计算生物学所与营养所合作在营养与衰老研究中取得新进展
“人如其食”——饮食决定寿命。中科院上海生命科学研究院计算生物学所韩敬东研究组和营养所刘勇研究组组成的合作团队，通过系统研究节食和运动干预对小鼠寿命的影响，发现了若干参与衰老调控的基因表达程序和信号通路，为深入了解营养代谢与延年益寿之间的机制关系和生物学基础提供了新的启示。4月16日，国际著名学术期刊PNAS 以长篇论文形式在线发表了这项研究成果。 在多种生命体中，对衰老相关基因表达谱的大量研究已发现了许多随年龄而发生表达变化的基因。然而在总体上而言，这些基因大多都是作为衰老的标识基因而并非衰老的调控基因。在有效影响个体寿命和衰老的不同干预手段中，热量限制是研究最多的一种，在多数生物体中均能减缓衰老、延长寿命；而运动也能缓解许多由衰老引起的机体功能下降。另一方面，营养过剩导致的肥胖会诱发许多衰老相关的代谢性疾病，如糖尿病、心脑血管疾病甚至某些肿瘤；但在肥胖发生的情形下，我们对于饮食限制或运动在减缓衰老、促进健康长寿方面......阅读全文
PCR－Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器（三）
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域，包括：癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证截止目前，QIAGEN 拥有ZL申请的PCR Array可以分析超过150条通路和特异的疾病类型。具
PCR－Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器（二）
RT2 Profiler PCR Array操作流程 首先将RNA样本反转录成cDNA第一链，作为PCR模板；接着将cDNA模板与合适的即用型PCR预混液混合，等体积加入到已经固定好基因特异性引物的同一个孔板的每个孔中，然后即可运行real-time PCR循环程序。RT2 Profiler PCR
PCR－Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器（一）
以前只要提到基因表达分析，人们就会想到荧光定量PCR；只要提到高通量基因表达分析，人们会首先想到基因芯片。虽然荧光定量PCR仪几乎每个实验室都有，但是做芯片就不一定每个实验室都具备这个条件了。那么只有一台荧光定量PCR仪是否也能进行高通量的基因表达谱分析呢？QIAGEN 推出的RT2 Profile
Wnt信号通路的生物学功能
多细胞生物体轴分化过程中起重要作用经典的Wnt-β-catenin信号通路是这样的:在没有Wnt配体，通路中的每一种蛋白都正常表达时,Axin 会结合β-catenin ， Axin同时已结合有GSK3和APC ，于是GSK3就可以磷酸化β-catenin ，β-catenin接着能够被APC复合物
什么是基因信号通路？
信号通路是指当细胞里要发生某种反应时，信号从细胞外到细胞内传递了一种信息，细胞要根据这种信息来做出反应的现象。信号通路（signal pathway）的提出最早可以追溯到1972年，不过那时被称为信号转换（signal transmission）。1980年，M. Rodbell在一篇综述中提到信号
基因信号通路的定义
细胞内各种不同的生化反应途径都是由一系列不同的蛋白组成的，执行着不同的生理生化功能。各个信号通路中上游蛋白对下游蛋白活性的调节（包括激活或抑制作用）主要是通过添加或去除磷酸基团，从而改变下游蛋白的立体构象完成的。所以，构成信号通路的主要成员是蛋白激酶和磷酸酶，它们能够快速改变和恢复下游蛋白的构象。从
基因信号通路的分类？
一是当信号分子是胆固醇等脂质时，它们可以轻易穿过细胞膜，在细胞质内与目的受体相结合；二是当信号分子是多肽时，它们只能与细胞膜上的蛋白质等受体结合，这些受体大都是跨膜蛋白，通过构象变化，将信号从膜外domain传到膜内的domain，然后再与下一级别受体作用，通过磷酸化等修饰化激活下一级别通路。
TGFf3/Smad信号通路相关蛋白表达
