454用于西红柿基因组测序
最近，西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱，以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱，并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较，寻找与水果有些特性相关的基因，相关文献在Nature杂志作为封面文章发表1。 西红柿不但是重要的经济作物，也作为研究有花植物非常重要的研究模型。通过更多的西红柿不同品种的测序研究，能够掌握更多性状相关的信息，从而帮助农业育种以及有花植物研究工作。 此次研究中使用了454 GS FLX测序，获得了Solanum lycopersicum基因组约900Mb的数据，与Sanger测序结果结合，拼接出700Mb的基因组图谱，仅含有91个scaffolds。以此为基础，对野生型的S. pimpinellifolium基因组则通过短读长平台进行测序，获得约740Mb数据。两个基因组共发现54......阅读全文
全球首张榨菜高质量基因组图谱问世
9月6日，《自然-遗传》（Nature Genetics）杂志在线发表了浙江大学农业与生物技术学院园艺系教授张明方团队的最新研究成果，课题组通过高通量测序技术，绘制了世界上第一张榨菜全基因组图谱，并从基因组选择与进化层面解答了榨菜“家乡味”的成因，这一进展将对芥菜类蔬菜作物的改良产生重要意义。
我国科学家完成扇贝基因组精细图谱绘制
日前，中国海洋大学教授包振民团队完成了扇贝基因组精细图谱绘制，探究原始动物祖先染色体核型进化、躯体结构多样性产生、眼睛起源及其调控机制等，在动物宏观进化研究领域取得重要进展。相关成果日前发布于《自然.生态学与进化》。 动物界99%的物种隶属于双侧对称动物，进化学家推测这些双侧对称动物可能起
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日，中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作，破译了褐牙鲆全基因组序列，通过与半滑舌鳎全基因组比较分析，初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
科学家绘制褐牙鲆全基因组精细图谱
近日，中国水产研究院黄海水产研究所研究员陈松林领导的研究组与上海海洋大学、德国维尔茨堡大学、葡萄牙阿尔加夫大学、深圳华大基因研究院等单位合作，破译了褐牙鲆全基因组序列，通过与半滑舌鳎全基因组比较分析，初步揭示了比目鱼变态发育的分子机制。该研究成果发表于《自然—遗传学》。 通过与半滑舌鳎全基因组
香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱
香港中文大学7日宣布，该校医学院研究人员成功破解鼻咽癌的全基因组图谱，这一突破性发现有助评估鼻咽癌病人的预后情况，并向鼻咽癌的个人化治疗迈出一大步。 鼻咽癌是华南地区常见的癌症，也是一种极具侵略性的头颈癌。据介绍，鼻咽癌大多与感染EB病毒相关。由于缺乏早期病征，60%至70%患者于确诊时已届晚
科学家构建高质量金粟兰基因组图谱
11月26日，《自然—通讯》以背靠背的形式在线发表了两项由中国科研团队主导的研究，这两项研究填补了核心被子植物最后一个主要分枝——金粟兰目的基因组信息，为破解被子植物的早期演化历程提供了更翔实的证据。被子植物是地球上数量最多、种类最丰富的植物类群。还原植物清晰的间亲缘关系系统发育树，对了解被子植物的
Nature里程碑成果：扩展人类表观基因组图谱
10年前，科学家们宣布人类基因组计划(Human Genome Project)完工。通过这一国际项目人们旨在了解人类独特的四种核苷酸——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鸟嘌呤的组合。这一生物学字母表帮助研究人员确定了人类基因组中大约2.5万个编码基因，然而随着时间的推移，他们开始提出一些关于这些
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前，复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队，首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划，“DNA元件百科全书计划”（Encyclopedia of DNA Elements）从2003年启动至今整整20周年；本研
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
日前，复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队，首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划，“DNA元件百科全书计划”（Encyclopedia of DNA Elements）从2003年启动至今整整20周年；本研
Science：绘制一张复杂疾病基因组图谱
尽管研究人员已经利用全基因组关联研究(GWAS)确定了与人类疾病相关的遗传因素，但是要解释这些数据，还需要清楚的了解这些新的风险基因是如何被调控的。 近期Science杂志发布了最新研究成果，解析了人类天然免疫系统中的遗传调控网络，并且也指出了这些信息如何能直接用于理解自身免疫疾病的遗传学
研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497746.shtm 日前，复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队，首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划，“DN
致榆树枯萎病真菌基因组图谱绘制完成
据《每日科学》网站近日报道，加拿大多伦多大学研究人员宣布，他们已成功绘制出可引起榆树枯萎病的真菌的基因图谱，该图谱包含有3000万个DNA(脱氧核糖核酸)字符。此项研究成果发表在本周《BMC基因组学》网络版上。 研究报告作者之一、多伦多大学细胞和系统生物学助理教授艾伦·摩西称，从本质上说，
科学家绘制高精度类人猿基因组图谱
一个国际科研团队宣布，他们新近绘制出红毛猩猩和黑猩猩这两种类人猿的高精度基因组图谱。与过去类似研究不同的是，这次没有参照人类基因组图谱，因此更准确地揭示了人类与类人猿的基因差异。 利用第三代基因测序技术和先进的拼接方法，美国华盛顿大学等机构研究人员绘制出的这个高精度基因组图谱，对人与类人猿基因组
科学家绘制出首幅小麦基因组物理图谱
《科学》：有助于培育出更高产和抗旱的小麦新品种 一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱，这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行
