“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”取得阶段性进展
4月20日,中科院组织有关专家对昆明植物研究所李德铢研究员主持的中国科学院大科学装置开放研究项目“依托种质资源库的植物DNA条形码研究”的进展进行了评议。该项目从2009年开始运行,目前已取得下列阶段性成果。 通过项目的实施,联合了来自全国22个科研院所和高校的60余人的植物分类学研究集体,并依托西南野生生物种质资源库的研究力量,完成了中国维管属植物62目、273科、1217属、5131种、17847个体,近60000个DNA条形码的获取与分析。项目已发表论文60余篇,其中在PNAS、Plos One、Genome、American Journal of Botany、Journal of Plant Research、Journal of Systematics and Evolution、Taxon、Planta Medica等国际刊物50多篇;国内核心期刊10篇;在Journal of System......阅读全文
我国木材DNA识别新技术研究获突破
日前,中国林业科学研究院木材工业研究所(简称“中国林科院木材所”)研究员殷亚方率领的木材解剖学研究组,近期在国际木材科学领域重要学术期刊IAWA Journal(国际木材解剖学家协会期刊)2012年33卷第4期发表了最新研究成果――“Comparative analysis of two D
Science里程碑!哈佛大牛有望还原生物所有细胞的发育过程
每个多细胞生命的诞生之初,都是一个单细胞。这个细胞会一变二,二变四,四变八,最终变成一个天文数字。据估计,新生儿体内约有260亿个细胞,这一数字在成年后还会继续增加。 从1到260亿,生命的发育过程让人叹为观止。这些细胞是怎么形成的?哪些细胞在先?哪些细胞在后?人们顺理成章地提出了疑问。但由于
DNA重组技术(DNA-Recombination)
一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃
“昆明超算分中心”项目通过专家验收
10月27日,受中国科学院信息办委托,中国科学院计算机网络信息中心在昆明组织并主持召开了“西南战略生物资源超级计算环境建设与应用”(以下称“昆明超算分中心”)项目验收评审会。 专家组听取了项目承建单位的工作总结报告,审查了验收的相关文档,并到现场查验了超算中心机房环境及软硬件系
我国学者在空间转录组学测序方面取得进展
图 空间转录组测序技术Decoder-Seq的示意图 在国家自然科学基金项目(批准号:21927806)等资助下,厦门大学杨朝勇教授团队在空间转录组测序技术与应用上取得进展,相关研究成果以“解码测序提高空间转录组测序的转录本捕获效率(Decoder-seq enhances mRNA captur
摸清生物资源家底我国将建红树林基因库
由中国科学院南海海洋研究所牵头承担的“红树林生物资源调查与重要种类DNA条形码库构建”项目近日在广州启动。该项目意在摸清我国红树林生物资源和重要种类基因资源“家底”,为我国的红树林研究、保护与管理以及资源可持续发展提供科学依据和基础数据。 项目将完成浙江福建红树林生物资源调查、红树林生物资源D
摸清生物资源家底--我国将建红树林基因库
由中国科学院南海海洋研究所牵头承担的“红树林生物资源调查与重要种类DNA条形码库构建”项目近日在广州启动。该项目意在摸清我国红树林生物资源和重要种类基因资源“家底”,为我国的红树林研究、保护与管理以及资源可持续发展提供科学依据和基础数据。 项目将完成浙江福建红树林生物资源调查、红树林生物资源D
研究揭示DNA提取方法对浮游生物群落研究结果的影响
浮游生物是湖泊与水库生态系统的重要组成部分,在物质循环、污染物降解和水体自净等方面发挥基础和关键作用。浮游生物具有个体小、丰度高和极其复杂多样的特点,导致其难观测、难定量和难分析。长期以来,浮游生物群落生态研究严重依赖显微观测技术,随着高通量DNA测序技术的发展和应用,微型浮游生物群落的研究迎来
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体3
在作为载体时,这些噬菌体有一个很大的优点,即克隆到M13mp载体的外源DNA片段(双链),在子代噬菌体便成为了单链形式。故应用M13mp进行克隆,可方便地分离到大量含有外源DNA某一单链的DNA分子。这种单链DNA可在下列工作中作模板:①主要用作双脱氧链终止法进行DNA序列测定的模板;②制备仅有一条
