中美联合揭示SidE同ubiquitin及其配体互作方式和催化机制

2018年5月3日,Cell杂志在线发表了高璞课题组与纽约大学合作的研究论文“Structural Insights into Non-canonical Ubiquitination Catalyzed by SidE”。该工作解析了来源于高致病性嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)的新型泛素化酶SidE与ubiquitin和配体的多个复合物的高分辨率晶体结构,并结合大量的生化实验和突变体分析,揭示了SidE同ubiquitin及其配体的新颖互作方式和催化机制。图一:SidE的两步反应中,mART结构域及PDE结构域结合ubiquitin的三维结构 泛素化修饰调控着真核细胞几乎所有的生命活动。在与宿主的长期博弈过程中,病原菌进化出了多种方式来干预宿主的泛素修饰系统,从而达到增强侵染效率和逃避免疫监视的目的。以往报道的泛素化修饰(不论是宿主自身的,或是病原参与的),均是通过经典的E1-E2-E3三酶级......阅读全文

干货分享——揭开糖基化修饰的神秘面纱

  相对于磷酸化、乙酰化修饰等相对较为简单的PTM来讲,糖基化修饰稍显复杂和多样,各位看官对糖基化修饰的知识了解多少呢?是否又对O糖、N糖傻傻分不清楚呢?没关系,今天小编带您一起走进糖的世界,一起揭开糖基化修饰的神秘面纱。  糖基化修饰主要发生在内质网和高尔基体。主要过程是将糖基在糖基转移酶作用下将

研究抗体药物的糖基化修饰为何重要?

  在众多的蛋白质翻译后修饰中,糖基化修饰是最重要和最复杂的修饰之一,也是评价抗体的关键质量属性之一。单抗药物功能的实现与其糖基化修饰密切相关,糖基化修饰会影响蛋白的性能,如构象、稳定性、溶解度、药物代谢动力学、活性及免疫原性。本文中,笔者就糖基化及其对抗体药物的稳定性/半衰期、安全性及生物活性进行

为何要关注抗体药物的糖基化修饰?

   在众多的蛋白质翻译后修饰中,糖基化修饰是最重要和最复杂的修饰之一,也是评价抗体的关键质量属性之一。单抗药物功能的实现与其糖基化修饰密切相关,糖基化修饰会影响蛋白的性能,如构象、稳定性、溶解度、药物代谢动力学、活性及免疫原性。本文中,笔者就糖基化及其对抗体药物的稳定性/半衰期、安全性及生物活性进

我国学者在新型泛素化反应分子机制研究领域取得进展

           图. SdeA及其与泛素复合物的结构。a)SdeA的结构域组成;b) SdeA整体结构的两个视角;c) SdeA mART结构域与泛素结合的结构;d) SdeA与泛素结合结构细节。  在国家自然科学基金项目(项目编号:31670766、21532004、2147500

泛素样蛋白的来源及功能

真核生物蛋白可以通过与各种小分子物质或蛋白质相结合的方式被修饰。在众多的修饰方式当中有一种就是与泛素蛋白或泛素样蛋白(UBL)相结合,采用这种抗原肽修饰方法可以对多种生理过程进行调控。UBL蛋白可以控制被修饰蛋白与其它生物大分子(比如蛋白酶体或染色质)间的相互作用。各种UBL系统都会使用相应的酶来催

组蛋白的合成修饰的相关介绍

  这是形成组蛋白各组分微不均一性的主要原因。修饰的方式有:  ①乙酰化。有两种:  一种是H1、H2A、H4组蛋白的氨基末端乙酰化,形成α-乙酰丝氨酸,组蛋白在细胞质内合成后输入细胞核之前发生这一修饰。  另一种是在H2A、H2B、H3、H4的氨基末端区域的某些专一位置形成N6-乙酰赖氨酸。  ②

常用多肽修饰方法及过程综述

多肽是一种由两个或多个氨基酸通过肽键(酰胺键)连接而形成的化合物。多肽在调节机体各系统、器官、组织和细胞的功能活动以及在生命活动中发挥重要作用,并且常被应用于功能分析、抗体研究、药物研发等领域。而通过对多肽进行修饰进而改变多肽的理化性质也是多肽研究中一种常用的手段。多肽修饰种类繁多,从修饰位点不同则

E3泛素连接酶HOIL1L的催化机制和调控机理研究获进展

  泛素化修饰是哺乳动物细胞中广泛存在的一种蛋白质翻译后修饰。泛素化修饰包括单泛素化修饰和不同连接方式的多泛素化修饰。泛素化修饰在众多的细胞过程中发挥关键作用,包括蛋白质降解、细胞自噬、DNA修复、信号传导等。其中,线性泛素化修饰参与多种免疫相关过程,如NF-kB信号通路和抗入侵病原体的选择性自噬等

