中科院大化所代谢组学深度覆盖分析技术获新进展
近日,中科院大连化物所高分辨分离分析及代谢组学许国旺研究员团队在代谢组学深度覆盖分析技术研究方面取得新进展,相关工作在Analytical Chemistry《分析化学》杂志上连续发表3篇研究论文。 代谢组学是研究表型的重要工具,但现有技术在代谢组数据采集质量和数据解析方面仍存在很大瓶颈,制约了代谢组技术的大规模应用,发展代谢组高覆盖定量检测和识别技术是代谢组学技术的发展方向。针对上述瓶颈问题,该研究团队开展系统深入研究,通过发展拟靶向代谢组学方法、研究代谢物结构-质谱特征规律、结合结构-色谱保留规律提高代谢组分析的覆盖度,发展代谢物数据库以改进代谢物的批量结构鉴定能力等。 研究团队建立了高覆盖度拟靶向脂质组学分析新方法,涵盖19个脂类,3377个脂质离子对,覆盖7000多种脂质分子结构。方法具有良好的线性、重复性,更低的检测线,更高的覆盖度,更好的数据质量,特别适合于大规模脂质组学分析(Anal Chem.)。 ......阅读全文
LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析,是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰
大连化物所等肝癌代谢组学研究取得进展
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的高分辨分离分析及代谢组学研究团队(1808组)与上海东方肝胆医院王红阳院士课题组合作,将基于液相色谱-质谱用于肝癌组织非靶标代谢组学研究并取得了重要进展,相关研究成果已经在线发表在Cancer Research杂志上。 原发性肝癌是全球最
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息。如
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
代谢组学的优势、应用及研究内容介绍
我们知道细胞内的生命活动由众多基因、蛋白质、以及小分子代谢产物来共同承担,而上游的(核酸、蛋白质等)大分子的功能性变化最终会体现于代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、受体作用效应、细胞信号释放、能量传递和细胞间通讯等,所以代谢组处于基因调控网络和蛋白质作用网络的下游,所提供的是生物学的终端信息
氨基酸和脂质预测糖尿病风险在代谢组学病例对照研...2
通过T2D组与非T2D组对照,发现37个代谢产物表达差异有统计学意义(FDR < 0.05),其中23个表达上调,14个表达下调,这些差异代谢物有以下特征:①戊糖是增加最显著的代谢物。②氨基酸代谢在T2D和非T2D对照中也有变化:11个氨基酸(组氨酸、异亮氨酸、丝氨酸、酪氨酸、亮氨酸、蛋氨酸
高分辨质谱Orbitrap直击靶标代谢组学新热点
在生命科学奇妙世界里,基因、核酸、蛋白和小分子代谢产物构成了细胞生命活动的基本要素,以这些物质为基础的诸多组学技术的发展,推动着生命科学研究不断向前。 基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命科学研究中研究的范式⁽¹⁾,研究成果可谓精妙纷呈、大放异彩。 图1:基因-蛋白-代谢-表型之间的互动成为生命
代谢组学新工具:METLIN
METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。 超过上万个代谢物 目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,
GCMS-HRAM-代谢组学数据库-探索代谢组学的奥秘
盐城4公分厚外墙岩棉板报价 岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后,采用的四辊离心制棉工序,将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维,再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂,经过沉降、固化、切割等工艺,根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan s
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(system
高深度空间代谢组学助力肿瘤微环境研究
肿瘤的发展除了与癌细胞自身基因突变导致的恶性增殖有关以外,还与肿瘤微环境息息相关。在癌症中,正常组织中和谐的细胞相互作用关系被破坏,原本保护正常细胞生存的微环境在肿瘤细胞的影响下,逐渐演变成适应肿瘤生长的条件。针对肿瘤微环境的检测和表征研究也可为癌症治疗提供新的思路。目前空间多组学技术已用于研究几种
功能代谢组学用于胶质瘤研究获进展
近日,中国科学院大连化学物理研究所与美国NIH、哈尔滨医科大学附属第一医院合作将功能代谢组学用于胶质瘤研究取得新进展:利用毛细管电泳-质谱技术,发现瘤组织中的亚牛磺酸含量显著高于癌旁对照组织中的亚牛磺酸,并且与胶质瘤分级即恶性程度呈正相关。经过分子对接计算机模拟,科研人员发现亚牛磺酸能够与α-酮
细胞衰老的溶酶体代谢组学研究的新突破
溶酶体对细胞代谢至关重要,并异质地参与各种细胞过程。测量溶酶体代谢异质性的能力对于理解它们的生理作用至关重要。 2021年6月14日,中国科学技术大学熊伟与仓春蕾共同通讯在Nature Methods 在线发表题为“Metabolomic profiling of single enlarge
