植物所发现重复基因结构分化机制及其对生物进化的重要性

基因的重复和分化为生物的演化提供了原材料。重复基因的分化可以发生在调控区或者编码区。发生在编码区的、能够导致功能分化的突变大体上分为两类,即非同义替换和内含子-外显子结构变化,前者导致同源位点上的氨基酸替换,后者则引起氨基酸的插入和缺失。作为点突变的一种方式,非同义替换的机制、速度和后果都已比较清楚。但是,相对而言,人们对内含子-外显子结构分化的研究尚不深入。 继2007和2009年发现内含子-外显子结构分化对重复基因分化的贡献之后,系统与进化国家重点实验室孔宏智研究组对这一问题进行了进一步的研究。通过深入分析612对重复基因(即旁系同源基因)和300对非重复基因(即直系同源基因),该研究组不但再次确认了内含子-外显子结构分化在重复基因分化中的普遍性和重要性,而且发现了导致结构分化的三类主要机制(即插入/缺失、外显子化/假外显子化和外显子/内含子获得/丢失)发生的频率及其对结构和功能分化的作用各不相同。 有意思的......阅读全文

内含子早现的定义

中文名称内含子早现英文名称introns early定  义认为内含子非常古老,早就出现在进化早期的基因中,现正逐渐从真核基因组中丢失的假说。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)

关于内含子的起源介绍

  内含子起源有两种假说。  1.内含子与它所在的基因一样古老,在装配第一个这样的基因时,内含子就已存在。早期的内含子具有自催化、自我复制等能力,因此,它们是原始基因和基因组的组织与复制必不可少的部分。而原核生物和少数低等的真核生物,由于它们需要进行快速的DNA复制从而进行快速的细胞分裂,因而失去了

内含子迟现的概念

中文名称内含子迟现英文名称introns late定  义认为内含子是在近期演化中才出现的,在真核基因组中逐渐积累的假说。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)

细胞化学词汇核内含子

中文名称:核内含子英文名称:nuclear intron定  义:存在于核基因中的、隔开外显子的、但转录后须经加工切除的序列。核内含子的5′端和3′端分别具有保守的GT和AG序列,为内含子被剪接除去的识别位点。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

结构基因的结构

  人类结构基因4个区域:①编码区,包括外显子与内含子;②前导区,位于编码区上游,相当于RNA5’末端非编码区(非翻译区);③尾部区,位于RNA3’编码区下游,相当于末端非编码区(非翻译区);④调控区,包括启动子和增强子等。基因编码区的两侧也称为侧翼顺序(图3-1)。  1.外显子和内含子 大多

载脂蛋白基因结构

  载脂蛋白基因的分离是通过用相应的cDNA作为探针筛选基因文库而完成的。比较基因的核苷酸序列与cDNA的核苷酸序列得以鉴定基因的内含子与外显子数目以及它们的分界线。大部分真核细胞的基因含有内含子,内含子不编码氨基酸,但有些内含子参与基因表达的调控。外显子通常占据基因内的三个区域:第一个区域不编码氨

载脂蛋白CII的结构及生理功能

  结构  人Apo CⅡ为含79个 氨基酸残基的单链多肽,分子量为9.1kD。先合成的Apo CⅡ含101氨基酸残,其中 22个氨基酸构成信号肽,除去信号肽后则转变为成熟Apo CⅡ。Apo CⅡ的等电点为5.0,其氨基酸组成有3个特点: ⑴缺乏组氨酸和半胱氨酸; ⑵ 含有较多的极性氨基酸; ⑶苏

真核基因组的单拷贝顺序的内容介绍

  一、真核基因组的单拷贝顺序的简介  单拷贝顺序在单倍体基因组中只出现一次或数次,因而复性速度很慢。单拷贝顺序在基因组中占50-80%,如人基因组中,大约有60-65%的顺序属于这一类。单拷贝顺序中储存了巨大的遗传信息,编码各种不同功能的蛋白质。目前尚不清楚单拷贝基因的确切数字,但是是有其在单拷贝