Nat-Communi-|-谭泽华/庄怀佳揭示了T细胞活化的重要调控新机制

  DUSP22是一种双特异性磷酸酶,通过使激酶Lck失活来抑制T细胞活化。  2024年1月15日,中国台湾国家卫生研究院谭泽华及庄怀佳共同通讯在Nature Communications 发表题为“The phosphatase DUSP22 inhibits UBR2-mediated K63

科学家揭示多个翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制

近日,中国科学院植物研究所研究员宋献军等揭示了多个翻译后修饰协作调控水稻种子大小的新机制。相关研究成果发表于《自然—通讯》。我国未来农业的发展面临诸多挑战,随着人民生活水平的不断提高,在确保粮食安全,高产稳产的同时,也要满足人们对于优质粮的需求。水稻是我国的主粮作物,籽粒大小决定了稻米的产量和品质。

物理所SM1组基于单分子力谱技术解析泛素修饰对基因调控

  人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN

LifeSensors超全泛素及多聚泛素链使用指南

       泛素(ubiquitin)是一种存在于所有真核生物(大部分真核细胞)中的小蛋白。 泛素由76个氨基酸组成,分子量大约8.5kDa。泛素的主要功能是标记需要分解掉的蛋白质,使其水解,是机体调节细胞内蛋白水平与功能的一个重要机制。        泛素氨基酸序列        MQIFVKT

我国学者在蛋白质酪氨酸泛素化方面取得进展

图 FUSEP化学生物学技术用于系统研究赖氨酸和非赖氨酸泛素化的位点信息  在国家自然科学基金项目(22137004、22307062)资助下,清华大学药学院尹航教授团队在蛋白质泛素化研究领域取得新进展,开发了FUSEP(Fusion E2-Ub-R74G Profiling)化学生物学技术,揭示了

GENE-DEV封面文章:Wnt信号通路泛素化连接酶降解机制

  6月1日,《基因与发育》(genes & development)杂志以封面论文的形式发表了中国科学院生物物理研究所梁栋材课题组与美国诺华生物医学研究所Feng Cong研究团队、华盛顿大学教授许文清关于Wnt信号通路泛素化连接酶降解机制的最新研究成果,文章题为The SIAH E3 ubiqu

核小体识别和泛素化机制,有助开发更好的癌症治疗方法

  在一项新的研究中,来自美国梅奥诊所的研究人员利用先进的成像技术,对BRCA1-BARD1蛋白复合物有了前所未有的了解,该复合物在乳腺癌或卵巢癌患者中经常发生突变。这项研究确定了BRCA1-BARD1功能的多个方面,为未来的转化研究、癌症预防工作和药物开发提供了支持。相关研究结果于2021年7月2

揭示去泛素化酶OTUD1抑制肠炎发生新机制

  炎症性肠病(IBD)是一类免疫反应失调所致的反复发作的慢性肠道炎症性疾病,包括溃疡性结肠炎(UC)、克罗恩病(CD),多发于结肠和回肠末端。近几十年来,IBD发病率呈明显上升趋势,且目前临床上尚未找到有效根治IBD的治疗方案。肠道免疫系统能通过多种细胞和分子机制维持肠道免疫稳态,其紊乱可能导致多

如何判断一个细胞样品中哪些泛素化酶有表达

A、癌细胞的主要特征是能够无限增殖,分裂间期进行DNA复制,这过程需要酶参与,故A错误;B、蛋白质的合成过程包括转录和翻译,转录是指以DNA为模板合成RNA的过程,需要相关的酶催化,故B错误;C、蛋白质是氨基酸脱水缩合形成肽链,肽链盘曲折叠形成具有一定空间结构的蛋白质,这过程需要有关的酶,故C错误;

NSMB:科学家发现调节基因组复制的代码信号

  三年前,来自西班牙国家癌症研究中心的研究者首次对干预细胞重要过程的特殊蛋白进行了描述,该细胞过程即细胞分裂期间遗传物质的复制过程,当时研究者发现,DNA复制的关键基因组区域充满着特殊蛋白的修饰,即为小分子泛素样修饰蛋白(Small ubiquitin-like modifier, SU

泛素蛋白酶体途径

泛素(ubiquitin,UB)是一类含76个氨基酸、大小约为8.6 kDa的小蛋白质,在真核生物中普遍存在且高度保守。人类基因组中有四个基因编码泛素的基因: UBB , UBC , UBA52 和 RPS27A 。泛素氨基酸序列:MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKE

