计算机辅助鉴定药物代谢产物
随着分析仪器的发展,单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物,如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题,同时加速了无标准谱图化合物的解析过程,在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样,根据其工作原理,现分为化学结构数据库基础上的自动化鉴定、碎片树、基于代谢反应预测的代谢产物鉴定3类,其中化学结构数据库基础上的自动化鉴定适用于无标准谱图的已知化合物的鉴定,碎片树以及基于代谢反应预测的代谢产物鉴定为普适性方法,同时适用于未知代谢产物的分析鉴定。1 化学结构数据库基础上的自动化鉴定相对于存在标准质谱图的化合物,数据库收录的具有结构信息的化合物在数目上具有绝对优势,例如质谱专用数据库MassBank中收录了3 127个化合物的26 296张质谱图,而化学结构数据库ChemSpider中收录了580 000多个化合物结构。如果在化合物结构数据库基础上,根据化......阅读全文
计算机辅助鉴定药物代谢产物
随着分析仪器的发展,单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物,如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题,同时加速了无标准谱图化合物的解析过程,在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样,根据其工作原理,现分为化学结构数据库基础上的
科研人员发布新型代谢产物鉴定工具
近日,中国科学院上海药物研究所与中国科学技术大学杭州高等研究院合作,发布代谢产物鉴定工具DMetFinder。药物及先导化合物在体内外的代谢过程往往十分复杂。传统解析依赖人工经验,耗时费力,还可能遗漏低丰度或非经典代谢物。DMetFinder为这些难题提供了新的解决方案。该工具融合余弦相似度算法、同
非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法
据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类,特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质,现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述:1.主成分分析(PCA)非靶向代谢组学中鉴
LCMS应用药物代谢产物质谱解析
LC-MS应用-药物代谢产物质谱解析 1. 药物代谢的介绍 药物代谢指药物在体内多种药物代谢酶(肝药酶和肠道菌群酶)的作用下,化学结构发生改变的过程,又称生物转化或药物代谢。药物在体内生物转化后的结果有两种: 一是失活,成为无药理活性药物; 二是活化,由无药理活性成为有药理活性的代谢物或产生
以毒攻毒”—脂肪代谢产物“狙击”糖类代谢产物的毒性效应
研究者们很久之前就知道,低碳水、丰富脂肪的饮食能够防止一系列因生活习惯或年龄导致的疾病的发生,进而保证老年人的健康。然而,直到目前为止,我们仍不清楚其中的原因。根据最近一项由来自Aarhus大学的科学家们发表在《nature cell biology》杂志上的一篇文章,机体的能量代谢以及其化学中
细菌分解代谢产物的检测和鉴定是如何实现的
代谢产物的话因不同种的细菌而异吧,如果只是简单点的话,像楼上那样检验二氧化碳还是酒精或乳酸就够了,如果是不怎么熟悉的菌种的话首先要查阅相关资料进行初步了解和判断,再对其可能产物进行分别鉴定。例如了解到纤维素分解菌的产物可能是某种还原糖或非还原糖,然后再分别具体鉴定到底是什么,产生了气体的话也要检验。
PCR产物的电泳鉴定
一、准备工作1、实验器具与材料:(1)移液枪:10ul(2)吸头:20ul(3)吸头台:放置200ul和20ul的吸头一个(4)三角烧瓶:50ml一个(5)琼脂糖2、实验器具的处理与准备(1) 塑料制品:(包括吸头等)送至高压3次,试验前将枪头放入吸头台。(2)电泳板及电泳槽:用自来水冲洗干净备用3
PCR产物的电泳鉴定
