454用于西红柿基因组测序

最近,西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱,以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱,并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较,寻找与水果有些特性相关的基因,相关文献在Nature杂志作为封面文章发表1。 西红柿不但是重要的经济作物,也作为研究有花植物非常重要的研究模型。通过更多的西红柿不同品种的测序研究,能够掌握更多性状相关的信息,从而帮助农业育种以及有花植物研究工作。 此次研究中使用了454 GS FLX测序,获得了Solanum lycopersicum基因组约900Mb的数据,与Sanger测序结果结合,拼接出700Mb的基因组图谱,仅含有91个scaffolds。以此为基础,对野生型的S. pimpinellifolium基因组则通过短读长平台进行测序,获得约740Mb数据。两个基因组共发现54......阅读全文

盘点:2012年顶尖基因组研究

  基因组研究是一门新兴的、发展迅速的生命科学,其普遍应用及向其他学科、领域的不断渗透日趋明显,这些学科涵盖了现代农业、生物能源、生态环境和人类健康等各个方面。随着测序成本的下降,基因组研究成果也呈现井喷之势。近日The Scientist对2012年最突出的基因组研究进行了盘点……   1.

中外科研人员绘出老虎基因组图谱

  一个国际科研团队最近报告说,他们完成了对一只东北虎的基因组测序。这是人类首次获得老虎的全基因组图谱,有助研究大型猫科动物的遗传多样性和保护濒危动物。   这项研究由韩国、中国、俄罗斯、蒙古国等国科研人员共同完成,测序目标是韩国首尔一家动物园中一只9岁的雄性东北虎,历时三年绘制出它的完整基因组图

我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制

       4月15日,深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱,这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只,这一研究成果将对于挽救和保护朱

全球癌症基因组图谱计划又一研究突破

  最近,发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中,来自从事癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)研究计划的科学家通过进行研究,对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析,并且对这种常见类型的肾癌进行了

迄今最全面的非编码基因组图谱问世

  生命科学    非编码 DNA 延伸段在发育和基因调控中发挥着关键作用。2 月 3 日发表在《自然》(Nature)上的一项新研究称,来自美国麻省理工学院(MIT)的研究团队发表了迄今为止最全面的非编码基因组图谱,EpiMap(Epigenome Integration across Multi

中国科学家成功绘制人参基因组图谱

  3月4日,在钓鱼台国宾馆中国人参基因组图谱新闻发布会上,中科院基因组所副所长、世界知名基因组学专家于军向媒体公布:经过吉林省通化市政府、中科院北京基因组研究所、吉林紫鑫药业的共同努力,于2月底成功绘制出人参基因组图谱,揭开了人参的神秘面纱,为人参的种植、防病、开发与人参产业发展振兴提供

首个韩国人基因组图谱绘制成功

据韩国联合通讯报道,韩国研究机构日前宣布,第一个完整的韩国人基因组图谱已经绘制成功。 报道指出,这是人类染色体碱基序列第四次被完整破译,这项成果是由韩国嘉泉医科大学和韩国生命工程研究院的两个研究团队通过共同研究取得的。研究人员宣布,分析测序中使用的基因物质来自于嘉泉医科大学教授金圣镇。 研究的目的是

构建水稻基因组倒位变异图谱

  近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内多家单位发布了迄今为止最大的水稻群体水平倒位变异图谱,并挖掘获得了新的水稻耐热优异等位基因,该研究对水稻育种改良具有重要意义。相关研究成果发表在《科学通报(Science Bulletin)》上。  水稻中的基因组倒位变异是指染色体上的DNA序列发

接近完整:高质量白菜基因组图谱发布

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494026.shtm近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所分子育种创新团队研究获得接近完整组装的白菜基因组,揭示白菜着丝粒的快速进化特征。相关研究成果在线发表于《植物生物技术》(Plant Biotechno