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体2
二、噬菌体载体作为细菌寄生物的噬菌体,大多数具有编码多种蛋白质的基因,能利用宿主细胞的蛋白质合成体系,进行生长和增殖。构建的噬菌体载体,以λ噬菌体、M13和粘粒最为常用。㈠ λ噬菌体载体野生型λDNA是一种基因组为4.8 kb的线性双链DNA,全部序列已知,共编码50多个基因。其中约一半基因参与
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定1
重组DNA是在体外用限制性内切酶,将不同来源的DNA分子进行特异地切割,获得的目的基因或DNA片段与载体重新连接,从而组成一个新的DNA杂合分子。重组的DNA分子能够通过一定的方式进入相应的宿主细胞,在宿主细胞中进行无性增殖,获得大量的目的基因或DNA片段,此过程称基因克隆。重组的DNA分子也能够在
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定2
(1)CaCl2处理以后的转化: 当细菌处于0℃、二价阳离子(如Ca2+、Mg2+等)低渗溶液中时,细菌细胞膨胀成球形,处于感受态;此时转化混合物中的DNA形成抗DNA酶的羟基-钙磷酸复合物粘附于细胞表面,重组DNA在42℃短时间热冲击后吸附在细胞表面,在丰富培养基中生长数小时后,球状细胞恢复原
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组与鉴定3
当多克隆位点有外源DNA片段插入时,破坏此酶的N端阅读框架,产生无α互补功能的N端片段,因此在带有外源DNA片段的细菌在含有IPTG/X-gal的培养基上呈白色,见图7-11 。如果外源DNA插入片段相当短,不破坏β-半乳糖苷酶的氨基端氨基酸序列的阅读框,有时产生的重组体菌落不呈白色而是呈浅蓝色。4
DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA重组的载体1
载体(vector)是携带靶DNA(目的DNA)片段进入宿主细胞进行扩增和表达的运载工具。常用的载体是通过改造天然的细菌质粒、噬菌体和病毒等构建而成。目前已构建成的载体主要有质粒载体、噬菌体载体、病毒载体和人工染色体等多种类型,亦可根据其用途不同分为克隆载体和表达载体二类。载体的构建和选择应考虑以下
盘点:2015年那些横空出世的“非典型”测序仪
提及测序仪,那就不得不说Illumina和Thermo两只“大鳄”。这两家公司提供的测序仪占据了绝大部分市场份额。出于应对特殊政策的需要,国内的几家企业也纷纷推出了“自己”的测序仪。放眼国际市场,有一些企业另辟蹊径,研发出别具特色的测序仪,力图从垄断者手中分得一杯羹。小编今天就带大家认识一下这些
带您了解基因测序技术的发展
在生物多样性急剧减少和物种消失的时代,有时被称为“第六次大灭绝”或“全新世灭绝”,人们对开发有效的生物多样性研究和监测工具提出了很高的要求。迄今为止,世界各地的分类学家已经描述了超过170万个物种。然而,这只是地球上预计存在的数百万生物的一小部分。当试图使用传统的基于形态学的方法对所有物种进行分
条形码化检验信息标签在临床实验室中的应用
摘要:目的:研制一种能适用于我国检验领域的条形码信息标签。方法:依据检验过程中所涉及的检验标本种类以及专业分工,条形码信息标签分为14种,每种标签独具一种颜色和一个固定2位数前缀的10位流水号码。结果: 此标签配合检验科信息管理系统不仅能适用于生化、免疫、血液分析仪,而且能涵盖所有的手工检验项目;
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍
DNA合成(DNA-synthesis-)技术介绍
蛋白质概念提出:DNA多肽合成(DNA synthesis ):按照预定核苷酸的顺序,将脱氧核苷酸逐个进行人工连接合成DNA链的方法。目前多是采用固相合成法,即是在多聚体支持物上从3′端延伸核苷酸,可自动化操作。)目前,oligo DNA合成一般都采用固相亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,此方法具有高效
DNA证据也能造假
置换样本“偷天换日”,拼凑“条形码”蒙混过关 DNA证据也能“造假 在著名美剧《犯罪现场CSI》中,每当那些神气的“法医科学家”带着一点假惺惺的遗憾对一个人说,“你的DNA和犯罪现场取到的DNA吻合”时,我们就知道这个人很可能完蛋了。不过最近英国《每日邮报》却宣称,科学家们证明犯罪现
使用SPEX组织研磨仪鉴定在抗击新冠中表现突出的中药...