转化生长因子(TGF)-13/Smads信号传导通路相关蛋白表达主要用于：（1）研究肿瘤组织TGF-13/Smad信号传导通路中相关蛋白的表达；（2）联系临床病理资料作相关分析，阐明癌症发病机制。实验方法原理TGF-13/Smads信号传导通路中任一元件的异常都可以引起TGF-13/Smads信号传
TGFf3/Smad信号通路相关蛋白表达
TGF-f3/Smad信号通路相关蛋白表达 实验方法原理 TGF-13/Smads信号传导通路中任一元件的异常都可以引起TGF-13/Smads信号传导紊乱，
TGFf3/Smad信号通路相关蛋白表达
TGF-f3/Smad信号通路相关蛋白表达 实验方法原理 TGF-13/Smads信号传导通路中任一元件的异常都可以引起TGF-13/Smads信号传导紊乱，
DNA修饰QKI基因信号通路介绍
该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白，可调节mRNA的前剪接，从细胞核输出mRNA，蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化，并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。
Hippo信号通路相关的基因介绍MYC基因
该基因编码的蛋白质是一种多功能的核磷蛋白，在细胞周期进展、凋亡和细胞转化中起到作用。作为调节特定靶基因转录的转录因子发挥作用。这种基因的突变、过度表达、重排和易位与多种造血肿瘤、白血病和淋巴瘤，包括伯基特淋巴瘤有关。有证据表明，来自上游、非aug（cug）帧和下游aug起始位点的选择性翻译起始导致两
Hippo信号通路相关的基因介绍PRKCI基因
该基因编码丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶蛋白激酶c（pkc）家族的一个成员。pkc家族至少由8个成员组成，它们是差异表达的，参与多种细胞过程。这种蛋白激酶不依赖钙和磷脂。它不被佛波酯或甘油二酯激活。这种激酶可以通过与小gtpase rab2的直接相互作用被募集到囊泡管簇（vtcs），在那里这种激酶磷酸化甘油
Wnt信号通路的相关基因介绍TERT基因
端粒酶是一种核糖核蛋白聚合酶，通过添加端粒重复序列TTagg来维持端粒末端。这种酶由一种具有逆转录酶活性的蛋白质成分（由该基因编码）和一种作为端粒重复模板的RNA成分组成。端粒酶的表达在细胞衰老中起作用，因为它通常在出生后的体细胞中被抑制，导致端粒逐渐缩短。体细胞端粒酶表达的放松调控可能与肿瘤发生有
Wnt信号通路的相关基因介绍MYC基因
该基因编码的蛋白质是一种多功能的核磷蛋白，在细胞周期进展、凋亡和细胞转化中起到作用。作为调节特定靶基因转录的转录因子发挥作用。这种基因的突变、过度表达、重排和易位与多种造血肿瘤、白血病和淋巴瘤，包括伯基特淋巴瘤有关。有证据表明，来自上游、非aug（cug）帧和下游aug起始位点的选择性翻译起始导致两
Wnt信号通路的相关基因介绍APC基因
APC为抑癌基因，所编码的蛋白在Wnt信号通路中起负调控作用，也参与到细胞迁移、粘附、转录激活和凋亡中。这个基因缺陷导致家族性腺瘤性息肉（FAP），这是一种常染色体显性遗传疾病，通常易发生癌变，主要机制为突变的APC基因缺失了与Axin的结合序列，因而不能与Axin、CK1和GSK-3β形成β-ca
Wnt信号通路的相关基因介绍CREBBP基因
该基因广泛表达，参与多种不同转录因子的转录共激活。首先作为一种结合cAMP反应元件结合蛋白（creb）的核蛋白被分离出来，该基因通过将染色质重塑与转录因子识别结合，在胚胎发育、生长控制和体内平衡中发挥关键作用。该基因编码的蛋白质具有固有的组蛋白乙酰转移酶活性，也作为支架稳定与转录复合物的额外蛋白质相
Wnt信号通路的相关基因介绍JUN基因
该基因是禽肉瘤病毒17的假定转化基因。它编码一种与病毒蛋白高度相似的蛋白质，并与特定靶DNA序列直接相互作用以调节基因表达。这个基因是无内含子的，被定位到1P32-P31，一个涉及人类恶性肿瘤易位和缺失的染色体区域。
Wnt信号通路的相关基因介绍MITF基因
该基因编码一个转录因子，包含碱性螺旋环螺旋和亮氨酸拉链结构特征。调节黑素细胞视网膜色素上皮的分化和发育，并负责黑素生成酶基因的色素细胞特异性转录。该基因的杂合子突变引起听觉色素综合征，如Waardenburg综合征2型和Tietz综合征。另外，还发现了编码不同亚型的剪接转录变体。
