PCRArray——基因表达分析疾病和信号通路的利器（三）
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域，包括：癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证截止目前，QIAGEN 拥有ZL申请的PCR Array可以分析超过150条通路和特异的疾病类型。具体如下通路名称供您参考：Adherens Junctions粘附连接Adipogenesis脂肪生成Aging衰老Allergy & Asthma过敏&哮喘Alzheimer’s Disease阿尔茨海默氏症（老年痴呆）Alzheimer’s Disease阿尔茨海默氏症（老年痴呆）Amino Acid Metabolism I氨基酸代谢IAmino Acid Metab......阅读全文
PCR－Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器（三）
RT2 PCR Profiler Arrays可用于生物学和医学研究的各个领域，包括：癌症研究、炎症和细胞因子分析、干细胞研究、神经生物学、信号转导通路研究、细胞黏附和细胞迁移、生物标记分子筛选和验证截止目前，QIAGEN 拥有ZL申请的PCR Array可以分析超过150条通路和特异的疾病类型。具
PCR－Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器（一）
以前只要提到基因表达分析，人们就会想到荧光定量PCR；只要提到高通量基因表达分析，人们会首先想到基因芯片。虽然荧光定量PCR仪几乎每个实验室都有，但是做芯片就不一定每个实验室都具备这个条件了。那么只有一台荧光定量PCR仪是否也能进行高通量的基因表达谱分析呢？QIAGEN 推出的RT2 Profile
PCR－Array——基因表达分析疾病和信号通路的利器（二）
RT2 Profiler PCR Array操作流程 首先将RNA样本反转录成cDNA第一链，作为PCR模板；接着将cDNA模板与合适的即用型PCR预混液混合，等体积加入到已经固定好基因特异性引物的同一个孔板的每个孔中，然后即可运行real-time PCR循环程序。RT2 Profiler PCR
PCR－Array－简单实用的检测基因表达的高通量方法（三）
PCR 芯片实验体系 完整的PCR芯片实验体系包括RT2ProfilerTM PCR芯片，RT2 Real-TimeTM SYBR Green PCR反应体系和cDNA合成试剂盒。所有这些组分均为基于SYBR Green的实时定量PCR反应优化。精心设计的引物和优化的PCR反应体系一起，为
PCR－Array－简单实用的检测基因表达的高通量方法
简介：什么是PCR芯片？实时定量PCR是检测基因表达最灵敏，最可靠的方法。通过在试验过程中，实时监测荧光染料的信号变化，反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广（能达到5个数量级），因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是，由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内
PCR－Array－简单实用的检测基因表达的高通量方法
简介：什么是PCR芯片？实时定量PCR是检测基因表达zui灵敏，zui可靠的方法。通过在试验过程中，实时监测荧光染料的信号变化，反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广（能达到5个数量级），因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是，由于实时定量PCR需要制备标准曲线和
Hippo信号通路和疾病
a. Hippo信号通路和癌症癌症是涉及异常细胞生长，可能侵入或蔓延到其他多个身体部位的疾病。虽然第一次发现Hippo通路是因为它可以通过促进细胞凋亡及抑制细胞周期来控制成像椎间盘生长，但是目前在动物模型中的研究已经将该通路的功能扩展到了其他癌症，如乳头状肾癌，结直肠癌，卵巢癌，乳腺癌和胃癌。 Ca
通过qPCR开展基因表达谱分析
一提起基因表达谱分析，大家马上会想到芯片。然而，并不是每个实验室都具备这个条件。现在，利用每个实验室都有的定量PCR仪，也能开展可靠的基因表达谱分析啦。 QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术，它利用实时定量PC
PCR－Array－简单实用的检测基因表达的高通量方法（五）