使用SPEX组织研磨仪鉴定在抗击新冠中表现突出的中药材银柴胡 25日零时起,湖北省除武汉市以外地区解除离鄂通道管控,国内“抗疫”成果显著。本以为国内的疫情得到有效控制,我们就可以松一口气了,但国外患者数不断创新高。截至3月24日,全球已突破40万例,海外新增较前日增长15.18%,国外疫情
DNA-指纹的概念高变区DNA与DNA指纹
人的卫星DNA 或称随体DNA 是由一些短的DNA 片段(10bp 左右)多次重复所构成的。重复片段的组成和拷贝数在不同的个体及基因组的不同位置上不一样。提取不同个体的基因组DNA 后,用其切点能识别序列为4 个碱基而又不切割该重复片段的限制性内切酶在重复片段的两侧切割基因组DNA ,然后将样品进行
中药材“骨碎补”的DNA分子鉴定研究取得进展
“骨碎补”是我国传统的中药材,用于治疗骨折、关节炎、骨质增生等与骨相关的疾病。《中华人民共和国药典》记载的“骨碎补”为槲蕨(Drynaria roosii Nakaike)的干燥根状茎。由于大量不同物种干燥根状茎的形态相似,目前药材市场上存在大量的混伪品,传统的鉴定方法准确度和效率均较低,导致“
Nature:新型DNA标签证实血液中细胞发育树的存在
血液中多种不同的细胞类型是如何发育的?科学家们长期以来一直在研究这个问题。根据经典的模型,不同的发育路线像树一样分枝。树干由干细胞组成,树枝由各种不同的祖细胞组成,这些祖细胞可以产生许多不同的细胞类型。然后,它又进一步分化成特殊的血细胞,即红细胞、血小板和免疫系统的各种白细胞。然而,近年来,人们
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(五)
二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究,但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近
SiMSenSeq:DNA测序错误率降至万分之一
加拿大多伦多安大略癌症研究所(OICR)的研究员与国际合作者发明了一种技术,提高了重要癌症检测的敏感度。 最近发表在Nature Protocols杂志上的文章描述了提高DNA测序的敏感度的改进方法。该方法被称为SiMSen-Seq,可以帮助检测癌症复发,以更快的速度改善病人的预后。 聚合酶
SiMSenSeq:DNA测序错误率降至万分之一
生物通报道:加拿大多伦多安大略癌症研究所(OICR)的研究员与国际合作者发明了一种技术,提高了重要癌症检测的敏感度。 最近发表在Nature Protocols杂志上的文章描述了提高DNA测序的敏感度的改进方法。该方法被称为SiMSen-Seq,可以帮助检测癌症复发,以更快的速度改善病人的预后
基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基
新方法能一次检测数十种生物标志物
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/509394.shtm ?纳米孔读取DNA序列并将其转换为电信号。图片来源:牛津纳米孔技术公司科技日报北京9月26日电 (记者张梦然)英国帝国理工学院的科学家与牛津纳米孔技术公司合作研制出一种新
独特人类基因进化是平衡行为
人类和黑猩猩的DNA仅百分之一不同。人类加速区域(HAR)是基因组的一部分,美国研究人员分析了数以千计的人类和黑猩猩HAR,发现人类进化过程中积累的许多变化具有相反的影响。研究结果近日发表在《神经元》杂志上。 论文主要作者、格拉德斯通数据科学与生物技术研究所所长凯蒂·波拉德博士说,这有助于回答