更新再更新!基因总数的确定对我们的影响真那么大吗?

自2001年人类基因组计划的最终草案公布以来,蛋白质编码基因的数目先是被确定在2~2.5万个,此后,这一数目先后又被一些研究机构分别修改至1.9万个和超过2.1万个。近日,西班牙国家癌症研究中心一项研究又认为,人类基因组中的编码基因可能会减少20%!意味着对人类基因数目的统计或又要推翻重来。然而,这一数字的确定对于人类而言有着怎样的的意义呢? 这项发表在《Nucleic Acids Research》杂志、由西班牙国家癌症研究中心( CNIO )领导的新研究显示,多达20%的编码基因可能根本没有被编码,因为它们具有非编码或假基因(过时的编码基因)的典型特征。 编码基因数量及其鉴定对于包括癌症、心血管疾病等在内的多种疾病的研究至关重要。因此这一最新结论随之带来的人类基因组的缩小或会对生物医学产生重要影响。 01 编码基因与非编码基因 早期发现的基因多数是编码蛋白质的基因,即DNA序列通过一定的规则指导蛋白的合成。蛋白质......阅读全文

基因数悖理的定义

中文名称基因数悖理英文名称gene number paradox定  义基因数的反常现象,即按照通常认为的“一个基因一条多肽”的理论,从基因组测序结果预期的基因数目与细胞中存在的蛋白质种类之间存在的矛盾。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇基因数悖理

中文名称:基因数悖理英文名称:gene number paradox定  义:基因数的反常现象,即按照通常认为的“一个基因一条多肽”的理论,从基因组测序结果预期的基因数目与细胞中存在的蛋白质种类之间存在的矛盾。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

谷歌致力于基因数据市场,整合Tute-Genomics基因数据库

  谷歌希望凭借人类基因组云端服务Google Genomics在基因组研究市场占有一席之地,如今,公司正忙于用最好的工具来填满这个工具箱。   Google Genomics是谷歌2013年推出的一项云端服务,帮助大学实验室和医院等机构将患者或科研对象的生物基因储存到云端上,推进人类基因组信息的存

群众基因数据:揭示疾病病因

  本月月初,来自40个国家的研究人员和提倡者成立了一个全球联盟来开启安全共享的基因组和临床数据库,目的是为了在这个时代结束时可以使人类能够利用遗传数据。   英国政府,凯萨医疗机构及美国共同努力收集和整理了大量的遗传数据。但是随着全球的联盟,有一天临床医生可以广泛使用遗传数据,全世界的研究者可以

美国推进癌症基因数据共享

  美国麦利亚德基因公司(Myriad Genetics)拥有关于乳腺癌和卵巢癌的两个基因的ZL,这让它们垄断乳腺癌检测的行业多年。虽然美国最高法院在去年六月已经对这两个基因的ZL做了无效判决,但该公司仍然掌握这独有的130万份的检测数据。这些信息则使得麦利亚德公司在检测结果解释上有巨大优势。但是遗

-牛津大学校刊:人类蛋白质编码基因数量降至1.9万

  7月10日消息,据Science Daily报道,人体蛋白质的编码基因数量最早估计有10万个左右,人类基因组计划将其数量减少到了2万个左右。而最新研究再次将这一数量减少到了1.9万。  研究负责人、西班牙国立癌症研究中心的Alfonso Valencia说,几年前无人会想到,如此少的基因会创造出

谷歌将提供基因数据在线服务

  近日,谷歌公司宣布将开始提供由生物医学研究机构 Broad 研究所开发的DNA 分析软件的云服务版本。  Broad 研究所是由来自哈佛大学、麻省理工学院和哈佛大学附属医院的科学家组成的。该机构的基因组分析工具包GATK,可用于分析基因组测序数据,并已被研究人员和企业下载20000 次。谷歌表示

基因数据分析的主流软件

基因组测序在过去的几年中,许多生物的基因组完成了测序工作,如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用,正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具,已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取,那些基于

