因子，转录调节蛋白，双相信号传递蛋......阅读全文
Cell子刊：揭秘细菌的耐受基因
科学家们发现，细菌的一个基因能够关闭自身的蛋白合成进入休眠状态，以便逃过抗生素的攻击。文章发表在Cell旗下的Molecular Cell杂志上。 上世纪四十年代人们发现，一群细菌中总有那么一两个，能够在抗生素的攻击下生存下来，这一现象被称为细菌的耐药性。细菌耐药性依赖于细胞的休眠，这
细菌的抗药性早有基因根源
抗生素作为药物问世还不到一百年，如今具有抗药性的“超级病菌”已让医学界头疼。的抗药性如何产生？加拿大研究人员最近报告说，他们从3万多年前的细菌DNA中分离出了抗药基因，首次通过严谨的实验表明，抗药性基因根植于细菌，甚至远早于人类发现抗生素。 加拿大麦克马斯特大学的研究人员从该国西北部的育空地区钻取沉
细菌基因组DNA提取方法综述
细菌基因组DNA的提取方法综述，提供了5种方法。 1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中，12000rpm离心1min, 丢去上清夜，收集菌体。B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混匀,置于37oC水浴1hr
细菌中制备基因组DNA实验
小量制备 氯化铯法 实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿
细菌中制备基因组DNA实验
实验方法原理 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。实验材料 细菌试剂、试剂盒 TE氯化铯溴化乙锭NaCl乙醇CTAB仪器、耗材 离心机摇床实验步骤 1
中科院、华大基因发表Nature新文章
由中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院领导的一个国际研究小组完成了对太平洋牡蛎(Pacific oyster)的测序、组装与分析，这是第一个测序的软体动物基因组，将有助于填补我们对于种类丰富而较少研究的软体动物家族的了解空白。这一研究在线发布在9月19日的《自然》(Nature)杂志上，
中科院Science公布最新基因组
继2012年中国科学院昆明动物研究所、深圳华大基因研究院等单位合作完成了首个山羊全基因组图谱之后，6月昆明动物研究所，华大基因等处的研究人员又公布了绵羊基因组序列，并且将这一基因组与其它哺乳动物基因组进行了比对，构建了相关的系统发育树。这一研究成果公布在6月6日Science杂志上。 参与这项
Nature:－人类肠道细菌具有获得性细菌防御（AID）基因簇
近日，美国华盛顿大学的科研人员在Nature上发表了题为“Human gut bacteria contain acquired interbacterial defence systems”的文章，发现肠道中的几种拟杆菌属（Bacteroidales sp.）的细菌具有基因簇防御功能，可以中和
中科院深圳先进院发现细菌细胞周期控制规律
中科院深圳先进技术研究院合成生物学工程研究中心研究员刘陈立团队，近日在细菌细胞周期控制领域取得重要研究进展，相关论文“扰动细胞尺寸探寻大肠杆菌细胞周期”发表于《美国科学院院刊》。 不同物种细胞的基因组序列各不相同，其细胞形态与大小也各异。即使基因组序列完全一致的细胞，其形态与大小也并非一成不变
中科院最新研究成果使铲除“超级细菌”成为可能
中科院生物物理研究所研究员黄亿华团队的一项最新研究成果为研发攻克“超级细菌”的新型抗生素铺平了道路，使铲除“超级细菌”成为可能。国际知名学术期刊《自然》近日在线发表了这项重要成果。 长期以来，由于滥用抗生素导致细菌耐药，产生所谓的“超级细菌”，已成为一个全球医疗卫生难题。 世界卫生组织的数
中科院国家纳米中心在肿瘤细菌疗法方面获进展
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497825.shtm 近日，国家纳米科学中心聂广军研究员与赵潇研究员在肿瘤细菌疗法方面取得重要进展。相关研究成果以Modular-designed engineered bacteria for pr
用转基因光合细菌生产单糖好处多
美国哈佛大学维斯生物启迪工程研究所和哈佛医学院的研究人员表示，光合细菌进行基因工程改造后能够产生单糖和乳酸，利用该项研究成果有望开发出新的环保型生产日用化工产品的方法。相关研究刊登在新出版的《应用和环境生物》杂志上。 光合细菌（PSB）是一种能进行光合作用而不产氧的特殊生理
科学家从北极细菌提取“耐寒基因”
加拿大研究人员从北极的喜寒细菌中提取的基因可以让某些细菌变得对温度非常敏感，因此，植入了这些耐寒基因的细菌菌株在一定温度下会死亡，这有助于研究人员研发出稳定的肺结核和其他传染病活疫苗。相关论文发表在最近出版的美国《国家科学院院刊》（PNAS）上。 研究人员表示，所有的细菌在进化过程中
“超级细菌”的耐药性基因可遗传
德国科学家日前发布的一项研究成果显示，让细菌具有耐药性的基因不仅能够跨越不同物种传播，还能通过接触染色体而遗传。 以某些大肠杆菌为代表的革兰氏阴性菌已对多种抗生素具有耐药性。目前，多粘菌素是对抗耐药性细菌的最后一道防线，但是一个名为MCR－1的基因会让细菌对多粘菌素也产生耐药性，变成“超级细
反义RNA的调控细菌基因的表达功能
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补，因此在体外mic
科学家发现细菌基因表达常规机理
美国纽约大学兰贡（Langone）医学中心的科学家发现和阐述了细菌体内控制转录延伸（transcription elongation）的常规机理。在4月23日出版的《科学》杂志上，他们表示，该机理依赖游离核糖体和核糖核酸聚合酶（RNAP）之间的协同作用，因为这种协同作用使得转录率对应于转