科学家破译枸杞子基因组图谱

枸杞作为传统的药食同源植物,含有丰富的果胶多糖。枸杞果胶多糖(LBPPs)是重要的生物活性成分,具有抗氧化、免疫调节、抗衰老等功效。尽管枸杞在健康领域应用较多,但对枸杞的遗传图谱、枸杞活性成份LBPPs的合成过程和调控机制知之甚少。这在很大程度上制约了枸杞的分子育种发展与推广。近日,中国科学院院士、

美科学家绘制出瓜类基因组图谱

  炎炎夏日,以西瓜为代表的各种瓜类成为人们最爱。美国科研人员最新报告说,他们绘制出了西瓜等瓜类的基因组图谱,将来有望利用基因技术开发出更甜、更可口、更健康的瓜类新品种。   得克萨斯农机大学科研人员在新一期《美国园艺科学协会杂志》上报告说,此前法国和西班牙研究人员曾经完成了瓜类某些DNA(脱氧核

光滑双脐螺免疫细胞基因组图谱完成

  科技日报北京12月20日电 (记者张梦然)施普林格自然出版社旗下《免疫遗传学》杂志近日公布了世界上第一份曼氏血吸虫中间宿主免疫细胞的单细胞RNA测序(scRNA-seq)的比较基因组学和转录组学科学成果,该成果是由中国北部湾大学和加拿大阿尔伯塔大学共同主持。  光滑双脐螺是世界上排名第二的最重大

草莓和可可树基因组图谱出炉

  据美国物理学家组织网12月26日报道,在26日出版的《自然—遗传学》杂志上,两组科学家表示,他们分别解开了野生草莓和克里奥洛可可树的基因密码,新发现有助于育种专家培育出品质更高的草莓和可可树品种。   英国生物工艺学和生物学研究委员会(BBSRC)和其他4个国家的70名研究人员绘制出了野生草莓

山苍子基因组图谱揭秘精油合成分子机制

  山苍子,是我国南方家喻户晓的一种香树,其果实有香气,无毒,可治疗急性肺炎,有抗病毒抗菌消炎作用。山苍子精油还是高级化妆品紫罗兰酮的原料。山苍子花 陈炳华摄  4月3日,《自然—通讯》在线发表中国林业科学研究院亚热带林业研究所(以下简称亚林所)研究员汪阳东团队的重要成果。该团队成功组装全球首个染色

科学家完成糜子全基因组精细图谱

  1月25日,《自然-通讯》(Nature Communications)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心张蘅研究组和朱健康研究组题为The genome of broomcorn millet 的研究论文。该研究完成了糜子基因组精细图

研究团队合作发布白木香基因组精细图谱

  近日,中国热带农业科学院热带生物技术研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所崔鹏团队合作发布了白木香基因组精细图谱,相关研究结果已发表在GigaScience期刊。该基因组精细图谱的发布将为野生白木香种群保护生物学、沉香结香机制和香味基因及树种的进化研究奠定良好基础,也为进一步基于基因组的白木

中国科学家成功破译飞蝗基因组图谱

  1月14日,由中国科学院动物研究所康乐院士领衔, 深圳华大基因研究院和中科院北京生命科学研究院等单位参与的一项研究,成功破译了飞蝗(Locusta migratoria)的全基因组序列图谱,这是迄今人类破译的最大动物基因组。基于基因组信息,这项研究还揭示了飞蝗食性、迁飞和群聚的奥秘。研究成果

西藏成功绘制出全球首个青稞基因组图谱

  西藏自治区农牧科学院与华大科技2日向新华社记者透露,继全球首个大麦基因绘制成功后不久,他们率先在世界上完成青稞基因组图谱的绘制。该项科研成果将为深入揭示西藏青稞起源、驯化及栽培选育过程等提供坚实的遗传学基础。   青稞,在藏语中称为“乃”,在分类学上是一种裸大麦。青稞在青藏高原经过3500—4

中国人参基因组图谱成功绘制

  3月4日,由吉林省通化市人民政府、中国科学院、吉林紫鑫药业共同主办的中国人参基因组图谱新闻发布会在北京钓鱼台国宾馆举行。吉林省省长王儒林、中科院副院长李家洋出席大会。中科院生物局、长春分院、北京分院、北京基因组研究所等科研单位的领导和专家、吉林省省直和通化市市直有关领导以及国内外新闻媒