Science:癌症基因数据提出技术质疑

  据美国国立癌症研究所的一位病理学家David Levens称,在PubMed数据目录上有超过25,000篇关于Myc基因的论文,这种基因与转移性癌症有关,但是现在由于一项最新研究成果,因此都需要重新再评估,这项研究指出了Myc的致癌作用比大多数人认为的都要更广泛,而目前的实验方法具有缺陷,也

基因数据噪音或可保护患者隐私

  大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过,对于贡献了DNA的人来说,这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示,黑客能利用网络上公开可用的信息,从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。  为解决这些担忧,一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger

基因数据分析的主流软件

在过去的几年中,许多生物的基因组完成了测序工作,如何对如此庞大的原始序列信息进行分析和应用,正是现在最为棘手的问题。大量的基因预测软件和在线工具应运而生。如何广泛而深入地了解并能有的放矢地利用这些工具,已经成为21世纪分子生物学家的必修课。随着大规模EST和cDNA序列信息的获取,那些基于表达序列同

科学家缩小哮喘相关基因数量

  科学家在确定那些导致患者易发哮喘和过敏症的目标基因上有了进一步的发现,《自然—免疫学》报告了这项发现。  根据之前的全基因组关联研究(GWAS)的结果显示,目前有超过1500种潜在基因与哮喘有关,这个数字太大以至于科学家们无法检测出它们在发病过程中的个体相关性。比如作为白细胞的一个子群和免疫反应

orflab和N基因数值多少是正常

文 | 吕蒙【核酸的基本知识】新冠肺炎疫情暴发以来,“核酸”的大名“如雷贯耳”、老幼皆知,到底什么是核酸呢?核酸就是脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的总称,是遗传信息的携带者。简而言之就是个生命体最核心最特异的物质,由于核酸的唯一性,因此可以用来区分鉴别某种病毒的存在,核酸检测作为目前诊断

orflab和N基因数值多少是正常

【核酸的基本知识】新冠肺炎疫情暴发以来,“核酸”的大名“如雷贯耳”、老幼皆知,到底什么是核酸呢?核酸就是脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的总称,是遗传信息的携带者。简而言之就是个生命体最核心最特异的物质,由于核酸的唯一性,因此可以用来区分鉴别某种病毒的存在,核酸检测作为目前诊断新冠肺炎的“

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全球最大癌症基因数据库发布

  美国国家癌症研究所(NCI)科学家发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库,为研究者们提供了迄今为止最全面的方式,搞清楚如何将治疗药物靶向疾病。   周一NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库,将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更

人和未来加速基因数据分析-助推精准医疗

  6月8日,人和未来生物科技有限公司(Genetalks,以下简称“人和未来”)受邀参加第二届“精准医疗时代的协作创新——2016英特尔生命科学信息技术论坛”,公司CTO宋卓博士出席论坛并发表演讲。作为世界首家将FPGA加速技术应用于基因检测实践的生物科技企业,宋卓博士在论坛上对其公司最新产品GT

欧洲食品安全局开放转基因数据

   图片来源:blog.friendseat.com  欧洲食品安全局(EFSA)近日公布了孟山都公司为获转基因玉米NK603的批准证书而提交的文件和资料。这些资料在EFSA发布的一份公告中出现,这样做说明EFSA打算着手满足公众所倡仪的透明度,旨在通过数据使得广大科学社

众包个体基因数据库缓慢发展

Yaniv Erlich   计算遗传学家Yaniv Erlich因其建立了世界最大“家谱”而引人注目。而目前,他的DNA.land又引发新一轮个体基因数据库“众包热潮”。  早在2013 年,Erlich 团队就发表了一篇论文,介绍了如何利用公共资源,通过交叉比对的方法确定遗传学研究参与者的个人身