美用转基因细菌合成高能火箭燃料
图：石油基燃料和先进生物燃料的能量密度比较。先进生物燃料(绿色)与石油基燃料(黑色)相比，能量密度较低。蒎烯二聚体(红色)与石油基燃料JP-10能量密度类似。 目前的生物燃料体积热值太低，在应用与火箭、导弹中时，高能燃料非常重要。有一种从树木中提炼的化合物蒎烯，经二聚化后生成蒎
细菌的限制修饰系统包含哪些基因？
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因：（1）hsd R：编码限制性核酸内切酶（2）hsd M：编码限制性甲基化酶（3）hsd S：编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
人造细胞－美利用人造基因“复活”细菌
美国一个研究小组20日报告说，他们合成了一个人工基因组，并用它使一个被掏空的单细胞细菌“起死回生”。研究人员表示，这是第一个完全由人造基因指令控制的细胞，它向人造生命形式迈出了关键一步。 美国J·克雷格·文特尔研究所的研究人员在最新一期美国《科学》杂志上报告说，他们人工合成了一种名为
基因测序是怎么判断病毒或者细菌来源
目前以新冠病毒来解释，首先病毒的体外活性，其实他与病毒的种类和体外环境因素有关。病毒的起源似乎并不一定与其体外失活有关。由于病毒不能形成化石，其复制机制复杂，因此研究病毒的起源非常困难。事实上，它们可以感染几乎所有的生物，这使得问题更加复杂。一些病毒如疱疹病毒和单核细胞增多症病毒与其宿主细胞的基因有
《科学》：古老蛋白塑造细菌紧凑基因组
该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素 与人类相比，细菌不携带过多的“垃圾DNA”，它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA，而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现，细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为R
科学家发现细菌基因表达常规机理
美国纽约大学兰贡（Langone）医学中心的科学家发现和阐述了细菌体内控制转录延伸（transcription elongation）的常规机理。在4月23日出版的《科学》杂志上，他们表示，该机理依赖游离核糖体和核糖核酸聚合酶（RNAP）之间的协同作用，因为这种协同作用使得转录率对应于
细菌基因或推动陆地植物进化
数亿年前从微生物转移到绿藻的基因可能推动了陆地植物的进化。一项分析表明，来自细菌、真菌和病毒的数百种基因已被整合到植物中，使后者具有适于陆地生活的特性。3月2日，相关论文发表于《分子植物》。 “我们的研究改变了陆地植物进化的传统观点。”论文通讯作者、美国东卡罗莱纳大学生物学专家黄金玲（音译）说，
英发明高效识别细菌“有用”基因新技术
英国研究人员16日报告说，他们发明一种快速高效分析细菌基因组中成千上万个基因的新技术，可以在一次实验中识别出“有用”的基因，从而防治细菌导致的疾病。 英国桑格研究所16日发布新闻公报说，这种名为TraDIS技术的实质是在基因层面上的“剪切和粘贴”。基因是DNA链上具有特定功能的一个片段，如
反义RNA调控细菌基因的表达功能介绍
反义RNA对编码CAP的基因的调控作用已如前述。这里再介绍一下micF RNA对ompF基因的表达的调控。ompF蛋白质是大肠杆菌的外膜蛋白的主要成分这一。micF RNA是从另一基因(ompC基因)附近的DNA序列转录而来，和o-mpFn RNA的5'端有70%的序列互补，因此在体外m
基因改造细菌将废气转为化工原料
美国西北大学和郎泽科技公司研究人员在最新一期《自然·生物技术》发表论文称，他们在一项新的试点研究中，将一种梭菌进行遗传工程改造，用于合成此前它们无法产生的化合物，这种选择、设计和优化细菌菌株的过程，成功地证明了其将CO2转化为丙酮和异丙醇的能力。这种新的气体发酵过程不仅可从大气中去除温室气体，还
真菌细菌如何影响基因表达和肿瘤存活
共聚焦显微镜下可见白色念珠菌生物膜代谢物刺激SCC25细胞 一项由巴西São Paulo州立大学(UNESP)的一组研究人员进行的体外研究显示了真菌和细菌如何激活与头颈部肿瘤相关的基因，由于生物膜的代谢(这些微生物以一种有结构和协调的方式自组织的群落)通过有利于肿瘤发展和抵抗治疗所需的细胞
细菌基因转移与重组的方式有哪些？
1.接合作用：当细菌与细菌相互接触时，质粒DNA就可从一个细菌转移到另一个细菌。2.转化作用：由外源性DNA导入宿主细胞，并引起生物类型改变或使宿主细胞获得新的遗传表型的过程，称为转化作用。3.转导作用：当病毒从被感染的细胞释放出来，再次感染另一细胞时，发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因
中科院新研究:－抗生素滥用增强肠道细菌耐药性
抗生素滥用或过度使用会引发一系列问题。近日，中国科学院微生物所朱宝利研究员带领的研究团队对中国、丹麦和西班牙人的肠道微生物耐药基因进行了分析，结果发现，中国人肠道微生物的耐药基因类型较多，而且这三个国家的人群，肠道微生物的四环素耐药基因型都很高。科研人员据此推测，这种情况的产生很可能与兽用抗生素
中科院基因组测序平台联盟成立
2月12日上午，在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下，中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。 会上，北京基因组所副所长、党委