中科院“细菌全基因组测序及分析”取得阶段性成果
中科院北京基因组研究所的胡松年研究员和浙江大学医学院附属二院的胡讯教授合作研究的项目“细菌Phenylobacterium zucineum全基因组测序及分析”取得阶段性成果，相关论文发表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方从K562细胞系中分离到的兼性细菌。系统分类学上，该细菌属于Phenylobacterium。早期研究者发现Phenylobacterium属细菌可以把苯丙氨酸(phenylalanine)作为唯一碳源，故将该细菌属命名为Phenylobacterium。P.zucineum基因组含有苯丙氨酸代谢通路的所有关键基因，这为Phenylobacterium属细菌利用苯丙氨酸提供了遗传依据。P.zucineum能在细胞外自由生长，又能在体外培养的细胞系中长期生存，具有强大的环境适应能力。P.zucineum基因组编码大量的细胞外周sigma作用因子，转录调节蛋白，双相信号传递蛋......阅读全文
细菌利用基因开关来防御金属带来的死亡
格里菲斯大学的研究人员在一种常见细菌中发现了一种基因开关，这种基因开关有助于防御人体的自然免疫系统。格里菲斯大学药学院的Matthew Sullivan博士和Kelvin Goh博士研究了B族链球菌对锌和铜金属的反应，并发现了细菌能够抵抗金属压力的多种方式。沙利文博士说:“我们观察到B组链球菌的基因
人体肠道细菌基因组集研究成果
2019年2月5日上午，深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集（Culturable GenomeReference, CGR）研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组，为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据，同时
科学家揭示超级细菌产生耐药基因原因
[提要] 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”，而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力”，选择并进化这些整合有“耐药基因”的病菌，使得后者最终成为人类的噩梦――临床上的“耐药菌”。 自然界(非临床环境)中本来就存在大量的“天然耐药基因”，而人类对抗生素的滥用如同“筛选压力
科学家合成“最小”细菌－仅有473个基因
当谈到基因组的大小时，一种被称为衣笠草的罕见日本植物无疑是当下的重量级冠军——其脱氧核糖核酸（DNA）数量是人类的50倍。而在天平的另一端，一个新的轻量级纪录保持者如今诞生在美国加利福尼亚州的一个培养皿中。在3月25日出版的《科学》杂志中，由基因组测序先驱Craig Venter率领的研究人员报
中科院基因组测序平台联盟成立
2月12日上午，在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下，中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。 会上，北京基因组所副所长、党委
中科院海洋所破译海参基因组
记者从中科院海洋所获悉，国际学术期刊PLoS Biology13日在线刊发了由中国科学院海洋研究所杨红生研究员课题组和相建海、李富花研究员课题组主导，天津生物芯片技术公司、加拿大纽芬兰纪念大学等单位合作，由张晓军、孙丽娜、袁剑波等青年科研人员为共同第一作者，协力完成的研究论文“The sea c
Autophagy：中科院研究揭示学习记忆功能相关基因
中科院生物物理所张宏课题组最近在权威期刊Autophagy上发表了题为“The autophagy gene Wdr45/Wipi4 regulates learning and memory function and axonal homeostasis”的研究论文，报告了他们在Wdr45/W
中科院，港中大PNAS基因编辑研究新成果
近日来自香港中文大学、中科院广州生物医药与健康研究院等机构的研究人员成功利用遗传工程转录激活因子样效应物核酸酶(TALENs)技术在爪蟾胚胎中获得了高效的靶向基因破坏。相关论文“Efficient targeted gene disruption in Xenopus embryos usi
中科院、华大基因Nature子刊测序新成果
