叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生态学将系统发育分析方法整合到群落生态学的分析中，为探究群落生物多样性的演化与维持机制提供了新视角。建立准确可靠的群落系统树是进行群落系统发育分析的前提和基础，分辨率较低的群落系统树可能导致对系统发育多样性指数的估计产生偏差，进而影响对特定群落的生态过程的推断。 目前群落系统树的构建主要是利用Phylomatic、V.PhyloMaker等软件生成名录合成树，或是基于一代DNA条形码片段构建分子系统树。合成树方法无需采样、测序等步骤，成本较低，但结果中往往会出现较多的多歧分枝；一代DNA条形码树的物种分辨率相对更......阅读全文
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生
叶绿体基因组树优化森林大样地群落构建获揭示
群落构建是生态学家广泛关注的核心问题之一。1月2日，记者从中国科学院华南植物园获悉，该园分子生态学团队及其合作者，基于中国森林监测网络（CForBio）平台，揭示了叶绿体基因组树优化我国森林大样地群落构建认知。相关研究发表于《分子生态资源》。 据悉，系统发育群落生
沿海拔梯度变化的森林群落构建机制研究中获进展
森林群落构建机制是群落生态学研究的一个重要科学问题。在森林群落中，生态过程在不同空间尺度和不同垂直结构中的作用尚不清楚，需要量化不同生态因子对群落构建作用的影响。近年来，功能多样性和系统发育多样性的研究为探究群落构建机制提供了新思路。 2013年以来，中国科学院昆明植物研究所植物多样性演化和生
武汉植物园在亚热带山地森林群落构建研究中获进展
群落构建机制是生态学基本和核心问题之一。环境过滤、种间作用和随机过程被认为是群落构建三类主要驱动力，区分它们在不同生态系统的相对贡献也成为当下生态学家们关心的问题。湖南八大公山25 ha样地代表了亚热带山地常绿落叶阔叶混交林类型，该样地物种丰富，地形起伏多变，沟谷纵横，厘清该样地内不同生态学过程
我国荒漠微生物多样性格局及群落构建机制获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511565.shtm
峨眉山两栖动物群落构建机制获揭示
理解生物多样性的空间格局及其沿地理梯度的内在驱动机制是生态学、生物地理学和保护生物学的重要科学问题之一。其中，物种共存和群落构建机制是研究的热点，更是难点。近年来，随着功能多样性与系统发育多样性研究的兴起与发展，通过整合物种多样性、物种在生态系统中的功能及其系统发育关系来探讨物种共存和群落构建机制，
我国在南亚热带常绿阔叶林群落构建机制研究获新进展
长期以来，群落生态学家困惑于究竟是确定性过程（如：生境过滤和生态位分化），还是随机过程（如：扩散限制）主导了生态系统群落的构建。当前，多数群落学家认为回答这一问题最好的途径之一，是探究确定性和随机过程在不同空间尺度上对生态群落构建的相对重要性，即：在不同的空间尺度上，影响群落构建的生态过程是不同
森林群落中物种稀有性机制研究中获进展
局域群落中的大部分物种都是只有较少个体的稀有种，理解局域群落中物种稀有性的机制是群落生态学的挑战之一。生态位分割假说（Niche partitioning hypothesis）认为，稀有种利用空间上有限且局域稀有的资源。 为了更好地理解不同多度树种如何在群落里中实现共存，中国科学院西双版纳热
多养分添加下基因组大小调控草地群落机制获揭示
近日，中科院植物研究所研究员韩兴国团队与合作者揭示了多养分添加下基因组大小调控草地群落的新机制。相关研究成果发表于《新植物学家》。 资源与植物生产力、多样性之间的关系是生态学长期关注的核心问题之一，资源的增加通常会在提高植物群落生产力的同时降低其植物多样性。草地生态系统是全球最重要的陆地生态系统
多养分添加下基因组大小调控草地群落机制获揭示
近日，中科院植物研究所研究员韩兴国团队与合作者揭示了多养分添加下基因组大小调控草地群落的新机制。相关研究成果发表于《新植物学家》。 资源与植物生产力、多样性之间的关系是生态学长期关注的核心问题之一，资源的增加通常会在提高植物群落生产力的同时降低其植物多样性。草地生态系统是全球最重要的陆地生态系