最新Science公布人类基因组重组图谱

  来自美国国立卫生研究院NIH,美国健康科学统一服务大学等处的研究人员发表了题为“Recombination initiation maps of individual human genomes”的文章,构建出了一张人类基因组中染色体交换遗传信息的详细图谱,这将有助于解析这些位点如何影响人类基因

首张非洲人全基因组图谱问世

据《自然》杂志报道,2月6日,美国加州Illumina生物技术公司宣布,他们首次对一位非洲男子进行了完整的基因组测序。 在此之前,科学家已经对两位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中国男性进行了全基因组测序,但从未对非洲人进行研究。因此,这位匿名的尼日利亚约鲁巴人男

科学家破译枸杞子基因组图谱

枸杞作为传统的药食同源植物,含有丰富的果胶多糖。枸杞果胶多糖(LBPPs)是重要的生物活性成分,具有抗氧化、免疫调节、抗衰老等功效。尽管枸杞在健康领域应用较多,但对枸杞的遗传图谱、枸杞活性成份LBPPs的合成过程和调控机制知之甚少。这在很大程度上制约了枸杞的分子育种发展与推广。  近日,中国科学院院

《Cell》:如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤

  时至今日,这一计划已经取得了许多成果,最新Cell杂志公布了泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas),这也是癌症基因组图谱(TCGA)的收官项目,同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表,以及相关的一些主要发现(每种肿瘤类型的标记论文)。  生物通报道:2005年美国国立

破译对虾基因组-获国际首个高质量对虾基因组参考图谱

  由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组,获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱,研究成果于1月21日在《自然-通讯》(Nature communications)在线发表,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重

中国启动十万人基因组计划:绘制国人精细基因组图谱

  科学家们希望通过绘制中国人精细基因组图谱,来研究疾病健康和基因遗传的关系。  此次启动的“中国十万人基因组计划”覆盖地域包含我国主要地区,涉及人群除汉族外,还将选择人口数量在500万以上的壮族、回族等9个少数民族。  基因是DNA上有遗传效应的片断,人类的生、老、病、死等都与基因有关。而基因组和

海洋所成功破译对虾基因组并获得国际首个基因组图谱

  由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组,获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱,研究成果于1月21日在《自然-通讯》(Nature communications)在线发表,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重

西红柿有了国际标准

由联合国粮农组织和世界卫生组织联合创立的食品法典委员会日前推出西红柿的国际标准。根据这一标准,“合格的”西红柿必须完整、干净、新鲜、无虫、无异味。 据法新社7月4日报道,在长达7年的研究和激烈争论之后,食品法典委员会最终确定了西红柿的国际标准。首先,合格西红柿必须呈圆形、伞拱形、椭圆形或泪滴形。其次

Science:美味西红柿的关键基因

  对于许多的杂货店购物者来说,那些来自商店的看似完美的红彤彤的西红柿却远不如自家宅园里的美味。近日来自康奈尔大学鲍依斯•汤普森植物研究所、美国农业部和加州大学戴维斯分校的研究人员破译了一个可增加西红柿中糖、碳水化合物和类胡萝卜素水平的基因GLK2。相关论文发布在6月29日的《科学》(Science

如何选择和处理西红柿种子?

西红柿别名番茄(tomato),果实营养丰富,具特殊风味。可以生食、煮食、加工制成番茄酱、汁或整果罐藏。西红柿的营养价值如今已被很多人接受,也因此,很多地方都有种植西红柿,尤其是美国、俄罗斯、意大利和中国为最。那么,西红柿种植前如何选择西红柿种子呢?西红柿种子不但关系到西红柿的生 长状况,还关系到西

香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱

  香港中文大学7日宣布,该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱,这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况,并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。  鼻咽癌是华南地区常见的癌症,也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍,鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于确诊时已届晚