植物所发现重复基因结构分化机制及其对生物进化的重要性
基因的重复和分化为生物的演化提供了原材料。重复基因的分化可以发生在调控区或者编码区。发生在编码区的、能够导致功能分化的突变大体上分为两类,即非同义替换和内含子-外显子结构变化,前者导致同源位点上的氨基酸替换,后者则引起氨基酸的插入和缺失。作为点突变的一种方式,非同义替换的机制、速度和后果都已比较清楚。但是,相对而言,人们对内含子-外显子结构分化的研究尚不深入。 继2007和2009年发现内含子-外显子结构分化对重复基因分化的贡献之后,系统与进化国家重点实验室孔宏智研究组对这一问题进行了进一步的研究。通过深入分析612对重复基因(即旁系同源基因)和300对非重复基因(即直系同源基因),该研究组不但再次确认了内含子-外显子结构分化在重复基因分化中的普遍性和重要性,而且发现了导致结构分化的三类主要机制(即插入/缺失、外显子化/假外显子化和外显子/内含子获得/丢失)发生的频率及其对结构和功能分化的作用各不相同。 有意思的......阅读全文
关于内含子归巢的第Ⅱ类内含子介绍
在第Ⅱ类内含子中大部分开放读框都具有一个与反转录转座子相关的区域(除核酸内切酶编码区之外)。这种类型的内含子在低等真核生物和某些细菌中都有发现。反转录酶对于内含子来说是特异的,而且和归巢有关。反转录酶以初始mRNA为模板合成内含子的DNA拷贝,通过采用与反转录病毒相似的机制使内含子插入到靶位点中
内含子的特点
特点内含子(introns)在转录后的加工中, 从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。大多数真核结构基因中的间插序列(intervening sequence)或不编码序列。它们可以转录,但在基因转录后,由这些间插序列转录的部分(也可用内含子这个
内含子的定义
内含子(Intron)又称间隔顺序,指一个基因或mRNA分子中无编码作用的片段 。是真核生物细胞DNA中的间插序列。这些序列被转录在前体RNA中,经过剪接被去除,最终不存在于成熟RNA分子中。内含子和外显子的交替排列构成了割裂基因。在前体RNA中的内含子常被称作“间插序列”。在转录后的加工中,它比
关于内含子的特点介绍
内含子(introns)在转录后的加工中, 从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。 大多数真核结构基因中的间插序列(intervening sequence)或不编码序列。它们可以转录,但在基因转录后,由这些间插序列转录的部分(也可用内含子
关于内含子归巢的第I组类内含子介绍
第I组内含子具有编码核酸内切酶的开放续框;有时成熟酶的活性和此蛋白有关。第II类内含子具有编码核酸内切酶和反转录酶式的序列,另外成熟酶的活性也与此蛋白有关。在有些情况下还具有与其它酶活性相关联的成熟酶功能的遗传信息,成熟酶主要功能是使内含子的构象稳定,这于剪接来说是很必要的。 现已知道有些
结构基因的编码区的介绍
自起始密码至终止密码的一般DNA序列称为编码区。编码区含有若干段编码/顷序,是该基因表达为多肽 链的部分,称为外显子。外显子是不连续的,其间有不编码的间隔顺序隔开,间隔顺序称为内含子。转录后的内含子顺序,在初级转录物加工时被切掉;因此,结构基因又称为不连续基因或断裂基因。如果一个结构基因含有n个
关于双顺反子mRNA的编码区的介绍
自起始密码至终止密码的一般DNA序列称为编码区。编码区含有若干段编码/顷序,是该基因表达为多肽 链的部分,称为外显子。外显子是不连续的,其间有不编码的间隔顺序隔开,间隔顺序称为内含子。转录后的内含子顺序,在初级转录物加工时被切掉;因此,结构基因又称为不连续基因或断裂基因。如果一个结构基因含有n个
核内含子的概念
中文名称核内含子英文名称nuclear intron定 义存在于核基因中的、隔开外显子的、但转录后须经加工切除的序列。核内含子的5′端和3′端分别具有保守的GT和AG序列,为内含子被剪接除去的识别位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
内含子起源的假说
内含子起源有两种假说。1.内含子与它所在的基因一样古老,在装配第一个这样的基因时,内含子就已存在。早期的内含子具有自催化、自我复制等能力,因此,它们是原始基因和基因组的组织与复制必不可少的部分。而原核生物和少数低等的真核生物,由于它们需要进行快速的DNA复制从而进行快速的细胞分裂,因而失去了内含子。
简述内含子的相位
内含子可以在转录抄本的任何位置,甚至在以后成为密码子的三核苷酸之间。若内含子位于一密码子的第三位核苷酸和另一密码子的第一位核苷酸(即两密码子之间),则被称为0位内含子。相应地,位于一密码子第一第二位核苷酸之间的内含子被称为1位内含子,位于第二和第三位之间时,则被称为2位内含子。这在外显子复制中很
内含子的类型介绍
根据剪接过程为自发还是要经过剪接体的加工,人们将内含子分为自剪接和剪接体内含子。自剪接内含子:在1981年由汤玛斯·切希发现的自剪接内含子中,又分为:Ⅰ型内含子与Ⅱ型内含子。剪接体内含子:这类内含子的剪除要有剪接体的帮助。一段序列在剪接中是内含子还是外显子,取决于其自身。GT-AG-内含子:最常见的
如何对-cDNA、gDNA进行选择性引物设计?
设计策略 PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆 反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合
中国科大发现新型非编码RNA
最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起
如何对-cDNA、gDNA进行选择性引物设计?