全外显子测序和高通量测序一样吗

能否简述下全外显子测序和普通的基因测试、全基因组测序有什么不同...全外显子组测序,是指利用序列捕获技术将只占基因组1%的外显子进行高通量测序,从而检测出约85%的致病突变,测序深度更高,数据更有效,变异检测更准确。全基因组测序,是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,可以同时

为什么QPCR引物设计在跨外显子的接头区

如果反转录体系里面有基因组残留,而且你的引物没有跨内含子,这样的情况下就很容易造成你的Ct偏小(除了cDNA扩增外,基因组的模板也会作为模板进行扩增,导致模板起始量偏高);cDNA逆转后是切除内含子的,而基因组是存在内含子的,如果你的引物设计在了跨两个外显子的区域,则只能扩增cDNA而不扩增基因组。

关于第Ⅲ类内含子的剪接hnRNA的剪接的介绍

  核基因hnRNA内含子的剪接点序列为…外显子…↓GU…内含子…AG↓…外显子…,这就是普遍适用的所谓Breathnach-Chambon规则(GU-AG规则)(GU-AG rule),此规律不适合于线粒体和叶绿体的内含子,也不适合于tRNA和某些编码rRNA的核结构基因,酵母的分支位点序列是高度

关于断裂的基因的介绍

  也是在1977年发现的,它是内部包含一段或几段最后不出现在成熟的mRNA中的片段的基因。这些不出现在成熟的mRNA中的片段称为内含子,出现在成熟的mRNA中的片段则称为外显子。例如下面这一基因,有三个外显子和两个内含子。在几种哺乳动物的核基因、酵母菌的线粒体基因以及某些感染真核生物的病毒中都发现

关于外显子基因识别的基本介绍

  许多基因中遗传上的“无义”片段——即内含子,会妨碍基因指导蛋白质的合成。现在,一篇发表于3月11日期的《自然遗传学》杂志上的文章提出了基因识别这些内含子的新机制。  细胞产生一种蛋白质时,首先需要将编码蛋白质的基因转化成RNA分子,接下来,通过细胞的剪接机制除去有潜在破坏作用的内含子,再把基因序

Cmyc癌基因的结构及表达

  c-myc基因是禽类髓细胞病毒(AMN)MC-29的V-myc的细胞同源序列,从MC-29病毒中分离的V-myc是gag-myc融合体,它由1358个bp的gag基因与1568个bp的V-myc基因共同组成。C-myc基因由3个外显子及2个内含子组成,第一个外显子不编码,只起调节作用,只有外显子

关于myc基因的结构及表达的介绍

  c-myc基因是禽类髓细胞病毒(AMN)MC-29的V-myc的细胞同源序列,从MC-29病毒 中分离的V-myc是gag-myc融合体,它由1358个bp的gag基因与1568个bp的V-myc基因共 同组成.C-myc基因由3个外显子及2个内含子组成,第一个外显子不编码,只起调节作 用,只有

关于Ⅱ型内含子的基本信息介绍

  同I型内含子类似,是一类具有酶催化功能的内含子,转录成RNA后,可以自我剪接。Ⅱ型内含子以与剪接体类似的方式进行剪接,但不需要任何蛋白质(自剪接)。  Ⅱ型内含子是主要存在于线粒体中的一类内含子,它的剪接位点类似于核编码结构基因的内含子,并同样遵从GU-AG规律。剪接机理同核内含子的剪接相似,也

卵白蛋白结构的相关介绍

  卵白蛋白是一种磷糖球蛋白, 等电点为4.5, 由385个氨基酸组成, 分子量为44.5 ku, 包含约3%的糖基组分。卵白蛋白分子不耐酶解, 用链霉蛋白酶水解其晶体, 可以生成5个含天冬酰胺糖基的组分。  卵白蛋白基因家族及其结构已基本上被人们所了解, 其基因长为7 564 bp, 编码1 87

