以码抗病：计算机也能辅助抗病毒药物研发
我原以为，这依然会是一个寻常的寒假。 直到疫情的形势愈发严峻。 对病毒各类蛋白的调研任务分配到远在五湖四海的每个实验室成员头上。没有瓶瓶罐罐，没有五花八门的试剂，没有昂贵精致的仪器。一台能远程连上服务器的电脑，这便是我所拥有的全部。图1。 药物研发有时只需要一台能连上服务器的笔记本（图片来源：veer图库） 很多人以为，药物的研发只有在穿着白大褂的实验室里可以做。然而，随着近十余年，各类理论方法、计算机硬件、及工业和学术专业软件的发展与成熟，计算机辅助药物设计（Computer-Aided Drug Design， CADD）的方法已日趋成熟，其应用极大地加快了新药研发的速度与效率，已成为现代药物研发的常规方法之一[1]。 依赖于这样的技术，即便我足不出户，在家远程工作，也能为寻找治疗此次病毒感染的潜在药物贡献自己的力量。 寻找关键蛋白质 蛋白质是生命的物质基础，是组成细菌、病毒及动植物的一切细胞、组织的重要成分......阅读全文
计算机辅助鉴定药物代谢产物
随着分析仪器的发展，单个代谢样品中即可检测到成千甚至上万个化合物，如此庞大的数据亟需无监督的自动化鉴定过程。计算机的引入有效解决了大数据处理难题，同时加速了无标准谱图化合物的解析过程，在一定程度上实现了药物代谢产物的自动化鉴定。计算机辅助鉴定方法多种多样，根据其工作原理，现分为化学结构数据库基础上的
上海药物所计算机靶标预测及发现技术研究取得新进展
中科院上海药物所蒋华良课题组与华东理工大学药学院李洪林课题组合作，继反向对接方法——TarFisDock后，该研究团队构建了药效团靶标库—PharmTargetDB（包含7000余个重要靶标结构的信息和药效团模型，涵盖了349种生物功能和110种临床适应症）。通过药效团匹配方法，课
上海药物所发现抗凝血候选药物
长久以来，血栓栓塞性疾病如深静脉血栓、肺栓塞、脑卒中、急性冠脉综合征等，严重威胁着人类的生命健康，而抗凝药物被广泛用于血栓栓塞性疾病的预防与治疗。传统抗凝药物如肝素（普通肝素、低分子量肝素）、维生素K拮抗剂（华法林）等，在发挥其抗凝作用的同时，由于其自身存在的诸多缺陷，难以满足临床的广泛需求。因
计算机模拟发现宇宙膨胀与大脑成长相似
一项新的计算机模拟结果显示，在大脑回路、社交网络和宇宙膨胀等现象中，或许有某种基础的自然规律在支配着。 北京时间11月30日消息，根据一项新的计算机模拟研究，宇宙可能像一个巨大的大脑一样增长着。该研究的结果发表于11月16日《科学报告》期刊上。文章称，一些尚未发现的基础规律
哪些筛选途径可以发现药物
一般是由天然药化或药物化学专业提取或合成的一系列化合物，送药理进行活性筛选，药理活性筛选一般由体外细胞实验开始，进行活性的初步筛选，一般过程是培养细胞-造成病理模型-给予化合物-检测指标。初步筛选的方法一般有MTT法，生化试剂盒。如果初步筛选有疗效，可以再进行一些其他的生化实验加以确证，如weste
AI语言模型“提速”药物发现
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502762.shtm美国麻省理工学院和塔夫茨大学研究人员设计出一种基于大型语言模型（如ChatGPT）的人工智能算法，这种称为ConPLex的新模型可将目标蛋白与潜在的药物分子相匹配，而无需执行计算分子结
上海药物所发现新型抗MRSA候选药物
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）作为社区获得性感染和院内获得性感染中最常见的病原菌之一，其感染者的死亡率比非耐药细菌感染者的死亡率高出64%，被世界卫生组织列为十分严重的耐药细菌，呼吁开发新型抗生素用于治疗MRSA感染。 螺嘧啶三酮类化合物是一类全新结构、全新作用机理的新型抗菌化合物，对多
上海药物所发现新型抗MRSA候选药物
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）作为社区获得性感染和院内获得性感染中最常见的病原菌之一，其感染者的死亡率比非耐药细菌感染者的死亡率高出64%，被世界卫生组织列为十分严重的耐药细菌，呼吁开发新型抗生素用于治疗MRSA感染。 螺嘧啶三酮类化合物是一类全新结构、全新作用机理的新型抗菌化合物，对多