来自中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院和亚利桑那大学等机构的研究人员完成了对短花药野生稻(Oryza brachyantha)的全基因组测序，并揭示出了稻属基因组进化的机制。相关成果发表在3月12日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。
中科院、华大基因联合发表NatureGenetics新文章
由中科院动物研究所和深圳华大基因研究所领导的一个研究小组成功重建了大熊猫从起源至今连续的种群演化史。研究结果表明：全球气候变化是上百万年来熊猫种群波动的主要驱动因素，人类活动有可能是近期熊猫种群分化和数量严重下降的重要原因。这一研究为评估和建立其他濒危物种最好的保护方法提供了一个极好的范例。最新
中科院团队发现抑制高毒力超级细菌感染致病的非编码RNA
近日，中国科学院上海免疫与感染研究所晁彦杰研究组在《自然-通讯》（Nature Communications）上发表了题为RNA interactome of hypervirulent Klebsiella pneumoniae reveals a small RNA inhibitor of
长读测序发现高达20％的果蝇基因来自细菌
科学家芭芭拉·麦克林托克在20世纪40年代首次发现了“跳跃基因”，即那些可以在其他物种基因组内移动或转移到其他物种基因组中的基因。然而，研究人员继续发现它们在进化和健康中的重要性。在UMSOM和IGS的微生物学和免疫学教授Julie Dunning Hotopp博士的带领下，IGS的研究人员使用了新
英专家称“超级细菌”基因强悍－难治但易防
“超级细菌”近来引发全球关注，英国因其科研人员主导相关研究和国内病例数量较多而成为这一事件的焦点。记者就此采访了英国加的夫大学的马克·托尔曼博士。他指出，“超级细菌”的超强抗药性来源于一个强悍基因，虽抗药性超强，但致病性却并不一定强。对个人而言，多洗手，注意饮食卫生是目前简单有效的预防
《科学》：细菌能将基因转移到复杂有机体
细菌等微生物之间的横向基因转移（lateral gene transfer）现象频繁发生，这对于它们的进化发展至关重要。美国科学家最新研究发现，细菌也能将基因转移到复杂有机体中去。这将促使科学家重新思考种间基因转移在进化中的作用，也使得遗传学家今后在为新基因组排序时，不得不采用新的方法以过滤掉细菌基
王友绍团队发现浮游细菌基因转移因子
近日，中科院南海海洋所研究员王友绍团队在南海北部首次发现浮游细菌的基因转移因子。相关成果发表在《公共科学图书馆·综合》上。 基因转移因子广泛存在于海洋细菌基因组上，可传递抗光合基因、固碳基因和硫还原基因等。目前，对海洋细菌基因转移因子研究尚处于起步阶段。 基因转移因子是一种由细菌释放的、形态
基于SHERLOCK的基因工具快速而全面地口腔细菌
由于一种使用SHERLOCK（CRISPR的进化版）检测唾液中细菌的新型工具，这在未来可能可以帮助人们在检查后很快带着关于口腔健康的更全面信息离开牙医。这种精确的工具比现有的方法要快得多，并可能导致口腔和其他疾病的早期检测和治疗。 来自马萨诸塞州福斯研究所的研究人员调整了基于基因编辑的CRIS
细菌基因组DNA快速提取试剂使用说明
细菌基因组DNA快速提取试剂◆ 产品说明核酸抽取系列是检测试剂配套使用的DNA/RNA提取系列产品。本产品为细菌基因组DNA快速提取试剂，采用独特的溶解系统，可快速地从样品中制备DNA。提取过程中无需使用有毒的酚氯仿，也无需进行耗时的醇类沉淀，整个过程只需10-15分钟。◆ 产品组成 071011M
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（二）
三.组织或液体样品中细菌DNA提取该方案适合于从各种组织、血液、分泌液等液体样品中提取基因组DNA和寄生的细菌DNA。纯化的DNA可直接用于各种细菌的检测。若需从粪便样品中提取细菌DNA，我们推荐使用DePure Stool DNA Kit，若需要从土壤样品中提取细菌DNA，推荐使用DePure
使用基因测试可精确区分病毒和细菌感染
美国杜克大学医学院的研究人员近日研发出一种基因测试方式，可以准确区分病毒或细菌感染，从而有助于减少不必要的抗生素过量服用以及进而出现的细菌耐药性等问题。 杜克大学医学院的研究人员通过血液基因测试，成功区分了人类呼吸系统疾病的病毒和细菌感染，准确率可达90%以上。 这种测试可以检测出患