科研人员创制首个植物E3泛素连接酶文库

近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队创制了植物中首个E3泛素连接酶(UbE3)文库用于泛素化互作组鉴定,并利用该文库鉴定了苯丙氨酶家族蛋白PALs的核心E3泛素连接酶OsFBK16,揭示OsFBK16通过降解OsPALs负调控稻瘟病抗性的分子机制。相关研究论文发表于《

修饰性甲基化酶的基本信息

中文名称修饰性甲基化酶英文名称modification methylase定  义编号:EC 2.1.1.72;EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一种修饰酶。通常甲基化发生在限制性酶切位点的一两个碱基上,从而保护该酶切位点,使其不被相应的限制性内切酶所切割。应用学科生物化学与分子生物学(

组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系

在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—

修饰性甲基化酶的基本信息

中文名称修饰性甲基化酶英文名称modification methylase定  义编号:EC 2.1.1.72;EC 2.1.1.37。催化DNA甲基化作用的一种修饰酶。通常甲基化发生在限制性酶切位点的一两个碱基上,从而保护该酶切位点,使其不被相应的限制性内切酶所切割。应用学科生物化学与分子生物学(

拟南芥RNA核糖甲基化修饰研究方面获进展

  3月30日,中国科学院生物物理研究所研究员叶克穷课题组、北京大学现代农学院博士王玉秋和中科院遗传与发育研究所研究员李家洋课题组合作在Nucleic Acids Research上发表了题为Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha

【干货分享】四大类糖基化修饰

  相对于磷酸化、乙酰化修饰等相对较为简单的PTM来讲,糖基化修饰稍显复杂和多样,各位看官对糖基化修饰的知识了解多少呢?是否又对O糖、N糖傻傻分不清楚呢?没关系,今天小编带您一起走进糖的世界,一起揭开糖基化修饰的神秘面纱。  糖基化修饰主要发生在内质网和高尔基体。主要过程是将糖基在糖基转移酶作用下将

关于分泌蛋白的修饰加工糖基化的介绍

  这些修饰包括糖基化、羟基化、酰基化(酰化)、二硫键形成等,其中最主要的是糖基化,几乎所有内质网上合成的蛋白质最终被糖基化。糖基化的作用是:  ①使蛋白质能够抵抗消化酶的作用;  ②赋予蛋白质传导信号的功能;  ③某些蛋白只有在糖基化之后才能正确折叠。  糖基化有两种类型:  (1)糖蛋白是由寡糖

中科院吕东平课题组在细菌中实现植物泛素化途径的重建

  泛素化是一种重要的真核生物蛋白质翻译后修饰方式,它决定了被修饰蛋白的命运。  泛素化修饰的作用可概括为两点:1.参与蛋白质降解;2.直接影响蛋白质的活性和定位。  泛素激活酶(E1)、泛素结合酶(E2)、泛素连接酶(E3)、去泛素化酶、蛋白酶体共同构成了泛素-蛋白酶体系统(UPS)。在细胞内,U

丝氨酸检测方法

国内外用于L-丝氨酸检测的方法主要包括高效液相色谱法、茚三酮法、荧光淬灭法,酶反应法、纸层析-分光光度法等。其中高效液相色谱法其灵敏度好,准确度高,常用于L-丝氨酸的定量测定。茚三酮显色法作为最基本最传统的检测方法,其操作简便、反应快速,但是其对反应条件的要求较高,需要对反应温度、pH、时间进行精确

动物所有关泛素链形成机制研究取得新进展

  蛋白质泛素化修饰有着重要的生物学功能。在泛素化修饰过程中,泛素相互之间可以连接在一起形成泛素链。在泛素上有7个赖氨酸残基,所有这7个赖氨酸都可以被用来合成泛素链,而且不同连接方式的泛素链具有不同的功能。其中,Lys48连接的泛素链是研究最为充分的连接方式之一,其主要介导蛋白质的降解,但是哺乳动物

ITCH有望作为黑色素瘤潜在治疗靶点

  BRAF蛋白在很多类型癌症发生中都扮演着非常关键的角色,包括黑色素瘤,如今研究人员发现,BRAF能被生长因子所激活,随后刺激下游蛋白表达,进而促进癌细胞生长、侵袭和生存;然而目前研究人员并不是非常清楚BRAF如何参与到与促炎性因子释放的信号的交流过程中去,这些促炎性因子能被肿瘤周围环境的免疫细胞