一、准备工作1、实验器具与材料:(1)移液枪:10ul(2)吸头:20ul(3)吸头台:放置200ul和20ul的吸头一个(4)三角烧瓶:50ml一个(5)琼脂糖2、实验器具的处理与准备(1) 塑料制品:(包括吸头等)送至高压3次,试验前将枪头放入吸头台。(2)电泳板及电泳槽:用自来水冲洗干净备用3
计算机辅助精子分析
(一)计算机辅助精子分析概述 计算机辅助精子分析(CASA)是利用计算机视屏技术,通过一台与显微镜相连接的录像机,确定和跟踪个体精子细胞的活动和计算精子活动的一系列“运动学”参数。CASA对精液既可定量分析精子总数、活动力、活动率,又可分析精子运动速度和运动轨迹特征,所有参数均按WHO规定的标
鞘磷脂的代谢产物
鞘磷脂是细胞膜的主要组成成分,其代谢产物如神经酰胺(ceramide, Cer)、鞘氨醇(sphingosine, Sph)、1-磷酸鞘氨醇(sphingosine-1-phosphate, S1P)是具有生物活性的信号分子,可作为第一和(或)第二信使调控细胞的生命活动,如细胞的生长、分化、衰老和凋
细菌合成代谢的产物
①热原质;②毒素和侵袭性酶;③色素;④抗生素;⑤细菌素;⑥维生素。
用质谱技术确定的药物代谢产物的分子式
在代谢产物分析过程中,各类有机化合物的质谱裂解行为与其结构密切相关,因此质谱图谱解析适用于所有化合物的结构分析。但是仅依靠质谱无法判定化合物的精确结构,所以质谱图谱解析仅能作为化合物结构鉴定的辅助手段。随着先进的分析仪器的不断涌现,在化合物检测中可获得更精准的数据信息,更多反映代谢产物性质的参数。人
PCR扩增产物的鉴定
实验原理生物大分子如蛋白质、核酸、多糖等常以颗粒分散在溶液中.它们的净电荷取决于介质的H 浓度或与其他大分子的相互作用。在电场中,带电颗粒向阴极或阳极迁移.迁移的方向取决于它们带电的符号.这种迁移现象即谓电泳。迁移的方式目前可以根据分子尺寸大小、分子所带的电荷或分子的生物学与化学特性分为三类。如
PCR扩增产物的鉴定
实验原理生物大分子如蛋白质、核酸、多糖等常以颗粒分散在溶液中.它们的净电荷取决于介质的H 浓度或与其他大分子的相互作用。在电场中,带电颗粒向阴极或阳极迁移.迁移的方向取决于它们带电的符号.这种迁移现象即谓电泳。迁移的方式目前可以根据分子尺寸大小、分子所带的电荷或分子的生物学与化学特性分为三类
PCR扩增产物的鉴定
PCR扩增产物的鉴定实验原理生物大分子如蛋白质、核酸、多糖等常以颗粒分散在溶液中.它们的净电荷取决于介质的H 浓度或与其他大分子的相互作用。在电场中,带电颗粒向阴极或阳极迁移.迁移的方向取决于它们带电的符号.这种迁移现象即谓电泳。迁移的方式目前可以根据分子尺寸大小、分子所带的电荷或分子的生物学与化学
PCR扩增产物的鉴定
实验概要PCR扩增产物可以通过酶切分析、凝胶电泳(琼脂糖电泳、聚丙烯酰胺电泳、毛细管电泳等)、Southern杂交、克隆、测序等方法分析,电泳前还可以应用紫外分光光度计定量DNA。当采用凝胶电泳时也有溴化乙锭显色、银染法、荧光显色等不同的显色方法。本实验室采用的是非变性连续缓冲系统聚丙烯酰胺凝胶垂直
糖酵解中间产物的鉴定
原理利用碘乙酸对糖酵解过程中3-磷酸甘油醛脱氢酶的抑制作用,使3-磷激甘油醛不再向前变化而积累。硫酸肼作为稳定剂,用来保护3-磷酸甘油醛使不自发分解。然后用2,4-二硝基苯肼与3-磷酸甘油醛在碱怀条件下形成2,4-二硝基苯肼-丙糖的棕色复合物,其棕色程度与3-磷酸甘油醛含量成正比。操作方法1、取小烧
什么是植物次生代谢产物
由糖类、氨基酸等初生代谢产物通过次生代谢过程产生的有机物称为次生代谢产物,包括萜类、酚类和生物碱等。次生代谢产物是由次生代谢产生的一类细胞生命活动或植物生长发育正常运行的非必需的小分子有机化合物,其产生和分布通常有种属、器官、组织以及生长发育时期的特异性。
细菌代谢产物的观察实验
实验方法原理 由于各种细菌具有不同的酶,故分解糖类的能力不同,分解糖类后的终末产物亦不一致,例如肠道非致病菌一般均有乳糖酶,能分解乳糖产酸(乳酸,甲酸,乙酸等),尚有甲酸脱氢酶。能将甲酸进一步分解产生气体( CO2,H2),而肠道致病菌一般无乳糖酶,不能分解乳糖,因此,细菌的糖发酵试验,可用于鉴
藻类辅助鉴定计数
在2009年,迅数推出全球首创的“基于图像的浮游生物检测与智能鉴定系统”,迎合国家对环境监测事业重视,为环境监测机构及科研院所的藻类监测和研究提供了有效的手段。在藻类鉴定过程中一般基于藻体的具体形态特,由于藻体的形态特征比较复杂,不同时期,不同角度所展现的形态都有所不同,所以给藻种的鉴定带来了不小的