方法二：细菌基因组DNA的微量提取法
本方法通过SDS裂解细胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分一：仪器：同方法一 二：试剂：TE、TAE缓冲液；10%SDS；５ＭNaCL；20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml水中，缓慢加入10gCTAB，加热溶解)；
细菌基因组DNA提取试剂使用说明（一）
细菌基因组DNA提取试剂使用说明书◆ 产品说明基于硅胶柱纯化方式。试剂中的溶菌酶消化去除细菌的细胞壁，革兰氏阳性细菌还可加入玻璃珠涡旋破壁，在裂解液和蛋白酶作用下裂解消化，DNA释放到裂解液中。加入乙醇后，转移至吸附柱中过滤，DNA被吸附至吸附柱的膜上，而蛋白质则被去除。吸附柱经Buffer G
中科院学部主席团倡议规范转基因研发
记者今天从中科院获悉，中科院学部主席团发布《关于负责任的转基因技术研发行为的倡议》（以下简称《倡议》），倡议从事转基因基础研究、应用研究和产品开发的科研人员以及在相关机构中负责转基因技术安全监测和评价、检测技术研究的科研人员，以对人类社会发展高度负责任的态度，加强职业操守，规范科研行为，履
中科院昆明动物所等发布新款基因测序软件
中科院昆明动物研究所研究员马占山与美国马里兰大学叶承曦博士在基因测序领域的合作再次取得重要突破。合作团队近日正式发布了一款代号为 Sparc 的软件。 针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%~40%的问题，该团队研发出了一套“线性复杂度”（复杂性最低）的算法，Sparc软件即基于该新算法完成
中科院大连化物所等揭示肝癌重要抑癌基因
中科院大连化物所生物技术研究部朴海龙团队与大连医科大学附属第一医院肝胆外科谭广团队合作，解释了肝癌细胞中去泛素化酶USP10的生物分子功能及分子机制。相关成果日前发表于《癌症快讯》杂志。 肝癌是异质性强、死亡率高的难治性恶性肿瘤，我国肝癌患者的五年生存率仅为15%左右。这在很大程度上源自肝癌切
华大基因、中科院Nature子刊发表新成果
OpGen公司今日宣布，通过利用ARGUS® Whole Genome Mapping System技术结合新一代测序技术(NGS)，生成了首个家山羊(domestic goat)的高质量参考基因组。这一研究是由深圳华大基因研究院和中科院昆明动物研究所领导，相关成果发表在《自然生物技术》
中科院院士金力：基因学“不只是有趣”
炎炎夏日，为什么一些人更容易晒黑？原来，这是基因在捣鬼。近日，中国科学院院士金力帮记者解开了这个谜题。 不过，他表示，目前究竟是哪个基因在掌控“变白变黑”还需要进一步研究。 人类基因组是人类进化遗传过程中最忠实的记录者，其蕴含的信息远超过我们的想象。 不久前，金力与其团队的一项研究成果就
中科院海外评审最新《Cell》：旧基因新发现
来自约翰霍普金斯大学医学院细胞工程研究院，国立卫生研究院精神卫生研究院（National Institute of Mental Health），加州大学戴维斯分校的研究人员报道了一个在精神分裂症和其它神经失序症扮演了重要角色的基因，其作用比之前科学家们认为的要广泛的多，这些新发现的功能也许解释了为
纳米颗粒在中科院细菌外膜囊泡的肿瘤免疫治疗体系研...
纳米颗粒在中科院细菌外膜囊泡的肿瘤免疫治疗体系研究进展的应用肿瘤免疫治疗可通过激活人体自身免疫机能杀灭肿瘤细胞，具有十分广阔的应用前景，但肿瘤免疫抑制微环境已成为掣肘肿瘤免疫疗法发挥功效的关键问题。近日，中科院过程工程所生化工程国家重点实验室马光辉研究员和魏炜研究员团队发现了细菌天然分泌的单纯细菌外
《基因组生物学》：一种超级细菌的基因组测序完成
最近，英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作，研究结果显示，这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
Genome－Res：全基因组测序追踪耐药细菌传播机制
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是一种常见的引发院内感染的致病菌，其也是资源不足医院感染的一大负担，此前当资源较好的临床机构运用全基因组测序来追踪MRSA的扩散时，针对有限的感染控制的传播动力学常常并不清楚，近日，来自剑桥大学的研究人员就利用全基因组测序的技术揭示了高传播率的资源受限医院中M