“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”取得阶段性进展
4月20日，中科院组织有关专家对昆明植物研究所李德铢研究员主持的中国科学院大科学装置开放研究项目“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”的进展进行了评议。该项目从2009年开始运行，目前已取得下列阶段性成果。 通过项目的实施，联合了来自全国22个科研院所和高校的60余人的植物分类学研究集体，并依托西南野生生物种质资源库的研究力量，完成了中国维管属植物62目、273科、1217属、5131种、17847个体，近60000个DNA条形码的获取与分析。项目已发表论文60余篇，其中在PNAS、Plos One、Genome、American Journal of Botany、Journal of Plant Research、Journal of Systematics and Evolution、Taxon、Planta Medica等国际刊物50多篇；国内核心期刊10篇；在Journal of System......阅读全文
我国最大热带雨林永久样地将开展树木条形码合作研究
准确的物种鉴定是人类认知自然和可持续发展的必要前提。基于形态学特征鉴定物种难以满足科学发展的巨大需求，DNA条形码提供了可信息化的分类学标准和有效的分类学手段，成为进展最迅速的学科前沿之一。鉴于目前对热带雨林树种条形码研究的共同需求，来自中国科学院西双版纳热带植物园的5个不同研究组
保护长江鱼－长江鱼有了“身份证”
东亚特有的鲤科鱼类。何舜平供图 随着2020年脚步的临近，“十年禁渔”也在抓紧推行，为长江渔业资源的可持续利用创造条件。作为我国“淡水鱼类的摇篮”，长江渔业资源包含鱼类约400余种，鱼类产量占我国淡水鱼类产量的70%左右，是渔业发展的重要支撑。 长江沿岸蓬勃的经济发展和人类活动，却给渔业资源
家犬基因组学研究获新进展
科学界对于家犬的起源和驯化一直争议不断。近日，中科院院士张亚平带领团队发现，家犬中亚起源的假说与基于全基因组重测序数据分析的家犬东亚南部起源模式相冲突。相关成果日前在线发表于美国《国家科学院院刊》。 2015年，美国学者Shannon等人通过分析大量的家犬群体全基因组DNA芯片数据，提出了家犬
华裔学者Nature子刊发布生物医学新技术
生物通报道 很像收银员利用机器扫描包装上的条形码来识别顾客在商店中购买的物品，科学家们利用显微镜和它们自身各种条形码来帮助辨别细胞的各个部分，或是疾病位点的分子类型。但他们的条形码只有极少数的“种类”，限制了科学家们在任何时间研究的细胞样品中对象的数量。 近日来自哈佛大学维斯生物工程研
我国将对最大热带雨林永久样地开展树木条形码合作研究
准确的物种鉴定是人类认知自然和可持续发展的必要前提。由于形态学特征鉴定物种难以满足科学发展的巨大需求，DNA条形码提供了可信息化的分类学标准和有效的分类学手段，成为进展最迅速的学科前沿之一。 针对热带雨林树种条形码研究的共同需求，近日，来自中国科学院西双版纳热带植物园5个不同研究组的科技人员在
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生
条形码技术在临床实验室中的应用
摘要 :目的：将条形码技术应用于临床实验室信息系统，提高实验室的自动化程度、工作效率，减少差错并方便病人。方法：在交费或标本采集时生成条形码，并贴在标本容器上。根据条形码信息完成分送标本、传送资料、核实和处理标本、分析仪双向通讯、查询结果、打印报告、保存标本等实验室的常规操作。结果：条形码作为标本的
科学家提出生物资源知识产权保护新方案
生物资源的分发、鉴定及知识产权保护是生物技术产业健康发展的重要基础。近日，来自美国德克萨斯大学达拉斯分校的研究团队在《Science Advances》发表题为“Genetic physical unclonable functions in human cells”的研究论文，通过遗传工程技术在人
研究蛋白质相互作用的新技术
近期，来自多伦多大学Lunenfeld-Tanenbaum Research Institute (LTRI)和Donnelly中心的一组研究人员，开发出一种新技术，可以将细胞内的DNA条形码拼接在一起，以同时搜寻数百万个蛋白质配对，用以分析蛋白质相互作用。相关研究结果发表在4月22日的《Mol