设计策略PS:该方法适用于检测或部分 DNA 片段克隆,不适合全长基因克隆反转录 PCR 的主要问题是基因组 DNA (gDNA) 污染的存在,这将导致产生假阳性信号,特异性降低或对特定 RNA 的过高估计。为了消除 RT-PCR 中 gDNA 的干扰,可将引物设计为与两个外显子的接合部退火,该点为
关于RNA剪接的简介
大多数脊椎动物基因的编码序列,无论是编码多肽的基因还是编码除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非编码的间隔序列(内含子)分隔为各个外显子部分。这些基因的外显子和内含子都转录在一条初级RNA转录分子中,接下来,此初级RNA转录分子要经过RNA剪接,此过程包括一系列的加工反应:RNA的内含子部分
概述割裂基因的由来
现在割裂基因的原始形式是怎样的呢? 有两种模型,“内含子占先(Introns early)”模型支持内含子总是基因的整体部分。认为基因起始于割裂的结构,没有内含子的基因是在进化过程中丢失的。“内含子滞后(Introns late)”模型认为原始蛋白质编码单位由非割裂的DNA 序列组成,内含子是随
载脂蛋白CII的结构
人Apo CⅡ为含79个 氨基酸残基的单链多肽,分子量为9.1kD。先合成的Apo CⅡ含101氨基酸残,其中 22个氨基酸构成信号肽,除去信号肽后则转变为成熟Apo CⅡ。Apo CⅡ的等电点为5.0,其氨基酸组成有3个特点: ⑴缺乏组氨酸和半胱氨酸; ⑵ 含有较多的极性氨基酸; ⑶苏氨酸及丝
概述RNA剪接的类型
RNA剪接及其机制的研究,不仅解决了不连续基因“连续”转录产物的问题,而且对于了解不连续基因的起源乃至整个生命起源与进化等问题,均产生极大的推动作用,另外,由此发现了核酸分子的催化功能,进一步拓宽了对于酶的认识。不连续基因中的介入序列称为内含子;被内含子隔开的基因序列称为外显子(exon)。一个
植物所发现重复基因结构分化机制及其对生物进化的重要性
基因的重复和分化为生物的演化提供了原材料。重复基因的分化可以发生在调控区或者编码区。发生在编码区的、能够导致功能分化的突变大体上分为两类,即非同义替换和内含子-外显子结构变化,前者导致同源位点上的氨基酸替换,后者则引起氨基酸的插入和缺失。作为点突变的一种方式,非同义替换的机制、速度和后果都已比较
关于RNA剪接第Ⅱ类内含子的自我剪接介绍
第Ⅱ类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列多为…外显子…↓GUGCG…内含子…嘧啶碱AU↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,在离3’剪接点上游6-12bp有一段比较保守的序列,一致序列为CUCAC,在这一保守序列A的两侧各有一段3~5核苷酸的短序列能与上游方向的核苷酸互补,而A总是不包含在这
外显子基因为什么保守?《Nature-Genetics》出新答案了!
基因的基本结构分外显子和内含子,比较不同物种的基因发现外显子序列通常是保守的,而内含子序列则很少保守。外显子的种间差异不大,换句话说,人和老鼠、线虫的外显子基因都很相似。 这种相似性的科学解释是,外显子是生物体生存的关键区域,这部分区域的许多变异都会导致死亡表型,所以未存于世。内含子由于没有
第1类内含子自我剪接rRNA的自我剪接介绍
第1类内含子,其5’剪接点和3’剪接点的序列绝大部分为…外显子…U↓…内含子…G↓…外显子…,除了剪接点序列特征之外,第1类内含子还具有比较保守的4种10一12核苷酸的序列,分别以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能与Q序列互补,R序列能与S序列互补,形成一个所谓中部
细胞化学词汇核内含子
中文名称:核内含子英文名称:nuclear intron定 义:存在于核基因中的、隔开外显子的、但转录后须经加工切除的序列。核内含子的5′端和3′端分别具有保守的GT和AG序列,为内含子被剪接除去的识别位点。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
内含子早现的定义
中文名称内含子早现英文名称introns early定 义认为内含子非常古老,早就出现在进化早期的基因中,现正逐渐从真核基因组中丢失的假说。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)
内含子迟现的概念
中文名称内含子迟现英文名称introns late定 义认为内含子是在近期演化中才出现的,在真核基因组中逐渐积累的假说。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)
关于内含子的定义介绍
内含子(Intron)又称间隔顺序,指一个基因或mRNA分子中无编码作用的片段 [1] 。是真核生物细胞DNA中的间插序列。这些序列被转录在前体RNA中,经过剪接被去除,最终不存在于成熟RNA分子中。内含子和外显子的交替排列构成了割裂基因。在前体RNA中的内含子常被称作“间插序列”。在转录后的加
关于内含子的起源介绍
内含子起源有两种假说。 1.内含子与它所在的基因一样古老,在装配第一个这样的基因时,内含子就已存在。早期的内含子具有自催化、自我复制等能力,因此,它们是原始基因和基因组的组织与复制必不可少的部分。而原核生物和少数低等的真核生物,由于它们需要进行快速的DNA复制从而进行快速的细胞分裂,因而失去了
外显子应用机理
应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。
什么是外显子?
断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。
结构基因的结构
人类结构基因4个区域:①编码区,包括外显子与内含子;②前导区,位于编码区上游,相当于RNA5’末端非编码区(非翻译区);③尾部区,位于RNA3’编码区下游,相当于末端非编码区(非翻译区);④调控区,包括启动子和增强子等。基因编码区的两侧也称为侧翼顺序(图3-1)。 1.外显子和内含子 大多