版纳园提出基于稀疏图结构的基因组组装改进方法
全基因组组装工作是生物信息领域最基础也是最难的课题之一。长久以来，这项工作的实现需要耗用极大量计算机内存。 曾在中科院西双版纳热带植物园动植物关系研究组工作的叶承羲（现为美国马里兰大学计算机系计算生物方向博士研究生）在该园工作期间内，提出一新颖简洁的算法解决了这一难题。2012年4月，叶承羲在生物信息大会Recomb-seq国际会议上报告了该成果，其方法实现的高效性和组装结果的高质量，获得与会专家的一致肯定。 叶承羲在他的全基因组装工作中提出了一种新颖的稀疏k-mer图结构，该结构是叶承羲针对目前生物信息领域广泛采用的de Bruijn图的稀疏的改进。相对de Bruijn图，稀疏k-mer图略去了以往储存在de Bruijn图中的绝大多数冗余信息，节省了90-95%的计算资源，同时达到更好的效果。 这项技术有望将以往仅仅能在超级计算机上进行的人类基因组组装任务在个人计算机上就......阅读全文
信息素生物合成的定义
中文名称信息素生物合成英文名称biosynthesis of pheromone定 义在生物体内生成信息素的过程。应用学科生态学（一级学科），化学生态学（二级学科）
生物信息学教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
整合基因组和组织学信息－基因组学公司联手开拓新前沿
10x Genomics公司宣布收购位于瑞典斯德哥尔摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空间基因组学（spatial genomics）领域的领先公司。空间基因组学是一个新兴领域，它不但让研究人员可以获得单细胞内的基因组数据
比较原核生物和真核生物基因组的结构特征
异：1、原核生物基因组很小，一般只有一条染色体；而真核生物基因组结构庞大。2、原核dna分子的绝大部分是用来编码蛋白质的，只有非常小的一部分不转录，这与真核dna的冗余现象不同。3、原核生物dna序列中功能相关的rna和蛋白质基因，往往丛集在基因组的一个或几个特定部位，形成功能单位或转录单位，它们可
生物芯片用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
《基因组生物学》：一种超级细菌的基因组测序完成
最近，英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作，研究结果显示，这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
基因组蛋白质组与生物信息学报进入国际同学科领域Q1区
中科院32种SCI收录期刊进入国际同学科排名Q1区——《基因组蛋白质组与生物信息学报》等今年获得首个影响因子即进入国际同学科领域Q1区。 近日，科睿唯安2017年SCI期刊引证报告（Journal Citation Reports，JCR）正式公布。中国科学院SCI收录期刊增加至81种，占全国
生物学术语基因组当量的概念
基因组当量是基因组文库容量的度量单位。基因组文库容量的度量单位，指文库中所有载体的插入片段总长度相当于基因组的总长度。
基因组重编码生物体“赭石”诞生
美国耶鲁大学合成生物学家创建了一种新型基因组重新编码生物体（GRO），并命名为“赭石”（Ochre），实现了对生物体遗传密码的重写。这一成果发表在最新一期《自然》杂志上，不仅促进了人类对遗传密码可塑性的理解，也为未来合成生物学的应用提供了更多可能。在这项研究中，科学家成功将DNA或RNA中的冗余密码
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告，近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组，这个有48000年历史的微生物的基因组，是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图，研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲，从1
天津生物芯片参与绘制海参基因组
海参属于棘皮动物，是其中体型与形态最为特殊的种类，且处于从无脊椎向脊椎动物分化的独特进化地位，也是国内外重要的海产经济物种，具有极高的营养与医用价值。 10月12号，国际学术期刊PLoS Biology在线刊发了天津生物芯片参与的海参全基因组精细参考图谱项目文章-“The sea cucumb
生物学术语基因组扫描的概念
中文名称基因组扫描英文名称genome scanning定 义从全基因组的遗传标记中寻找与特定性状或基因紧密连锁的标记，并在染色体上定位相关基因的方法。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
人类生物基因组DNA可以分为哪几类？
1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异，在人类细胞基因组中，这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列，一般在基因组中只有一个拷贝（单一基因），然而，也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况，这些都来自于从基因家族里派生出来
科学家解析大豆灰斑病菌基因组信息
大豆灰斑病又称褐斑病、蛙眼病，由真菌Cercospora sojina Hara引起，是世界性的病害，同时也是我国大豆主产区的一个主要病害，尤其在东北三省的发病最重。大豆灰斑病菌引起的病害在东北地区造成的产量损失在10%至30%之间。在阿根廷和巴西等国，据报道损失可达60%以上。灰斑病可在大豆的
叶绿体基因组遗传信息获取技术体系建立
