中科院大化所代谢组学深度覆盖分析技术获新进展
近日,中科院大连化物所高分辨分离分析及代谢组学许国旺研究员团队在代谢组学深度覆盖分析技术研究方面取得新进展,相关工作在Analytical Chemistry《分析化学》杂志上连续发表3篇研究论文。 代谢组学是研究表型的重要工具,但现有技术在代谢组数据采集质量和数据解析方面仍存在很大瓶颈,制约了代谢组技术的大规模应用,发展代谢组高覆盖定量检测和识别技术是代谢组学技术的发展方向。针对上述瓶颈问题,该研究团队开展系统深入研究,通过发展拟靶向代谢组学方法、研究代谢物结构-质谱特征规律、结合结构-色谱保留规律提高代谢组分析的覆盖度,发展代谢物数据库以改进代谢物的批量结构鉴定能力等。 研究团队建立了高覆盖度拟靶向脂质组学分析新方法,涵盖19个脂类,3377个脂质离子对,覆盖7000多种脂质分子结构。方法具有良好的线性、重复性,更低的检测线,更高的覆盖度,更好的数据质量,特别适合于大规模脂质组学分析(Anal Chem.)。 ......阅读全文
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍
什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的? 代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生
中科院大化所代谢组学深度覆盖分析技术获新进展
近日,中科院大连化物所高分辨分离分析及代谢组学许国旺研究员团队在代谢组学深度覆盖分析技术研究方面取得新进展,相关工作在Analytical Chemistry《分析化学》杂志上连续发表3篇研究论文。 代谢组学是研究表型的重要工具,但现有技术在代谢组数据采集质量和数据解析方面仍存在很大瓶颈,
代谢组学的研究方法
代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱
代谢组学的研究方法
代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱
高硒摄入有危害?或诱导猪Ⅱ型糖尿病的发生
图片来源:中国农业科学院 近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所优质功能畜产品创新团队在高硒摄入诱导猪Ⅱ型糖尿病发生分子机制研究方面取得重要进展。相关研究成果已在营养学领域TOP期刊《The Journal of Nutrition》在线发表。 众所周知,硒是机体必需的微量元素,在氧化还原调控、
酰基肉碱谱检测有助预知Ⅱ型糖尿病早期风险
中科院上海生科院营养科学研究所林旭团队和生物化学与细胞生物学研究所吴家睿、曾嵘团队在Ⅱ型糖尿病早期预测研究方面取得新进展。相关成果日前在线发表于《糖尿病护理》杂志。 肉碱是转运长链脂肪酸进入线粒体内膜进行β氧化的重要载体,在线粒体脂肪代谢中起到重要作用。酰基肉碱作为肉碱代谢的中间产物,在动
Ⅱ型糖尿病早期预测研究获突破
中科院上海生科院营养科学研究所林旭团队和生物化学与细胞生物学研究所吴家睿、曾嵘团队在Ⅱ型糖尿病早期预测研究方面取得新进展。相关成果日前在线发表于《糖尿病护理》杂志。 肉碱是转运长链脂肪酸进入线粒体内膜进行β氧化的重要载体,在线粒体脂肪代谢中起到重要作用。酰基肉碱作为肉碱代谢的中间产物,在动物研
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度
代谢组学——肿瘤研究的利器
细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么? 1、肿瘤与代谢组学 肿瘤
做好代谢组学研究的关键
首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次
“代谢组学”技术与方法研究
【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现
液相色谱高分辨质谱联用技术应用新进展!