美国发现可能改进计算机的新类型材料
美国能源部阿莫斯国家实验室物理学家近日发现了一种拓扑金属——PtSn4，这种材料具有非常独特的电子结构，并有可能帮助制造具有更高能效、更快运行速度、更高数据存储速度的计算机。 科学家在PtSn4材料中发现了高密度的传导电子，并且发现大量紧密排列的狄拉克点，形成了线或弧状。而在此前的研究中，人们
上海药物所发现纳米药物载体递送力学机制
中科院上海药物所甘勇课题组与国家纳米科学中心施兴华团队合作，深入解析了纳米药物载体的力学性能对于克服多重生理屏障的影响。相关成果日前在线发表于《自然—通讯》杂志。 纳米药物载体在到达靶细胞之前，须克服生物体内的多重生理屏障。为实现疗效最大化，设计和制备能克服多重生理屏障并具备高效细胞摄取的递送载
科学家发现奇异液态自旋量子－可用于量子计算机
科学家们在剑桥大学主导的研究中发现了一种在40年前被首次预测到的奇异的新状态物质。液态自旋量子是一种物质的神秘状态，它被世人认为暗藏于某些磁性物质，但从未在自然界中被确凿发现据国外媒体报道，科学家们在剑桥大学主导的一项研究中发现了一种在40年前被首次预测到的奇异的新状态物质。这种名为液态自旋量
英国成立药物发现弹射创新中心
英国在位于英格兰西北地区的阿尔德利园区新近成立了药物发现弹射创新中心，依托北方经济动力区良好的科学与创新基础，重点支持企业开发药物临床前评价新技术。药物发现弹射创新中心的目标是加强英国商业化的临床能力，以提高药品的开发和生产能力，使之成为推出新药品和新服务的世界领先之地。 新弹射中心将进一步
研究发现脑修复的潜在药物
苏黎世大学的Kasum Azim及其来自里昂大学和朴茨茅斯大学的同事发现了一种新药可以激活小鼠脑部干细胞发育成成熟脑细胞，这项研究于近日发表在PLOS BIOLOGY 上。这项发现也许开启了治疗退行性脑疾病的新药研发新途径。 整个成年期，来自脑室下区的神经干细胞都会发育成新神经和支持细胞——小
上海药物所又发现新药
近日，中科院上海药物研究所研究员张志文、李亚平等与合作者提出并证实利用仿生脂蛋白系统高效递送一氧化氮（NO）供体-奥沙利铂前药（FO），通过重塑肿瘤物理屏障促进T淋巴细胞（CTL）瘤内浸润、增强基于免疫检查点抑制剂（ICIs）免疫治疗的新策略。相关研究成果发表于《先进材料》。 ICIs的免疫治疗
结核病开源药物开发项目发现首个候选药物分子
该项目使用网络工具测绘了结核分枝杆菌的4000个基因。 目标是开发结核病新疗法的科学家把散落的结核分枝杆菌的遗传信息集合在一起的一种独特的努力已经发现了首个候选药物分子。 当印度科学与工业研究理事会（CSIR）的主任Samir Brahmachari于2007年提出开源药物开发（
以码抗病：计算机也能辅助抗病毒药物研发
我原以为，这依然会是一个寻常的寒假。 直到疫情的形势愈发严峻。 对病毒各类蛋白的调研任务分配到远在五湖四海的每个实验室成员头上。没有瓶瓶罐罐，没有五花八门的试剂，没有昂贵精致的仪器。一台能远程连上服务器的电脑，这便是我所拥有的全部。图1。 药物研发有时只需要一台能连上服务器的笔记本（图片来源
计算机辅助诊断程序让医生更早发现脑肿瘤的生长
根据近日发表在开放获取杂志《PLOS Medicine》杂志上的一项新研究，一种计算机辅助诊断过程可以帮助医生更准确地发现较低级和体积比较小脑部肿瘤的生长，该研究由来自伯明翰阿拉巴马大学的Hassan Fathallah-Shaykh及其同事们一起完成。然而，还需要更多的临床研究来确定早期肿瘤生
AI加速药物发现，前景尚需实践检验
技术的飞跃支持人工智能引导的药物设计，如可以纯化蛋白质和移动液体的全机器人工作站。图片来源：英国《自然》网站 这或许是医疗保健行业最引人注目的变革：数字生物学和生成式人工智能（AI）正在帮助重塑药物发现进程。 利用AI开发新药尚处于起步阶段，但AI设计的药物在过去几年已经进入临床试验的早期阶段
Nature发现万能抗癌药物
来自伦敦大学学院和剑桥大学Babraham 研究所的科学家们在一项新研究中证实，一种当前用于治疗白血病的药物可以转化成对抗各种癌症的“万能武器”。研究人员发现其具有一种意料之外的效应，能够增强对许多不同肿瘤的免疫反应。 这种叫做p110δ抑制剂的药物在近期的一些临床试验中对某些白血病显示出显著
Nature新发现为药物研发提速