测序黑马10X－Genomics正式发售GemCode平台
2015年7月3日，10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器，引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补，产生长片段信息（10-100 kb），实现结构变异和单体型等分析。GemC
中科院学者最新Nature改写教科书对DNA甲基化酶的分类
雌性哺乳动物的一生中只能提供有限数目的卵子。卵子的DNA甲基化水平很低，只有精子和绝大部分终末分化的体细胞的DNA甲基化水平的一半左右。然而，卵子的这种独特的DNA甲基化状态是怎样形成的，受哪些因子调控，又有着怎样的生物学意义却并不清楚。 中科院生物物理研究所的研究人员发表了题为“Stell
昆明动物所在生物多样性监测方法研究上取得突破
那些令人毛骨悚然的昆虫、令人惊声尖叫的小爬虫们，它们不再只是我们儿时玩伴藏匿在盒子里的“惊喜”，这些小虫子其实有着更为神奇的作用——监测环境中的生物多样性。 中国科学院昆明动物研究所研究员Douglas Yu领导的团队研究发现，通过对一定区域内昆虫样本的混合DNA测序，可以对该区域的生
25万美元资助DNA数字数据存储技术
该公司周一表示，Cache DNA 已从美国国家科学基金会获得 256,000 美元的第一阶段小企业创新研究资助，用于开发其可扩展的 DNA 数字数据存储技术。 麻省理工学院的衍生公司最近申请了一种基于质粒的“文件系统”的ZL，该系统能够将数百万 TB 的数据存储为 DNA 分子。 Cach
Ziath2D条形码扫描仪中的隐藏技术
扫描2D条码到底有多困难？ 它真的比您想象的要复杂得多！尽管条形码扫描似乎是一项普通而又平凡的任务，但实际上，Ziath研发部门会不断推出新功能，以使我们的客户尽可能轻松应对扫描任务。扫描仪面临的一些挑战：打印质量差的条形码；不同高度放置的管架；区分窗口上的灰尘颗粒和条形码；应对严苛的顶
Ziath2D条形码扫描仪中的隐藏技术
Ziath-2D条形码扫描仪中的隐藏技术 扫描2D条码到底有多困难？ 它真的比您想象的要复杂得多！尽管条形码扫描似乎是一项普通而又平凡的任务，但实际上，Ziath研发部门会不断推出新功能，以使我们的客户尽可能轻松应对扫描任务。扫描仪面临的一些挑战：打印质量差的条形码；不同高度
PLOS－ONE：科学家鉴定濒危松柏植物的条形码
罗汉松科(Podocarpaceae)植物是分布范围很小的濒危植物，仅仅通过它们的外貌特征，很难甚至不可能对这个科的一些植物个体进行鉴定。德国波鸿鲁尔大学和纽约植物园的科学家们，在11月27日的PLOS ONE杂志上发表的一项最新研究中，解析了来自世界多个地区的320个罗汉松科植物个体样本的
Ziath2D条形码扫描仪中的隐藏技术
扫描2D条码到底有多困难？ 它真的比您想象的要复杂得多！尽管条形码扫描似乎是一项普通而又平凡的任务，但实际上，Ziath研发部门会不断推出新功能，以使我们的客户尽可能轻松应对扫描任务。扫描仪面临的一些挑战：打印质量差的条形码；不同高度放置的管架；区分窗口上的灰尘颗粒和条形码；应对严苛的
昆明动物所等家养动物线粒体DNA基因组学研究取得进展
近年来，家养动物线粒体DNA（mtDNA）基因组学得到了迅速发展，积累了大量的mtDNA序列数据。与此同时，一些问题随之浮现出来。除了数据质量存在缺陷（Shi, et al. 2014. Mol Ecol）之外，mtDNA世系划分标准不一，世系命名混乱的问题也已开始干扰家养动物mtDNA的研究工
转折性技术横空出世，CryoEM后继有人
图片到视频，纳米技术不断创造着以DNA为介质的文字或影像记录神话，研究人员不断拓展着破译生物结构空间排布的方法。目前，观察DNA、蛋白质或其他复合物通常需要使用先进的显微镜设备以及相匹配的样品处理方法。你很难只通过一种处理，使用一种设备，同时观察许多分子类型，尤其是有着高密度和高通量，或者动态相
昆明动物所在生物多样性快速监测方法研究中取得进展
近期，中国科学院昆明动物研究所研究员Douglas Yu课题组在Methods in Ecology and Evolution（MEE）上发表了第一篇描述“生物多样性汤（Biodiversity Soup）”这一高通量条形码技术流程的论文。如今，高通量条形码技术在环境保护和管理相关决策研究中的