外显子混编的功能

即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编而成。这种基因片段可能就是外显子,因此称为外显子混编。

外显子的基因反应

剪接方式并不是唯一的(参看替代剪接),所以外显子只能在成体mRNA中被看出。即使是使用生物信息学方法,要精确预测外显子的位置也是非常困难的,外显子的识别及其拼接都是难题。 真核生物的基因,其线性表达被内含子阻断,这就是所谓的断裂基因(英语splitgene),该现象的发现者RichardJ.Robe

外显子跳读的概念

中文名称外显子跳读英文名称exon skipping定  义跳过一个或多个外显子剪接为成熟的mRNA,是mRNA剪接多样性中的一种主要方式。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

什么叫跨外显子

这是针对逆转录pcr而言,所谓的跨外显子就是一个引物(比如上游引物)、出现在两个外显子交界,那么做RT-PCR时,dna 由于2个外显子被内含子隔开,引物就不会起作用了

外显子重复的定义

中文名称外显子重复英文名称exon duplication定  义(1)一个基因内部产生一个或者多个外显子的复制拷贝。(2)两分子同种前体RNA进行反式剪接时,成熟RNA分子上出现重复的外显子序列。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

外显子插入的定义

中文名称外显子插入英文名称exon insertion定  义一个或者多个外显子从一个基因参入到另一个基因中去的现象。其结果是使剪接更有多样性,造成可读框移动,出现翻译终止密码子而使蛋白质合成中止或产生新的蛋白质。是进化中出现新事物的一个源泉。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控

外显子捕获与扩增

            实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α

真核生物和原核生物的基因结构分别是怎样的

原核与真核生物基因结构都包括编码区和非编码区。但是原核生物的编码区是连续的,全部都可以转录出mRNA,编码出蛋白质。而真核基因的编码区是不连续的,又分为外显子和内含子,外显子能够转录出mRNA,编码出蛋白质,而内含子则不可以。因此真核基因的非编码序列包括非编码区的所有序列以及编码区里面的内含子。另外

研究揭示多态性重复基因的基因组演化机制

  近百年来,进化遗传学工作致力于探索重复基因的起源机制和功能演化过程。经典观点认为,基因重复后产生两个完全等同的拷贝,其中一个冗余拷贝在自然选择作用下获得新功能。也有观点认为,剂量效应和不完整基因重复等因素使重复基因并非是等同的冗余拷贝。剂量敏感基因(满足剂量平衡效应的蛋白复合体成员基因或X染色体

分子遗传学词汇内含子

断裂基因的非编码序列,在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。内含子可能含有“旧码”,就是在进化过程中丧失功能的基因部分。正因为内含子对翻译产物的结构无意义,不受自然选择的压力,所以它比外显子累积有更多的突变。中文名称:内含子英文名称:Intron;Intervening r

什么是内含子的归巢?

内含子的归巢intron homing 在I类II类的某些内含子中含有开放阅读框,可产生具有三种功能的蛋白。这些蛋白可使内含子(或以其原来的DNA形式,或作为RNA的DNA拷贝)移动(mobile),使内含子可插到一个新的靶位点,这个现象叫做归巢(homing)I组和II组内含子分布很广。

内含子归巢的功能简介

  在这些内含子的开放续框中编码具有三种功能的蛋白,这些蛋白与DNA或RNA的代谢有关。  (1)核酸内切酶:在DNA的靶位点剪切,使内含子得以插入;  (2)反转录酶:涉及将内含子RNA变成DNA拷贝;  (3)成熟酶:从前体的RNA中切掉内含子的部分。

常兴研究组发现RNA剪接基因编辑的新方法

  2018年10月5日,国际知名学术期刊《分子细胞》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)常兴研究组题为“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。证明可