Wnt信号通路的相关基因介绍SRC基因
SRC基因编码的蛋白属于SRC家族激酶（SFKs），该家族由9个成员组成，分别是SCR、LYN、FYN、LCK、HCK、FGR、BLK、YRK和YES，其中SRC是目前研究最多的成员，也是与人类疾病联系最为密切的蛋白。SRC蛋白是非受体酪氨酸激酶，可被多条信号转导途径所激活，而激活后的SRC激酶又通
Wnt信号通路的相关基因介绍CYLD基因
该基因编码一种细胞质蛋白，具有三个细胞骨架相关蛋白-甘氨酸保守（cap-gly）结构域，作为一种去氢酶。该基因突变与圆筒状瘤、多发性家族性毛发上皮瘤和brooke-spiegler综合征有关。交替转录剪接变体，编码不同的亚型，已经被描述出来。
Notch信号通路的相关基因介绍AR基因
雄激素受体（AR），也称为NR3C4（核受体亚家族3，C组，成员4），是一种核受体，通过结合任何雄激素激活，包括睾酮和二氢睾酮在细胞质中，然后易位到细胞核。 雄激素受体与孕酮受体的关系最为密切，较高剂量的孕激素可以阻断雄激素受体。 雄激素受体的主要功能是作为调节基因表达的DNA结合转录因子; 然而，
Notch信号通路的相关基因介绍MYCN基因
这个基因是myc家族的一员，编码一个具有基本螺旋-环-螺旋（bhlh）结构域的蛋白质。这种蛋白位于细胞核内，必须与另一种bhlh蛋白二聚以结合DNA。这种基因的扩增与多种肿瘤有关，尤其是神经母细胞瘤。该基因有多种编码不同亚型的选择性剪接转录变体。
Notch信号通路的相关基因介绍CBL基因
这个基因是一个原癌基因，编码一个无名指E3泛素连接酶。编码蛋白是蛋白酶体降解底物所需的酶之一。该蛋白介导泛素从泛素结合酶（E2）转移到特定底物。该蛋白还包含一个N端磷酸酪氨酸结合域，使其与许多酪氨酸磷酸化底物相互作用，并以蛋白酶体降解为靶点。因此，它作为许多信号转导途径的负调节器发挥作用。该基因在包
Notch信号通路的相关基因介绍CREBBP基因
该基因广泛表达，参与多种不同转录因子的转录共激活。首先作为一种结合cAMP反应元件结合蛋白（creb）的核蛋白被分离出来，该基因通过将染色质重塑与转录因子识别结合，在胚胎发育、生长控制和体内平衡中发挥关键作用。该基因编码的蛋白质具有固有的组蛋白乙酰转移酶活性，也作为支架稳定与转录复合物的额外蛋白质相
Notch信号通路的相关基因介绍REL基因
该基因编码一种属于rel同源域/免疫球蛋白样折叠、丛蛋白、转录因子（rhd/ipt）家族的蛋白质。这个家族的成员调节参与细胞凋亡、炎症、免疫反应和致癌过程的基因。这种原癌基因在B淋巴细胞的存活和增殖中起作用。这种基因的突变或扩增与B细胞淋巴瘤，包括霍奇金淋巴瘤有关。该基因的单核苷酸多态性与溃疡性结肠
Notch信号通路的相关基因介绍SPEN基因
这个基因编码一种激素诱导的转录抑制因子。这种基因产物的转录抑制可以通过与其他抑制因子的相互作用、参与组蛋白脱乙酰化的蛋白质的募集或通过转录激活因子的分离来实现。这个基因的产物含有一个羧基末端结构域，可以与其他共加压蛋白结合。该结构域还允许与nurd复合物的成员相互作用，nurd复合物是一种核小体重塑
Hedgehog信号通路的相关基因介绍SMO基因
Hedgehog（Hh）信号通过两个跨膜蛋白Patched（Ptc）和Smoothened（Smo）介导，在无Hedgehog的情况下，Ptc抑制Smo。当Hedgehog与Ptc结合时，则解除了Ptc对Smo的抑制作用，激活的Smo可导致下游靶基因的活化。Smo或者Hh基因突变或表达异常均可导致细
Hedgehog信号通路的相关基因介绍GNAS基因
GNAS作为一个重要的信号转导蛋白，主要功能是在G蛋白偶联受体信号转导途径中，激活腺苷酸环化酶，导致cAMP水平的升高，参与调控细胞生长和细胞分裂。
Hedgehog信号通路的相关基因介绍GNAQ基因
GNAQ基因所编码的蛋白属于鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白）的家族，GNAQ与GNA11形成的复合物为G蛋白α亚基，这两个基因调控细胞分裂，增强MEK（有丝分裂原活化蛋白激酶的激酶）蛋白活性，在80%的葡萄膜黑色素瘤病人中发现GNA11和GNAQ基因的突变，其机制为基因突变导致MEK的异常激活，目前正