首次!纳米孔测序让流感病毒终于“无所遁形”|Nature
4月12日,这项研究的领导者、美国疾病控制和预防中心(CDC)的微生物学家John Barnes在给bioRxiv服务器(生命科学领域专有的预印本文献库)的预印本(a preprint posted)中介绍了这项工作,他说:“我们第一次可以真正开始观察基因组在其原始状态的本质,这确实开始开辟了很多可能性。” 变革前的“RNA测序” RNA的化学性质类似于它的”近亲”——DNA。在细胞生物中,它充当DNA编码基因和蛋白质之间的中介,并在细胞中执行其他任务。但许多病毒(包括脊髓灰质炎病毒、埃博拉病毒以及普通感冒病毒)将其遗传信息存储为RNA,而非DNA。 据Barnes介绍,几乎所有的“RNA测序”都使用一种叫做逆转录酶的病毒酶,它通过将RNA复制到“序列友好”(sequencer-friendly)的DNA链中完成测序,而这种传统的“RNA测序”技术自20世纪70年代被发明以来就未改变过,这一技术缺陷也导致没有人对上述病......阅读全文
质粒dna的提取与基因组dna的提取有何异同
质粒DNA提取一般用沸水浴法和碱裂解法,现在一般都采用碱裂解法,并有试剂盒可用。它主要是将细胞内的环状质粒提取出来,一般需要用SDS裂解,RNA酶降解,然后过柱,再进行洗脱.过程比较简单。 而基因组DNA提取则较为复杂,也需要用SDS裂解和RND酶降解,但降解时间较长,同时对有些革兰氏阳性细菌
DNA扩增标准化操作规范(DNA基因分型实验室)
1 目的:DNA 扩增标准化操作规范适用于HLA试验中的DNA 扩增操作。2 适用范围:DNA 基因分型实验室。3 依据:DNA 扩增标准化操作规范4 引用文件:德国BAG公司(以下简称BAG)《Instructions for use Instructions for use HISTO TYPE
北京鸭基因组研究或助力抗击“禽流感”
2013年6月10日,由中国农业大学、深圳华大基因研究院和英国爱丁堡大学等多家单位合作完成的北京鸭基因组研究成果在《自然·遗传学》(Nature Genetics)杂志上在线发表。这项研究鉴定了鸭子对禽流感产生免疫反应的相关遗传基因,将有助于进一步了解鸟类的免疫机制,同时为深入解析禽流感病毒
关于H7N9禽流感的基因来源介绍
2013年4月初,中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室对H7N9禽流感病毒进行基因溯源研究显示,H7N9禽流感病毒基因来自于东亚地区野鸟和中国上海、浙江、江苏鸡群的基因重配。而病毒自身基因变异可能是H7N9型禽流感病毒感染人并导致高死亡率的原因。 研究结果初步显示,H7N9禽流感病毒暂未发现
Nature-Genetics-:发现鸭对禽流感产生免疫反应的基因
近日,《自然—遗传学》期刊发表了鸭基因组的全序列,并找出令鸭子对禽流感产生免疫反应的遗传基因。此一发现将有助科学家进一步了解水禽的免疫保护机制。 最近出现的H5N1亚型禽流感病毒已在家禽中广泛散布,而鸭子更被视为此病毒的天然宿主。早期的研究显示,鸭子能在毫无症状的情况下传播流感病毒。
朝鲜开发出诊断禽流感的基因分析法
朝鲜农业科学院兽医学研究所的研究人员最近开发出能快速诊断禽流感的基因分析法,并研制出新型诊断试剂。 据朝鲜中央通讯社7月21日报道,这家研究所的研究人员4年前揭示了世界流行的一些禽流感病毒的生物特性,并建立了相应的基因数据库。在此基础上,研究人员成功开发出在不需要标准血清和标准抗原的情况下,能迅速诊
深圳禽流感死亡病例病毒与野鸟病毒基因接近
记者1月2日从深圳疾控中心了解到,深圳一感染高致病性禽流感患者2011年12月31日因医治无效死亡。深圳疾控中心对死亡病例样本进行病毒测序,结果显示,此例病毒与香港2011年禽流感死亡的野鸟病毒基因接近,与家禽较远。但目前仍不能确定这名患者感染上高致病性禽流感是否与候鸟有关。 深圳疾控中心
我科学家发现鸭免疫禽流感遗传基因
最近出现的H5N1亚型禽流感病毒在家禽中广泛散布,而鸭子更被视为此病毒的天然宿主。鸭子为什么能成为流感病毒的天然宿主?中国农业大学教授李宁等人比较了受高致病性和低致病性H5N1病毒感染的鸭子,发现其肺部组织的基因表达会因病毒感染而有所改变,从而找出了令鸭子对禽流感产生免疫
