中美联合揭示SidE同ubiquitin及其配体互作方式和催化机制

2018年5月3日,Cell杂志在线发表了高璞课题组与纽约大学合作的研究论文“Structural Insights into Non-canonical Ubiquitination Catalyzed by SidE”。该工作解析了来源于高致病性嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)的新型泛素化酶SidE与ubiquitin和配体的多个复合物的高分辨率晶体结构,并结合大量的生化实验和突变体分析,揭示了SidE同ubiquitin及其配体的新颖互作方式和催化机制。图一:SidE的两步反应中,mART结构域及PDE结构域结合ubiquitin的三维结构 泛素化修饰调控着真核细胞几乎所有的生命活动。在与宿主的长期博弈过程中,病原菌进化出了多种方式来干预宿主的泛素修饰系统,从而达到增强侵染效率和逃避免疫监视的目的。以往报道的泛素化修饰(不论是宿主自身的,或是病原参与的),均是通过经典的E1-E2-E3三酶级......阅读全文

首次发现类泛素蛋白SUMO修饰在ZGA过程中有潜在重要功能

  6月21日,北京大学分子医学研究所汪阳明研究组与胡新立以及清华大学那洁实验室合作在PLOS Biology在线发表最新研究成果“DPPA2/4 and SUMO E3 ligase PIAS4 opposingly regulate zygotic transcriptional program

简述N糖基化的修饰

  在内质网中糖链的修饰包括切除末端的3分子葡萄糖和b支的末端甘露糖,进入内质网后在各种糖基转移酶和糖苷酶的剪切和加工后最终形成复杂型,杂交型和高甘露糖型的N-糖链。在植物中复杂糖和杂交糖第二个N-乙酰葡糖胺还连接一个木糖,形成植物特有的复杂N-糖的糖型。

蛋白质PEG化修饰与纯化

聚乙二醇具有较广的分子量分布,随着平均分子量的不同,性质也产生差异,当分子量小于1000Da时,聚乙二醇是无色无臭粘稠的液体,高分子量的聚乙二醇则是蜡状白色固体,固体聚乙二醇的熔点正比于分子量,逐渐接近67℃的极限。毒性随分子量的增加而减少,小于400Da的 PEG在体内会经乙醇脱氢酶降解成有毒的代

我国学者在泛素化研究取得新进展

  泛素化是指泛素(一类低分子量的蛋白质)分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分类,从中选出靶蛋白分子,对靶蛋白进行特异性修饰的过程。泛素化在蛋白质的定位、代谢、功能、调节和降解中起着重要的作用,同时也参与了细胞周期、增殖、凋亡、分化、转移等几乎一切生命活动的调控。泛素化与肿瘤、心血管等疾病

蛋白质泛素化调控细胞凋亡研究取得进展

  细胞凋亡是维持机体组织平衡的重要生物学过程,肿瘤细胞的抗凋亡现象是目前癌症治疗领域中的主要障碍。在细胞凋亡过程中,caspase家族扮演着关键角色,其中caspase-8作为凋亡起始因子显得尤为重要。HECTD3是近年来发现的一个新的E3泛素连接酶。中科院昆明动物研究所陈策实研究员课题组前期研究

去泛素化酶(DUB)的5大分类详解

        泛素一蛋白酶体途径(ubiquitin-proteasome pathway)是细胞内一个重要的蛋白质降解调节系统。通过对底物蛋白的多聚泛素化并经蛋白酶体降解,可以影响或调节多种细胞活动,包括:基因转录、细胞周期调节、免疫反应、细胞受体功能及肿瘤生长、炎症过程等。该途径也是一种动

遗传发育所水稻泛素连接酶调控干旱胁迫信号转导获进展

  干旱胁迫严重影响农作物的产量和质量,在当前人口日益增长和粮食缺乏的情况下,对其调控机制进行研究显得极为迫切和重要。泛素介导的蛋白酶体途径是植物体内蛋白质修饰最重要的调控机制之一,其功能涉及植物细胞周期和光周期调控、激素信号转导、新陈代谢调控和DNA修复等多个过程。目前拟南芥中一系列

单分子力谱定量解析泛素修饰对基因调控研究的新进展

  人类基因组包含大约31.6亿个DNA碱基对,线性DNA分子作为庞大遗传信息的载体一般都比较长(人类一条染色体的DNA长度约为2米),生命通过组蛋白将DNA分子有序组织压缩形成微米级别的染色质存储到细胞核中。核小体是染色质的结构和功能的最基本单元,其中DNA缠绕在组蛋白巴聚体周围约两圈,完成对DN