英国生物科学理事会( BBSRC )旗下的John Innes 研究所(John Innes Centre)的科学家们发现了一种自然界存在的重要酶，这一发现打开了高效廉价生成药物化合物之门。研究成果发表在11月21日的《自然》(Nature)杂志上。 “成千上万的化合物都来源于这种我们
研究发现PROTAC药物具有高成药性
中国科学院上海药物研究所研究员刁星星课题组、陈浩课题组，运用放射性标记技术，成功合成[14C]ARV-110作为PROTAC（蛋白水解靶向嵌合体）的代表性模型化合物，并揭示了PROTAC在口服生物利用度较低的情况下，依然能够展现出良好的特异性和生物活性。相关研究成果发表于《药物化学杂志》，并获选
我国海洋药物研发现状堪忧
“这么大一个国家，重磅海洋药物一个也没有，如何说得过去？” 在国内进行了大量调研之后，中科院海洋所研究员史大永感到既失望又无奈。4月19日，在山东省科协承办的山东省智库高端人才研修班暨新旧动能转换创新峰会上，他向现场数百名科技系统的专家、官员分享了一组数据，作为问题的注脚： “国际上有13
糖尿病药物研发发现新线索
胰岛素分泌功能缺陷是引发糖尿病的主要原因，因此，促进胰岛素分泌便成为治疗糖尿病的主攻方向之一。我国科学家领衔联合国际团队，首次解析了胰高血糖素样肽-1受体（即GLP-1R）七次跨膜区的晶体结构并揭示了相关的别构调节机理，将掀起新一轮抗糖尿病药物设计和新药开发的热潮。这项研究成果日前在国际顶级学术
先进院发现GPCR药物全新结合模式
日前，中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队与上海科技大学合作，通过计算药学与生物化学相结合的方法，发现G蛋白偶联受体蛋白（GPCR）全新药物分子结合模式与激活机制。相关工作近期发表在ACS Central Science上。 G蛋白偶联受体（G Prot
AI加速药物发现，前景尚需实践检验
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517244.shtm 技术的飞跃支持人工智能引导的药物设计，如可以纯化蛋白质和移动液体的全机器人工作站。图片来源：英国《自然》网站这或许是医疗保健行业最引人注目的变革：数字生物学和生成式人工智能（
先进院发现GPCR药物全新结合模式
日前，中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队与上海科技大学合作，通过计算药学与生物化学相结合的方法，发现G蛋白偶联受体蛋白（GPCR）全新药物分子结合模式与激活机制。相关工作近期发表在ACS Central Science上。 GPCR参与着人类体内包括细
乙肝治愈性药物，发现之路还有多长？
中国拥有世界20%的人口，却同时也有全球一半的肝癌患者！肝癌，已成为具有我国特色的癌种之一，这其中最主要的原因，即为乙肝病毒（HBV）感染！与此同时，因HBV感染而导致的肝硬化，同样也是因HBV感染而死亡的主要疾病！基于此，HBV治疗药物亟待开发！但现实中凉凉的却是，国外那些大型跨国制药公司并不
上海药物所发现戊二酸尿症潜在药物靶标
记者从中科院上海药物所获悉，该所化学蛋白质组学研究中心科研人员首次发现了与遗传代谢性疾病戊二酸尿症相关的体内蛋白修饰新型通路——赖氨酸戊二酰化，并发现了治疗此疾病的潜在新药物靶标。相关研究论文日前已发表于《细胞·代谢》。 近年来，代谢性疾病患病率逐渐增高，严重影响了人们的生活质量。据统计，
科学家发现一种新磁性－有助制造新型磁性计算机
在交替磁体中，相邻的原子被旋转，它们的磁自旋被翻转。图片来源：LIBOR SMEJKAL近日，一项在线发表于《自然》的研究报告说，科学家首次测量到一种新的磁性。产生这种磁性的交变磁体包含了现有不同类别磁体的混合特性，可用于制造高容量和快速存储设备或新型磁性计算机。直到20世纪，人们还认为只有一种永磁
IBM量子计算机商业化突破:发现模拟分子的新方法
今天，IBM的研究人员宣布了一种在量子计算机上模拟分子结构的新方法，这项研究还上了科学期刊《Nature》的封面。 研究论文也于今天刊登在《Nature》上，由Abhinav Kandala，Antonio Mezzacapo，Jerry M. Chow & Jay M. Gambetta