记者日前从中科院昆明植物所获悉，该所种质资源库多年来致力于叶绿体基因组学研究，并建立了较为完善的叶绿体基因组遗传信息获取技术体系。该技术体系解决了叶绿体基因组获取方法需要大量新鲜材料以及一些物种因个体微小须通过二代测序方法获取叶绿体基因组的难题。 2012年以来，科研人员利用二代测序技术研究了
中美倡议启动“地球生物基因组计划”－对所有真核生物测序
在美国斯密森尼生物多样性基因组学项目组与中国华大基因公司近日联合主办的生物基因组学会议（BioGenomics2017）闭幕论坛上，加州大学戴维斯分校基因组学家哈瑞斯·莱文等人和华大基因生物学家张国捷等组成的科研团队联合倡议，全球科学家合作开启另一项与人类基因组计划（HGP）类似的项目——地球生
Qiagen公司收购生物信息公司OmicSoft
分析测试百科网讯 近日，Qiagen公司宣布已使用现金收购了生物信息公司OmicSoft。 该交易的具体价格未作披露。 OmicSoft推出了一套工具，使研究人员能够分析和可视化数据，并将其与大型的，可公开获得的多组学数据集进行比较。 Qiagen说，该收购将为其提供可扩展和灵活的软件架构解
生物素的基本信息
中文名称：生物素 中文别名：维生素H；D-生物素 ；D-(+)-生物素 ；VH英文名称：Vitamin H维生素H英文别名：D-Biotin ；Biotin ；Vitamin B7 ；CAS：58-85-5EINECS：200-399-3 分子式：C10H16N2O3S 分子量：244.303
关于生物酶的信息简介
生物酶是一种无毒、对环境友好的生物催化剂，其化学本质为蛋白质。人类利用生物酶的历史已非常悠久，远在6000年前，巴比伦人已用麦芽酿造类似啤酒的饮料。5000年前，巴比伦人已懂得将乙醇转变为醋的方法，阿拉伯人利用羊胃膜凝乳酶制造干酪。我国先民利用酶的历史也非常悠久，秦汉以前人们已掌握制造美味豆酱的
生物样本库的信息系统
生物样本库（Biobank）资源管理信息系统是为了便利于有效的管理生物样本和相关信息所建立的具有搜集、保存、检索和分析功能的信息系统。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核内容。为此： 生物样本库（Biobank）资源管理信息系统的功能包括但不限于：追踪捐赠者的问卷和知情同意，管理生物样本采集、
生物识别技术:－领跑信息安全时代
生物识别技术因其安全、便捷等优势近年获得了用户的青睐，得到快速的发展。但是利用生物识别技术收集在数据库中的信息，却是它的“阿喀琉斯之踵”，能否保证这些信息的安全，防止信息被复制和滥用就成为影响其健康发展的重要因素。 进入现代社会以后，人们的生活高度信息化，一个突出特征就是人们高度依赖由互联
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
生物芯片技术用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
成都生物所开发新型生物信息学软件
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/1/472859.shtm 近年来，随着测序技术的快速发展，动物（尤其是非模式动物）全基因组数据（WGS）获取变得简单、便宜，这使得数据库中全基因组数据量呈指数态势增长。全基因组测序数据往往同时包含
美吉生物引领生物信息挖掘进入交互时代
“大数据、云计算、免费”这些在互联网行业司空见惯的字眼，如果我们把它们融入到基因测序行业会出现什么样的新鲜事物？有一家公司就把互联网的理念灌输到了基因测序行业里，它就是上海美吉生物医药科技有限公司（以下简称“美吉生物”）。 互联网思路玩转基因测序行业 近日，一则“生物信息挖掘进入交互时代”的
基因组测序揭示多细胞生物进化之谜
最近，研究人员通过对各种绿藻进行基因组测序，已经接近于解开了“引起多细胞生物的遗传变化”的谜团。 从单细胞生物到多细胞生物的过渡，是地球上生命进化的关键进步；在不同的系统发育谱系中，这种改变已经独立地发生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因，对单细胞祖先成为多细胞来说是必要的”，是一个有趣的
推进后基因组时代物理生物学探索
5月7日~8日，科学与技术前沿论坛在中科院学术会堂召开，此次论坛的主题为“后基因组时代的物理生物学”。欧阳钟灿、郝柏林、陈润生、欧阳颀等多名来自全国各大高校和科研院所的院士和学者出席了此次论坛，并发表了主题演讲。 本次论坛召集人中科院院士杨玉良表示，上世纪末以来，生命科学获得了飞速发展，积累了
真核生物基因组的结构特点有哪些
1、真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存在细胞核中。除了配子外，体细胞中的基因基因组是二倍体，即有两个同源的基因组。2、真核细胞基因的转录产物为单顺反式。结构基因被转录并翻译成mRNA分子和多肽链。3、有重复，重复次数可以超过一百万次。4、在基因组中，非编码区多于编码区。5、大多数基因含
宏基因组如何指导微生物分离培养
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所奶产品质量与风险评估科技创新团队受邀撰写综述文章，阐述了宏基因组指导未培养微生物分离培养的机遇与挑战，系统总结了基于宏基因组分离培养未培养微生物的方法。相关综述文章发表在《微生物》（Microbiome）。 随着宏基因组测序技
美国农业部加入地球生物基因组计划
美国农业部（USDA）近日宣布，将正式加入“地球生物基因组计划”（EBP）的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”，必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全新的应对挑战解决方案。 EBP是一项国际合作倡议，将在未来10年内对超过150万种物种的DNA进行测序。2018年