重复性 实时定量PCR的定量特性使得PCR芯片的重复性强。为检测重复性，2位研究者采用了同样的总RNA样品，分别进行了4次重复试验。两个人使用同种PCR芯片，但批号不同，并且每个人都分两天进行试验。比较两位研究者分别做的4张芯片的原始Ct值。图5显示了比较结果的图示和相关系数。每一组比较结果均获得理
PCR－Array－简单实用的检测基因表达的高通量方法（二）
PCR芯片的设计和所包含的基因 96孔模式的每种RT2Profiler PCR芯片，含有基因特异性引物，可用于研究84个与某种信号通路或者疾病相关的基因。此外，芯片中还有设置了3个检测实验质量的对照。图2为PCR芯片模式图。由于每种芯片都是根据特别的信号通路或者特定的应用范围设计的，研究者可以用它来
PCR－Array－简单实用的检测基因表达的高通量方法（一）
简介：什么是PCR芯片？ 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏，最可靠的方法。通过在试验过程中，实时监测荧光染料的信号变化，反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广（能达到5个数量级），因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是，由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析
PCR－Array－简单实用的检测基因表达的高通量方法（四）
RT2ProfilerTM PCR芯片特点灵敏度 研究者总是希望能检测到表达量相当低的基因，有时候，研究者得到的起始总RNA量也很少，但仍希望能进行实时定量PCR检测。为了满足研究者的这些需要，Superarray严格检测了PCR芯片系统的灵敏度。例如，Superarray使用PCR芯片检测了一系列
什么是pcr－array？
pcr array 中文名称就是PCR阵列，或者PCR芯片。运用高通量荧光定量PCR array 方法，在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或疾病相关基因的多个基因的表达量变化进行检测，芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因或者待考证的基因;目前启因生物针对不同的信号通路和疾病相关基因
PCR－Array－技术原理
PCR Arrays是分析一组特定基因表达的可靠工具，引物经过优化。每个96孔板、384孔板PCR Array都包含SYBR® Green优化的引物分析，可对相关的通路或疾病相关的基因进行细致的研究，并含有相应的RNA、DNA质量控制。PCR Arrays也可针对您特定的研究兴趣对一些基因作定制化
PCR－Array－性能优势
灵敏度： 每个芯片使用至少1 ng或至多5 µg总RNA可获得高于80%的阳性信号率，即使细胞中细胞因子的表达量很低，25 ng总RNA的阳性率也>80%。 重复性： 图为对比不同研究人员在间隔3个月的时间下使用不同批次的Human Drug Metabolism PC
基因信号通路的分类？
一是当信号分子是胆固醇等脂质时，它们可以轻易穿过细胞膜，在细胞质内与目的受体相结合；二是当信号分子是多肽时，它们只能与细胞膜上的蛋白质等受体结合，这些受体大都是跨膜蛋白，通过构象变化，将信号从膜外domain传到膜内的domain，然后再与下一级别受体作用，通过磷酸化等修饰化激活下一级别通路。
基因信号通路的定义
细胞内各种不同的生化反应途径都是由一系列不同的蛋白组成的，执行着不同的生理生化功能。各个信号通路中上游蛋白对下游蛋白活性的调节（包括激活或抑制作用）主要是通过添加或去除磷酸基团，从而改变下游蛋白的立体构象完成的。所以，构成信号通路的主要成员是蛋白激酶和磷酸酶，它们能够快速改变和恢复下游蛋白的构象。从
Atlas™cDNA表达距阵(Expression－Array)
AtlasTM cDNA表达距阵(Expression Array)同时对588种/1176种关键基因做全景表达图谱分析同时对大量已知基因的表达进行大规模高通量(High-htroughput)分析检测关键基因在细胞关键功能中的角色只需简单的杂交步骤就在数年前，核酸矩阵技术只能在资金雄厚的大实验室开
FAO通路通过抑制失巢凋亡促进结肠直肠癌细胞远端转移
中山大学附属肿瘤医院肿瘤研究所徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗及抗癌药物研究。该课题组利用NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array研究发现在非贴壁的结直肠癌细胞中，脂肪酸氧化（FAO）通路被激活。而在转移的肿瘤中，CPT1A表达上调，由CPT1A
FAO通路通过抑制失巢凋亡促进结肠直肠癌细胞远端转移