以码抗病:计算机也能辅助抗病毒药物研发
我原以为,这依然会是一个寻常的寒假。 直到疫情的形势愈发严峻。 对病毒各类蛋白的调研任务分配到远在五湖四海的每个实验室成员头上。没有瓶瓶罐罐,没有五花八门的试剂,没有昂贵精致的仪器。一台能远程连上服务器的电脑,这便是我所拥有的全部。图1。 药物研发有时只需要一台能连上服务器的笔记本(图片来源
PCR扩增产物鉴定与纯化
实验原理琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验)本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purification Kit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DNA制
PCR扩增产物鉴定与纯化
实验原理 琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验) 本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purification Kit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DN
PCR扩增产物鉴定与纯化
实验原理 琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验) 本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purification Kit),该试剂盒是从琼脂糖凝胶中回收并纯化DNA片段的试剂盒。试剂盒采用了独特的凝胶融解系统,结合DN
PCR扩增产物鉴定与纯化
实验概要通过琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物,并对获得的产物进行割胶纯化回收,为接下来的DNA重组和转化实验提供外源DNA片段。实验原理琼脂糖凝胶电泳鉴定PCR扩增产物。(原理参照琼脂糖凝胶电泳检测DNA实验) 本实验使用了TaKaRa公司的胶纯化试剂盒(Agarose Gel DNA Purifi
细菌合成代谢产物及其意义
(1)热原质:大多数为革兰阴性菌合成的菌体脂多糖。(2)毒素:◇内毒素:G-菌的脂多糖。◇外毒素:G+菌产生的蛋白质,毒性强且有高度的选择性。(3)侵袭性酶:有些细菌还能产生具有侵袭性的酶,如卵磷脂酶、透明质酸酶等。注:毒素和侵袭性酶在细菌致病性中甚为重要。(4)色素:◇水溶性色素◇脂溶性色素注:有
细菌的合成代谢产物及意义
细菌的合成代谢产物及意义是临床检验技师考试辅导的部分内容,以下是医学教育网对这块内容的整理,希望对考生有所帮助: (1)热原质:大多数为革兰阴性菌合成的菌体脂多糖。注入人体或动物体内能引起发热反应,故称热原质。 注:热原质耐高温,121℃20min不被破坏,蒸馏法去除热原质较好。 (2)毒
黏细菌的代谢产物有哪些?
次生代谢产物:这些是由黏细菌的次生代谢途径产生的化合物,如抗生素、抗真菌素、抗病毒素、抗肿瘤素等。例如,链霉菌属的一些种类可以产生链霉素、土霉素、红霉素等抗生素。 酶:黏细菌可以产生各种酶,如蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等,这些酶在工业上有很多应用,如食品工业、制酒工业等。 生物表面活性剂:黏细
关于鞘磷脂的代谢产物介绍
鞘磷脂是细胞膜的主要组成成分,其代谢产物如神经酰胺(ceramide, Cer)、鞘氨醇(sphingosine, Sph)、1-磷酸鞘氨醇(sphingosine-1-phosphate, S1P)是具有生物活性的信号分子,可作为第一和(或)第二信使调控细胞的生命活动,如细胞的生长、分化、衰老
植物的次生代谢产物有哪些
植物的次生代谢产物是指由次生代谢产生的一类细胞生命活动或植物生长发育正常运行的非必需的小分子有机化合物,其产生和分布通常有种属、器官、组织以及生长发育时期的特异性。植物次生代谢产物是植物对环境的一种适应,是在长期进化过程中植物与生物和非生物因素相互作用的结果。在对环境胁迫的适应、植物与植物之间的相互