基因数据表明STAP细胞并不存在

Teruhiko Wakayama   两篇发表于《自然》杂志的关于一种可将成熟细胞转化为干细胞的新方法的争议性论文被指控存在数据篡改和捏造问题。现在,论文共同作者提供的基因数据显示,这种方法所获得的细胞并非研究小组声称的那样。该说法也得到了另一个来源的支持——用这种方法制造的STAP细胞(由刺激触

《细胞系统》:基因数据噪音或可保护患者隐私

  大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过,对于贡献了DNA的人来说,这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示,黑客能利用网络上公开可用的信息,从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。  为解决这些担忧,一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger

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外媒:基因数据是中美较量的新领域

  在美国联邦调查局(FBI),没有很多特工像埃德•尤(Ed You)那样。在这个鼓励工作人员让自己看上去平淡无奇的工作环境中,他那剃得锃亮的光头十分抢眼。尽管他的多数同事都是出了名的口风严密,但尤却是科技会议上健谈的明星,例如西南偏南大会(South-by-Southwest)和拉斯维加斯国际黑客

基因检测解码“生命说明书”-全球竞跑基因数据库

  随着华大基因上市临近,基因检测概念再度被关注。  华大基因CEO尹烨曾在公开场合介绍,给基因学家一滴血,能查到生育、肿瘤、感染,从三检合一到N检合一,液体活检可以做更多的事情。  相比于传统的影像学检测手段只能检测出已经发生且长成一定大小的异物,基因检测技术的优势在于,在更早的发病初始期,从分子

解码“基因宝藏”:最全海洋微生物基因数据库出炉

9月4日晚,华大生命科学研究院(简称“华大”)联合山东大学、英国东安格利亚大学、中国海洋大学、厦门大学、丹麦哥本哈根大学等机构,在《自然》上发表研究成果。他们通过对目前已公开的海洋微生物宏基因组数据进行分析和深度挖掘,构建了迄今为止最完整的海洋微生物基因数据库,并从中发现了大量具有应用潜力的基因资源

什么是分配系数、萃取分离因数与萃取因数

分配系数的含义: 用有机溶剂从水相中萃取溶质A时,如果溶质A在两相中存在的型体相同,平衡时溶质在有机相的活度与水相的活度之比称为分配系数,用KD表示。分配比的含义:将溶质在有机相中的各种存在形式的总浓度CO和在水相中的各种存在形式的总浓度CW之比,称为分配比.用D表示。当溶质在两相中以相同的单一形式

科学家公布人类基因数量引发争议

  估测人类基因组中基因数量的最早尝试涉及喝醉酒的基因学家、美国纽约冷泉港的一个酒吧以及纯粹的臆测。在人类基因组项目完成十多年后,辨别基因仍是一项挑战。  那是2000年。当时,人类基因组序列草图仍在绘制中。基因学家正在打赌人类拥有多少基因,赌注从几万个到几十万个不等。近20年后,掌握了真实数据的科

科学家公布人类基因数量引发争议

在人类基因组项目完成十多年后,辨别基因仍是一项挑战。 图片来源:Alan Phillips/Getty 估测人类基因组中基因数量的最早尝试涉及喝醉酒的基因学家、美国纽约冷泉港的一个酒吧以及纯粹的臆测。 那是2000年。当时,人类基因组序列草图仍在绘制中。基因学家正在打赌人类拥

微软的医疗布局:瞄准医疗信息化与基因数据

  2018年,微软陆续在iOS、Android、Windows商店中删除了HealthVault Insights——由微软在2017年2月与Healtcare NExT同时推出的一款为特定患者提供长期呵护和康复计划的软件。  这一措施并不意味着微软退出个人护理领域,相反,这表明Microsoft

机器人模拟出基因数百代进化结果

  据美国物理学家组织网5月4日(北京时间)报道,最近,瑞士洛桑联邦理工大学和洛桑大学合作,使用机器人模拟生物基因在数百代间的进化,阐明了生物学界持久争论的难题,也为汉米尔顿亲缘选择规则提供了数量证据。该研究将于下周发表在开放杂志《科学公共图书馆·生物学》上。   汉米尔顿亲缘选择