泛素活化酶的泛素系统的介绍

  蛋白质的泛素化修饰主要发生在赖氨酸残基的侧链,且通常是多聚化 (多泛素化) 过程。被多泛素化修饰的蛋白质会被蛋白酶体(proteasome)识别进而被降解。三种关键的酶共同介导了这一多泛素化过程, 包括泛素活化酶 E1 (ubiquitin activating enzyme),泛素结合酶 E2

组蛋白甲基化修饰研究再获突破

  日前,复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展,相关成果发布在《分子细胞》上,该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。  组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰,参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是

sumo化与磷酸化修饰联合分析

随着质谱技术的不断进步,大规模修饰组学的方法也越来越成熟,PTM作为生物体内非常重要的生理现象也逐步被揭示出参与各项生命活动。今天我们就一起来学习一篇运用质谱技术对磷酸化修饰和类泛素化修饰鉴定,找出两种修饰联合作用对在DNA复制损伤压力时的响应。该篇文献来自哥本哈根大学的研究人员于2017年10月发

糖基化修饰的基本原理

  一、 糖基化修饰   蛋白质的糖基化是一种最常见的蛋白翻译后修饰,是在糖基转移酶作用下将糖类转移至蛋白质和蛋白质上特殊的氨基酸残基形成糖苷键的过程。研究表明70%人类蛋白包含一个或多个糖链1%的人类基因组参与了糖链的合成和修饰。   二、糖基化修饰功能   在参与糖基化形成的过程中,糖基转

糖基化修饰的基本原理

  一、 糖基化修饰   蛋白质的糖基化是一种最常见的蛋白翻译后修饰,是在糖基转移酶作用下将糖类转移至蛋白质和蛋白质上特殊的氨基酸残基形成糖苷键的过程。研究表明70%人类蛋白包含一个或多个糖链1%的人类基因组参与了糖链的合成和修饰。   二、糖基化修饰功能   在参与糖基化形成的过程中,糖基转

解析糖基化修饰及位点分析

  经常听到糖基化修饰,今天带大家一探究竟。什么是糖基化修饰呢?糖基化是在糖基转移酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网和高尔基体。糖基化修饰是一类非常重要的翻译后修饰,大部分膜蛋白和分泌蛋白均为糖蛋白,糖基化修饰不仅影响蛋白质的空间构象、活性、运输和定位,同时在信号转导、分子识别,

糖基化修饰的基本原理

一、 糖基化修饰蛋白质的糖基化是一种最常见的蛋白翻译后修饰,是在糖基转移酶作用下将糖类转移至蛋白质和蛋白质上特殊的氨基酸残基形成糖苷键的过程。研究表明70%人类蛋白包含一个或多个糖链1%的人类基因组参与了糖链的合成和修饰。二、糖基化修饰功能在参与糖基化形成的过程中,糖基转移酶和糖苷酶扮演了重要的角色

Dev-Cell丨同济王平组揭示肿瘤干细胞调控新机制

  肿瘤干细胞是导致肿瘤产生耐药性、潜伏及转移的关键因素,因此靶向肿瘤干细胞是治疗癌症的有效策略。转录因子NANOG(源于 Tir Nan Og 凯尔特语,意即永恒青春之地【1,2】)对维持肿瘤细胞的干性至关重要,可作为多种癌症恶性程度和预后不良的标志。因此,阐明NANOG的表达调控机制有助于找到靶

Science-|-抗逆突破!泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径

  为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫,全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中,研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用,影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解,叶绿体降解进而会引发植物早衰,最终影响作物产量。   叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器。

Science-|-抗逆突破!泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径

   为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫,全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中,研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用,影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解,叶绿体降解进而会引发植物早衰,最终影响作物产量。   叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器

Science-|-抗逆突破!泛素化介导叶绿体蛋白降解新途径

   为了应对全球气候变化带来的频繁逆境胁迫,全面而清晰地了解植物面对胁迫反应的不同调控机制具有重要的意义。在植物抗逆研究中,研究发现非生物胁迫会抑制植物的光合作用,影响叶绿体的稳定性并诱导叶绿体的降解,叶绿体降解进而会引发植物早衰,最终影响作物产量。   叶绿体是为植物提供能量来源的重要细胞器

核因子κB信号通路的激活

  NF-κB信号通路是由细胞外的刺激引起的。细胞外信号因子与细胞膜上的受体结合,开启了一连串下游的反应。受体蛋白接受刺激后先活化IκB激酶(IKK)。IKK将细胞内NF-κB·IκB复合物的IκB亚基调节位点的丝氨酸磷酸化,使得IκB亚基被泛素化修饰,进而被蛋白酶降解,从而释放NF-κB二聚体。自