代谢组学与临床医学的研究进展
人体是一个复杂的系统,存在于这一系统中的生物分子相互关联、互相依赖。近年来,人们已经意识到生物学的整体复杂性以及基因构成与环境因素之间的复杂交互作用,而对这些交互作用的理解已经不能单单从基因组学、蛋白质组学或转录组学水平去揭示。关注生物分子之间途径及网络的动态变化和关系的系统生物学(
布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略
摘要 * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征; * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像; * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict
岛津超快速质谱助力靶向代谢组学研究
靶向代谢组学中,通常需要同时检测多个目标组分,这对质谱数据的采集速度提出了很高的要求。 岛津超快速质谱(UFMS)拥有业内首屈一指采集速度。以LCMS-8050为例,其驻留时间(Dwell time≥0.8 ms)、切换时间(Pause time≥1 ms)、扫描速度(Scan speed≤3
看大牛如何做有望实现临床转化的大队列研究
代谢组学技术的兴起加快了生物标志物的筛选工作,每年都有大量的文献发表。很遗憾的是绝大数文章的研究队列小规模较小,只是属于前瞻性的研究,离真正走入临床应用还有很长一段距离。小编注意到国内在肝癌、冠心病、结直肠癌等领域已经有了多篇大规模的报道,其中中国药科大学临床代谢组学中心主任齐炼文教授一直走的是大队
大化所动物所在代谢组学研究中取得新进展
近日,中科院大连化学物理研究所许国旺研究员领导的研究组(1808组)利用其构建的代谢组学技术平台取得重要科研成果。他们与中科院动物研究所康乐院士研究组合作,首次发现了肉碱类代谢物在飞蝗两型转变过程中的关键调控作用。相关论文已在线发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上(doi
J-Proteome-Res:-代谢组学应用于微囊藻毒素代谢研究
微囊藻毒素(MCLR),作为一种肝毒素,正在威胁着人类的公共卫生安全。在体内,肝脏是MCLR主要攻击的器官,然而具体代谢变化目前任然未知。近日,中国科学院水生生物研究所谢平等研究人员在与上海敏芯信息科技公司的合作下,通过对灌服MCLR的大鼠模型进行代谢组学的研究,向我们揭示了MCLR扰乱肝脏代谢
将领域知识引入神经网络,MIT团队用光谱Transformer研究非靶向代谢组学图谱
代谢组学研究已经确定了介导细胞信号传导、竞争和疾病病理学的小分子,部分原因是大规模社区努力测量数千种代谢物标准品的串联质谱。然而,在临床样品中观察到的大多数光谱不能与已知结构明确匹配。令人惊讶的是,用于阐明小分子结构的深度学习方法无法与经典统计方法相媲美,科学家认为这可能是由于缺乏纳入当前神经网络架
非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?
据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借
非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...
非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些
蛋白质酰基化修饰与生物合成代谢研究再获新进展
近日,华东理工大学生物工程学院、生物反应器工程国家重点实验室叶邦策教授团队在蛋白质酰基化修饰与生物合成代谢研究领域再次取得重要进展,相关研究成果以“乙酰磷酸与c-di-GMP协同调节BldD活性,控制放线菌发育与抗生素合成”为题,发表于国际知名学术期刊《核酸研究》。 放线菌作为生产抗生素种类最
关于极长链酰基辅酶A脱氢酶缺乏症的检查介绍
1.一般检查 稳定期常见高尿酸血症、高脂血症、转氨酶增高、肌酶增高,急性发作时可有低酮症性低血糖、代谢性酸中毒、肌红蛋白尿,一些患者伴肾功能损害。 超声检查常见脂肪肝、心肌肥厚。心肌损害的患者心电图异常。 2.血液酰基肉碱谱检测 长链酰基肉碱升高,以肉豆蔻烯酰基肉碱升高最明显,游离肉碱不
与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点
那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究
LCMS在脂质组学中的应用
脂质组学(lipidomics)已经作为一门独立的学科与非靶代谢组学、靶向代谢组成为代谢组学中“三大主要研究领域”。为什么脂质组学会成为研究热点中的新宠?请听我一一道来。 还记得上面这张18年初风靡全生物圈的“小鼠拔罐”图吗?今年2月,陆军军医大学新桥医院李咏生团队发表在【Cellular P
进入前景光明的代谢组学
内容概要: 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法,而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作
如何看待代谢组学的前景
是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越
如何看待代谢组学的前景
是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越