高通量组织研磨仪针对中药药材DNA提取的研磨方法
实验目的 通过提取药材的DNA，进行DNA条形码分子对照，进而鉴定中药。 实验原理 通过对照药材自身独有的DNA条形码记录，可以准确鉴定出中药材品种。用DNA条形码分子法鉴定中药是药典中一项重要的鉴定方法。 实验材料和器具样品：甘草，陈皮，阿胶饮片仪器：高通量组织研磨仪（上海
研究揭示马先蒿属超级条形码未显著提升物种鉴别能力
近年来，完整质体基因组包含更全面的遗传信息，被寄望成为新一代“超级条形码”，尤其在标准条形码难以区分的近缘物种中展现潜力。然而，很少有研究系统探讨分类复杂性会如何影响质体基因组条形码的有效性。这一问题在经历过快速辐射演化的复杂支系中尤为突出。马先蒿属（Pedicularis）是被子植物中最大的半
Infinity－Bio完成800万美元A轮融资并收购Serimmune资产
Infinity Bio 周三宣布，已完成 800 万美元 A 轮融资，并以未公开金额收购了免疫分析公司 Serimmune 的资产。 本轮融资由 Illumina Ventures 领投，PTX Capital、Blackbird BioVentures 和 Propel Baltimore
怎么解决条形码扫描出现重码、漏码和错码的情况？
我想很多企业都经历了在线生产的产品即将出货之前，在顾客和质量检查的抽样检查中被检测出不良品，所有的产品都被重新加工的事情。 另外，企业在生产线生产的生产中，经常发生加工遗漏，弄错材料，导致客户投诉，给企业带来大量损失。 特别是条形码发生重码、漏字、错别码的情况，让人不胜其烦。 条码不仅仅方便分辨
安捷伦靶向序列富集系统支持样本条形码标记及索引
进一步提升测序效率，降低测序成本高达16倍 2010年2月24日，安捷伦科技公司(纽约证交所：A)在基因组生物学技术进展年会 (AGBT)宣布：安捷伦SureSelect 靶向序列富集系统，可以根据用户所选择的不同新一代测序平台，实现每泳道12-16个样本的并行DNA测序，从而降低测序成本
研究人员提出大尺度生物多样性监测方法
近日，中国科学院昆明动物研究所Douglas Yu课题组在《自然—生态学与进化》杂志上发表文章对实现大尺度生物多样性监测方法进行展望，为环境保护政策的制定提供了全面的科学依据。 大尺度实时生物多样性管理监测，对精细研究生物多样性格局动态和物种适应策略、预测生物兴衰和分布格局态势有重要意义。《中
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定3
2．利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下，末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端，如果作为底物的核苷酸经过修饰（如ddNTP），则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段，亦存在DNA的两侧均被标记问题，可通过上述同
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定2
目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等（1977）提出的酶法（双脱氧链终止法）和Maxam（1977）提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭，但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸，每组核苷酸都有共同的起点，却随机终止于一种（或多种）特定的残基，形成一系列以某一特定核苷酸
DNA重组（DNA－recombination）技术：DNA序列测定1
㈣ DNA聚合酶 如前所述，选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶： 1．大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段（Klenow片段） 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题：①Klenow片段的持续合成能力较