高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制成功
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所动物基因工程与种质创新科技创新团队联合北京相关生物企业等单位成功绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱，为我国地方猪种质资源保护和开发利用奠定了基础。相关成果发表于《分子生态资源（Molecular Ecology Reso
我国完成世界首张－西瓜基因组序列图谱
由北京市农林科学院蔬菜平台牵头，联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位，共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译，获得了高质量的西瓜基因组序列图谱，成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列
最新测序的完整的人类基因组图谱
最新测序的完整的人类基因组图谱。 图片来源：英国《新科学家》网站 20年前，科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸（DNA），其实，他们漏掉了少许。现在，由于读取DNA方法的改进，科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了！据生物预印本网站（biorxiv）近日报道，美国科学家对全部
我国完成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国主导完成世界首张西瓜基因组序列图谱的绘制与破译，相关研究成果于北京时间11月26日凌晨在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》上在线发表。 西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果，但就是这样一种常见的水果，人们却始终未能从内到外了解它。过去，各国科学家虽然知道栽培西瓜遗传多样性狭窄是制约西瓜
我国完成首部高原濒危物种全基因组序列图谱
12月25日，由青海大学和深圳华大基因研究院共同发起并承担的藏羚羊基因组序列图谱在青海大学医学院宣告绘制完成，这是世界上第一部绘制完成的高原濒危物种全基因组序列图谱，也是中国科学家对全球基因组科学的又一重大贡献。 藏羚羊是我国青藏高原特有的物种，其生存环境高寒、缺氧，自然条件极为严酷。在喜
科学家成功绘制－首幅小麦基因组物理图谱
一个由法国、美国、澳大利亚等国科学家组成的研究小组日前为小麦的一个基因组绘制出了首幅物理图谱，这一成果将有助于科学家培育出更高产和抗旱的小麦新品种。 基因组物理图谱是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。绘制物理图谱的目的是把有关基因的遗传
荷兰科研人员首次绘出女性个人基因组图谱
荷兰科研人员5月26日说，他们首次绘出女性的个人基因组图谱，这将有助于深入研究人的遗传多样性。 荷兰莱顿大学医学中心发表的一份声明说，科研人员已测定该中心一位女性临床遗传学家的基因组序列，她是基因组被完整测序的首位女性和首位欧洲人。 基因组是指包含在生物DNA（脱氧核糖核酸）中的全部遗传信息。此前科
我国学者首次绘制一串红基因组图谱
北京市园林科学研究院21日对外称，由该研究院和北京林业大学合作共同完成了一串红高质量的基因组图谱绘制项目工作，这使我国成为世界上首个绘制出一串红基因组图谱的国家。图片来源于网络 唇形科是开花植物中的第六大科，包括约236个属，6900—7200个种类。而一串红则隶属唇形科鼠尾草属，其花色艳丽
最广泛的人类基因组相互作用图谱
最近，英国剑桥Babraham研究所和伦敦Francis Crick研究所的研究人员，开发并使用了一种新的技术，将基因组拼图中的点连接起来。就像连接点拼图，需要完成才能看到整幅图片，研究者的这项分析把称为启动子和增强子的调控因子连接起来，并指出了它们在小鼠和人类基因组中长距离内的物理相互作用。确
首张拓扑异构酶II全基因组剪切图谱
DNA切割酶对基因结构调节起着关键作用。研究人员发现，它在导致癌症的（如白血病和实体瘤）易位（translocations）异常重排中表现活跃。 II型拓扑异构酶（type II topoisomerase， TOP2）通过断裂DNA双链磷酸二酯键，来更正DNA连环数，使细胞DNA正常转录、复
Cell绘制广泛的人类基因组互作图谱
来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)、斯坦福大学的科学家们阐明了，我们的基因表达在DNA中受控的机制。发表在《细胞》(Cell)杂志上的这项新研究，将促成更好地了解某些遗传变异可以开启或关闭控制基因表达的调控元件，最终表现为个体特征和疾病易感性的机制。 这些变异存在于非直接负责编码基因，而是发
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
我国科学家完成甜橙基因组图谱找到甜橙起源
甜美又不上火的甜橙来源于柚作为母本和橘杂交，其后代再与橘杂交而形成的杂种。华中农业大学徐强博士等人26日发表在国际著名学术刊物《自然-遗传学》题为“甜橙基因组图谱”的研究论文，提出了甜橙起源这一新理论。 专家表示，甜橙基因组将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架，也将在应用上为果实品质包括色
蔬菜中心：绘成世界首张西瓜基因组序列图谱
我国是世界第一西瓜生产与消费大国，但是人们却始终未能从外到内了解它，直到2013年1月，国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱（影响因子35.532），标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新，为高效培育兼具优质、高产、抗
多国科学家破解硬粒小麦全基因组图谱
近日，来自意大利、加拿大、德国等多国科研机构的科学家共同在Nature Genetics上发表了题为“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章，绘制
《自然—生物技术》：美教授“自绘”个人基因组图谱
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一台机器、3个人、5万美元，美国斯坦福大学教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自绘”个人基因组图谱的经历说明，这项“游戏”已不再是谁也玩不起的了。 斯坦福大学8月10日发表声明说，夸克在两名同事的帮助下，利用一台冰箱大