关于H7N9禽流感的基因序列介绍
科学家们说,一种此前从未在人体内发现的致命禽流感病毒的基因序列数据显示,这一病毒已经发生某些可能使之更易在人类中大流行的变异。 2013年4月3日,迄今没有证据显示,H7N9禽流感病毒正在人际间传播,也存在以下可能性:这种病毒可能会逐渐销声匿迹,不会完全变异为一种人流感。就在中国宣布已确诊多例
流感病毒与流感疫苗
1. 流感病毒的形态及实验室分离纯化: 引起人类流感的病毒是冠状病毒。冠状病毒只感染脊椎动物。 感染流感病毒后会引起人与动物的呼吸道、消化道与神经系统病患。 流感病毒的代表型在上世纪 60年代被查明, 60年代后对各种流感病毒的完整形态已进行了深入研究。冠状病毒的基因图谱序列(包括各种蛋白酶和病毒内
流感病毒与流感疫苗
1. 流感病毒的形态及实验室分离纯化:l#61472;引起人类流感的病毒是冠状病毒。冠状病毒只感染脊椎动物。l#61472;感染流感病毒后会引起人与动物的呼吸道、消化道与神经系统病患。l#61472;流感病毒的代表型在上世纪 60年代被查明, 60年代后对各种流感病毒的完整形态已进行了深入研究。冠状
DNA修饰ARID2基因信号通路介绍
该基因编码一个富含AT的相互作用域(ARID)的DNA结合蛋白家族成员。 ARID家族的成员在胚胎模式,细胞谱系基因调控,细胞周期控制,转录调控和染色质结构修饰中发挥作用。 该蛋白作为多溴和BRG1相关因子或PBAF(SWI / SNF-B)染色质重塑复合物的亚基,通过核受体促进配体依赖性转录激活。
人肌肉基因首次插入面包酵母DNA
荷兰研究人员成功将人类肌肉基因插入面包酵母的DNA中,这是科学家首次将如此重要的人类特征植入酵母细胞,得到的人源化酵母模型,可作为药物筛选和癌症研究工具。相关论文发表于《细胞报告》杂志。 代尔夫特理工大学研究团队添加到酵母细胞中的特征由一组十个基因控制,人类没有这些基因就无法生存。这组基因包含了
与DNA损伤相关的145个基因“现形”
研究示意图。图片来源:《自然》杂志 据最新一期《自然》杂志报道,通过对近1000只转基因小鼠开展研究,英国科学家发现了100多个与DNA损伤有关的关键基因。这项研究为开发癌症和神经退行性疾病个性化疗法提供了有希望的标靶。 基因组包含生物体细胞内所有基因和遗传物质。当基因组稳定时,细胞可准确复制和
DNA修饰SMARCB1基因信号通路介绍
SMARCB1基因编码的蛋白是ATP依赖性染色质调节复合物SWI/SNF的核心亚基,参与基因的表观修饰和转录调控。SMARCB1基因突变与神经鞘瘤的发生相关,其作为抑癌基因可以诱导细胞G1停滞、抑制染色体非整倍性等,发挥肿瘤抑制的作用。
DNA基因突变的过程和结果分析
突变是指生物体、病毒或染色体外DNA基因组核苷酸序列的改变。包括哪怕是只有一个碱基变化的碱基替换、DNA插入、DNA缺失或DNA重复引起的序列的改变 。一些突变是可遗传的,生殖细胞发生的突变可以遗传给后代。发生在非生殖细胞即体细胞的突变,称为体细胞突变,是非遗传的突变。DNA复制过程出错可以导致突
DNA与RNA能协同互补调控基因表达
比利时布鲁塞尔自由大学主导的一项研究揭示,DNA和RNA的表观遗传学协同调控比过去想象的更加紧密。这项发表在最新一期《细胞》杂志上的研究,结合了DNA和RNA研究结果,指出这两种调控方式共同作用,形成一个互补系统:DNA表观遗传学决定了哪些基因可以被激活,而RNA表观遗传学则动态调整这些基因的表达水
DNA修饰CHD2基因信号通路介绍
CHD家族蛋白的特征是存在染色质(染色质组织修饰剂)结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达,从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。
利用基因芯片检测尿液游离DNA样本
膀胱尿路上皮癌具有复杂多样的特征,其中一部分原因是基因组多样化所致。1,2Togneri等在《European Journal of Human Genetics》上发表的文章中称,尿液样本上清液中的游离DNA(cfDNA),与从制成颗粒的尿液细胞材料或传统肿瘤组织样本中获得的DNA相比,检测基