中山大学附属肿瘤医院肿瘤研究所徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗及抗癌药物研究。该课题组利用NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array研究发现在非贴壁的结直肠癌细胞中，脂肪酸氧化（FAO）通路被激活。而在转移的肿瘤中，CPT1A表达上调，由CPT1A介导的
基因表达系列分析实验（SAGE）（三）
58. 用 1：10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上观察，分出感兴趣的区带。59. 把每一块凝胶放入底部有约 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量离心管中（用 21-G 针头刺的）。60. 把 0.5 离心管连同凝胶块放入 2.0 ml 的硅烷化的离心管里
什么是基因信号通路？
信号通路是指当细胞里要发生某种反应时，信号从细胞外到细胞内传递了一种信息，细胞要根据这种信息来做出反应的现象。信号通路（signal pathway）的提出最早可以追溯到1972年，不过那时被称为信号转换（signal transmission）。1980年，M. Rodbell在一篇综述中提到信号
BioMark™基因分析系统介绍
美国Fluidigm公司www.fluidigm.com创立于1999年，总部设在美国加州。其创始人是Steve Quake和Gajus Worthington(公司CEO)。Steve Quake是美国斯坦福大学教授，是微液流领域（Microfluidic Technology）的权威专家http
Atlas™cDNA表达距阵(Expression－Array)2
区分关系相近肿瘤的诊断工具 分析在肿瘤发生中起关键作用的基因的表达 588种与癌症相关的cDNA点阵于一带正电的尼龙膜上，另外还包括9个管家基因的质粒、噬菌体等阴性对照。cDNA按分子途径和家族分类置于不同板块，包括癌基因、抑癌基因、细胞周期相关基因和凋亡等。 Atlas? Mouse cD
FAO通路通过抑制失巢凋亡促进结肠直肠癌细胞远端转移
中山大学附属肿瘤医院肿瘤研究所徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗及抗癌药物研究。该课题组利用NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array研究发现在非贴壁的结直肠癌细胞中，脂肪酸氧化（FAO）通路被激活。而在转移的肿瘤中，CPT1A表达上调，由CPT1A
Nacia数字PCR在基因表达分析中的应用
华盛顿大学医学院儿科和加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院儿科的研究人员建立了一个稳定可靠的基于RNA磁珠提取和数字PCR的方法，可从粪便样本中检测与EE（热带肠病）关联的人mRNA，灵敏度可达20拷贝GAPDH mRNA/200mg粪便样本。已有报道表明病人粪便中存在人mRNA，可作为反应病人消化道病
Hippo信号通路及其在人类健康和疾病中的意义
Hippo途径最早是在黑腹果蝇身上发现的，在过去的20年里一直被研究。Hippo途径的基本发现和过程的时间表。在哺乳动物中，Hippo通路由几个关键成分组成，包括哺乳动物STE20样激酶1/2(MST1/2)、蛋白萨尔瓦多同源物1(SAV1)、MOBKL1A/B(MOB1A/B)、大肿瘤抑制因子
快速可靠的甲基化分析，无需亚硫酸氢盐转化
在甲基化分析中，亚硫酸氢盐转化通常是必经之路。它将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不变，之后再结合PCR、测序等技术分析甲基化状态。听上去似乎很简单，但要想获得漂亮的结果，却并非那么容易。转化效率如何?回收率如何?这都是需要考量和优化的因素。 最近，QIAGEN
NALP3炎性体与非感染性炎症疾病及其通路研究工具
一、NALP3炎性体的结构和分布 NALP3炎性体是一类分子量约为700kDa的大分子蛋白复合体，由核苷酸结合寡聚化结构域样受体（nucleotide-binding oligomerization domain-like receptors，NLRs）家族成员NALP3、衔接蛋白ASC
BioTNT－PCR－Array实验操作（二）
三、数据导出后进行分析； 3.1 数据分析基本设置1. 确定基线基线是qPCR扩增前期的荧光本底信号，一般都由仪器自动设置。不同仪器类型，基线的设置也略有不同，往往在荧光信号指数扩增阶段的前几个循环处，一般将定量PCR的前15个循环信号作为荧光本底信号，如果实验数据中最低CT还小于基线的设置上