NFκB信号通路介绍

NF-κB信号通路是由细胞外的刺激引起的。细胞外信号因子与细胞膜上的受体结合,开启了一连串下游的反应。受体蛋白接受刺激后先活化IκB激酶(IKK)。IKK将细胞内NF-κB·IκB复合物的IκB亚基调节位点的丝氨酸磷酸化,使得IκB亚基被泛素化修饰,进而被蛋白酶降解,从而释放NF-κB二聚体。自由的

定量蛋白质组学方法获得了泛素化分布和动态变化信息的介绍

泛素化是真核生物特有的翻译后修饰,在哺乳动物细胞中,泛素化靶向∼100,000 个位点,并由约640种泛素化酶和约90种去泛素化酶可逆调控。尽管目前泛素化已被广泛关注和研究,但对蛋白质特定位点的泛素化比例(占有率)进行量化的研究却很少。因此本文主要通过定量蛋白质组学方法,量化了人类细胞中蛋白质组范围

华中科大连发五文:发布lncRNA、泛素修饰等重要数据库

  近年来,随着“精准医学”计划的发布,如何有效整合海量的高异质性、高复杂性生物医学大数据成为生命科学和医学领域的重大命题和挑战。  近日,华中科技大学生命科学与技术学院的“健康大数据”团队陆续发表了5篇论文,公布了多个重要的数据库,这些成果同期刊发在1月4日的Nucleic Acids Resea

线性泛素化在调控IFN抗病毒信号的新机制的应用

近年来,蛋白质泛素化成为基因表达调控研究的热点,泛素化在各类细胞信号通路中发挥重要的调节作用。泛素分子通常含有7种内部赖氨酸残基,通过这些残基可与其他泛素分子的甘氨酸C端相连产生分支,形成多聚泛素化修饰。 近年来又鉴定了一种新的多聚泛素链——线性泛素链,由两个泛素N、C端首尾相接而成。已有研究鉴定线

蛋白翻译后修饰的基金申请解析与研究注意点(二)

由此可见,泛素化相关基金无论是申请项目数还是金额数均在向磷酸化逼近,甚至从重点项目数看,18年泛素化的项目数已然超过了磷酸化。进一步统计表明,泛素化研究资助项目在医学部中一共98项,总资助金额高达4700万元。由此可见,泛素化的相关研究正是科研界的“当红小生”,基金申请的一大热点。图2.国自然基金项

Autophagy:新技术帮助科学家们观察蛋白泛素化过程

  稳态调节指的是细胞进化出复杂的系统,从在外界环境的刺激下维持内在稳定以及生理上的健康与平衡。这些系统对于细胞在压力状态下的反应尤其重要。举例来说,当细胞受到极限温度、紫外照射等刺激下,如果不能够保持稳态,就很容易发生病变。  细胞自噬是细胞维持稳态平衡的关键过程。自噬过程能够降解细胞中的有毒成分

浙江大学Nature子刊揭示泛素化调控新机制

  来自浙江大学的研究人员证实,E3泛素连接酶CRL4ACRBN可限制大电导钙激活钾通道(BK)的活性,阻止癫痫发生。这一研究发现发表在5月21日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  论文的通讯作者是浙江大学生命科学研究院的仓勇(Yong Cang)教授,其主要从事

Nat-Chem-Bio:新研究揭示蛋白泛素化的信号传导机制

  人体细胞具有先进的调节系统:用小分子泛素蛋白标记蛋白质。第一,来自慕尼黑工业大学(TUM)的团队成功地在试管和活细胞中以有针对性的方式用泛素标记蛋白质。  泛素分子包含76个氨基酸的序列,使其成为相对较小的生物分子。但它的影响是深远的:与蛋白质结合的泛素分子的类型,位置和数量决定了它们在细胞内的

泛素连接酶E3的识别机制

  靶蛋白通过被泛素途径的酶E2或E3识别而被泛素化修饰,通常是通过识别靶蛋白的特定Lys残基而将泛素连接到靶蛋白上。有时对靶蛋白的识别还需要特定位点的磷酸化并且要达到一定的磷酸化阈值。除此之外还有另外两种识别机制,即N.end规则和一种新的区别于N.end规则的N端氨基酸残基识别机制。N.end规

蛋白质的糖基化修饰主要分为

特征 N-连接 O-连接合成部位 粗面内质网 主要在高尔基体合成方式 来自同一个寡糖前体 一个个单糖加上去与之结合的氨基酸残基 天冬酰氨 丝氨酸、苏氨酸、羟脯、羟赖最终长度 至少5个糖残基 1-4个糖残基第一个糖残基 N-乙酰葡萄糖胺 N-乙酰半乳糖胺大概清楚了吧! 蛋白质糖基化是一种蛋白质修饰,作