海岸带土壤细菌群落构建研究获进展
中国科学院华南植物园生态中心硕士研究生吴赐豪在该园研究员任海的指导下，在海岸带土壤细菌群落构建研究方面取得新进展。相关成果近日发表于《全球生态与保护》（Global Ecology and Conservation）。资源匮乏在自然界中普遍存在，影响了土壤微生物的多样性和共存。然而，目前资源可得性对
揭示树种菌根类型对温带森林群落结构的调控机制
森林是陆地生态系统的主体，因而针对森林群落结构及其影响因素的研究一直受到广泛关注，为林业生产和管理提供重要参考。然而，以往研究多关注土壤养分等环境因子对森林群落结构的影响，结果发现存在很大不确定性。土壤微生物作为重要的生物因子，其对群落结构的影响也逐渐受到重视。近期大量的控制实验研究表明，土壤微
从全基因组水平构建鸟类物种生命树
近日，“第一届万种鸟类基因组（B10K）项目国际研讨会——鸟类复杂性状的进化解析与调控”在北京召开。会议由中国科学院昆明动物研究所主办，中国科学院动物研究所协办。会议组织委员会主席由昆明动物所特聘讲座研究员张国捷和动物所研究员雷富民担任。 据悉，由中国科学院昆明动物研究所、中国科学院动物研究所
研究揭示树种菌根类型对温带森林群落结构的调控机制
森林是陆地生态系统的主体，因而针对森林群落结构及其影响因素的研究一直受到广泛关注，为林业生产和管理提供重要参考。然而，以往研究多关注土壤养分等环境因子对森林群落结构的影响，结果发现存在很大不确定性。土壤微生物作为重要的生物因子，其对群落结构的影响也逐渐受到重视。近期大量的控制实验研究表明，土壤微
叶绿体和线粒体基因组变异检测获突破
近日，《公共科学图书馆―综合》发表了中国农业科学院油料作物研究所博士后曾长立与合作导师伍晓明研究建立的能高通量检测叶绿体和线粒体基因组遗传变异的新方法。 据曾长立介绍，叶绿体和线粒体基因组作为植物细胞质基因组，对光合作用、呼吸作用等重要生命过程具有重要意义。 研究叶绿体和线粒体基因组
榕属叶绿体基因组比较研究获进展
近年来，叶绿体基因组因基因组小、突变率和重组率低的特点，被广泛用于植物系统发育、分子进化、谱系地理学的研究。榕属（Ficus）作为桑科的最大属，且是热带雨林的关键物种，而其系统发育关系仍需进一步研究。榕属物种具有多样的生态型，体现了对不同生境的高度适应性。尽管近年来关于榕属叶绿体基因组的研究有所
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器，叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初，人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的，但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子，其大小在1
科学家揭示德保苏铁叶绿体基因组特征
广西大学植物生理生态与进化课题组在苏铁植物的基因组学研究方面取得新进展，首次用苏铁的叶绿体全基因组重建了苏铁植物的系统进化树，揭示托叶铁科为非单系起源，该研究成果近日发表在《科学报告》上。 据介绍，研究人员通过对德保苏铁展开二代测序，获得了德保苏铁基因组几百万条的短片段，用先进的算法进行组装，
二代测序技术助龙胆族叶绿体基因组进化和系统学获进展
随着二代测序技术的发展，植物叶绿体基因组序列已普遍应用于重建植物“生命之树”研究中。大多数植物叶绿体基因组呈环状四分体结构，包含约80个蛋白编码基因。叶绿体基因组由于缺乏重组，而常被认为是连锁的单一基因座；然而，越来越多的研究表明，叶绿体基因组中不同区域以及不同编码基因具有不同的核酸替代速率，经
在这个天然实验室－他们揭示了鸟类群落构建机制
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519235.shtm近日，中国科学院成都生物研究所研究员胡军华团队揭示了峨眉山鸟类多层次多样性的海拔梯度格局及群落构建机制，相关成果发表于《生物地理学杂志》。 峨眉山独特的地理位置和显著的海拔梯度共同塑造
