版纳园提出基于稀疏图结构的基因组组装改进方法
全基因组组装工作是生物信息领域最基础也是最难的课题之一。长久以来，这项工作的实现需要耗用极大量计算机内存。 曾在中科院西双版纳热带植物园动植物关系研究组工作的叶承羲（现为美国马里兰大学计算机系计算生物方向博士研究生）在该园工作期间内，提出一新颖简洁的算法解决了这一难题。2012年4月，叶承羲在生物信息大会Recomb-seq国际会议上报告了该成果，其方法实现的高效性和组装结果的高质量，获得与会专家的一致肯定。 叶承羲在他的全基因组装工作中提出了一种新颖的稀疏k-mer图结构，该结构是叶承羲针对目前生物信息领域广泛采用的de Bruijn图的稀疏的改进。相对de Bruijn图，稀疏k-mer图略去了以往储存在de Bruijn图中的绝大多数冗余信息，节省了90-95%的计算资源，同时达到更好的效果。 这项技术有望将以往仅仅能在超级计算机上进行的人类基因组组装任务在个人计算机上就......阅读全文
全基因组重测序的生物信息分析内容
1．数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计，测序深度分析。2．一致性序列组装与参考基因组序列（Reference genome sequence）的比对分析，利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型，并组装出该个体
天津工业生物所通过信息整合获得更可靠的基因组注释
不同来源的数据信息的比较整合是提高数据质量，获得对特定生物更准确认识进而进行设计改造的常用方法。目前已有多种基于web的基因组注释服务(如RAST, JCVI, IMG, IGS等)，通过这些服务提交序列信息即可得到基因注释结果，但不同服务得到的结果往往有较大不同，因此对不同来源的基因注
“计算生物学与生物信息学术研讨会”在基因组所召开
随着生命科学研究及基因测序等相关技术的飞速发展，计算生物学的重要性和复杂性在当前生物学数据量的不断增长中日益显现，并逐渐成为现代生物学研究的核心方法之一。为了推动国内相关研究单位间计算生物学和生物数据库等领域的交流与合作，10月27日至28日，中科院北京基因组研究所召集国内外众多
基因组学：将数字信息转化为生物学功能
优势 · 同时检测克隆和定量荧光标记---使用表现型筛选克隆 · 从加样、涂布到挑取完全自动化工作流程 · 从样品涂布到挑取、复制和重排记录并追踪样品数据 · 每天准确挑取超过30000个筛选到的克隆，效率>98% 美国能源部联合基因组研究所（
《基因组蛋白质组与生物信息学报》影响因子显著提高
在日前举行的第四届中国英文版科技期刊研讨会上，中国科学技术信息研究所发布了《2007年版中国英文版科技期刊引证报告》。根据这一报告提供的数据，中科院北京基因组研究所主办的《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，简称GPB）的
生物信息学在人类基因组计划中的应用
生物信息学是当前生物学领域的研究热点，预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。近期任务由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加，近期生物信息学将在以下几方面迅速发展：大规模基因组测序中的信息分析大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前
真核生物基因组4
（2） 苯丙酮尿症 苯丙酮尿症（PKU）的病因是患者肝细胞缺乏苯丙氨酸羟化酶，使体内的苯丙氨酸不能正常代谢为酪氨酸，导致血清中苯丙酮酸浓度升高。现已知苯丙氨酸羟化酶基因定位于12q24.1，此基因全长约90kb，含13个外显子，在中国人中已发现10余种点突变，这是造成酶活性缺乏的原因。 2．
真核生物基因组2
（二） 中度重复序列中度重复序列是指在真核基因组中重复数十至数万次（
真核生物基因组3
第二节 基因组结构与疾病一、人类染色体的结构与疾病（一） 人体染色体数目、结构和形态人类体细胞中有46条染色体，其中44条（22对）为常染色体，另两条为性染色体（女性为XX，男性为XY）。生殖细胞中卵细胞和精子各有23条染色体，卵细胞为22＋X，精子为22＋X或22＋Y。为便于鉴别人类的每一条染色体
真核生物基因组1
真核生物的基因组比较庞大，并且不同生物种间差异很大，例如人的单倍体基因组由3.16×109 bp组成。在人细胞的整个基因组中实际上只有很少一部份（约占2%~3％）的DNA序列用以编码蛋白质。 第一节 真核生物基因组特点 真核生物体细胞内的基因组分细胞核基因组与细胞质基因组，细胞核基因
组学期刊三巨头：《基因组、蛋白质组与生物信息学报》
近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄 从编委到现任执行副主编，美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，以下简称GPB）期刊结缘已近10年。前些年，该刊编辑部不时找他约稿子，以解“缺米之炊”
地球生物基因组计划正式启动
据物理学家组织网报道，科学家近日在英国伦敦正式启动了一个庞大的全球性项目——地球生物基因组计划（EBP），准备在10年内对地球上所有150万种已知真核生物的基因组进行测序、编目和分类，预计耗资47亿美元。 科学家称，地球生物基因组计划是继人类基因组计划（HGP）之后的“下一个生物学登月计划”
生物基因组DNA的分类介绍
1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异,在人类细胞基因组中,这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列,一般在基因组中只有一个拷贝（单一基因）,然而,也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况,这些都来自于从基因家族里派生
生物基因组DNA的种类介绍
1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异，在人类细胞基因组中，这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列，一般在基因组中只有一个拷贝（单一基因），然而，也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况，这些都来自于从基因家族里派生出来