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员团队在利用液相色谱-高分辨质谱联用技术(LC-HRMS)分析酰基肉碱的研究中取得新进展,研究结果在Analytical Chemistry杂志发表。 酰基肉碱是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥重要作用,如脂肪酸的b-氧化代谢。由于不同长度的酰基链和同
研究找到调控盐敏感高血压新靶点
近日,《自然-通讯》发表的一项来自国家心血管病中心、中国医学科学院阜外医院顾东风院士与鲁向锋教授团队的研究首次阐明“肠道—酰基肉碱”轴对血压盐敏感性的关键调控作用。研究证实,肠源性代谢物异戊酰肉碱(isovalerylcarnitine)在高盐膳食下显著下降,进而诱发盐敏感性高血压,而补充该代谢物具
许国旺Analytical-Chemistry发文:LCHRMS-分析酰基肉碱获进展
近日,中科院大连化学物理研究所的许国旺研究员团队在利用液相色谱-高分辨质谱联用技术(LC-HRMS)分析酰基肉碱的研究中取得新进展,研究结果在Analytical Chemistry杂志发表。 酰基肉碱是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥重要作用,如脂肪酸的b-氧化代谢。由于不同长度的酰基
长寿的代谢特征代谢组学研究的启示
长生不老是人类自古以来的夙愿。 中国古代神话故事中,有菩提老祖的大品天仙诀,王母娘娘盛会上的蟠桃,太上老祖炼丹炉里的不老丹,还有妖怪们梦寐以求的唐僧肉都可以实现长生不老。在史学瀚海中,《史记》记载秦始皇东巡碣石,携童男童女入海求仙,寻求长生不老药;在现代科学中,衰老仍然是生物医学领域热门主题之
代谢组生物标记物与肾功能下降及高尿酸发病风险的关系
最近,国际临床医学研究期刊《美国肾脏病学会临床杂志》(Clinical Journal of the American Society of Nephrology)和《关节炎护理与研究》(Arthritis Care & Research)先后发表了中国科学院上海营养与健康研究所林旭研究组和中科
多不饱和脂肪酸与代谢综合征发病风险研究中取得进展
近日,《脂质研究杂志》(Journal of Lipid Research)在线发表了中国科学院上海营养与健康研究院林旭研究组的研究论文“Erythrocyte PUFAs, circulating acylcarnitines, and metabolic syndrome risk: a p
临床代谢组学研究常见问题
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。Q:如何设置验证集和测试集?A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念,通常
中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案
中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。 赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和
液相色谱高分辨质谱联用技术应用新进展
酰基肉碱是一类重要的代谢物,在许多生物过程中发挥重要作用,如脂肪酸的b-氧化代谢。由于不同长度的酰基链和同分异构体的存在,酰基肉碱的种类繁多。已有的大多分析方法中,可检测到的酰基肉碱数常常几十种。为了提高酰基肉碱的分析覆盖度,该课题组建立了一种能分析700余种酰基肉碱的液相色谱-质谱方法。 首先,
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)
在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,
质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现
质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子,按质荷比m/e大小分
临床代谢组学研究常见问题(一)
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后,所收集到的常见问题,供大家学习和参考。 Q:如何设置验证集和测试集? A:按我理解你想问的问题是:training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
临床代谢组学研究常见问题(一)
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婴儿肠道菌群及代谢物与肥胖的关联
近日,中国科学院大连化学物理研究所研究员许国旺团队与郑州大学附属第一医院、聊城市人民医院以及大连市妇女儿童医疗中心等合作,在探索婴儿早期饮食—菌群—代谢及其与婴儿后期肥胖风险的关联研究中取得新进展。合作团队揭示了健康婴儿的年龄特异性肠道微生物组特征,解析了肠道菌群在婴儿适应饮食结构转变中的潜在作
质谱——让临床检测更完美-暨第一届临床质谱论坛圆满落幕
分析测试百科网讯 2018年3月31日,第一届临床质谱检验医学学术论坛暨‘一带一路’质谱临床应用培训班(北京站)在北京亚洲大酒店胜利闭幕。本次大会共有十余位国内外顶级质谱专家亲临现场,并做了精彩的报告,与大家分享最前沿的临床质谱技术。三百余专家学者与会,共享临床质谱盛宴(相关报道:第一届临床质谱