在这个天然实验室－他们揭示了鸟类群落构建机制
近日，中国科学院成都生物研究所研究员胡军华团队揭示了峨眉山鸟类多层次多样性的海拔梯度格局及群落构建机制，相关成果发表于《生物地理学杂志》。 峨眉山独特的地理位置和显著的海拔梯度共同塑造了多样的气候条件并孕育了丰富的鸟类多样性，使其成为研究鸟类多样性海拔梯度格局及群落构建机制的天然实验室。 研究过程中
西双版纳20公顷热带雨林动态监测大样地研究获进展
自从美国史密斯研究院在巴拿马建立世界第一个热带森林动态监测大样地以来，基于大型固定样地的森林生物多样性监测受到越来越多的关注，为人们了解生物多样性的变化及其影响，理解物种共存机制等提供了翔实的数据。 从2004年开始，中国森林生物多样性监测网络在我国不同气候带建立了一系列森林动
大尺度森林土壤固氮菌群落分布格局研究获进展
生物固氮每年能向陆地生态系统提供40~100Tg的氮素，其中共生和自生固氮菌是生物固氮的主要贡献者，它们能将大气中的氮还原成氨，可为植物生长提供有效氮，维持森林生态系统土壤肥力并提高植物生产力。因此，阐明固氮菌群落分布格局可为理解森林氮循环过程以及调控氮素供给策略提供重要支撑。 为此，中国科学院
大尺度森林土壤固氮菌群落分布格局研究获进展
生物固氮每年能向陆地生态系统提供40~100Tg的氮素，其中共生和自生固氮菌是生物固氮的主要贡献者，它们能将大气中的氮还原成氨，可为植物生长提供有效氮，维持森林生态系统土壤肥力并提高植物生产力。因此，阐明固氮菌群落分布格局可为理解森林氮循环过程以及调控氮素供给策略提供重要支撑。 为此，中国科学
科研人员在兰科植物研究方面获得进展
15日从中科院成都生物研究所获悉，中科院成都生物研究所植物多样性研究团队利用Illumina测序技术分别研究了极小种群之一的巴郎山杓兰和对叶杓兰的叶绿体基因组特征，并基于叶绿体基因组数据重建了兰科植物5个亚科中的47个物种的系统发育树，为阐明杓兰属和兰科植物的系统发育关系和分类关系作出了重要贡
我国学者揭示花叶组重楼植物叶绿体基因组特征
重楼属植物主要生物活性物质为甾体皂苷，具有消炎、止血、抗肿瘤等功效，是云南白药、宫血宁等86种著名中成药的重要原料。重楼属花叶组包括花叶重楼与禄劝花叶重楼两种，与属内其它植物相比，叶具斑块，植株矮小，果实很小且产量低。花叶组重楼植物含有中国药典规定的四种重楼皂苷。然而，花叶组重楼生长十分缓慢，对
我国森林WUE和NA空间变化格局获揭示
中国科学院华南植物园生态中心博士生汤松波在研究员旷远文的指导下，联合国内多个团队，对我国森林水分利用效率（WUE）和大气氮可利用性（NA）经纬向变化格局及其调控因子研究取得进展。相关研究近日发表于《环境研究快报》。 全球变化，如全球变暖、降水格局变化及N沉降增加，显著影响森林生态系统植物WU
叶绿体基因组的概念
采用高盐、低pH值法提取雷蒙德氏棉叶绿体DNA;通过物理剪切法获得随机断裂的DNA片段;剪切片段末端、补平修饰后与pCC1FOS载体连接;用噬菌体包装蛋白包装重组DNA,侵染大肠杆菌EPI300,构建了雷蒙德氏棉叶绿体基因组文库。对于叶绿体DNA剪切,以1 mL注射器中等速度吸打18次为最佳参数。
花叶芋叶片关联分析和叶绿体基因组研究获进展
广东省农业科学院环境园艺研究所特色花卉研究室在花叶芋叶片重要观赏性状关联分析和叶绿体基因组研究方面取得新进展。相关研究分别发表于Physiologia Plantarum和Genes。 花叶芋（Caladium）是天南星科花叶芋属多年生草本植物，被誉为“观叶皇后”。花叶芋资源丰富，表型性状变异丰
全球海洋鱼类群落对气候变化的响应获揭示
近日，南方海洋科学与工程广东省实验室（广州）魏辅文院士团队全面分析了20世纪60年代以来全球海洋鱼类群落的监测数据，揭示了气候变化和渔业活动对全球海洋鱼类群落特征的深远影响。相关成果发表于《保护生物学》（Conservation Biology）。气候变化正在重塑全球海洋生态系统，引起鱼类群落物种的