原核生物基因组的特点
原核生物基因组的特点如下：1、基因组较小，通常只有一个环形或线形的DNA分子；2、通常只有一个DNA复制起点；3、非编码区主要是调控序列；4、存在可移动的DNA序列；5、基因密度非常高，基因组中编码区大于非编码区；6、结构基因没有内含子，多为单拷贝，结构基因无重叠现象；7、重复序列很少，重复片段为转
真核生物基因组的特点
问题一：真核生物基因组的结构特点有哪些 真核生物基因组有以下特点1.真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，除配子细胞外，体细胞内的基因的基因组是双份的（即双倍体,diploid），即有两份同源的基因组。2.真核细胞基因转录产物为单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRN
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达，检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化，显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据，仅仅进行差异表达分析还远远不够，如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
关于基因组改变的基本信息介绍
生物体所有细胞都源自同一个单细胞，因此它们应该具有相同的基因组。但是，在某些情况下，细胞间会出现差异。细胞分裂期间的DNA复制和环境诱变剂的作用都可导致体细胞发生突变。在某些情况下，这种突变会导致癌症，因为它们会导致细胞更快地分裂并侵入周围组织。 在减数分裂期间，二倍体细胞分裂两次以产生单倍体生
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
中国本土期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》被SCIE收录
由中国科学院主管、中国科学院北京基因组研究所和中国遗传学会主办的英文期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics（简称GPB，中文名《基因组蛋白质组与生物信息学报》，ISSN 1672-0229，CN 11-4926/Q）于2017年8月被科睿唯安旗下的Scie
中美倡议启动“地球生物基因组计划”
在美国斯密森尼生物多样性基因组学项目组与中国华大基因公司近日联合主办的生物基因组学会议（BioGenomics2017）闭幕论坛上，加州大学戴维斯分校基因组学家哈瑞斯·莱文等人和华大基因生物学家张国捷等组成的科研团队联合倡议，全球科学家合作开启另一项与人类基因组计划（HGP）类似的项目——地球生
真核生物基因组的结构特点
真核生物基因组结构特点:1、真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体，储存于细胞核内，除配子细胞外，体细胞内的基因组是双份的（即双倍体，diploid），即有两份同源的基因组。2、真核细胞基因转录产物为单顺反子（monocistron），即一个结构基因转录、翻译成一个mRNA分子，一条多肽链。3、
关于真核基因组的基本信息介绍
真核基因组：由真核基因编码的以及感染真核生物的DNA和RNA病毒编码的基因组。 真核生物的基因组一般比较庞大，例如人的单倍体基因组由3×106 bp碱基组成，按1000个碱基编码一种蛋白质计，理论上可有300万个基因。但实际上，人细胞中所含基因总数大概会超过10万个。这就说明在人细胞基因组中有
基因组信息如何加密－制定标准是必须
随着基因测序成本直线下降，专家认为，我们的基因组将有助于医生发现疾病，拯救生命。但并不是每个人都愿意将自己的基因组序列公之于众。现在，密码学家正在完善一个新的隐私保护工具，可将遗传信息转变成安全而实用的格式。 所谓的同态加密方法，可以帮助保持基因组隐私，就好像基因检测转移到廉价的在线云服务
关于全基因组测序的基本信息介绍
全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。 1986年， Renato Dulbecco是最早提出人类基因组测序的科学家之一。他认为如果能够知道所有人类基因的序列，对癌症的研究将会很有帮助。美国能源部（DOE）与美国国家卫生研究院（NIH），分别在1986年与1987年加入人类基
关于真核基因组的基本信息介绍
真核基因组由一条或多条线性DNA染色体组成。组成真核生物基因组的染色体的数量差异很大，杰克跳线蚂蚁和无性线虫的基因组每个只有一对染色体 [6]，而蕨类物种有720对染色体 [7]。人类细胞具有22对常染色体和1对性染色体。 除了细胞核中的染色体外，真核生物的细胞器如叶绿体和线粒体都有自己的DN
信息素生物测定的概念
中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定 义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学（一级学科），化学生态学（二级学科）
信息素生物测定的定义
中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定 义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学（一级学科），化学生态学（二级学科）
信息素生物测定的定义
中文名称信息素生物测定英文名称bioassay of pheromone定 义测定信息素引起同种动物靶标的行为或生理反应的大小与强度。应用学科生态学（一级学科），化学生态学（二级学科）
基因芯片——生物信息精灵
基因芯片，也叫DNA芯片，是在90年代中期发展出来的高科技产物。基因芯片大小如指甲盖一般，其基质一般是经过处理后的玻璃片。每个芯片的基面上都可划分出数万至数百万个小区。在指定的小区内，可固定大量具有特定功能、长约20个碱基序列的核酸分子（也叫分子探针）。由于被固定的分子探针在基质上形成不同的探针阵列