DNA修饰EP300基因信号通路介绍
该基因编码腺病毒E1A相关的细胞p300转录辅激活蛋白。作为组蛋白乙酰转移酶,通过染色质重塑调节转录,在细胞增殖和分化过程中起重要作用。通过与磷酸化CREB蛋白特异性结合来介导cAMP基因调控。该基因也被鉴定为HIF1A(缺氧诱导因子1α)的共激活物,因此在缺氧诱导基因如VEGF的刺激中起到作用。这
染色质DNA基因组的介绍
凡是具有细胞形态的生物其遗传物质都是DNA,只有少数病毒的遗传物质是RNA。在真核细胞中,每条未复制的染色体包含一条纵向贯穿的DNA分子。狭义而言,某一生物的细胞中储存于单倍染色体组中的总遗传信息,组成该生物的基因组。真核生物基因组DNA的含量比原核生物高得多。 突变分析结果表明,并非所有基因
重组DNA技术与基因工程(组图)
重组DNA技术是现代分子生物技术发展中最重要的成就之一。即是基因工程(Gene Engineering)的核心技术。重组DNA技术(Recombinant DNA Technique)是人类根据需要选择目的基因(DNA片段)在体外与基因运载体重组,转移至另一细胞或生物体内,以达到改良和创造新的物种和
基因组DNA甲基化分析方法
早期的基因组DNA甲基化分析技术,如SssI甲基转移酶分析法、氯乙醛反应法、免疫学抗体技术等,已经不能满足现代表观遗传学研究的需求。今年来常用的基因组甲基化的方法有以下两种。1. 甲基化敏感扩增多态性实验甲基化敏感扩增多态性实验技术被用于检测双向型真菌的DNA甲基化,它是在扩增片段长度多态性技术的基
动物细胞基因组DNA提取实验
实验原理真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从
DNA修饰TOP2A基因信号通路介绍
这个基因编码一种DNA拓扑异构酶,这种酶在转录过程中控制和改变DNA的拓扑状态。这种核酶参与诸如染色体凝聚、染色单体分离以及DNA转录和复制过程中发生的扭转应力的减轻等过程。它催化双链DNA的两条链的瞬间断裂和重新结合,使双链彼此穿过,从而改变DNA的拓扑结构。这种酶有两种形式,可能是基因复制事件的
动物组织细胞基因组DNA提取
一、实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组 DNA。真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液
动物细胞基因组DNA的制备
实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA的制备原理及操作流程。本方法一般可从5×107培养的非整倍体细胞(如HeLa细胞)中获得大约200μg DNA。DNA的长度可达到100~150kb。20ml正常血的DNA产量约为250μg。实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组
酵母基因组DNA简易高效提取方案
1. 10ml菌液过夜培养至饱和(OD600值为2-3) 2. 离心沉降细胞(Sorvall中以2000rpm的速度),然后以冷的、等体积的无菌蒸馏水洗涤 3. 将细胞沉淀在200μl 裂解缓冲液中重悬浮,然后加入约300μl 玻璃珠和200μl的1:1苯酚:氯仿混和液 4. 漩涡摇匀1-2min
DNA修饰EWSR1基因信号通路介绍
该基因编码一种多功能蛋白,参与多种细胞过程,包括基因表达、细胞信号传导、RNA加工和转运。该蛋白包括一个N末端转录激活域和一个C末端RNA结合域。该基因与编码转录因子的各种基因之间的染色体易位导致参与肿瘤发生的嵌合蛋白的产生。这些嵌合蛋白通常由该蛋白的N末端转录激活域与转录因子蛋白的C末端DNA结合
美绘出DNA一修饰因子基因图谱
据美国物理学家组织网7月21日报道,美国科学家已经首次绘制出了人体胚胎干细胞内一个名为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)的修饰因子的全基因图谱。科学家们表示,5hmC在一些被打开或激活的基因内出现的频率非常高,最新研究将有助于癌症的控制。研究论文发表在最新一期《基因组生物学》杂志上。